MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 chromosome

Total Repeats: 74076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008740	CAG	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552945
2	NC_008740	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552945
3	NC_008740	TGG	2	6	666	671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552945
4	NC_008740	ATG	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552945
5	NC_008740	GGT	2	6	726	731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552945
6	NC_008740	GCC	2	6	747	752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552945
7	NC_008740	GAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552945
8	NC_008740	GAA	3	9	790	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552945
9	NC_008740	GGT	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552945
10	NC_008740	GGC	2	6	1039	1044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552945
11	NC_008740	ATGC	2	8	1069	1076	25 %	25 %	25 %	25 %	120552945
12	NC_008740	CG	4	8	1106	1113	0 %	0 %	50 %	50 %	120552945
13	NC_008740	CGGT	2	8	1204	1211	0 %	25 %	50 %	25 %	120552945
14	NC_008740	GCT	2	6	1218	1223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552945
15	NC_008740	T	6	6	1240	1245	0 %	100 %	0 %	0 %	120552945
16	NC_008740	AGG	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120552945
17	NC_008740	GCT	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552945
18	NC_008740	CAG	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552945
19	NC_008740	GAAA	2	8	1341	1348	75 %	0 %	25 %	0 %	120552945
20	NC_008740	GGA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120552945
21	NC_008740	TGA	2	6	1442	1447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552945
22	NC_008740	CAG	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552945
23	NC_008740	TCACT	2	10	1566	1575	20 %	40 %	0 %	40 %	120552945
24	NC_008740	CCG	2	6	1591	1596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552945
25	NC_008740	ATA	2	6	1655	1660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120552945
26	NC_008740	TAC	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552945
27	NC_008740	CTG	2	6	1705	1710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552945
28	NC_008740	CGC	2	6	1717	1722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552945
29	NC_008740	ACCA	2	8	1777	1784	50 %	0 %	0 %	50 %	120552945
30	NC_008740	ACCAC	2	10	1823	1832	40 %	0 %	0 %	60 %	120552945
31	NC_008740	TTG	2	6	1856	1861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120552945
32	NC_008740	ACC	2	6	1921	1926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120552945
33	NC_008740	CTG	2	6	2089	2094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552946
34	NC_008740	TGG	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552946
35	NC_008740	CGG	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552946
36	NC_008740	CAG	2	6	2431	2436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552946
37	NC_008740	TTA	2	6	2445	2450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120552946
38	NC_008740	GTT	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120552946
39	NC_008740	GAT	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552946
40	NC_008740	GAA	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552946
41	NC_008740	ATC	2	6	2654	2659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552946
42	NC_008740	TTGA	2	8	2698	2705	25 %	50 %	25 %	0 %	120552946
43	NC_008740	GCG	2	6	2744	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552946
44	NC_008740	GCGG	2	8	2796	2803	0 %	0 %	75 %	25 %	120552946
45	NC_008740	GTG	2	6	2828	2833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552946
46	NC_008740	GAT	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552946
47	NC_008740	CAG	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552946
48	NC_008740	TGT	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120552946
49	NC_008740	CTGT	2	8	3163	3170	0 %	50 %	25 %	25 %	120552947
50	NC_008740	GGA	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120552947
51	NC_008740	CCTTC	2	10	3357	3366	0 %	40 %	0 %	60 %	120552947
52	NC_008740	AAG	2	6	3376	3381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552947
53	NC_008740	ATC	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552947
54	NC_008740	TGC	2	6	3474	3479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552947
55	NC_008740	GAA	2	6	3496	3501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552947
56	NC_008740	GTG	2	6	3502	3507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552947
57	NC_008740	CTG	2	6	3541	3546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552947
58	NC_008740	TTG	2	6	3629	3634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120552947
59	NC_008740	ATG	2	6	3652	3657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552947
60	NC_008740	GAA	2	6	3658	3663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552947
61	NC_008740	TCA	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552947
62	NC_008740	CAA	2	6	3684	3689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120552947
63	NC_008740	TCT	2	6	3698	3703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120552947
64	NC_008740	T	6	6	3910	3915	0 %	100 %	0 %	0 %	120552947
65	NC_008740	GGTT	2	8	3963	3970	0 %	50 %	50 %	0 %	120552947
66	NC_008740	GTGA	2	8	4021	4028	25 %	25 %	50 %	0 %	120552947
67	NC_008740	TGG	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552947
68	NC_008740	TCTG	2	8	4122	4129	0 %	50 %	25 %	25 %	120552947
69	NC_008740	GAT	2	6	4174	4179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552947
70	NC_008740	GAC	2	6	4207	4212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552947
71	NC_008740	AAT	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120552947
72	NC_008740	TGC	2	6	4286	4291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552947
73	NC_008740	GATG	2	8	4341	4348	25 %	25 %	50 %	0 %	120552947
74	NC_008740	TCT	2	6	4564	4569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120552948
75	NC_008740	GGTC	2	8	4631	4638	0 %	25 %	50 %	25 %	120552948
76	NC_008740	ACTG	2	8	4687	4694	25 %	25 %	25 %	25 %	120552948
77	NC_008740	TTG	2	6	4884	4889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120552948
78	NC_008740	TGG	2	6	4891	4896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552948
79	NC_008740	CCTT	2	8	4946	4953	0 %	50 %	0 %	50 %	120552948
80	NC_008740	TTC	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120552948
81	NC_008740	AG	3	6	4977	4982	50 %	0 %	50 %	0 %	120552948
82	NC_008740	CGT	2	6	5246	5251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552948
83	NC_008740	TGG	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552948
84	NC_008740	TC	3	6	5328	5333	0 %	50 %	0 %	50 %	120552948
85	NC_008740	GCA	2	6	5338	5343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552948
86	NC_008740	TGA	2	6	5361	5366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552948
87	NC_008740	GAA	2	6	5600	5605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552948
88	NC_008740	TCC	2	6	5697	5702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120552949
89	NC_008740	CGA	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552949
90	NC_008740	TGG	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552949
91	NC_008740	CTGG	2	8	5832	5839	0 %	25 %	50 %	25 %	120552949
92	NC_008740	CAT	3	9	5858	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552949
93	NC_008740	GCC	2	6	5946	5951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552949
94	NC_008740	TCA	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552949
95	NC_008740	GGT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552949
96	NC_008740	CGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552949
97	NC_008740	CGG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552949
98	NC_008740	GT	3	6	6034	6039	0 %	50 %	50 %	0 %	120552949
99	NC_008740	CCG	2	6	6080	6085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552949
100	NC_008740	GTG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552949
101	NC_008740	AGG	2	6	6310	6315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120552949
102	NC_008740	GGT	2	6	6333	6338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552949
103	NC_008740	TTG	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120552949
104	NC_008740	CAA	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120552949
105	NC_008740	ACG	2	6	6451	6456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552949
106	NC_008740	CAA	2	6	6485	6490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120552949
107	NC_008740	TGG	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552949
108	NC_008740	GCA	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552949
109	NC_008740	CT	3	6	6548	6553	0 %	50 %	0 %	50 %	120552949
110	NC_008740	AAC	2	6	6555	6560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120552949
111	NC_008740	TGA	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552949
112	NC_008740	ATC	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552949
113	NC_008740	TCC	2	6	6672	6677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120552949
114	NC_008740	GAT	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552949
115	NC_008740	CCG	2	6	6851	6856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552949
116	NC_008740	GGT	2	6	6960	6965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552949
117	NC_008740	GAA	2	6	7116	7121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552949
118	NC_008740	CAT	4	12	7151	7162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552949
119	NC_008740	CCGATG	2	12	7165	7176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120552949
120	NC_008740	CTG	3	9	7200	7208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552949
121	NC_008740	ATC	2	6	7236	7241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552949
122	NC_008740	GCC	2	6	7268	7273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552949
123	NC_008740	GAAG	2	8	7328	7335	50 %	0 %	50 %	0 %	120552949
124	NC_008740	GAT	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552949
125	NC_008740	GCA	2	6	7493	7498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552949
126	NC_008740	ACA	2	6	7507	7512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120552949
127	NC_008740	GAAG	2	8	7535	7542	50 %	0 %	50 %	0 %	120552949
128	NC_008740	GC	3	6	7566	7571	0 %	0 %	50 %	50 %	120552949
129	NC_008740	TCTGGA	2	12	7583	7594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	120552949
130	NC_008740	CGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552949
131	NC_008740	CTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120552949
132	NC_008740	TGA	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552949
133	NC_008740	ACC	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120552949
134	NC_008740	GAT	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552949
135	NC_008740	CAC	2	6	8006	8011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120552949
136	NC_008740	GAT	2	6	8022	8027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552949
137	NC_008740	CGG	2	6	8037	8042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552949
138	NC_008740	GAG	2	6	8200	8205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120552950
139	NC_008740	CTTTT	2	10	8229	8238	0 %	80 %	0 %	20 %	120552950
140	NC_008740	AGA	2	6	8318	8323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120552950
141	NC_008740	CAT	3	9	8328	8336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552950
142	NC_008740	ATC	2	6	8356	8361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552950
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144	NC_008740	ATG	2	6	8455	8460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552950
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146	NC_008740	CTC	2	6	8520	8525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120552950
147	NC_008740	TTCTT	2	10	8533	8542	0 %	80 %	0 %	20 %	120552950
148	NC_008740	CGG	2	6	8651	8656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552950
149	NC_008740	AGCC	2	8	8680	8687	25 %	0 %	25 %	50 %	120552950
150	NC_008740	GCC	2	6	8712	8717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552950
151	NC_008740	GAT	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552950
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153	NC_008740	TCA	2	6	8864	8869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552950
154	NC_008740	ATG	3	9	8884	8892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120552950
155	NC_008740	CAG	2	6	8898	8903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552950
156	NC_008740	TGG	2	6	8923	8928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552950
157	NC_008740	CTTC	2	8	9078	9085	0 %	50 %	0 %	50 %	120552951
158	NC_008740	CAA	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120552951
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161	NC_008740	CAG	2	6	9184	9189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552951
162	NC_008740	CTT	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120552951
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165	NC_008740	TCT	2	6	9392	9397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120552951
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174	NC_008740	CTT	2	6	9804	9809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120552951
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248	NC_008740	ACGAA	2	10	13876	13885	60 %	0 %	20 %	20 %	120552953
249	NC_008740	GGC	2	6	13914	13919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552953
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251	NC_008740	CCA	2	6	14048	14053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120552953
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254	NC_008740	CAC	2	6	14274	14279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120552954
255	NC_008740	CTG	2	6	14280	14285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552954
256	NC_008740	GCA	2	6	14402	14407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552954
257	NC_008740	GCT	2	6	14474	14479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120552954
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259	NC_008740	TCA	2	6	14615	14620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552954
260	NC_008740	CGGC	2	8	14659	14666	0 %	0 %	50 %	50 %	120552954
261	NC_008740	CA	3	6	14765	14770	50 %	0 %	0 %	50 %	120552954
262	NC_008740	CGG	2	6	14804	14809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552954
263	NC_008740	CGG	2	6	14840	14845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120552954
264	NC_008740	GCA	2	6	14900	14905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552954
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271	NC_008740	GC	3	6	15218	15223	0 %	0 %	50 %	50 %	120552954
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380	NC_008740	TGG	2	6	19987	19992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120552955
381	NC_008740	ACC	2	6	20010	20015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120552955
382	NC_008740	GCA	2	6	20029	20034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552955
383	NC_008740	TGCCGG	2	12	20113	20124	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120552955
384	NC_008740	GGTT	2	8	20188	20195	0 %	50 %	50 %	0 %	120552955
385	NC_008740	CCG	3	9	20229	20237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120552956
386	NC_008740	GCA	2	6	20280	20285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120552956
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498	NC_008740	ACC	2	6	26378	26383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120552958
499	NC_008740	AAC	2	6	26387	26392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120552958
500	NC_008740	ATC	2	6	26438	26443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120552958

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