MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU02

Total Repeats: 430

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008739	AATC	2	8	738	745	50 %	25 %	0 %	25 %	120537038
2	NC_008739	TGCT	2	8	778	785	0 %	50 %	25 %	25 %	120537038
3	NC_008739	ATGT	2	8	948	955	25 %	50 %	25 %	0 %	120537038
4	NC_008739	CGGA	2	8	1127	1134	25 %	0 %	50 %	25 %	120537038
5	NC_008739	ACGT	2	8	1426	1433	25 %	25 %	25 %	25 %	120537038
6	NC_008739	TGAA	2	8	2029	2036	50 %	25 %	25 %	0 %	120537039
7	NC_008739	TACG	2	8	2352	2359	25 %	25 %	25 %	25 %	120537039
8	NC_008739	AATC	2	8	2475	2482	50 %	25 %	0 %	25 %	120537039
9	NC_008739	TATG	2	8	3440	3447	25 %	50 %	25 %	0 %	120537040
10	NC_008739	GAAC	2	8	3620	3627	50 %	0 %	25 %	25 %	120537040
11	NC_008739	CGAT	2	8	3763	3770	25 %	25 %	25 %	25 %	120537040
12	NC_008739	TGGT	2	8	5574	5581	0 %	50 %	50 %	0 %	120537042
13	NC_008739	GTCG	2	8	5629	5636	0 %	25 %	50 %	25 %	120537042
14	NC_008739	GTGG	2	8	5656	5663	0 %	25 %	75 %	0 %	120537042
15	NC_008739	CTTC	2	8	5899	5906	0 %	50 %	0 %	50 %	120537043
16	NC_008739	GGAA	2	8	6801	6808	50 %	0 %	50 %	0 %	120537044
17	NC_008739	GTTC	2	8	6975	6982	0 %	50 %	25 %	25 %	120537045
18	NC_008739	CCAG	2	8	7385	7392	25 %	0 %	25 %	50 %	120537045
19	NC_008739	CAGC	2	8	7454	7461	25 %	0 %	25 %	50 %	120537045
20	NC_008739	AGGG	2	8	7669	7676	25 %	0 %	75 %	0 %	120537045
21	NC_008739	CACT	2	8	8389	8396	25 %	25 %	0 %	50 %	120537046
22	NC_008739	TTGC	2	8	8432	8439	0 %	50 %	25 %	25 %	120537046
23	NC_008739	AGAT	2	8	8520	8527	50 %	25 %	25 %	0 %	120537046
24	NC_008739	GACT	2	8	8824	8831	25 %	25 %	25 %	25 %	120537047
25	NC_008739	CGGA	2	8	9194	9201	25 %	0 %	50 %	25 %	120537047
26	NC_008739	TGGG	2	8	9687	9694	0 %	25 %	75 %	0 %	120537048
27	NC_008739	AGCG	2	8	10655	10662	25 %	0 %	50 %	25 %	120537050
28	NC_008739	ATTG	2	8	10964	10971	25 %	50 %	25 %	0 %	120537050
29	NC_008739	CAAA	2	8	11606	11613	75 %	0 %	0 %	25 %	120537051
30	NC_008739	AACC	2	8	11827	11834	50 %	0 %	0 %	50 %	120537051
31	NC_008739	ATGA	2	8	13021	13028	50 %	25 %	25 %	0 %	120537052
32	NC_008739	GACG	2	8	13905	13912	25 %	0 %	50 %	25 %	120537053
33	NC_008739	TGGT	2	8	14639	14646	0 %	50 %	50 %	0 %	120537054
34	NC_008739	TCAA	2	8	14774	14781	50 %	25 %	0 %	25 %	120537054
35	NC_008739	CGGG	2	8	15100	15107	0 %	0 %	75 %	25 %	120537054
36	NC_008739	CCAT	2	8	15356	15363	25 %	25 %	0 %	50 %	120537054
37	NC_008739	CTTC	2	8	16082	16089	0 %	50 %	0 %	50 %	120537055
38	NC_008739	ATCC	2	8	16840	16847	25 %	25 %	0 %	50 %	120537055
39	NC_008739	TTTG	2	8	18149	18156	0 %	75 %	25 %	0 %	120537056
40	NC_008739	GGAA	2	8	18277	18284	50 %	0 %	50 %	0 %	120537056
41	NC_008739	GGGC	2	8	18822	18829	0 %	0 %	75 %	25 %	120537057
42	NC_008739	TCTG	2	8	18918	18925	0 %	50 %	25 %	25 %	120537057
43	NC_008739	GGCT	2	8	19214	19221	0 %	25 %	50 %	25 %	120537057
44	NC_008739	GATC	2	8	19680	19687	25 %	25 %	25 %	25 %	120537057
45	NC_008739	ACCT	2	8	20297	20304	25 %	25 %	0 %	50 %	120537058
46	NC_008739	GCCT	2	8	20415	20422	0 %	25 %	25 %	50 %	120537058
47	NC_008739	GCCA	2	8	20543	20550	25 %	0 %	25 %	50 %	120537058
48	NC_008739	GGCG	2	8	21118	21125	0 %	0 %	75 %	25 %	120537058
49	NC_008739	TTGC	2	8	22308	22315	0 %	50 %	25 %	25 %	120537059
50	NC_008739	CACG	2	8	23456	23463	25 %	0 %	25 %	50 %	120537059
51	NC_008739	GCAC	2	8	23689	23696	25 %	0 %	25 %	50 %	120537059
52	NC_008739	TTCA	2	8	24275	24282	25 %	50 %	0 %	25 %	120537060
53	NC_008739	GGTT	2	8	24307	24314	0 %	50 %	50 %	0 %	120537061
54	NC_008739	CGAA	2	8	24514	24521	50 %	0 %	25 %	25 %	120537061
55	NC_008739	TGGC	2	8	24598	24605	0 %	25 %	50 %	25 %	120537061
56	NC_008739	CACC	2	8	24834	24841	25 %	0 %	0 %	75 %	120537061
57	NC_008739	CGCT	2	8	25291	25298	0 %	25 %	25 %	50 %	120537061
58	NC_008739	CCGG	2	8	26178	26185	0 %	0 %	50 %	50 %	120537062
59	NC_008739	TTCG	2	8	26298	26305	0 %	50 %	25 %	25 %	120537062
60	NC_008739	TTGA	2	8	26397	26404	25 %	50 %	25 %	0 %	120537062
61	NC_008739	ATCG	2	8	26601	26608	25 %	25 %	25 %	25 %	120537062
62	NC_008739	GAGC	2	8	26870	26877	25 %	0 %	50 %	25 %	120537063
63	NC_008739	TTTC	2	8	27419	27426	0 %	75 %	0 %	25 %	120537064
64	NC_008739	CCAC	2	8	27828	27835	25 %	0 %	0 %	75 %	120537064
65	NC_008739	GTTG	2	8	27898	27905	0 %	50 %	50 %	0 %	120537064
66	NC_008739	AGGC	2	8	28654	28661	25 %	0 %	50 %	25 %	120537064
67	NC_008739	TTTC	2	8	28864	28871	0 %	75 %	0 %	25 %	120537064
68	NC_008739	TGGT	2	8	29114	29121	0 %	50 %	50 %	0 %	120537064
69	NC_008739	GAAC	2	8	30252	30259	50 %	0 %	25 %	25 %	120537064
70	NC_008739	CGTT	2	8	31960	31967	0 %	50 %	25 %	25 %	120537066
71	NC_008739	TCGA	2	8	32158	32165	25 %	25 %	25 %	25 %	120537066
72	NC_008739	CATT	2	8	34869	34876	25 %	50 %	0 %	25 %	120537071
73	NC_008739	CCTG	2	8	34963	34970	0 %	25 %	25 %	50 %	120537071
74	NC_008739	CGTT	2	8	35017	35024	0 %	50 %	25 %	25 %	120537071
75	NC_008739	CTGG	2	8	35570	35577	0 %	25 %	50 %	25 %	120537072
76	NC_008739	GCTG	2	8	35862	35869	0 %	25 %	50 %	25 %	120537072
77	NC_008739	CGGC	2	8	35963	35970	0 %	0 %	50 %	50 %	120537072
78	NC_008739	TGTT	2	8	36485	36492	0 %	75 %	25 %	0 %	120537072
79	NC_008739	GGAT	2	8	38003	38010	25 %	25 %	50 %	0 %	120537073
80	NC_008739	ATTC	2	8	38097	38104	25 %	50 %	0 %	25 %	120537073
81	NC_008739	TTCA	2	8	38410	38417	25 %	50 %	0 %	25 %	120537073
82	NC_008739	TAGA	2	8	39251	39258	50 %	25 %	25 %	0 %	120537074
83	NC_008739	TCCA	2	8	39668	39675	25 %	25 %	0 %	50 %	120537074
84	NC_008739	CGGC	2	8	39878	39885	0 %	0 %	50 %	50 %	120537074
85	NC_008739	ATGG	2	8	40195	40202	25 %	25 %	50 %	0 %	120537074
86	NC_008739	TGAA	2	8	40523	40530	50 %	25 %	25 %	0 %	120537074
87	NC_008739	GCAG	2	8	40611	40618	25 %	0 %	50 %	25 %	120537074
88	NC_008739	GTTC	2	8	40820	40827	0 %	50 %	25 %	25 %	120537075
89	NC_008739	TTCA	2	8	41639	41646	25 %	50 %	0 %	25 %	120537076
90	NC_008739	ACGA	2	8	41768	41775	50 %	0 %	25 %	25 %	120537076
91	NC_008739	ATCC	2	8	43001	43008	25 %	25 %	0 %	50 %	120537078
92	NC_008739	AATG	2	8	43082	43089	50 %	25 %	25 %	0 %	120537078
93	NC_008739	CCCG	2	8	43299	43306	0 %	0 %	25 %	75 %	120537078
94	NC_008739	CTTT	2	8	43412	43419	0 %	75 %	0 %	25 %	120537078
95	NC_008739	GACT	2	8	43433	43440	25 %	25 %	25 %	25 %	120537078
96	NC_008739	GATT	2	8	44244	44251	25 %	50 %	25 %	0 %	120537079
97	NC_008739	GATA	2	8	44927	44934	50 %	25 %	25 %	0 %	120537080
98	NC_008739	TGGA	2	8	44998	45005	25 %	25 %	50 %	0 %	120537080
99	NC_008739	TCGA	2	8	45044	45051	25 %	25 %	25 %	25 %	120537080
100	NC_008739	AAGC	2	8	45775	45782	50 %	0 %	25 %	25 %	120537081
101	NC_008739	GAAA	2	8	46800	46807	75 %	0 %	25 %	0 %	120537082
102	NC_008739	GGAT	2	8	47560	47567	25 %	25 %	50 %	0 %	120537083
103	NC_008739	AGAA	2	8	47906	47913	75 %	0 %	25 %	0 %	120537083
104	NC_008739	TAAC	2	8	48846	48853	50 %	25 %	0 %	25 %	120537084
105	NC_008739	ACGT	2	8	48887	48894	25 %	25 %	25 %	25 %	120537084
106	NC_008739	TCTT	2	8	48993	49000	0 %	75 %	0 %	25 %	120537084
107	NC_008739	CTTG	2	8	49878	49885	0 %	50 %	25 %	25 %	120537085
108	NC_008739	TTCA	2	8	50113	50120	25 %	50 %	0 %	25 %	120537085
109	NC_008739	AGGC	2	8	50159	50166	25 %	0 %	50 %	25 %	120537085
110	NC_008739	AAGC	2	8	50368	50375	50 %	0 %	25 %	25 %	120537085
111	NC_008739	TATC	2	8	50730	50737	25 %	50 %	0 %	25 %	120537085
112	NC_008739	CTTT	2	8	50742	50749	0 %	75 %	0 %	25 %	120537085
113	NC_008739	CAAA	2	8	51066	51073	75 %	0 %	0 %	25 %	120537086
114	NC_008739	TTTG	2	8	51664	51671	0 %	75 %	25 %	0 %	120537086
115	NC_008739	CTTT	2	8	51739	51746	0 %	75 %	0 %	25 %	120537086
116	NC_008739	AACT	2	8	53851	53858	50 %	25 %	0 %	25 %	120537087
117	NC_008739	AACA	2	8	53988	53995	75 %	0 %	0 %	25 %	120537087
118	NC_008739	AACT	2	8	54904	54911	50 %	25 %	0 %	25 %	120537087
119	NC_008739	GCCA	2	8	54949	54956	25 %	0 %	25 %	50 %	120537087
120	NC_008739	TACT	2	8	55626	55633	25 %	50 %	0 %	25 %	120537087
121	NC_008739	CAAG	2	8	56072	56079	50 %	0 %	25 %	25 %	120537088
122	NC_008739	TGGT	2	8	56119	56126	0 %	50 %	50 %	0 %	120537088
123	NC_008739	TCGT	2	8	56847	56854	0 %	50 %	25 %	25 %	120537090
124	NC_008739	AGAT	2	8	58146	58153	50 %	25 %	25 %	0 %	120537092
125	NC_008739	TCGT	2	8	58962	58969	0 %	50 %	25 %	25 %	120537092
126	NC_008739	GATA	2	8	59153	59160	50 %	25 %	25 %	0 %	120537093
127	NC_008739	CTGC	2	8	59724	59731	0 %	25 %	25 %	50 %	120537094
128	NC_008739	GGCA	2	8	59794	59801	25 %	0 %	50 %	25 %	120537094
129	NC_008739	GATC	2	8	60372	60379	25 %	25 %	25 %	25 %	120537095
130	NC_008739	AGCA	2	8	61357	61364	50 %	0 %	25 %	25 %	120537097
131	NC_008739	TGGC	2	8	61720	61727	0 %	25 %	50 %	25 %	120537097
132	NC_008739	CAGC	2	8	61758	61765	25 %	0 %	25 %	50 %	120537097
133	NC_008739	ACTG	2	8	62939	62946	25 %	25 %	25 %	25 %	120537098
134	NC_008739	ACTG	2	8	63640	63647	25 %	25 %	25 %	25 %	120537099
135	NC_008739	ACTT	2	8	63755	63762	25 %	50 %	0 %	25 %	120537099
136	NC_008739	GGTT	2	8	63856	63863	0 %	50 %	50 %	0 %	120537099
137	NC_008739	AATA	2	8	64311	64318	75 %	25 %	0 %	0 %	120537100
138	NC_008739	ATTG	2	8	64487	64494	25 %	50 %	25 %	0 %	120537100
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.