MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 32279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008942	CT	3	6	164866	164871	0 %	50 %	0 %	50 %	124485005
3002	NC_008942	GCT	2	6	164897	164902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485005
3003	NC_008942	AAT	2	6	164966	164971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485005
3004	NC_008942	ATC	2	6	165093	165098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485006
3005	NC_008942	GCC	2	6	165114	165119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485006
3006	NC_008942	ATG	2	6	165133	165138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485006
3007	NC_008942	CTG	2	6	165189	165194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485006
3008	NC_008942	GAT	3	9	165203	165211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485006
3009	NC_008942	TCTTG	2	10	165290	165299	0 %	60 %	20 %	20 %	124485006
3010	NC_008942	CGG	2	6	165341	165346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485006
3011	NC_008942	TCT	2	6	165404	165409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485006
3012	NC_008942	TCG	2	6	165421	165426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485006
3013	NC_008942	TCG	2	6	165433	165438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485006
3014	NC_008942	TCT	2	6	165518	165523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485006
3015	NC_008942	CGATT	2	10	165535	165544	20 %	40 %	20 %	20 %	124485006
3016	NC_008942	GGAAA	2	10	165547	165556	60 %	0 %	40 %	0 %	124485006
3017	NC_008942	CGT	2	6	165563	165568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485006
3018	NC_008942	TG	4	8	165700	165707	0 %	50 %	50 %	0 %	124485006
3019	NC_008942	CTC	2	6	165712	165717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485006
3020	NC_008942	CTG	2	6	165999	166004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485007
3021	NC_008942	TAG	2	6	166014	166019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485007
3022	NC_008942	AT	3	6	166098	166103	50 %	50 %	0 %	0 %	124485007
3023	NC_008942	TTATT	2	10	166156	166165	20 %	80 %	0 %	0 %	124485007
3024	NC_008942	TCA	2	6	166255	166260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485007
3025	NC_008942	GA	3	6	166268	166273	50 %	0 %	50 %	0 %	124485007
3026	NC_008942	TCCCG	2	10	166433	166442	0 %	20 %	20 %	60 %	124485007
3027	NC_008942	GGT	2	6	166523	166528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124485007
3028	NC_008942	CT	3	6	166602	166607	0 %	50 %	0 %	50 %	124485007
3029	NC_008942	GAG	2	6	166619	166624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485007
3030	NC_008942	GAG	2	6	166649	166654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485007
3031	NC_008942	GTC	2	6	166676	166681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485007
3032	NC_008942	TCG	2	6	166785	166790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485007
3033	NC_008942	GA	3	6	166890	166895	50 %	0 %	50 %	0 %	124485007
3034	NC_008942	ACGGAG	2	12	166965	166976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	124485007
3035	NC_008942	GTC	2	6	167039	167044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485007
3036	NC_008942	ATG	2	6	167106	167111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485007
3037	NC_008942	GAT	3	9	167132	167140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485007
3038	NC_008942	T	7	7	167140	167146	0 %	100 %	0 %	0 %	124485007
3039	NC_008942	GTTTT	2	10	167166	167175	0 %	80 %	20 %	0 %	124485007
3040	NC_008942	TAT	2	6	167180	167185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124485007
3041	NC_008942	CT	3	6	167189	167194	0 %	50 %	0 %	50 %	124485007
3042	NC_008942	ATG	2	6	167339	167344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485008
3043	NC_008942	C	6	6	167349	167354	0 %	0 %	0 %	100 %	124485008
3044	NC_008942	CAG	2	6	167378	167383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485008
3045	NC_008942	TCCTC	2	10	167385	167394	0 %	40 %	0 %	60 %	124485008
3046	NC_008942	AAACA	2	10	167418	167427	80 %	0 %	0 %	20 %	124485008
3047	NC_008942	GCA	2	6	167434	167439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485008
3048	NC_008942	ATT	2	6	167559	167564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124485008
3049	NC_008942	GAT	2	6	167648	167653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485008
3050	NC_008942	TCC	2	6	167685	167690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485008
3051	NC_008942	GACCCC	2	12	167707	167718	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	124485008
3052	NC_008942	GAG	2	6	167828	167833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485008
3053	NC_008942	GCTT	2	8	168113	168120	0 %	50 %	25 %	25 %	124485009
3054	NC_008942	GAT	2	6	168277	168282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485009
3055	NC_008942	ACA	2	6	168292	168297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485009
3056	NC_008942	AGA	2	6	168408	168413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485009
3057	NC_008942	GCG	2	6	168448	168453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485009
3058	NC_008942	AC	3	6	168503	168508	50 %	0 %	0 %	50 %	124485009
3059	NC_008942	CGA	2	6	168512	168517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485009
3060	NC_008942	CAC	2	6	168542	168547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124485009
3061	NC_008942	ACCCA	2	10	168716	168725	40 %	0 %	0 %	60 %	124485009
3062	NC_008942	TGC	2	6	168734	168739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485009
3063	NC_008942	CGATC	2	10	168779	168788	20 %	20 %	20 %	40 %	124485009
3064	NC_008942	TTC	2	6	168858	168863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485009
3065	NC_008942	CCGA	2	8	168903	168910	25 %	0 %	25 %	50 %	124485009
3066	NC_008942	ATC	2	6	168927	168932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485009
3067	NC_008942	CAG	2	6	168950	168955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485009
3068	NC_008942	CGAA	2	8	168964	168971	50 %	0 %	25 %	25 %	124485009
3069	NC_008942	GCC	2	6	169068	169073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485009
3070	NC_008942	GAA	2	6	169112	169117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485009
3071	NC_008942	ATG	2	6	169161	169166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485009
3072	NC_008942	GAACG	2	10	169232	169241	40 %	0 %	40 %	20 %	124485009
3073	NC_008942	CGT	2	6	169307	169312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485009
3074	NC_008942	GAT	2	6	169346	169351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485009
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3076	NC_008942	GCA	2	6	169389	169394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485009
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3078	NC_008942	TCG	2	6	169477	169482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485009
3079	NC_008942	GCC	2	6	169538	169543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485009
3080	NC_008942	TGA	2	6	169555	169560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485009
3081	NC_008942	GGA	2	6	169603	169608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485009
3082	NC_008942	CGT	2	6	169619	169624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485009
3083	NC_008942	TATG	2	8	169766	169773	25 %	50 %	25 %	0 %	124485010
3084	NC_008942	AGG	2	6	169777	169782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485010
3085	NC_008942	CGG	2	6	169912	169917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485010
3086	NC_008942	TCT	2	6	169925	169930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485010
3087	NC_008942	TGA	2	6	169957	169962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485010
3088	NC_008942	GAAG	2	8	169971	169978	50 %	0 %	50 %	0 %	124485010
3089	NC_008942	CTT	2	6	170000	170005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485010
3090	NC_008942	TGA	3	9	170008	170016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485010
3091	NC_008942	A	6	6	170058	170063	100 %	0 %	0 %	0 %	124485010
3092	NC_008942	ATCT	2	8	170070	170077	25 %	50 %	0 %	25 %	124485010
3093	NC_008942	TCA	2	6	170164	170169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485010
3094	NC_008942	GATC	2	8	170210	170217	25 %	25 %	25 %	25 %	124485010
3095	NC_008942	TGA	2	6	170233	170238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485010
3096	NC_008942	TTC	2	6	170241	170246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485010
3097	NC_008942	GAT	2	6	170261	170266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485010
3098	NC_008942	TTCT	2	8	170268	170275	0 %	75 %	0 %	25 %	124485010
3099	NC_008942	TTG	2	6	170278	170283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485010
3100	NC_008942	TGATCT	2	12	170296	170307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	124485010
3101	NC_008942	GCA	2	6	170325	170330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485010
3102	NC_008942	TCTG	2	8	170428	170435	0 %	50 %	25 %	25 %	124485010
3103	NC_008942	TGA	2	6	170605	170610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485010
3104	NC_008942	CAT	2	6	170625	170630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485010
3105	NC_008942	TCT	2	6	170651	170656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485010
3106	NC_008942	TCA	2	6	170719	170724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485010
3107	NC_008942	TTC	2	6	170748	170753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485010
3108	NC_008942	A	7	7	170866	170872	100 %	0 %	0 %	0 %	124485010
3109	NC_008942	CCTGAA	2	12	170918	170929	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124485011
3110	NC_008942	GAC	2	6	170980	170985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485011
3111	NC_008942	ATC	2	6	170996	171001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485011
3112	NC_008942	CGG	2	6	171040	171045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485011
3113	NC_008942	GATG	2	8	171055	171062	25 %	25 %	50 %	0 %	124485011
3114	NC_008942	AGA	2	6	171093	171098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485011
3115	NC_008942	AG	3	6	171168	171173	50 %	0 %	50 %	0 %	124485011
3116	NC_008942	GAG	2	6	171247	171252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485011
3117	NC_008942	CTC	2	6	171312	171317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485011
3118	NC_008942	GAT	2	6	171355	171360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485011
3119	NC_008942	AGA	2	6	171410	171415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485011
3120	NC_008942	GAA	2	6	171433	171438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485011
3121	NC_008942	CGA	2	6	171565	171570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485012
3122	NC_008942	TC	3	6	171571	171576	0 %	50 %	0 %	50 %	124485012
3123	NC_008942	GAT	2	6	171626	171631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485012
3124	NC_008942	GA	3	6	171756	171761	50 %	0 %	50 %	0 %	124485012
3125	NC_008942	CCT	2	6	171825	171830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485012
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3142	NC_008942	CAT	2	6	172792	172797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485013
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3237	NC_008942	CATT	2	8	178800	178807	25 %	50 %	0 %	25 %	124485016
3238	NC_008942	CGC	2	6	178826	178831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485016
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3240	NC_008942	CGG	2	6	178872	178877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485016
3241	NC_008942	AGA	2	6	179093	179098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485017
3242	NC_008942	AAT	2	6	179099	179104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485017
3243	NC_008942	TAA	3	9	179457	179465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124485018
3244	NC_008942	GGTC	2	8	179587	179594	0 %	25 %	50 %	25 %	124485018
3245	NC_008942	T	6	6	179627	179632	0 %	100 %	0 %	0 %	124485018
3246	NC_008942	TGA	2	6	179634	179639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485018
3247	NC_008942	TCA	2	6	179664	179669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485018
3248	NC_008942	A	6	6	179744	179749	100 %	0 %	0 %	0 %	124485018
3249	NC_008942	CCG	2	6	179752	179757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485018
3250	NC_008942	ATC	2	6	179856	179861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485018
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3252	NC_008942	A	6	6	179902	179907	100 %	0 %	0 %	0 %	124485018
3253	NC_008942	GAT	2	6	179908	179913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485018
3254	NC_008942	AGG	2	6	179943	179948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485018
3255	NC_008942	TCG	2	6	180028	180033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485019
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3259	NC_008942	GAT	3	9	180215	180223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485019
3260	NC_008942	CTT	2	6	180279	180284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124485019
3261	NC_008942	GAG	2	6	180295	180300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485019
3262	NC_008942	CCT	2	6	180427	180432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124485019
3263	NC_008942	GACGA	2	10	180531	180540	40 %	0 %	40 %	20 %	124485019
3264	NC_008942	AC	3	6	180652	180657	50 %	0 %	0 %	50 %	124485019
3265	NC_008942	ATT	2	6	180712	180717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124485019
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3267	NC_008942	AAAG	2	8	180752	180759	75 %	0 %	25 %	0 %	124485019
3268	NC_008942	TGA	2	6	180769	180774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485019
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3270	NC_008942	GTCG	2	8	180944	180951	0 %	25 %	50 %	25 %	124485020
3271	NC_008942	GCT	2	6	180978	180983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485020
3272	NC_008942	GCATC	2	10	181072	181081	20 %	20 %	20 %	40 %	124485020
3273	NC_008942	ATC	2	6	181092	181097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485020
3274	NC_008942	TGC	2	6	181115	181120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485020
3275	NC_008942	TCA	2	6	181261	181266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485020
3276	NC_008942	CAG	2	6	181288	181293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485020
3277	NC_008942	TGA	2	6	181315	181320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485020
3278	NC_008942	TCG	2	6	181321	181326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485020
3279	NC_008942	TGGACA	2	12	181336	181347	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	124485020
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3301	NC_008942	ATC	2	6	182073	182078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485020
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3313	NC_008942	TCG	3	9	182614	182622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485021
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3327	NC_008942	ATCG	2	8	183435	183442	25 %	25 %	25 %	25 %	124485022
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3334	NC_008942	TGA	2	6	183786	183791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485022
3335	NC_008942	TGA	2	6	183812	183817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485022
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3337	NC_008942	CGTGAC	2	12	183861	183872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124485022
3338	NC_008942	CTG	2	6	183995	184000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485022
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3341	NC_008942	A	7	7	184305	184311	100 %	0 %	0 %	0 %	124485023
3342	NC_008942	CGG	2	6	184339	184344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485023
3343	NC_008942	CCG	2	6	184372	184377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485023
3344	NC_008942	GCC	2	6	184442	184447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124485023
3345	NC_008942	CTG	2	6	184459	184464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485023
3346	NC_008942	CGG	2	6	184489	184494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485023
3347	NC_008942	GGA	2	6	184505	184510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485023
3348	NC_008942	GT	3	6	184523	184528	0 %	50 %	50 %	0 %	124485023
3349	NC_008942	ATCGA	2	10	184568	184577	40 %	20 %	20 %	20 %	124485023
3350	NC_008942	CTG	2	6	184683	184688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124485023
3351	NC_008942	CAA	2	6	184753	184758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124485023
3352	NC_008942	ATGG	2	8	184774	184781	25 %	25 %	50 %	0 %	124485023
3353	NC_008942	GAG	2	6	184790	184795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124485023
3354	NC_008942	CTGT	2	8	184806	184813	0 %	50 %	25 %	25 %	124485023
3355	NC_008942	TTG	2	6	184857	184862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124485023
3356	NC_008942	GCA	2	6	184910	184915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485023
3357	NC_008942	TCA	2	6	184941	184946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485023
3358	NC_008942	CGG	2	6	185134	185139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485024
3359	NC_008942	TCAT	2	8	185170	185177	25 %	50 %	0 %	25 %	124485024
3360	NC_008942	A	6	6	185191	185196	100 %	0 %	0 %	0 %	124485024
3361	NC_008942	TGA	2	6	185202	185207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485024
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3484	NC_008942	CGG	2	6	192489	192494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485030
3485	NC_008942	T	6	6	192609	192614	0 %	100 %	0 %	0 %	124485030
3486	NC_008942	AGT	2	6	192828	192833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485031
3487	NC_008942	GCG	2	6	192847	192852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124485031
3488	NC_008942	AGA	2	6	192895	192900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485031
3489	NC_008942	ATG	2	6	192955	192960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485031
3490	NC_008942	TGA	2	6	192992	192997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124485031
3491	NC_008942	TC	3	6	193054	193059	0 %	50 %	0 %	50 %	124485031
3492	NC_008942	G	6	6	193085	193090	0 %	0 %	100 %	0 %	124485031
3493	NC_008942	TCAT	2	8	193094	193101	25 %	50 %	0 %	25 %	124485031
3494	NC_008942	G	6	6	193107	193112	0 %	0 %	100 %	0 %	124485031
3495	NC_008942	ACGG	2	8	193168	193175	25 %	0 %	50 %	25 %	124485031
3496	NC_008942	TCCGG	2	10	193183	193192	0 %	20 %	40 %	40 %	124485031
3497	NC_008942	GCA	2	6	193216	193221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124485031
3498	NC_008942	TCA	2	6	193229	193234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485031
3499	NC_008942	AGA	2	6	193246	193251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124485031
3500	NC_008942	CAT	2	6	193293	193298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124485031

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