MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU02

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008739	TA	3	6	986	991	50 %	50 %	0 %	0 %	120537038
2	NC_008739	GA	3	6	1167	1172	50 %	0 %	50 %	0 %	120537038
3	NC_008739	CT	3	6	1816	1821	0 %	50 %	0 %	50 %	120537039
4	NC_008739	TA	3	6	2050	2055	50 %	50 %	0 %	0 %	120537039
5	NC_008739	CT	3	6	3353	3358	0 %	50 %	0 %	50 %	120537040
6	NC_008739	AT	3	6	3895	3900	50 %	50 %	0 %	0 %	120537040
7	NC_008739	TG	3	6	4024	4029	0 %	50 %	50 %	0 %	120537040
8	NC_008739	CA	3	6	6098	6103	50 %	0 %	0 %	50 %	120537043
9	NC_008739	GT	3	6	6297	6302	0 %	50 %	50 %	0 %	120537044
10	NC_008739	CG	3	6	7217	7222	0 %	0 %	50 %	50 %	120537045
11	NC_008739	AG	3	6	8337	8342	50 %	0 %	50 %	0 %	120537046
12	NC_008739	CA	3	6	8423	8428	50 %	0 %	0 %	50 %	120537046
13	NC_008739	AT	3	6	8493	8498	50 %	50 %	0 %	0 %	120537046
14	NC_008739	GC	3	6	8927	8932	0 %	0 %	50 %	50 %	120537047
15	NC_008739	GA	3	6	9071	9076	50 %	0 %	50 %	0 %	120537047
16	NC_008739	GA	3	6	9145	9150	50 %	0 %	50 %	0 %	120537047
17	NC_008739	GA	3	6	9222	9227	50 %	0 %	50 %	0 %	120537047
18	NC_008739	GC	3	6	9581	9586	0 %	0 %	50 %	50 %	120537048
19	NC_008739	CG	3	6	9963	9968	0 %	0 %	50 %	50 %	120537049
20	NC_008739	CT	3	6	10035	10040	0 %	50 %	0 %	50 %	120537049
21	NC_008739	AG	3	6	10196	10201	50 %	0 %	50 %	0 %	120537050
22	NC_008739	TG	3	6	10219	10224	0 %	50 %	50 %	0 %	120537050
23	NC_008739	TG	3	6	10603	10608	0 %	50 %	50 %	0 %	120537050
24	NC_008739	GA	3	6	10947	10952	50 %	0 %	50 %	0 %	120537050
25	NC_008739	TC	3	6	11861	11866	0 %	50 %	0 %	50 %	120537051
26	NC_008739	TA	3	6	11985	11990	50 %	50 %	0 %	0 %	120537051
27	NC_008739	TG	3	6	12414	12419	0 %	50 %	50 %	0 %	120537051
28	NC_008739	GA	3	6	12811	12816	50 %	0 %	50 %	0 %	120537052
29	NC_008739	GT	3	6	14694	14699	0 %	50 %	50 %	0 %	120537054
30	NC_008739	TC	3	6	15119	15124	0 %	50 %	0 %	50 %	120537054
31	NC_008739	GC	3	6	16093	16098	0 %	0 %	50 %	50 %	120537055
32	NC_008739	GA	3	6	17107	17112	50 %	0 %	50 %	0 %	120537055
33	NC_008739	CT	3	6	17703	17708	0 %	50 %	0 %	50 %	120537056
34	NC_008739	AG	3	6	18964	18969	50 %	0 %	50 %	0 %	120537057
35	NC_008739	TG	3	6	21318	21323	0 %	50 %	50 %	0 %	120537058
36	NC_008739	GA	3	6	22375	22380	50 %	0 %	50 %	0 %	120537059
37	NC_008739	AC	3	6	23363	23368	50 %	0 %	0 %	50 %	120537059
38	NC_008739	CA	3	6	26520	26525	50 %	0 %	0 %	50 %	120537062
39	NC_008739	GC	3	6	27027	27032	0 %	0 %	50 %	50 %	120537063
40	NC_008739	AG	3	6	28972	28977	50 %	0 %	50 %	0 %	120537064
41	NC_008739	CT	4	8	30355	30362	0 %	50 %	0 %	50 %	120537064
42	NC_008739	GA	3	6	32143	32148	50 %	0 %	50 %	0 %	120537066
43	NC_008739	AC	3	6	33099	33104	50 %	0 %	0 %	50 %	120537067
44	NC_008739	AG	3	6	34991	34996	50 %	0 %	50 %	0 %	120537071
45	NC_008739	TG	3	6	35553	35558	0 %	50 %	50 %	0 %	120537072
46	NC_008739	GC	3	6	36276	36281	0 %	0 %	50 %	50 %	120537072
47	NC_008739	TA	3	6	39340	39345	50 %	50 %	0 %	0 %	120537074
48	NC_008739	TC	3	6	40303	40308	0 %	50 %	0 %	50 %	120537074
49	NC_008739	TG	3	6	41030	41035	0 %	50 %	50 %	0 %	120537075
50	NC_008739	CT	4	8	41272	41279	0 %	50 %	0 %	50 %	120537076
51	NC_008739	GA	3	6	43894	43899	50 %	0 %	50 %	0 %	120537079
52	NC_008739	GT	4	8	44190	44197	0 %	50 %	50 %	0 %	120537079
53	NC_008739	CT	3	6	46045	46050	0 %	50 %	0 %	50 %	120537081
54	NC_008739	GA	4	8	48375	48382	50 %	0 %	50 %	0 %	120537084
55	NC_008739	TC	3	6	48658	48663	0 %	50 %	0 %	50 %	120537084
56	NC_008739	AG	4	8	48668	48675	50 %	0 %	50 %	0 %	120537084
57	NC_008739	AC	3	6	48726	48731	50 %	0 %	0 %	50 %	120537084
58	NC_008739	TC	3	6	49056	49061	0 %	50 %	0 %	50 %	120537084
59	NC_008739	CT	3	6	49497	49502	0 %	50 %	0 %	50 %	120537085
60	NC_008739	CT	3	6	49764	49769	0 %	50 %	0 %	50 %	120537085
61	NC_008739	AG	3	6	51387	51392	50 %	0 %	50 %	0 %	120537086
62	NC_008739	AC	3	6	51758	51763	50 %	0 %	0 %	50 %	120537086
63	NC_008739	CT	3	6	54216	54221	0 %	50 %	0 %	50 %	120537087
64	NC_008739	AC	3	6	54361	54366	50 %	0 %	0 %	50 %	120537087
65	NC_008739	CA	3	6	54594	54599	50 %	0 %	0 %	50 %	120537087
66	NC_008739	GA	3	6	55313	55318	50 %	0 %	50 %	0 %	120537087
67	NC_008739	AG	3	6	55486	55491	50 %	0 %	50 %	0 %	120537087
68	NC_008739	GA	3	6	56313	56318	50 %	0 %	50 %	0 %	120537088
69	NC_008739	TC	3	6	56377	56382	0 %	50 %	0 %	50 %	120537088
70	NC_008739	GA	3	6	56659	56664	50 %	0 %	50 %	0 %	120537089
71	NC_008739	TC	3	6	56671	56676	0 %	50 %	0 %	50 %	120537089
72	NC_008739	CT	3	6	59910	59915	0 %	50 %	0 %	50 %	120537094
73	NC_008739	GC	3	6	60346	60351	0 %	0 %	50 %	50 %	120537095
74	NC_008739	AT	3	6	61525	61530	50 %	50 %	0 %	0 %	120537097
75	NC_008739	AG	3	6	62446	62451	50 %	0 %	50 %	0 %	120537098
76	NC_008739	CT	3	6	62476	62481	0 %	50 %	0 %	50 %	120537098
77	NC_008739	GC	3	6	62713	62718	0 %	0 %	50 %	50 %	120537098
78	NC_008739	GC	3	6	65073	65078	0 %	0 %	50 %	50 %	120537100
79	NC_008739	AG	3	6	65234	65239	50 %	0 %	50 %	0 %	120537100
80	NC_008739	TA	3	6	66099	66104	50 %	50 %	0 %	0 %	120537101
81	NC_008739	CT	3	6	70235	70240	0 %	50 %	0 %	50 %	120537105
82	NC_008739	CT	3	6	71488	71493	0 %	50 %	0 %	50 %	120537106
83	NC_008739	AG	3	6	72667	72672	50 %	0 %	50 %	0 %	120537107
84	NC_008739	AG	3	6	73950	73955	50 %	0 %	50 %	0 %	120537107
85	NC_008739	AT	3	6	76201	76206	50 %	50 %	0 %	0 %	120537108
86	NC_008739	GT	3	6	76295	76300	0 %	50 %	50 %	0 %	120537108
87	NC_008739	TC	3	6	76747	76752	0 %	50 %	0 %	50 %	120537109
88	NC_008739	GC	3	6	78215	78220	0 %	0 %	50 %	50 %	120537111
89	NC_008739	AG	3	6	78537	78542	50 %	0 %	50 %	0 %	120537111
90	NC_008739	GC	3	6	79256	79261	0 %	0 %	50 %	50 %	120537112
91	NC_008739	CG	3	6	80860	80865	0 %	0 %	50 %	50 %	120537113
92	NC_008739	GC	3	6	81604	81609	0 %	0 %	50 %	50 %	120537114
93	NC_008739	AG	3	6	82040	82045	50 %	0 %	50 %	0 %	120537115
94	NC_008739	GC	3	6	83004	83009	0 %	0 %	50 %	50 %	120537116
95	NC_008739	GC	3	6	84420	84425	0 %	0 %	50 %	50 %	120537117
96	NC_008739	CT	3	6	85704	85709	0 %	50 %	0 %	50 %	120537117
97	NC_008739	GC	3	6	85864	85869	0 %	0 %	50 %	50 %	120537117
98	NC_008739	TA	3	6	88584	88589	50 %	50 %	0 %	0 %	120537121
99	NC_008739	CG	3	6	91345	91350	0 %	0 %	50 %	50 %	120537123
100	NC_008739	GC	3	6	91976	91981	0 %	0 %	50 %	50 %	120537124
101	NC_008739	TC	3	6	93193	93198	0 %	50 %	0 %	50 %	120537126
102	NC_008739	GA	3	6	95627	95632	50 %	0 %	50 %	0 %	120537129
103	NC_008739	TG	3	6	95846	95851	0 %	50 %	50 %	0 %	120537129
104	NC_008739	TC	3	6	96218	96223	0 %	50 %	0 %	50 %	120537130
105	NC_008739	CA	4	8	97279	97286	50 %	0 %	0 %	50 %	120537131
106	NC_008739	CG	3	6	97444	97449	0 %	0 %	50 %	50 %	120537131
107	NC_008739	TC	3	6	98101	98106	0 %	50 %	0 %	50 %	120537131
108	NC_008739	CA	3	6	100380	100385	50 %	0 %	0 %	50 %	120537133
109	NC_008739	GA	3	6	101241	101246	50 %	0 %	50 %	0 %	120537134
110	NC_008739	TC	3	6	102821	102826	0 %	50 %	0 %	50 %	120537136
111	NC_008739	GA	3	6	104379	104384	50 %	0 %	50 %	0 %	120537137
112	NC_008739	GC	3	6	105320	105325	0 %	0 %	50 %	50 %	120537138
113	NC_008739	GT	4	8	106231	106238	0 %	50 %	50 %	0 %	120537139
114	NC_008739	GA	3	6	107459	107464	50 %	0 %	50 %	0 %	120537141
115	NC_008739	GC	4	8	107489	107496	0 %	0 %	50 %	50 %	120537141
116	NC_008739	CG	3	6	107537	107542	0 %	0 %	50 %	50 %	120537141
117	NC_008739	GA	3	6	109997	110002	50 %	0 %	50 %	0 %	120537144
118	NC_008739	GA	3	6	110413	110418	50 %	0 %	50 %	0 %	120537145
119	NC_008739	TG	3	6	112591	112596	0 %	50 %	50 %	0 %	120537148
120	NC_008739	GC	3	6	114442	114447	0 %	0 %	50 %	50 %	120537149
121	NC_008739	GC	3	6	116197	116202	0 %	0 %	50 %	50 %	120537151
122	NC_008739	CA	3	6	116531	116536	50 %	0 %	0 %	50 %	120537151
123	NC_008739	GC	3	6	116588	116593	0 %	0 %	50 %	50 %	120537151
124	NC_008739	AC	3	6	116745	116750	50 %	0 %	0 %	50 %	120537151
125	NC_008739	GC	3	6	117040	117045	0 %	0 %	50 %	50 %	120537151
126	NC_008739	AC	3	6	117275	117280	50 %	0 %	0 %	50 %	120537152
127	NC_008739	GC	3	6	118110	118115	0 %	0 %	50 %	50 %	120537152
128	NC_008739	AG	3	6	118172	118177	50 %	0 %	50 %	0 %	120537152
129	NC_008739	CA	3	6	118426	118431	50 %	0 %	0 %	50 %	120537153
130	NC_008739	TC	3	6	121376	121381	0 %	50 %	0 %	50 %	120537157
131	NC_008739	TA	3	6	121869	121874	50 %	50 %	0 %	0 %	120537157
132	NC_008739	AG	3	6	124160	124165	50 %	0 %	50 %	0 %	120537159
133	NC_008739	AG	3	6	124328	124333	50 %	0 %	50 %	0 %	120537159
134	NC_008739	GA	3	6	124949	124954	50 %	0 %	50 %	0 %	120537159
135	NC_008739	GA	3	6	125165	125170	50 %	0 %	50 %	0 %	120537159
136	NC_008739	CT	3	6	126256	126261	0 %	50 %	0 %	50 %	120537160
137	NC_008739	GA	3	6	127012	127017	50 %	0 %	50 %	0 %	120537160
138	NC_008739	CT	3	6	129988	129993	0 %	50 %	0 %	50 %	120537161
139	NC_008739	GA	3	6	131558	131563	50 %	0 %	50 %	0 %	120537162
140	NC_008739	AG	3	6	131841	131846	50 %	0 %	50 %	0 %	120537163
141	NC_008739	CA	3	6	132433	132438	50 %	0 %	0 %	50 %	120537164
142	NC_008739	GC	3	6	132444	132449	0 %	0 %	50 %	50 %	120537164
143	NC_008739	GT	3	6	132500	132505	0 %	50 %	50 %	0 %	120537164
144	NC_008739	CT	3	6	133081	133086	0 %	50 %	0 %	50 %	120537165
145	NC_008739	GC	3	6	134761	134766	0 %	0 %	50 %	50 %	120537166
146	NC_008739	CA	3	6	136878	136883	50 %	0 %	0 %	50 %	120537169
147	NC_008739	CG	3	6	138639	138644	0 %	0 %	50 %	50 %	120537171
148	NC_008739	GC	3	6	141975	141980	0 %	0 %	50 %	50 %	120537175
149	NC_008739	CT	3	6	145732	145737	0 %	50 %	0 %	50 %	120537179
150	NC_008739	GC	3	6	147109	147114	0 %	0 %	50 %	50 %	120537182
151	NC_008739	TG	3	6	150087	150092	0 %	50 %	50 %	0 %	120537186
152	NC_008739	GT	3	6	150909	150914	0 %	50 %	50 %	0 %	120537187
153	NC_008739	GC	3	6	151817	151822	0 %	0 %	50 %	50 %	120537188
154	NC_008739	AG	3	6	151934	151939	50 %	0 %	50 %	0 %	120537189
155	NC_008739	TG	3	6	153989	153994	0 %	50 %	50 %	0 %	120537192
156	NC_008739	GC	3	6	154284	154289	0 %	0 %	50 %	50 %	120537192
157	NC_008739	GA	3	6	154548	154553	50 %	0 %	50 %	0 %	120537193
158	NC_008739	TC	3	6	154574	154579	0 %	50 %	0 %	50 %	120537193
159	NC_008739	AT	3	6	157686	157691	50 %	50 %	0 %	0 %	120537195
160	NC_008739	TC	3	6	160260	160265	0 %	50 %	0 %	50 %	120537198
161	NC_008739	TA	3	6	161446	161451	50 %	50 %	0 %	0 %	120537199
162	NC_008739	TG	3	6	161742	161747	0 %	50 %	50 %	0 %	120537199
163	NC_008739	AG	3	6	161893	161898	50 %	0 %	50 %	0 %	120537199
164	NC_008739	GT	3	6	163449	163454	0 %	50 %	50 %	0 %	120537201
165	NC_008739	AG	3	6	163698	163703	50 %	0 %	50 %	0 %	120537202
166	NC_008739	TG	3	6	165683	165688	0 %	50 %	50 %	0 %	120537205
167	NC_008739	GC	3	6	171934	171939	0 %	0 %	50 %	50 %	120537208
168	NC_008739	GT	3	6	173547	173552	0 %	50 %	50 %	0 %	120537209
169	NC_008739	GA	3	6	173874	173879	50 %	0 %	50 %	0 %	120537210
170	NC_008739	CT	3	6	174172	174177	0 %	50 %	0 %	50 %	120537210
171	NC_008739	CA	3	6	175600	175605	50 %	0 %	0 %	50 %	120537213
172	NC_008739	AG	3	6	177992	177997	50 %	0 %	50 %	0 %	120537215
173	NC_008739	TC	3	6	178172	178177	0 %	50 %	0 %	50 %	120537215
174	NC_008739	TC	3	6	178389	178394	0 %	50 %	0 %	50 %	120537216
175	NC_008739	GT	3	6	178466	178471	0 %	50 %	50 %	0 %	120537216
176	NC_008739	TC	3	6	178709	178714	0 %	50 %	0 %	50 %	120537216
177	NC_008739	CT	3	6	180560	180565	0 %	50 %	0 %	50 %	120537216
178	NC_008739	TC	3	6	181049	181054	0 %	50 %	0 %	50 %	120537216
179	NC_008739	CT	3	6	181939	181944	0 %	50 %	0 %	50 %	120537216
180	NC_008739	GC	3	6	184044	184049	0 %	0 %	50 %	50 %	120537217
181	NC_008739	AG	3	6	184480	184485	50 %	0 %	50 %	0 %	120537218
182	NC_008739	GC	3	6	186492	186497	0 %	0 %	50 %	50 %	120537219
183	NC_008739	TG	3	6	186762	186767	0 %	50 %	50 %	0 %	120537219
184	NC_008739	GC	3	6	186868	186873	0 %	0 %	50 %	50 %	120537219
185	NC_008739	CA	3	6	187414	187419	50 %	0 %	0 %	50 %	120537219
186	NC_008739	GT	3	6	187639	187644	0 %	50 %	50 %	0 %	120537219
187	NC_008739	GA	3	6	188303	188308	50 %	0 %	50 %	0 %	120537219
188	NC_008739	CG	3	6	188418	188423	0 %	0 %	50 %	50 %	120537219
189	NC_008739	GT	5	10	188584	188593	0 %	50 %	50 %	0 %	120537219
190	NC_008739	AG	3	6	189208	189213	50 %	0 %	50 %	0 %	120537220
191	NC_008739	TC	3	6	189325	189330	0 %	50 %	0 %	50 %	120537220
192	NC_008739	CG	3	6	189587	189592	0 %	0 %	50 %	50 %	120537220
193	NC_008739	GC	3	6	190971	190976	0 %	0 %	50 %	50 %	120537221
194	NC_008739	TC	3	6	191661	191666	0 %	50 %	0 %	50 %	120537221
195	NC_008739	GA	3	6	193327	193332	50 %	0 %	50 %	0 %	120537222
196	NC_008739	CT	3	6	193578	193583	0 %	50 %	0 %	50 %	120537222
197	NC_008739	AC	3	6	193904	193909	50 %	0 %	0 %	50 %	120537222
198	NC_008739	TC	3	6	193935	193940	0 %	50 %	0 %	50 %	120537222
199	NC_008739	GT	3	6	194494	194499	0 %	50 %	50 %	0 %	120537222
200	NC_008739	GC	3	6	195197	195202	0 %	0 %	50 %	50 %	120537222
201	NC_008739	AG	3	6	195528	195533	50 %	0 %	50 %	0 %	120537222
202	NC_008739	TC	3	6	201525	201530	0 %	50 %	0 %	50 %	120537229
203	NC_008739	TG	3	6	201625	201630	0 %	50 %	50 %	0 %	120537229
204	NC_008739	AC	3	6	205563	205568	50 %	0 %	0 %	50 %	120537233
205	NC_008739	CG	3	6	207228	207233	0 %	0 %	50 %	50 %	120537234
206	NC_008739	GC	3	6	210228	210233	0 %	0 %	50 %	50 %	120537236
207	NC_008739	GC	3	6	210270	210275	0 %	0 %	50 %	50 %	120537236
208	NC_008739	GC	3	6	210380	210385	0 %	0 %	50 %	50 %	120537236

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.