MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylibium petroleiphilum PM1 plasmid RPME01

Total Repeats: 12938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_008826	GCCG	2	8	579275	579282	0 %	0 %	50 %	50 %	124263149
12502	NC_008826	CTG	2	6	579335	579340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263149
12503	NC_008826	GTG	2	6	579362	579367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124263149
12504	NC_008826	GTC	2	6	579383	579388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263149
12505	NC_008826	CG	3	6	579395	579400	0 %	0 %	50 %	50 %	124263149
12506	NC_008826	CG	3	6	579470	579475	0 %	0 %	50 %	50 %	124263149
12507	NC_008826	CCG	2	6	579514	579519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263149
12508	NC_008826	CGG	2	6	579533	579538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263149
12509	NC_008826	CTGG	2	8	579557	579564	0 %	25 %	50 %	25 %	124263149
12510	NC_008826	TC	3	6	579587	579592	0 %	50 %	0 %	50 %	124263149
12511	NC_008826	CGG	2	6	579599	579604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263149
12512	NC_008826	GC	3	6	579688	579693	0 %	0 %	50 %	50 %	124263150
12513	NC_008826	CGAAGA	2	12	579717	579728	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	124263150
12514	NC_008826	GCCT	2	8	579769	579776	0 %	25 %	25 %	50 %	124263150
12515	NC_008826	GTC	2	6	579818	579823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263150
12516	NC_008826	GCAA	2	8	579865	579872	50 %	0 %	25 %	25 %	124263150
12517	NC_008826	CAC	2	6	579886	579891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124263150
12518	NC_008826	GCC	2	6	580022	580027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263151
12519	NC_008826	CGG	2	6	580075	580080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263151
12520	NC_008826	AGGT	2	8	580088	580095	25 %	25 %	50 %	0 %	124263151
12521	NC_008826	CGAG	2	8	580104	580111	25 %	0 %	50 %	25 %	124263151
12522	NC_008826	CCG	2	6	580134	580139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263151
12523	NC_008826	AGCG	2	8	580162	580169	25 %	0 %	50 %	25 %	124263151
12524	NC_008826	CGA	3	9	580191	580199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263151
12525	NC_008826	GCGCG	2	10	580228	580237	0 %	0 %	60 %	40 %	124263151
12526	NC_008826	TGG	2	6	580278	580283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	124263151
12527	NC_008826	CGA	2	6	580300	580305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263151
12528	NC_008826	GAG	2	6	580306	580311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124263151
12529	NC_008826	GGTGCG	2	12	580315	580326	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	124263151
12530	NC_008826	CACCG	2	10	580638	580647	20 %	0 %	20 %	60 %	124263152
12531	NC_008826	CGC	2	6	580668	580673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263152
12532	NC_008826	CGA	2	6	580707	580712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12533	NC_008826	GGC	2	6	580744	580749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263152
12534	NC_008826	ACGC	2	8	580762	580769	25 %	0 %	25 %	50 %	124263152
12535	NC_008826	CGA	2	6	580803	580808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12536	NC_008826	CGG	2	6	580836	580841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263152
12537	NC_008826	A	6	6	580863	580868	100 %	0 %	0 %	0 %	124263152
12538	NC_008826	GCT	2	6	580872	580877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12539	NC_008826	TCG	2	6	580952	580957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12540	NC_008826	GCC	2	6	580994	580999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263152
12541	NC_008826	CTC	2	6	581002	581007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124263152
12542	NC_008826	ATG	2	6	581015	581020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124263152
12543	NC_008826	ACC	2	6	581063	581068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124263152
12544	NC_008826	GC	3	6	581086	581091	0 %	0 %	50 %	50 %	124263152
12545	NC_008826	ACATCG	2	12	581144	581155	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	124263152
12546	NC_008826	GGC	2	6	581166	581171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263152
12547	NC_008826	GC	3	6	581175	581180	0 %	0 %	50 %	50 %	124263152
12548	NC_008826	CTC	2	6	581196	581201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124263152
12549	NC_008826	CAACGA	2	12	581205	581216	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	124263152
12550	NC_008826	AAG	2	6	581233	581238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124263152
12551	NC_008826	TCT	2	6	581273	581278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124263152
12552	NC_008826	GGA	2	6	581292	581297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124263152
12553	NC_008826	ACG	2	6	581309	581314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12554	NC_008826	GAG	2	6	581323	581328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124263152
12555	NC_008826	TGA	3	9	581342	581350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124263152
12556	NC_008826	GCC	2	6	581364	581369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263152
12557	NC_008826	CAT	2	6	581403	581408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124263152
12558	NC_008826	GCC	2	6	581416	581421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263152
12559	NC_008826	AGG	2	6	581423	581428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	124263152
12560	NC_008826	CCCT	2	8	581481	581488	0 %	25 %	0 %	75 %	124263152
12561	NC_008826	CAAGGC	2	12	581544	581555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12562	NC_008826	AGCC	2	8	581688	581695	25 %	0 %	25 %	50 %	124263152
12563	NC_008826	CTC	2	6	581697	581702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	124263152
12564	NC_008826	GCA	2	6	581814	581819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12565	NC_008826	GC	3	6	581856	581861	0 %	0 %	50 %	50 %	124263152
12566	NC_008826	CGG	2	6	581871	581876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263152
12567	NC_008826	CGGCAA	2	12	581889	581900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12568	NC_008826	GGCG	2	8	581931	581938	0 %	0 %	75 %	25 %	124263152
12569	NC_008826	CACG	2	8	581985	581992	25 %	0 %	25 %	50 %	124263152
12570	NC_008826	TGA	2	6	582005	582010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124263152
12571	NC_008826	ACG	2	6	582038	582043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12572	NC_008826	GTC	2	6	582051	582056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12573	NC_008826	CGA	2	6	582081	582086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
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12577	NC_008826	CGGG	2	8	582188	582195	0 %	0 %	75 %	25 %	124263152
12578	NC_008826	CTG	2	6	582199	582204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12579	NC_008826	CTT	2	6	582231	582236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124263152
12580	NC_008826	AAG	2	6	582268	582273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124263152
12581	NC_008826	CTG	2	6	582274	582279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263152
12582	NC_008826	CAT	2	6	582432	582437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124263152
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12584	NC_008826	TCA	2	6	582539	582544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124263152
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12587	NC_008826	CGG	2	6	582630	582635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263152
12588	NC_008826	CGG	2	6	582639	582644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263152
12589	NC_008826	GGC	2	6	582657	582662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263152
12590	NC_008826	GAA	2	6	582810	582815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	124263152
12591	NC_008826	ACG	2	6	582854	582859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263152
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12593	NC_008826	CGT	2	6	582894	582899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263152
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12596	NC_008826	TCG	2	6	583045	583050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263153
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12598	NC_008826	CGTGCA	2	12	583094	583105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124263153
12599	NC_008826	CGC	2	6	583106	583111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263153
12600	NC_008826	GCA	2	6	583133	583138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263153
12601	NC_008826	CG	3	6	583159	583164	0 %	0 %	50 %	50 %	124263153
12602	NC_008826	CG	3	6	583231	583236	0 %	0 %	50 %	50 %	124263153
12603	NC_008826	GCC	2	6	583240	583245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263153
12604	NC_008826	CTT	2	6	583361	583366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	124263153
12605	NC_008826	CCA	2	6	583388	583393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	124263153
12606	NC_008826	GCT	2	6	583430	583435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263153
12607	NC_008826	GCG	2	6	583439	583444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	124263153
12608	NC_008826	GC	3	6	583461	583466	0 %	0 %	50 %	50 %	124263153
12609	NC_008826	ACG	2	6	583572	583577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263154
12610	NC_008826	AGC	2	6	583782	583787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263154
12611	NC_008826	CG	4	8	583864	583871	0 %	0 %	50 %	50 %	124263154
12612	NC_008826	GCC	2	6	583877	583882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263154
12613	NC_008826	ATG	2	6	583961	583966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	124263154
12614	NC_008826	CAT	2	6	584029	584034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124263154
12615	NC_008826	ACG	2	6	584039	584044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263154
12616	NC_008826	CTG	2	6	584054	584059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263154
12617	NC_008826	CTG	2	6	584117	584122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263154
12618	NC_008826	CTG	2	6	584126	584131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263154
12619	NC_008826	GCC	2	6	584230	584235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	124263154
12620	NC_008826	GCT	2	6	584305	584310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263154
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12622	NC_008826	AGC	2	6	584328	584333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263154
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12725	NC_008826	CTG	2	6	589269	589274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263162
12726	NC_008826	GCTCGA	2	12	589313	589324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	124263162
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12733	NC_008826	TCA	2	6	589716	589721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	124263163
12734	NC_008826	CGA	2	6	589735	589740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	124263163
12735	NC_008826	GTC	2	6	589827	589832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	124263163
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.