MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocorpusculum labreanum Z chromosome

Total Repeats: 32279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008942	CGC	2	6	28044	28049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484854
502	NC_008942	GCGG	2	8	28053	28060	0 %	0 %	75 %	25 %	124484854
503	NC_008942	CT	3	6	28064	28069	0 %	50 %	0 %	50 %	124484854
504	NC_008942	ATG	2	6	28075	28080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484854
505	NC_008942	GCC	2	6	28149	28154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484854
506	NC_008942	ACC	2	6	28204	28209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124484854
507	NC_008942	ATC	2	6	28219	28224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484854
508	NC_008942	CCA	2	6	28242	28247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124484854
509	NC_008942	A	6	6	28258	28263	100 %	0 %	0 %	0 %	124484854
510	NC_008942	ACA	2	6	28277	28282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484854
511	NC_008942	GTC	2	6	28318	28323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484854
512	NC_008942	CTC	2	6	28434	28439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484854
513	NC_008942	CGG	2	6	28487	28492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484854
514	NC_008942	CCG	2	6	28526	28531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484854
515	NC_008942	TGA	2	6	28542	28547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484854
516	NC_008942	ACCG	2	8	28606	28613	25 %	0 %	25 %	50 %	124484854
517	NC_008942	CCGA	2	8	28654	28661	25 %	0 %	25 %	50 %	124484854
518	NC_008942	CGA	2	6	28695	28700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484854
519	NC_008942	GCC	2	6	28750	28755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484854
520	NC_008942	CT	3	6	28797	28802	0 %	50 %	0 %	50 %	124484854
521	NC_008942	ATA	2	6	28852	28857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124484854
522	NC_008942	CAT	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484855
523	NC_008942	TCG	2	6	28963	28968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484855
524	NC_008942	GCC	2	6	28980	28985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484855
525	NC_008942	TCG	2	6	29029	29034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484855
526	NC_008942	ATC	2	6	29067	29072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484855
527	NC_008942	TCG	2	6	29074	29079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484855
528	NC_008942	AAG	2	6	29092	29097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484855
529	NC_008942	ATT	2	6	29124	29129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484855
530	NC_008942	CGGT	2	8	29182	29189	0 %	25 %	50 %	25 %	124484855
531	NC_008942	TCA	2	6	29290	29295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484855
532	NC_008942	TTC	2	6	29316	29321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484855
533	NC_008942	TGA	2	6	29380	29385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484855
534	NC_008942	TCA	2	6	29404	29409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484855
535	NC_008942	ATC	2	6	29418	29423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484855
536	NC_008942	AGA	2	6	29449	29454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484855
537	NC_008942	GGC	2	6	29537	29542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484855
538	NC_008942	AAAT	2	8	29575	29582	75 %	25 %	0 %	0 %	124484855
539	NC_008942	CGG	2	6	29672	29677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484855
540	NC_008942	GTT	2	6	29682	29687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484855
541	NC_008942	TC	3	6	29695	29700	0 %	50 %	0 %	50 %	124484855
542	NC_008942	CGA	2	6	29717	29722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484855
543	NC_008942	TC	3	6	29741	29746	0 %	50 %	0 %	50 %	124484855
544	NC_008942	CGATGC	2	12	29771	29782	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124484855
545	NC_008942	CAC	2	6	29795	29800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124484855
546	NC_008942	GAG	3	9	29805	29813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124484855
547	NC_008942	AGAA	2	8	29859	29866	75 %	0 %	25 %	0 %	124484855
548	NC_008942	CGA	2	6	29870	29875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484855
549	NC_008942	TC	3	6	29927	29932	0 %	50 %	0 %	50 %	124484855
550	NC_008942	CGG	2	6	29933	29938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484855
551	NC_008942	CTG	2	6	30051	30056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484855
552	NC_008942	GAT	2	6	30134	30139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484855
553	NC_008942	ACG	2	6	30166	30171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484855
554	NC_008942	GAC	2	6	30356	30361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484855
555	NC_008942	TCT	2	6	30383	30388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484855
556	NC_008942	CTG	2	6	30411	30416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484855
557	NC_008942	GAA	2	6	30539	30544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484855
558	NC_008942	CGG	2	6	30568	30573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484855
559	NC_008942	TC	3	6	30574	30579	0 %	50 %	0 %	50 %	124484855
560	NC_008942	CGA	2	6	30706	30711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484855
561	NC_008942	CGGAT	2	10	30826	30835	20 %	20 %	40 %	20 %	124484855
562	NC_008942	GTGA	2	8	30877	30884	25 %	25 %	50 %	0 %	124484855
563	NC_008942	GTTC	2	8	30921	30928	0 %	50 %	25 %	25 %	124484856
564	NC_008942	TCT	2	6	30953	30958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484856
565	NC_008942	CGGT	2	8	30962	30969	0 %	25 %	50 %	25 %	124484856
566	NC_008942	ATG	2	6	30970	30975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484856
567	NC_008942	GCG	2	6	30979	30984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484856
568	NC_008942	GCT	2	6	31002	31007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484856
569	NC_008942	CGG	2	6	31050	31055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484856
570	NC_008942	CTG	2	6	31087	31092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484856
571	NC_008942	GAC	2	6	31188	31193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484856
572	NC_008942	TCT	2	6	31244	31249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484856
573	NC_008942	GCT	2	6	31257	31262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124484856
574	NC_008942	CT	3	6	31298	31303	0 %	50 %	0 %	50 %	124484856
575	NC_008942	AG	4	8	31373	31380	50 %	0 %	50 %	0 %	124484856
576	NC_008942	AGC	2	6	31451	31456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484856
577	NC_008942	CGAT	2	8	31520	31527	25 %	25 %	25 %	25 %	124484856
578	NC_008942	GCG	2	6	31579	31584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124484856
579	NC_008942	TTC	2	6	31642	31647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484856
580	NC_008942	AAG	2	6	31652	31657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484856
581	NC_008942	T	6	6	32216	32221	0 %	100 %	0 %	0 %	124484857
582	NC_008942	ATT	2	6	32235	32240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484857
583	NC_008942	TA	3	6	32252	32257	50 %	50 %	0 %	0 %	124484857
584	NC_008942	TC	3	6	32320	32325	0 %	50 %	0 %	50 %	124484857
585	NC_008942	A	6	6	32373	32378	100 %	0 %	0 %	0 %	124484857
586	NC_008942	AC	3	6	32438	32443	50 %	0 %	0 %	50 %	124484857
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588	NC_008942	ATT	2	6	32499	32504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484857
589	NC_008942	ATTT	2	8	32520	32527	25 %	75 %	0 %	0 %	124484857
590	NC_008942	AT	3	6	32571	32576	50 %	50 %	0 %	0 %	124484857
591	NC_008942	TTC	2	6	32586	32591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484857
592	NC_008942	TTG	2	6	32606	32611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	124484857
593	NC_008942	GTTT	2	8	32629	32636	0 %	75 %	25 %	0 %	124484857
594	NC_008942	GAA	2	6	32694	32699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124484857
595	NC_008942	T	7	7	32756	32762	0 %	100 %	0 %	0 %	124484857
596	NC_008942	TTTA	2	8	32799	32806	25 %	75 %	0 %	0 %	124484857
597	NC_008942	AAC	2	6	32837	32842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484857
598	NC_008942	TTTC	2	8	32852	32859	0 %	75 %	0 %	25 %	124484857
599	NC_008942	TAT	2	6	32867	32872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	124484857
600	NC_008942	TGG	2	6	32885	32890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124484857
601	NC_008942	ACTC	2	8	33104	33111	25 %	25 %	0 %	50 %	124484858
602	NC_008942	CTT	2	6	33115	33120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484858
603	NC_008942	TC	3	6	33187	33192	0 %	50 %	0 %	50 %	124484858
604	NC_008942	TC	3	6	33199	33204	0 %	50 %	0 %	50 %	124484858
605	NC_008942	TCC	2	6	33239	33244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484858
606	NC_008942	AT	3	6	33254	33259	50 %	50 %	0 %	0 %	124484858
607	NC_008942	T	6	6	33379	33384	0 %	100 %	0 %	0 %	124484858
608	NC_008942	ATC	2	6	33391	33396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484858
609	NC_008942	TCGC	2	8	33434	33441	0 %	25 %	25 %	50 %	124484858
610	NC_008942	GCA	2	6	33474	33479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484858
611	NC_008942	TCA	2	6	33546	33551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484858
612	NC_008942	CAG	2	6	33634	33639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484858
613	NC_008942	ATA	2	6	33725	33730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124484858
614	NC_008942	TCT	2	6	34618	34623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484859
615	NC_008942	TTC	2	6	34820	34825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124484859
616	NC_008942	TAC	2	6	34870	34875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124484859
617	NC_008942	ATA	2	6	35051	35056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124484860
618	NC_008942	CCG	2	6	35082	35087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124484860
619	NC_008942	AG	3	6	35115	35120	50 %	0 %	50 %	0 %	124484860
620	NC_008942	AAT	2	6	35140	35145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	124484860
621	NC_008942	TCC	3	9	35214	35222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484860
622	NC_008942	TCC	2	6	35259	35264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124484860
623	NC_008942	GAT	2	6	35339	35344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484860
624	NC_008942	ATG	2	6	35385	35390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124484860
625	NC_008942	CAG	2	6	35453	35458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124484861
626	NC_008942	CAA	2	6	35518	35523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484861
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628	NC_008942	CAA	2	6	35602	35607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	124484861
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762	NC_008942	CTTT	2	8	42553	42560	0 %	75 %	0 %	25 %	124484868
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