MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 32279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008942	TCA	2	6	193304	193309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485031
3502	NC_008942	AAAGC	2	10	193310	193319	60 %	0 %	20 %	20 %	124485031
3503	NC_008942	AAGG	2	8	193321	193328	50 %	0 %	50 %	0 %	124485031
3504	NC_008942	CAT	2	6	193464	193469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485031
3505	NC_008942	GAA	2	6	193482	193487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485031
3506	NC_008942	ACCCC	2	10	193532	193541	20 %	0 %	0 %	80 %	124485031
3507	NC_008942	ACC	2	6	193561	193566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485031
3508	NC_008942	TCA	2	6	193712	193717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485031
3509	NC_008942	GGTC	2	8	193773	193780	0 %	25 %	50 %	25 %	124485031
3510	NC_008942	ATG	2	6	193799	193804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485031
3511	NC_008942	ATGCTC	2	12	193807	193818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	124485031
3512	NC_008942	CAA	2	6	193878	193883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485031
3513	NC_008942	AGA	2	6	193893	193898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485031
3514	NC_008942	GAAA	2	8	193914	193921	75 %	0 %	25 %	0 %	124485031
3515	NC_008942	GAAG	2	8	193942	193949	50 %	0 %	50 %	0 %	124485031
3516	NC_008942	TGC	2	6	193983	193988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485031
3517	NC_008942	GAC	2	6	193992	193997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485031
3518	NC_008942	CTT	2	6	194023	194028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485031
3519	NC_008942	TCA	2	6	194144	194149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485031
3520	NC_008942	CGA	2	6	194190	194195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485031
3521	NC_008942	GGC	2	6	194316	194321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485031
3522	NC_008942	GA	3	6	194418	194423	50 %	0 %	50 %	0 %	124485031
3523	NC_008942	GTACC	2	10	194445	194454	20 %	20 %	20 %	40 %	124485031
3524	NC_008942	GGA	2	6	194463	194468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485031
3525	NC_008942	GAA	2	6	194582	194587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485031
3526	NC_008942	CCTT	2	8	194588	194595	0 %	50 %	0 %	50 %	124485031
3527	NC_008942	TGC	2	6	194608	194613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485031
3528	NC_008942	AGC	2	6	194695	194700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485031
3529	NC_008942	GA	3	6	194921	194926	50 %	0 %	50 %	0 %	124485031
3530	NC_008942	T	6	6	195166	195171	0 %	100 %	0 %	0 %	124485032
3531	NC_008942	TGA	2	6	195186	195191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485032
3532	NC_008942	TCA	2	6	195371	195376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485032
3533	NC_008942	GCC	3	9	195394	195402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485032
3534	NC_008942	ATC	2	6	195428	195433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485032
3535	NC_008942	CGTC	2	8	195465	195472	0 %	25 %	25 %	50 %	124485032
3536	NC_008942	CTC	2	6	195535	195540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485032
3537	NC_008942	GGC	2	6	195577	195582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485032
3538	NC_008942	CCT	2	6	195588	195593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485032
3539	NC_008942	TCC	2	6	195602	195607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485032
3540	NC_008942	CAT	2	6	195666	195671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485032
3541	NC_008942	TC	3	6	195711	195716	0 %	50 %	0 %	50 %	124485032
3542	NC_008942	TCA	2	6	195786	195791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485032
3543	NC_008942	TC	4	8	195792	195799	0 %	50 %	0 %	50 %	124485032
3544	NC_008942	CCT	2	6	195822	195827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485032
3545	NC_008942	AT	3	6	195854	195859	50 %	50 %	0 %	0 %	124485032
3546	NC_008942	CGC	2	6	195901	195906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485032
3547	NC_008942	CCT	2	6	196065	196070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485032
3548	NC_008942	ATC	2	6	196084	196089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485032
3549	NC_008942	CAT	2	6	196249	196254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485033
3550	NC_008942	GCC	2	6	196267	196272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485033
3551	NC_008942	CAT	2	6	196347	196352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485033
3552	NC_008942	CTG	3	9	196380	196388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3553	NC_008942	TCT	2	6	196482	196487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485033
3554	NC_008942	TGC	2	6	196501	196506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3555	NC_008942	TGC	2	6	196627	196632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3556	NC_008942	CTC	3	9	196671	196679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485033
3557	NC_008942	CGA	2	6	196683	196688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3558	NC_008942	CTT	2	6	196690	196695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485033
3559	NC_008942	TCG	2	6	196751	196756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3560	NC_008942	TGA	3	9	196779	196787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485033
3561	NC_008942	ATC	2	6	196826	196831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485033
3562	NC_008942	CGC	2	6	196836	196841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485033
3563	NC_008942	TTC	2	6	196852	196857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485033
3564	NC_008942	CAG	2	6	196884	196889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3565	NC_008942	GGA	2	6	196903	196908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485033
3566	NC_008942	CCG	2	6	196919	196924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485033
3567	NC_008942	CGG	2	6	196964	196969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485033
3568	NC_008942	TGCC	2	8	196980	196987	0 %	25 %	25 %	50 %	124485033
3569	NC_008942	GTC	2	6	197011	197016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3570	NC_008942	AGA	2	6	197031	197036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485033
3571	NC_008942	TCT	2	6	197061	197066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485033
3572	NC_008942	CGA	2	6	197067	197072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3573	NC_008942	TCT	2	6	197157	197162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485033
3574	NC_008942	CTG	2	6	197172	197177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3575	NC_008942	GAT	2	6	197245	197250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485033
3576	NC_008942	GAT	2	6	197260	197265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485033
3577	NC_008942	GCC	2	6	197284	197289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485033
3578	NC_008942	ACGA	2	8	197359	197366	50 %	0 %	25 %	25 %	124485033
3579	NC_008942	CTGT	2	8	197509	197516	0 %	50 %	25 %	25 %	124485033
3580	NC_008942	TGA	2	6	197526	197531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485033
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3582	NC_008942	CTT	2	6	197569	197574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485033
3583	NC_008942	GAC	2	6	197593	197598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485033
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3585	NC_008942	CAT	2	6	197653	197658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485033
3586	NC_008942	TGC	2	6	197662	197667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3587	NC_008942	TGC	3	9	197803	197811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485033
3588	NC_008942	TCC	2	6	197851	197856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485033
3589	NC_008942	CTT	2	6	198116	198121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485034
3590	NC_008942	TGC	2	6	198138	198143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485034
3591	NC_008942	ATCC	2	8	198157	198164	25 %	25 %	0 %	50 %	124485034
3592	NC_008942	GCC	2	6	198193	198198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485034
3593	NC_008942	CAT	2	6	198236	198241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485034
3594	NC_008942	TGA	2	6	198254	198259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485034
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3596	NC_008942	GCA	2	6	198388	198393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485034
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3598	NC_008942	GAT	2	6	198720	198725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485034
3599	NC_008942	T	6	6	198746	198751	0 %	100 %	0 %	0 %	124485034
3600	NC_008942	GA	3	6	198786	198791	50 %	0 %	50 %	0 %	124485034
3601	NC_008942	ATG	2	6	198792	198797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485034
3602	NC_008942	AAT	2	6	198858	198863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485034
3603	NC_008942	CAT	2	6	198891	198896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485034
3604	NC_008942	TTCTG	2	10	198938	198947	0 %	60 %	20 %	20 %	124485034
3605	NC_008942	CAGGG	2	10	198999	199008	20 %	0 %	60 %	20 %	124485034
3606	NC_008942	GTT	2	6	199155	199160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485034
3607	NC_008942	CTG	2	6	199294	199299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485035
3608	NC_008942	GAT	2	6	199370	199375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485035
3609	NC_008942	ATA	2	6	199389	199394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485035
3610	NC_008942	CCG	2	6	199440	199445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485035
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3612	NC_008942	TGG	2	6	199617	199622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485035
3613	NC_008942	CTT	2	6	199648	199653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485035
3614	NC_008942	AAC	2	6	199686	199691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485035
3615	NC_008942	CTT	2	6	199748	199753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485035
3616	NC_008942	CT	3	6	199798	199803	0 %	50 %	0 %	50 %	124485035
3617	NC_008942	GAAACG	2	12	199806	199817	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	124485035
3618	NC_008942	CGA	2	6	199858	199863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485035
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3620	NC_008942	CCG	2	6	199905	199910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485035
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3843	NC_008942	A	7	7	211858	211864	100 %	0 %	0 %	0 %	124485052
3844	NC_008942	CTGAA	2	10	211870	211879	40 %	20 %	20 %	20 %	124485052
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3854	NC_008942	T	7	7	212529	212535	0 %	100 %	0 %	0 %	124485053
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3864	NC_008942	CT	3	6	213126	213131	0 %	50 %	0 %	50 %	124485054
3865	NC_008942	TCTG	2	8	213197	213204	0 %	50 %	25 %	25 %	124485054
3866	NC_008942	CGG	2	6	213237	213242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485054
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3868	NC_008942	CGG	2	6	213405	213410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485054
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3902	NC_008942	A	6	6	215772	215777	100 %	0 %	0 %	0 %	124485057
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3978	NC_008942	GAT	2	6	219950	219955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485061
3979	NC_008942	CTG	2	6	220026	220031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485061
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3981	NC_008942	TTC	2	6	220151	220156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485062
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3983	NC_008942	GAT	2	6	220228	220233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485062
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3986	NC_008942	GAG	2	6	220447	220452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485062
3987	NC_008942	GAG	2	6	220459	220464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485062
3988	NC_008942	CGA	2	6	220469	220474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485062
3989	NC_008942	GTG	2	6	220483	220488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485062
3990	NC_008942	CT	3	6	220527	220532	0 %	50 %	0 %	50 %	124485062
3991	NC_008942	GCA	2	6	220692	220697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485062
3992	NC_008942	ATG	2	6	220709	220714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485062
3993	NC_008942	AGG	2	6	220773	220778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485062
3994	NC_008942	GCAT	2	8	220815	220822	25 %	25 %	25 %	25 %	124485062
3995	NC_008942	TGC	2	6	220884	220889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485062
3996	NC_008942	ATG	2	6	220906	220911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485062
3997	NC_008942	TCG	2	6	220946	220951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485062
3998	NC_008942	TTGC	2	8	221038	221045	0 %	50 %	25 %	25 %	124485062
3999	NC_008942	A	6	6	221056	221061	100 %	0 %	0 %	0 %	124485062
4000	NC_008942	AG	3	6	221064	221069	50 %	0 %	50 %	0 %	124485062

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