MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanoculleus marisnigri JR1 chromosome

Total Repeats: 52982

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009051	CGG	2	6	234156	234161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178203
5002	NC_009051	TCG	2	6	234165	234170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178203
5003	NC_009051	CTA	2	6	234184	234189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178203
5004	NC_009051	CGGTG	2	10	234492	234501	0 %	20 %	60 %	20 %	126178204
5005	NC_009051	AAG	2	6	234519	234524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178204
5006	NC_009051	GAT	2	6	234805	234810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178205
5007	NC_009051	CGGTG	2	10	234929	234938	0 %	20 %	60 %	20 %	126178205
5008	NC_009051	GAA	2	6	234943	234948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178205
5009	NC_009051	TCG	2	6	235134	235139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178206
5010	NC_009051	GGC	2	6	235266	235271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178206
5011	NC_009051	TAC	2	6	235331	235336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178207
5012	NC_009051	CGA	2	6	235392	235397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5013	NC_009051	GGCG	2	8	235404	235411	0 %	0 %	75 %	25 %	126178207
5014	NC_009051	CGA	2	6	235434	235439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5015	NC_009051	ACG	2	6	235457	235462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5016	NC_009051	GCG	2	6	235520	235525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178207
5017	NC_009051	CTCGA	2	10	235526	235535	20 %	20 %	20 %	40 %	126178207
5018	NC_009051	CCT	2	6	235557	235562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178207
5019	NC_009051	CCGG	2	8	235563	235570	0 %	0 %	50 %	50 %	126178207
5020	NC_009051	GAC	2	6	235612	235617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5021	NC_009051	TCG	2	6	235635	235640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5022	NC_009051	GGC	2	6	235696	235701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178207
5023	NC_009051	TCG	2	6	235733	235738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5024	NC_009051	GTG	2	6	235813	235818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178207
5025	NC_009051	CGT	2	6	235834	235839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5026	NC_009051	GTC	2	6	235844	235849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5027	NC_009051	CCT	2	6	235870	235875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178207
5028	NC_009051	TCG	2	6	235916	235921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5029	NC_009051	CGC	2	6	235963	235968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178207
5030	NC_009051	GCT	3	9	235971	235979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5031	NC_009051	GTC	2	6	236000	236005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5032	NC_009051	AGG	2	6	236012	236017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178207
5033	NC_009051	GAG	2	6	236029	236034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178207
5034	NC_009051	GCGG	2	8	236065	236072	0 %	0 %	75 %	25 %	126178207
5035	NC_009051	GCT	2	6	236085	236090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5036	NC_009051	GAG	2	6	236254	236259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178207
5037	NC_009051	CGT	2	6	236328	236333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178207
5038	NC_009051	CGG	2	6	236367	236372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178207
5039	NC_009051	C	6	6	236391	236396	0 %	0 %	0 %	100 %	126178208
5040	NC_009051	CCG	2	6	236399	236404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178208
5041	NC_009051	CGAG	2	8	236424	236431	25 %	0 %	50 %	25 %	126178208
5042	NC_009051	GCG	2	6	236462	236467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5043	NC_009051	TGA	2	6	236595	236600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178208
5044	NC_009051	CGA	3	9	236769	236777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5045	NC_009051	AGA	2	6	236847	236852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178208
5046	NC_009051	AGC	2	6	236855	236860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5047	NC_009051	GCG	2	6	236877	236882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5048	NC_009051	GAGC	2	8	236886	236893	25 %	0 %	50 %	25 %	126178208
5049	NC_009051	CGG	2	6	236967	236972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5050	NC_009051	CGA	2	6	236973	236978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5051	NC_009051	CGAG	2	8	237009	237016	25 %	0 %	50 %	25 %	126178208
5052	NC_009051	GCG	2	6	237072	237077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5053	NC_009051	GAC	2	6	237100	237105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178208
5054	NC_009051	AAGA	2	8	237139	237146	75 %	0 %	25 %	0 %	126178208
5055	NC_009051	GGC	2	6	237175	237180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178208
5056	NC_009051	TGC	2	6	237244	237249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178209
5057	NC_009051	CACC	2	8	237255	237262	25 %	0 %	0 %	75 %	126178209
5058	NC_009051	GGA	2	6	237264	237269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178209
5059	NC_009051	AGG	2	6	237334	237339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178209
5060	NC_009051	GAC	2	6	237351	237356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178209
5061	NC_009051	GAC	2	6	237387	237392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178209
5062	NC_009051	CGG	2	6	237491	237496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178209
5063	NC_009051	GATGAG	2	12	237513	237524	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	126178209
5064	NC_009051	GGC	2	6	237603	237608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178209
5065	NC_009051	GGC	2	6	237621	237626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178209
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5068	NC_009051	GCT	2	6	237802	237807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178210
5069	NC_009051	GCG	2	6	237915	237920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178210
5070	NC_009051	CGG	2	6	237922	237927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178210
5071	NC_009051	ACC	2	6	237948	237953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126178210
5072	NC_009051	TCG	2	6	237961	237966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178210
5073	NC_009051	GGA	2	6	237973	237978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178210
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5083	NC_009051	TCC	2	6	238220	238225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178210
5084	NC_009051	TGA	2	6	238267	238272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126178210
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5086	NC_009051	CGT	2	6	238390	238395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178210
5087	NC_009051	GGT	2	6	238424	238429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126178210
5088	NC_009051	C	7	7	238433	238439	0 %	0 %	0 %	100 %	126178210
5089	NC_009051	CTG	2	6	238677	238682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178211
5090	NC_009051	TCG	2	6	238762	238767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178211
5091	NC_009051	GGGAT	2	10	238792	238801	20 %	20 %	60 %	0 %	126178211
5092	NC_009051	TCA	2	6	238846	238851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178211
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5101	NC_009051	C	6	6	239168	239173	0 %	0 %	0 %	100 %	126178212
5102	NC_009051	CGA	2	6	239179	239184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178212
5103	NC_009051	GGGA	2	8	239187	239194	25 %	0 %	75 %	0 %	126178212
5104	NC_009051	CGT	2	6	239245	239250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178212
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5107	NC_009051	CCGA	2	8	239334	239341	25 %	0 %	25 %	50 %	126178212
5108	NC_009051	CGG	2	6	239360	239365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178212
5109	NC_009051	GC	3	6	239470	239475	0 %	0 %	50 %	50 %	126178212
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5114	NC_009051	GGCG	2	8	239584	239591	0 %	0 %	75 %	25 %	126178212
5115	NC_009051	TCGTC	2	10	239620	239629	0 %	40 %	20 %	40 %	126178212
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5118	NC_009051	CCGCGA	2	12	239826	239837	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126178213
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5120	NC_009051	GAG	2	6	239855	239860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178213
5121	NC_009051	CGA	2	6	239910	239915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178213
5122	NC_009051	ACG	2	6	239966	239971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178213
5123	NC_009051	CGC	2	6	240024	240029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178213
5124	NC_009051	CCCG	2	8	240052	240059	0 %	0 %	25 %	75 %	126178213
5125	NC_009051	GAG	2	6	240121	240126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178213
5126	NC_009051	GAC	2	6	240181	240186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178213
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5131	NC_009051	CGG	2	6	240420	240425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178213
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5133	NC_009051	CGG	2	6	240435	240440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178213
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5140	NC_009051	CGA	2	6	240806	240811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178214
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5142	NC_009051	GCC	2	6	240872	240877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178214
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5144	NC_009051	CGA	2	6	241059	241064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178214
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5152	NC_009051	GAC	2	6	241293	241298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178214
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5172	NC_009051	CTTCG	2	10	243144	243153	0 %	40 %	20 %	40 %	126178216
5173	NC_009051	GTC	2	6	243187	243192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178216
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5177	NC_009051	CCT	2	6	243364	243369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178217
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5193	NC_009051	CCCGCA	2	12	244061	244072	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126178218
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5226	NC_009051	AAG	2	6	245898	245903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178219
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5231	NC_009051	CCG	2	6	246473	246478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178221
5232	NC_009051	TCG	2	6	246490	246495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178221
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5238	NC_009051	TCGG	2	8	246748	246755	0 %	25 %	50 %	25 %	126178221
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5240	NC_009051	CTC	2	6	246783	246788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178221
5241	NC_009051	GCG	2	6	246793	246798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178221
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5344	NC_009051	TGAT	2	8	251266	251273	25 %	50 %	25 %	0 %	126178224
5345	NC_009051	CCGC	2	8	251312	251319	0 %	0 %	25 %	75 %	126178224
5346	NC_009051	GGCCG	2	10	251349	251358	0 %	0 %	60 %	40 %	126178224
5347	NC_009051	GTC	2	6	251420	251425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178224
5348	NC_009051	AGCGCG	2	12	251451	251462	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	126178224
5349	NC_009051	CGGT	2	8	251472	251479	0 %	25 %	50 %	25 %	126178224
5350	NC_009051	CG	3	6	251545	251550	0 %	0 %	50 %	50 %	126178224
5351	NC_009051	CCCGGA	2	12	251554	251565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	126178224
5352	NC_009051	CGA	2	6	251623	251628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126178224
5353	NC_009051	A	6	6	251672	251677	100 %	0 %	0 %	0 %	126178224
5354	NC_009051	TTC	2	6	251726	251731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178225
5355	NC_009051	GAG	2	6	251761	251766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178225
5356	NC_009051	AG	3	6	251765	251770	50 %	0 %	50 %	0 %	126178225
5357	NC_009051	TGCA	2	8	251782	251789	25 %	25 %	25 %	25 %	126178225
5358	NC_009051	CCG	2	6	251816	251821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
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5360	NC_009051	GCT	2	6	251909	251914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178225
5361	NC_009051	CGG	2	6	251928	251933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178225
5362	NC_009051	GCC	3	9	252077	252085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
5363	NC_009051	CCG	2	6	252114	252119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
5364	NC_009051	GCC	2	6	252139	252144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
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5373	NC_009051	CCG	2	6	252356	252361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178225
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5377	NC_009051	CGG	2	6	252534	252539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178225
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5402	NC_009051	TGC	2	6	253372	253377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178226
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5451	NC_009051	CGG	2	6	255289	255294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178227
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5464	NC_009051	GAAGA	2	10	255872	255881	60 %	0 %	40 %	0 %	126178228
5465	NC_009051	GCT	2	6	255886	255891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178228
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5467	NC_009051	GTCCG	2	10	256013	256022	0 %	20 %	40 %	40 %	126178228
5468	NC_009051	GTC	2	6	256031	256036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178228
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5470	NC_009051	GGCG	2	8	256135	256142	0 %	0 %	75 %	25 %	126178228
5471	NC_009051	CGAG	2	8	256251	256258	25 %	0 %	50 %	25 %	126178228
5472	NC_009051	TCG	2	6	256335	256340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178228
5473	NC_009051	TCCC	3	12	256345	256356	0 %	25 %	0 %	75 %	126178228
5474	NC_009051	ATC	2	6	256412	256417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126178228
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5478	NC_009051	CATAG	2	10	256748	256757	40 %	20 %	20 %	20 %	126178228
5479	NC_009051	GC	3	6	256833	256838	0 %	0 %	50 %	50 %	126178228
5480	NC_009051	G	6	6	256868	256873	0 %	0 %	100 %	0 %	126178228
5481	NC_009051	GGGA	2	8	256916	256923	25 %	0 %	75 %	0 %	126178229
5482	NC_009051	TCT	2	6	256949	256954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178229
5483	NC_009051	AAG	2	6	256987	256992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126178229
5484	NC_009051	GAG	2	6	257011	257016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178229
5485	NC_009051	GGAA	2	8	257096	257103	50 %	0 %	50 %	0 %	126178229
5486	NC_009051	GTC	2	6	257129	257134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178229
5487	NC_009051	TCG	3	9	257213	257221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126178229
5488	NC_009051	GGA	2	6	257226	257231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126178229
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5490	NC_009051	CCT	2	6	257253	257258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126178229
5491	NC_009051	CGGCG	2	10	257262	257271	0 %	0 %	60 %	40 %	126178229
5492	NC_009051	GCG	2	6	257342	257347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178229
5493	NC_009051	TCT	2	6	257348	257353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126178229
5494	NC_009051	GGC	2	6	257373	257378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126178229
5495	NC_009051	CGGT	2	8	257458	257465	0 %	25 %	50 %	25 %	126178229
5496	NC_009051	GCC	2	6	257476	257481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126178229
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