MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009051	ATCC	2	8	189511	189518	25 %	25 %	0 %	50 %	126178157
4002	NC_009051	TCC	2	6	189530	189535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178157
4003	NC_009051	C	6	6	189543	189548	0 %	0 %	0 %	100 %	126178157
4004	NC_009051	GAT	2	6	189550	189555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178157
4005	NC_009051	CTT	2	6	189582	189587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178157
4006	NC_009051	TGA	2	6	189645	189650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178157
4007	NC_009051	TTC	2	6	189710	189715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178157
4008	NC_009051	TTCA	2	8	189812	189819	25 %	50 %	0 %	25 %	126178157
4009	NC_009051	CAG	2	6	190145	190150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4010	NC_009051	CGC	2	6	190164	190169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
4011	NC_009051	GAC	2	6	190195	190200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4012	NC_009051	TCA	2	6	190209	190214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178158
4013	NC_009051	TCA	2	6	190257	190262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178158
4014	NC_009051	CAGG	2	8	190264	190271	25 %	0 %	50 %	25 %	126178158
4015	NC_009051	C	6	6	190278	190283	0 %	0 %	0 %	100 %	126178158
4016	NC_009051	GGC	2	6	190303	190308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4017	NC_009051	CGC	2	6	190331	190336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
4018	NC_009051	GGC	2	6	190363	190368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4019	NC_009051	CCG	2	6	190371	190376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
4020	NC_009051	C	6	6	190377	190382	0 %	0 %	0 %	100 %	126178158
4021	NC_009051	GGA	2	6	190386	190391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
4022	NC_009051	GTC	2	6	190429	190434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4023	NC_009051	TCT	2	6	190494	190499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178158
4024	NC_009051	CCA	2	6	190512	190517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178158
4025	NC_009051	GACC	2	8	190549	190556	25 %	0 %	25 %	50 %	126178158
4026	NC_009051	GGA	2	6	190557	190562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
4027	NC_009051	AGC	2	6	190623	190628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4028	NC_009051	C	6	6	190630	190635	0 %	0 %	0 %	100 %	126178158
4029	NC_009051	CGG	2	6	190647	190652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4030	NC_009051	GCG	2	6	190662	190667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4031	NC_009051	ATCC	2	8	190678	190685	25 %	25 %	0 %	50 %	126178158
4032	NC_009051	TCG	2	6	190764	190769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4033	NC_009051	GAG	2	6	190771	190776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
4034	NC_009051	ATC	2	6	190796	190801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178158
4035	NC_009051	CGG	2	6	190806	190811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4036	NC_009051	CCGCA	2	10	190817	190826	20 %	0 %	20 %	60 %	126178158
4037	NC_009051	TCCGG	2	10	190902	190911	0 %	20 %	40 %	40 %	126178158
4038	NC_009051	TCC	2	6	190922	190927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178158
4039	NC_009051	GGA	2	6	190944	190949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178158
4040	NC_009051	CCGG	2	8	190981	190988	0 %	0 %	50 %	50 %	126178158
4041	NC_009051	ACG	2	6	191009	191014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4042	NC_009051	GTC	2	6	191024	191029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4043	NC_009051	CGG	2	6	191032	191037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178158
4044	NC_009051	ACG	2	6	191054	191059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4045	NC_009051	CGC	2	6	191107	191112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
4046	NC_009051	GCC	2	6	191144	191149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
4047	NC_009051	TCCGCC	2	12	191180	191191	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	126178158
4048	NC_009051	GTCC	2	8	191203	191210	0 %	25 %	25 %	50 %	126178158
4049	NC_009051	GC	3	6	191276	191281	0 %	0 %	50 %	50 %	126178158
4050	NC_009051	CGC	3	9	191293	191301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178158
4051	NC_009051	C	6	6	191380	191385	0 %	0 %	0 %	100 %	126178158
4052	NC_009051	CGA	2	6	191388	191393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178158
4053	NC_009051	GAG	2	6	192049	192054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178159
4054	NC_009051	GGAGCA	2	12	192086	192097	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126178159
4055	NC_009051	AG	3	6	192155	192160	50 %	0 %	50 %	0 %	126178159
4056	NC_009051	GATATC	2	12	192162	192173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	126178159
4057	NC_009051	GAG	2	6	192186	192191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178159
4058	NC_009051	GGA	2	6	192192	192197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178159
4059	NC_009051	TTC	2	6	192228	192233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178159
4060	NC_009051	AGG	2	6	192249	192254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178159
4061	NC_009051	ATGCG	2	10	192347	192356	20 %	20 %	40 %	20 %	126178159
4062	NC_009051	CGC	2	6	192380	192385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178160
4063	NC_009051	GA	3	6	192402	192407	50 %	0 %	50 %	0 %	126178160
4064	NC_009051	AAG	2	6	192408	192413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178160
4065	NC_009051	GACGTG	2	12	192506	192517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	126178160
4066	NC_009051	GCCC	2	8	192538	192545	0 %	0 %	25 %	75 %	126178160
4067	NC_009051	CG	3	6	192565	192570	0 %	0 %	50 %	50 %	126178160
4068	NC_009051	TCA	2	6	192666	192671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178160
4069	NC_009051	AG	3	6	192701	192706	50 %	0 %	50 %	0 %	126178160
4070	NC_009051	AGGC	2	8	192723	192730	25 %	0 %	50 %	25 %	126178160
4071	NC_009051	GACC	2	8	192903	192910	25 %	0 %	25 %	50 %	126178161
4072	NC_009051	TGC	2	6	192929	192934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178161
4073	NC_009051	CTC	2	6	192940	192945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178161
4074	NC_009051	ATCG	2	8	192960	192967	25 %	25 %	25 %	25 %	126178161
4075	NC_009051	ACC	2	6	192977	192982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178161
4076	NC_009051	CTCCAG	2	12	192993	193004	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	126178161
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4078	NC_009051	GAC	2	6	193165	193170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178161
4079	NC_009051	GAT	2	6	193206	193211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178161
4080	NC_009051	CCT	2	6	193224	193229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178161
4081	NC_009051	GAC	2	6	193238	193243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178161
4082	NC_009051	GAG	2	6	193264	193269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178162
4083	NC_009051	TCC	2	6	193271	193276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178162
4084	NC_009051	GAG	2	6	193366	193371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178162
4085	NC_009051	ATG	2	6	193710	193715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178163
4086	NC_009051	ACGT	2	8	193768	193775	25 %	25 %	25 %	25 %	126178163
4087	NC_009051	GA	3	6	193907	193912	50 %	0 %	50 %	0 %	126178163
4088	NC_009051	A	6	6	193917	193922	100 %	0 %	0 %	0 %	126178163
4089	NC_009051	CCA	2	6	193939	193944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178163
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4091	NC_009051	T	6	6	194024	194029	0 %	100 %	0 %	0 %	126178164
4092	NC_009051	CCA	2	6	194038	194043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178164
4093	NC_009051	C	6	6	194160	194165	0 %	0 %	0 %	100 %	126178164
4094	NC_009051	CGT	2	6	194245	194250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
4095	NC_009051	CCA	2	6	194274	194279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178165
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4100	NC_009051	GTC	2	6	194402	194407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
4101	NC_009051	GAC	2	6	194492	194497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178165
4102	NC_009051	CTC	2	6	194525	194530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178165
4103	NC_009051	G	6	6	194577	194582	0 %	0 %	100 %	0 %	126178165
4104	NC_009051	CCGG	2	8	194587	194594	0 %	0 %	50 %	50 %	126178165
4105	NC_009051	GCCC	2	8	194602	194609	0 %	0 %	25 %	75 %	126178165
4106	NC_009051	CCA	2	6	194611	194616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178165
4107	NC_009051	CGG	2	6	194705	194710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178165
4108	NC_009051	G	6	6	194741	194746	0 %	0 %	100 %	0 %	126178165
4109	NC_009051	GAT	2	6	194764	194769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178165
4110	NC_009051	GGC	2	6	194776	194781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178165
4111	NC_009051	CGA	2	6	194800	194805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178165
4112	NC_009051	GGC	2	6	194868	194873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178165
4113	NC_009051	CTC	2	6	194888	194893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178165
4114	NC_009051	TCA	2	6	194910	194915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178165
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4118	NC_009051	CGC	2	6	195016	195021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178165
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4120	NC_009051	CGG	2	6	195034	195039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178165
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4122	NC_009051	CTG	2	6	195170	195175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
4123	NC_009051	CGG	3	9	195181	195189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178165
4124	NC_009051	TCG	2	6	195192	195197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
4125	NC_009051	TCC	2	6	195207	195212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178165
4126	NC_009051	GCC	3	9	195221	195229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178165
4127	NC_009051	GGCACT	2	12	195268	195279	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126178165
4128	NC_009051	GTC	2	6	195299	195304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178165
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4130	NC_009051	CAG	2	6	195515	195520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178166
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4141	NC_009051	CGGAAG	2	12	195923	195934	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	126178166
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4154	NC_009051	ATC	2	6	196454	196459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178166
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4241	NC_009051	C	6	6	200951	200956	0 %	0 %	0 %	100 %	126178172
4242	NC_009051	CCG	2	6	200979	200984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178172
4243	NC_009051	CGC	2	6	200992	200997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178172
4244	NC_009051	GTC	2	6	201018	201023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178172
4245	NC_009051	TGG	2	6	201060	201065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178172
4246	NC_009051	CCG	2	6	201092	201097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178172
4247	NC_009051	CGC	2	6	201193	201198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178172
4248	NC_009051	CGC	2	6	201306	201311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178172
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4251	NC_009051	CGT	2	6	201370	201375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178172
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4254	NC_009051	CGG	3	9	201472	201480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178172
4255	NC_009051	AT	3	6	201490	201495	50 %	50 %	0 %	0 %	126178172
4256	NC_009051	CCG	2	6	201513	201518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178172
4257	NC_009051	CGTCG	2	10	201530	201539	0 %	20 %	40 %	40 %	126178172
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4264	NC_009051	GCC	2	6	201737	201742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178172
4265	NC_009051	CGCCC	2	10	201869	201878	0 %	0 %	20 %	80 %	126178172
4266	NC_009051	GTCCCG	2	12	201911	201922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	126178172
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4272	NC_009051	GGC	2	6	202178	202183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178173
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4274	NC_009051	ATC	2	6	202301	202306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178173
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4341	NC_009051	CGATA	2	10	204821	204830	40 %	20 %	20 %	20 %	126178175
4342	NC_009051	TCA	2	6	204961	204966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178175
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4345	NC_009051	CGG	2	6	205112	205117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178175
4346	NC_009051	CCG	2	6	205149	205154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178175
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4350	NC_009051	GGC	2	6	205244	205249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178175
4351	NC_009051	CGGG	2	8	205265	205272	0 %	0 %	75 %	25 %	126178175
4352	NC_009051	GCG	2	6	205303	205308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178175
4353	NC_009051	GAC	2	6	205352	205357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178175
4354	NC_009051	TCC	2	6	205444	205449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178175
4355	NC_009051	GACTGC	2	12	205464	205475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	126178175
4356	NC_009051	CGAT	2	8	205540	205547	25 %	25 %	25 %	25 %	126178175
4357	NC_009051	ACGG	2	8	205653	205660	25 %	0 %	50 %	25 %	126178175
4358	NC_009051	AGT	2	6	205746	205751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178176
4359	NC_009051	GCT	2	6	205752	205757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178176
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4361	NC_009051	CGAGAC	2	12	205836	205847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178176
4362	NC_009051	TCT	2	6	205871	205876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178176
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4482	NC_009051	GCGA	2	8	213119	213126	25 %	0 %	50 %	25 %	126178187
4483	NC_009051	GATG	2	8	213138	213145	25 %	25 %	50 %	0 %	126178187
4484	NC_009051	GA	3	6	213202	213207	50 %	0 %	50 %	0 %	126178187
4485	NC_009051	GGC	2	6	213229	213234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178187
4486	NC_009051	CGG	2	6	213271	213276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178187
4487	NC_009051	GTC	2	6	213349	213354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178187
4488	NC_009051	GTC	2	6	213376	213381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178187
4489	NC_009051	CACC	2	8	213393	213400	25 %	0 %	0 %	75 %	126178187
4490	NC_009051	GA	3	6	213434	213439	50 %	0 %	50 %	0 %	126178187
4491	NC_009051	GGC	2	6	213474	213479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178187
4492	NC_009051	TCG	2	6	213512	213517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178187
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4495	NC_009051	C	6	6	213600	213605	0 %	0 %	0 %	100 %	126178187
4496	NC_009051	GCCC	2	8	213606	213613	0 %	0 %	25 %	75 %	126178187
4497	NC_009051	GAG	2	6	213616	213621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178187
4498	NC_009051	CGA	2	6	213639	213644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178187
4499	NC_009051	CGC	2	6	213651	213656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178187
4500	NC_009051	TCC	2	6	213657	213662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178187

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