MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009051	GGA	2	6	112340	112345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178073
2502	NC_009051	TCC	2	6	112351	112356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178073
2503	NC_009051	CGA	2	6	112490	112495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178073
2504	NC_009051	TGA	2	6	112517	112522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178073
2505	NC_009051	CGA	2	6	112556	112561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178073
2506	NC_009051	AGG	2	6	112597	112602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178073
2507	NC_009051	GCT	3	9	113189	113197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178074
2508	NC_009051	TAT	2	6	113232	113237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178074
2509	NC_009051	TGT	2	6	113238	113243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126178074
2510	NC_009051	AAC	2	6	113256	113261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178074
2511	NC_009051	CCA	2	6	113268	113273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178074
2512	NC_009051	ATG	2	6	113290	113295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178074
2513	NC_009051	TAC	2	6	113313	113318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178074
2514	NC_009051	GGT	2	6	113325	113330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178074
2515	NC_009051	TGG	2	6	113340	113345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178074
2516	NC_009051	GAT	2	6	113436	113441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178074
2517	NC_009051	TCC	3	9	113493	113501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178074
2518	NC_009051	CT	3	6	113533	113538	0 %	50 %	0 %	50 %	126178074
2519	NC_009051	GGC	2	6	113625	113630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178074
2520	NC_009051	ACC	2	6	113718	113723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178074
2521	NC_009051	ATC	2	6	113730	113735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178074
2522	NC_009051	GCT	2	6	113806	113811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178074
2523	NC_009051	CGT	2	6	113857	113862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178074
2524	NC_009051	GTACG	2	10	113867	113876	20 %	20 %	40 %	20 %	126178074
2525	NC_009051	CATGAA	2	12	113897	113908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	126178075
2526	NC_009051	CTT	2	6	113940	113945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178075
2527	NC_009051	CGG	2	6	114037	114042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178075
2528	NC_009051	TGC	2	6	114044	114049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178075
2529	NC_009051	GTTCC	2	10	114072	114081	0 %	40 %	20 %	40 %	126178075
2530	NC_009051	ACG	2	6	114132	114137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178075
2531	NC_009051	TGC	2	6	114205	114210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178075
2532	NC_009051	TGAT	2	8	114265	114272	25 %	50 %	25 %	0 %	126178075
2533	NC_009051	CCTT	2	8	114317	114324	0 %	50 %	0 %	50 %	126178075
2534	NC_009051	GGA	2	6	114362	114367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178075
2535	NC_009051	C	6	6	114381	114386	0 %	0 %	0 %	100 %	126178075
2536	NC_009051	TG	3	6	114397	114402	0 %	50 %	50 %	0 %	126178075
2537	NC_009051	GGTGA	2	10	114441	114450	20 %	20 %	60 %	0 %	126178075
2538	NC_009051	CGG	4	12	114539	114550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178075
2539	NC_009051	GA	3	6	114578	114583	50 %	0 %	50 %	0 %	126178075
2540	NC_009051	GAA	2	6	114633	114638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178075
2541	NC_009051	TAT	2	6	114708	114713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126178075
2542	NC_009051	GATG	2	8	114725	114732	25 %	25 %	50 %	0 %	126178075
2543	NC_009051	CCTA	2	8	114735	114742	25 %	25 %	0 %	50 %	126178075
2544	NC_009051	CGG	2	6	114847	114852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178075
2545	NC_009051	GAA	2	6	114901	114906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178076
2546	NC_009051	TCA	2	6	114921	114926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178076
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2548	NC_009051	CCCG	2	8	115035	115042	0 %	0 %	25 %	75 %	126178076
2549	NC_009051	CAT	2	6	115065	115070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178076
2550	NC_009051	TCA	2	6	115081	115086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178076
2551	NC_009051	TCG	2	6	115287	115292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178076
2552	NC_009051	TCT	2	6	115329	115334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178076
2553	NC_009051	ATC	2	6	115367	115372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178076
2554	NC_009051	CG	3	6	115410	115415	0 %	0 %	50 %	50 %	126178076
2555	NC_009051	GGTC	2	8	115453	115460	0 %	25 %	50 %	25 %	126178076
2556	NC_009051	GTG	2	6	116037	116042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178077
2557	NC_009051	TCA	2	6	116137	116142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178077
2558	NC_009051	GAA	2	6	116169	116174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178077
2559	NC_009051	TGA	2	6	116237	116242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178077
2560	NC_009051	TTC	2	6	116351	116356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178077
2561	NC_009051	ATGG	2	8	116395	116402	25 %	25 %	50 %	0 %	126178077
2562	NC_009051	CTC	2	6	116426	116431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178077
2563	NC_009051	A	6	6	116471	116476	100 %	0 %	0 %	0 %	126178077
2564	NC_009051	AGTC	2	8	116515	116522	25 %	25 %	25 %	25 %	126178077
2565	NC_009051	GAT	2	6	116526	116531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178077
2566	NC_009051	AAC	3	9	116568	116576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126178077
2567	NC_009051	GTC	2	6	116703	116708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178077
2568	NC_009051	GGTC	2	8	116711	116718	0 %	25 %	50 %	25 %	126178077
2569	NC_009051	CCT	2	6	116800	116805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178077
2570	NC_009051	TG	4	8	116807	116814	0 %	50 %	50 %	0 %	126178077
2571	NC_009051	ACG	2	6	116830	116835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178077
2572	NC_009051	TGG	2	6	116847	116852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178077
2573	NC_009051	AGC	2	6	116857	116862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178077
2574	NC_009051	TGG	2	6	116940	116945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178077
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2578	NC_009051	AATC	2	8	117061	117068	50 %	25 %	0 %	25 %	126178078
2579	NC_009051	AT	3	6	117072	117077	50 %	50 %	0 %	0 %	126178078
2580	NC_009051	TC	3	6	117101	117106	0 %	50 %	0 %	50 %	126178078
2581	NC_009051	ACGT	2	8	117206	117213	25 %	25 %	25 %	25 %	126178078
2582	NC_009051	ATCG	2	8	117247	117254	25 %	25 %	25 %	25 %	126178078
2583	NC_009051	ACG	2	6	117308	117313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178078
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2585	NC_009051	TGC	2	6	117363	117368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178078
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2587	NC_009051	TCG	2	6	117509	117514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178079
2588	NC_009051	CCGA	2	8	117545	117552	25 %	0 %	25 %	50 %	126178079
2589	NC_009051	AGA	2	6	117553	117558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178079
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2591	NC_009051	GGA	2	6	117663	117668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178079
2592	NC_009051	TAC	2	6	117697	117702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178079
2593	NC_009051	CGT	2	6	117913	117918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178080
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2599	NC_009051	ATC	2	6	118091	118096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178080
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2601	NC_009051	GAG	2	6	118337	118342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178081
2602	NC_009051	AGG	3	9	118359	118367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178081
2603	NC_009051	GAC	2	6	118376	118381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178081
2604	NC_009051	C	7	7	118385	118391	0 %	0 %	0 %	100 %	126178081
2605	NC_009051	GAC	2	6	118394	118399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178081
2606	NC_009051	GAG	2	6	118463	118468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178081
2607	NC_009051	GAT	2	6	118472	118477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178081
2608	NC_009051	GGT	2	6	118480	118485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178081
2609	NC_009051	CCG	2	6	118505	118510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178081
2610	NC_009051	GCTC	2	8	118636	118643	0 %	25 %	25 %	50 %	126178081
2611	NC_009051	GGA	2	6	118694	118699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178081
2612	NC_009051	CTT	2	6	118732	118737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178081
2613	NC_009051	CTA	2	6	118911	118916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178082
2614	NC_009051	CGA	2	6	118917	118922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178082
2615	NC_009051	C	6	6	118934	118939	0 %	0 %	0 %	100 %	126178082
2616	NC_009051	TCT	2	6	118991	118996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178082
2617	NC_009051	AGG	2	6	119001	119006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178082
2618	NC_009051	CGCC	2	8	119032	119039	0 %	0 %	25 %	75 %	126178082
2619	NC_009051	GAAGTC	2	12	119041	119052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	126178082
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2621	NC_009051	CCT	2	6	119118	119123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178082
2622	NC_009051	CCGGG	2	10	119124	119133	0 %	0 %	60 %	40 %	126178082
2623	NC_009051	CGG	2	6	119175	119180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178082
2624	NC_009051	GTC	2	6	119185	119190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178082
2625	NC_009051	GGA	2	6	119217	119222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178082
2626	NC_009051	GGT	3	9	119242	119250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178082
2627	NC_009051	CGT	2	6	119269	119274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178082
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2631	NC_009051	CGT	2	6	119478	119483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178082
2632	NC_009051	TGA	2	6	119487	119492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178082
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2634	NC_009051	GCA	2	6	119621	119626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178082
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2636	NC_009051	TCC	2	6	119779	119784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178083
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2649	NC_009051	GTA	2	6	120843	120848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178084
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2652	NC_009051	GTA	2	6	120939	120944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178084
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2732	NC_009051	AAGC	2	8	124884	124891	50 %	0 %	25 %	25 %	126178088
2733	NC_009051	GCC	2	6	124936	124941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178088
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2737	NC_009051	CGA	2	6	125071	125076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178088
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2739	NC_009051	TGGAA	2	10	125242	125251	40 %	20 %	40 %	0 %	126178089
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2862	NC_009051	CCT	2	6	132229	132234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178096
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2865	NC_009051	GAC	2	6	132344	132349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178096
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2867	NC_009051	ATC	2	6	132428	132433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178096
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2974	NC_009051	CGT	2	6	137711	137716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178103
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2978	NC_009051	GCT	2	6	138055	138060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178103
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2981	NC_009051	ACC	2	6	138168	138173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178103
2982	NC_009051	GCCACC	2	12	138220	138231	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126178103
2983	NC_009051	AGG	2	6	138247	138252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178103
2984	NC_009051	CCT	2	6	138296	138301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178103
2985	NC_009051	GAC	2	6	138323	138328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178103
2986	NC_009051	TCC	3	9	138337	138345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178103
2987	NC_009051	AAG	2	6	138384	138389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178103
2988	NC_009051	CGA	2	6	138398	138403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178103
2989	NC_009051	TTC	2	6	138405	138410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178103
2990	NC_009051	GTC	2	6	138492	138497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178103
2991	NC_009051	CCG	2	6	138598	138603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178103
2992	NC_009051	GGC	2	6	138693	138698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178104
2993	NC_009051	CGG	2	6	138723	138728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178104
2994	NC_009051	CTC	2	6	138790	138795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178104
2995	NC_009051	CGA	2	6	138813	138818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178104
2996	NC_009051	CGC	2	6	138833	138838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178104
2997	NC_009051	TCA	2	6	138869	138874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178104
2998	NC_009051	GCG	2	6	138924	138929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178104
2999	NC_009051	TGA	2	6	138932	138937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178104
3000	NC_009051	CGA	2	6	139032	139037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178104

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