MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 32279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008942	T	6	6	221080	221085	0 %	100 %	0 %	0 %	124485063
4002	NC_008942	ACC	2	6	221120	221125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485063
4003	NC_008942	TCCT	2	8	221158	221165	0 %	50 %	0 %	50 %	124485063
4004	NC_008942	CAG	2	6	221234	221239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485063
4005	NC_008942	CT	3	6	221251	221256	0 %	50 %	0 %	50 %	124485063
4006	NC_008942	TGT	2	6	221306	221311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485063
4007	NC_008942	T	6	6	221323	221328	0 %	100 %	0 %	0 %	124485063
4008	NC_008942	T	7	7	221367	221373	0 %	100 %	0 %	0 %	124485063
4009	NC_008942	TGG	2	6	221413	221418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485063
4010	NC_008942	GAT	2	6	221447	221452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485063
4011	NC_008942	AAGG	2	8	221462	221469	50 %	0 %	50 %	0 %	124485063
4012	NC_008942	CGC	2	6	221494	221499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485063
4013	NC_008942	CTC	2	6	221524	221529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485063
4014	NC_008942	CTT	2	6	221530	221535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485063
4015	NC_008942	ATC	2	6	221546	221551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485063
4016	NC_008942	TCT	2	6	221566	221571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485063
4017	NC_008942	AAT	2	6	221585	221590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485063
4018	NC_008942	TCT	2	6	221628	221633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485063
4019	NC_008942	TTCTG	2	10	221645	221654	0 %	60 %	20 %	20 %	124485063
4020	NC_008942	CTCCTG	2	12	221695	221706	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	124485063
4021	NC_008942	AGG	2	6	221719	221724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485063
4022	NC_008942	ACA	2	6	221745	221750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485063
4023	NC_008942	ATC	2	6	221826	221831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485063
4024	NC_008942	T	7	7	221952	221958	0 %	100 %	0 %	0 %	124485063
4025	NC_008942	ATCTG	2	10	222012	222021	20 %	40 %	20 %	20 %	124485063
4026	NC_008942	TG	3	6	222551	222556	0 %	50 %	50 %	0 %	124485064
4027	NC_008942	TCG	2	6	222624	222629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485064
4028	NC_008942	GT	5	10	222684	222693	0 %	50 %	50 %	0 %	124485064
4029	NC_008942	AGGA	2	8	222735	222742	50 %	0 %	50 %	0 %	124485064
4030	NC_008942	GCA	2	6	222749	222754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485064
4031	NC_008942	CCA	2	6	222772	222777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485064
4032	NC_008942	A	7	7	222780	222786	100 %	0 %	0 %	0 %	124485064
4033	NC_008942	CTC	2	6	222876	222881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485065
4034	NC_008942	ATGT	2	8	222913	222920	25 %	50 %	25 %	0 %	124485065
4035	NC_008942	CCG	2	6	222989	222994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485065
4036	NC_008942	GT	5	10	223054	223063	0 %	50 %	50 %	0 %	124485065
4037	NC_008942	CTG	2	6	223159	223164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485065
4038	NC_008942	CGA	2	6	223169	223174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485065
4039	NC_008942	ATC	2	6	223227	223232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485065
4040	NC_008942	TGC	2	6	223262	223267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485065
4041	NC_008942	AAG	2	6	223275	223280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485065
4042	NC_008942	GTT	2	6	223506	223511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485065
4043	NC_008942	CAA	2	6	223517	223522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485065
4044	NC_008942	CTG	2	6	223556	223561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485065
4045	NC_008942	AAG	2	6	223611	223616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485065
4046	NC_008942	TTC	2	6	223617	223622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485065
4047	NC_008942	GGCT	2	8	223658	223665	0 %	25 %	50 %	25 %	124485065
4048	NC_008942	CTG	2	6	223723	223728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485065
4049	NC_008942	GAA	2	6	223736	223741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485065
4050	NC_008942	GAAG	2	8	223745	223752	50 %	0 %	50 %	0 %	124485065
4051	NC_008942	ATGC	2	8	223804	223811	25 %	25 %	25 %	25 %	124485065
4052	NC_008942	AGA	2	6	223817	223822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485065
4053	NC_008942	AAG	2	6	223881	223886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485065
4054	NC_008942	TGC	2	6	224000	224005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485066
4055	NC_008942	GCA	2	6	224010	224015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485066
4056	NC_008942	CT	3	6	224019	224024	0 %	50 %	0 %	50 %	124485066
4057	NC_008942	TAC	2	6	224031	224036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485066
4058	NC_008942	CGT	2	6	224059	224064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485066
4059	NC_008942	GGA	2	6	224088	224093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485066
4060	NC_008942	AAG	2	6	224153	224158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485066
4061	NC_008942	GA	3	6	224204	224209	50 %	0 %	50 %	0 %	124485066
4062	NC_008942	CCGA	2	8	224289	224296	25 %	0 %	25 %	50 %	124485066
4063	NC_008942	GCA	2	6	224322	224327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485066
4064	NC_008942	ACA	2	6	224377	224382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485066
4065	NC_008942	AGCCG	2	10	224444	224453	20 %	0 %	40 %	40 %	124485066
4066	NC_008942	ACC	2	6	224457	224462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485066
4067	NC_008942	AT	3	6	224477	224482	50 %	50 %	0 %	0 %	124485066
4068	NC_008942	AGC	2	6	224521	224526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485066
4069	NC_008942	TTC	2	6	224588	224593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485067
4070	NC_008942	TAC	2	6	224920	224925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485067
4071	NC_008942	ACC	2	6	224934	224939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485067
4072	NC_008942	TAC	2	6	224951	224956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485067
4073	NC_008942	ATG	3	9	224958	224966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485067
4074	NC_008942	AC	3	6	225000	225005	50 %	0 %	0 %	50 %	124485067
4075	NC_008942	TGCC	2	8	225025	225032	0 %	25 %	25 %	50 %	124485067
4076	NC_008942	GGA	2	6	225080	225085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485067
4077	NC_008942	GAA	2	6	225119	225124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485067
4078	NC_008942	GGA	2	6	225191	225196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485067
4079	NC_008942	GATAT	2	10	225204	225213	40 %	40 %	20 %	0 %	124485067
4080	NC_008942	GCT	2	6	225257	225262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485067
4081	NC_008942	TTC	2	6	225369	225374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485067
4082	NC_008942	GGA	2	6	225476	225481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485067
4083	NC_008942	A	6	6	225504	225509	100 %	0 %	0 %	0 %	124485068
4084	NC_008942	GAA	2	6	225531	225536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485068
4085	NC_008942	CGT	2	6	225632	225637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485068
4086	NC_008942	AAG	2	6	225691	225696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485068
4087	NC_008942	ACC	2	6	225709	225714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485068
4088	NC_008942	GTT	2	6	225726	225731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485068
4089	NC_008942	GCA	2	6	225732	225737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485068
4090	NC_008942	GGT	2	6	225786	225791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485068
4091	NC_008942	CGGAA	2	10	225866	225875	40 %	0 %	40 %	20 %	124485068
4092	NC_008942	CAA	2	6	225913	225918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485068
4093	NC_008942	CGG	2	6	225986	225991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485068
4094	NC_008942	GGT	2	6	226062	226067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485068
4095	NC_008942	CCG	2	6	226229	226234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485068
4096	NC_008942	GTG	2	6	226243	226248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485068
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4099	NC_008942	TG	3	6	226322	226327	0 %	50 %	50 %	0 %	124485068
4100	NC_008942	GCAC	2	8	226391	226398	25 %	0 %	25 %	50 %	124485068
4101	NC_008942	GTT	2	6	226401	226406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485068
4102	NC_008942	TG	3	6	226437	226442	0 %	50 %	50 %	0 %	124485068
4103	NC_008942	CTGC	2	8	226462	226469	0 %	25 %	25 %	50 %	124485068
4104	NC_008942	TCA	2	6	226534	226539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485068
4105	NC_008942	AGA	2	6	226573	226578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485068
4106	NC_008942	GA	3	6	226577	226582	50 %	0 %	50 %	0 %	124485068
4107	NC_008942	TCA	2	6	226609	226614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485068
4108	NC_008942	CT	3	6	226616	226621	0 %	50 %	0 %	50 %	124485068
4109	NC_008942	CAA	2	6	226654	226659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485068
4110	NC_008942	GTCC	2	8	226671	226678	0 %	25 %	25 %	50 %	124485068
4111	NC_008942	TGTC	2	8	226699	226706	0 %	50 %	25 %	25 %	124485068
4112	NC_008942	ACA	2	6	226735	226740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485068
4113	NC_008942	CTG	2	6	226772	226777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485068
4114	NC_008942	TCT	2	6	226840	226845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485068
4115	NC_008942	GAG	2	6	226878	226883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485068
4116	NC_008942	CTA	2	6	226886	226891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485068
4117	NC_008942	CAA	2	6	226955	226960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485068
4118	NC_008942	CCT	2	6	226964	226969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485068
4119	NC_008942	TTG	2	6	227023	227028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485068
4120	NC_008942	GCT	2	6	227037	227042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485068
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4122	NC_008942	GT	3	6	227161	227166	0 %	50 %	50 %	0 %	124485068
4123	NC_008942	GCA	2	6	227238	227243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485068
4124	NC_008942	CAGGT	2	10	227260	227269	20 %	20 %	40 %	20 %	124485068
4125	NC_008942	CTCTG	2	10	227348	227357	0 %	40 %	20 %	40 %	124485068
4126	NC_008942	GCA	2	6	227400	227405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485068
4127	NC_008942	TGG	2	6	227429	227434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485068
4128	NC_008942	GCA	2	6	227462	227467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485068
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4134	NC_008942	GCA	2	6	227771	227776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485069
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4139	NC_008942	ATC	2	6	228148	228153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485070
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4141	NC_008942	GTA	2	6	228227	228232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485070
4142	NC_008942	GGAT	2	8	228280	228287	25 %	25 %	50 %	0 %	124485070
4143	NC_008942	CGA	2	6	228505	228510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485071
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4153	NC_008942	CGAC	2	8	229032	229039	25 %	0 %	25 %	50 %	124485071
4154	NC_008942	TGT	2	6	229141	229146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485071
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4162	NC_008942	TTG	2	6	229617	229622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485071
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4166	NC_008942	A	6	6	229840	229845	100 %	0 %	0 %	0 %	124485072
4167	NC_008942	TGG	2	6	229932	229937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485072
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4231	NC_008942	TATT	2	8	233663	233670	25 %	75 %	0 %	0 %	124485075
4232	NC_008942	ATG	2	6	233683	233688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485075
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4239	NC_008942	ACT	2	6	234014	234019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485076
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4241	NC_008942	TCCTT	2	10	234188	234197	0 %	60 %	0 %	40 %	124485076
4242	NC_008942	GTG	2	6	234214	234219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485076
4243	NC_008942	AGG	2	6	234260	234265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485076
4244	NC_008942	CGT	2	6	234286	234291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485076
4245	NC_008942	ATA	2	6	234314	234319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485076
4246	NC_008942	ATA	2	6	234323	234328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485076
4247	NC_008942	T	6	6	234418	234423	0 %	100 %	0 %	0 %	124485077
4248	NC_008942	GCA	2	6	234436	234441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485077
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4250	NC_008942	GA	3	6	234571	234576	50 %	0 %	50 %	0 %	124485077
4251	NC_008942	CGT	2	6	234617	234622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485077
4252	NC_008942	TCCCTC	2	12	234648	234659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485077
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4354	NC_008942	TC	3	6	239984	239989	0 %	50 %	0 %	50 %	124485082
4355	NC_008942	TTCA	2	8	240022	240029	25 %	50 %	0 %	25 %	124485082
4356	NC_008942	GA	3	6	240055	240060	50 %	0 %	50 %	0 %	124485082
4357	NC_008942	TTA	2	6	240064	240069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124485082
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4360	NC_008942	TC	3	6	240206	240211	0 %	50 %	0 %	50 %	124485082
4361	NC_008942	GAA	2	6	240235	240240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485082
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4363	NC_008942	AACG	2	8	240278	240285	50 %	0 %	25 %	25 %	124485082
4364	NC_008942	CGCTT	2	10	240296	240305	0 %	40 %	20 %	40 %	124485082
4365	NC_008942	ATC	2	6	240394	240399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485082
4366	NC_008942	CTT	2	6	240432	240437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485082
4367	NC_008942	GA	3	6	240515	240520	50 %	0 %	50 %	0 %	124485082
4368	NC_008942	ATTA	2	8	240533	240540	50 %	50 %	0 %	0 %	124485082
4369	NC_008942	CTTA	2	8	240597	240604	25 %	50 %	0 %	25 %	124485083
4370	NC_008942	AT	3	6	240610	240615	50 %	50 %	0 %	0 %	124485083
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4386	NC_008942	TTTG	2	8	241555	241562	0 %	75 %	25 %	0 %	124485084
4387	NC_008942	TGAA	2	8	241569	241576	50 %	25 %	25 %	0 %	124485084
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4398	NC_008942	GCTTT	2	10	242141	242150	0 %	60 %	20 %	20 %	124485085
4399	NC_008942	TG	3	6	242227	242232	0 %	50 %	50 %	0 %	124485085
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4483	NC_008942	GA	3	6	247293	247298	50 %	0 %	50 %	0 %	124485091
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4485	NC_008942	GCA	2	6	247469	247474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485091
4486	NC_008942	TTC	2	6	247589	247594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485092
4487	NC_008942	CGG	2	6	247688	247693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485092
4488	NC_008942	TTTG	2	8	247721	247728	0 %	75 %	25 %	0 %	124485092
4489	NC_008942	CTT	2	6	247741	247746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485092
4490	NC_008942	ATC	2	6	247764	247769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485092
4491	NC_008942	TGC	2	6	247780	247785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485092
4492	NC_008942	GCA	2	6	247797	247802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485092
4493	NC_008942	GAT	2	6	247835	247840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485092
4494	NC_008942	CGC	2	6	247876	247881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485092
4495	NC_008942	AGG	2	6	247882	247887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485092
4496	NC_008942	AGTGA	2	10	247946	247955	40 %	20 %	40 %	0 %	124485092
4497	NC_008942	G	6	6	248000	248005	0 %	0 %	100 %	0 %	124485093
4498	NC_008942	CGT	2	6	248070	248075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485093
4499	NC_008942	AGA	2	6	248218	248223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485093
4500	NC_008942	GTT	2	6	248262	248267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485093

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