MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	TCAGC	2	10	2948	2957	20 %	20 %	20 %	40 %	120536824
2	NC_008738	GCCGT	2	10	7499	7508	0 %	20 %	40 %	40 %	120536831
3	NC_008738	GATCG	2	10	14721	14730	20 %	20 %	40 %	20 %	120536836
4	NC_008738	CCGCA	2	10	15523	15532	20 %	0 %	20 %	60 %	120536837
5	NC_008738	TCCGG	2	10	18656	18665	0 %	20 %	40 %	40 %	120536840
6	NC_008738	CCAGA	2	10	18991	19000	40 %	0 %	20 %	40 %	120536840
7	NC_008738	TTGCT	2	10	22085	22094	0 %	60 %	20 %	20 %	120536843
8	NC_008738	GAGCA	2	10	22228	22237	40 %	0 %	40 %	20 %	120536843
9	NC_008738	GTGCC	2	10	24404	24413	0 %	20 %	40 %	40 %	120536847
10	NC_008738	GGCTC	2	10	27236	27245	0 %	20 %	40 %	40 %	120536849
11	NC_008738	GACCC	2	10	31156	31165	20 %	0 %	20 %	60 %	120536853
12	NC_008738	CCAGC	2	10	31849	31858	20 %	0 %	20 %	60 %	120536853
13	NC_008738	TGGCC	2	10	33516	33525	0 %	20 %	40 %	40 %	120536855
14	NC_008738	CACCG	2	10	35971	35980	20 %	0 %	20 %	60 %	120536858
15	NC_008738	GGCGC	2	10	36577	36586	0 %	0 %	60 %	40 %	120536859
16	NC_008738	CCGGG	2	10	36817	36826	0 %	0 %	60 %	40 %	120536860
17	NC_008738	TGGGC	2	10	38472	38481	0 %	20 %	60 %	20 %	120536861
18	NC_008738	GCCGG	2	10	40204	40213	0 %	0 %	60 %	40 %	120536863
19	NC_008738	GGAAG	2	10	42751	42760	40 %	0 %	60 %	0 %	120536866
20	NC_008738	GGCAA	2	10	43629	43638	40 %	0 %	40 %	20 %	120536866
21	NC_008738	GAACA	2	10	44927	44936	60 %	0 %	20 %	20 %	120536866
22	NC_008738	CATTG	2	10	48478	48487	20 %	40 %	20 %	20 %	120536869
23	NC_008738	TACCG	2	10	51426	51435	20 %	20 %	20 %	40 %	120536873
24	NC_008738	CTCCG	2	10	53355	53364	0 %	20 %	20 %	60 %	120536874
25	NC_008738	AACCA	2	10	57458	57467	60 %	0 %	0 %	40 %	120536879
26	NC_008738	GAATC	2	10	59264	59273	40 %	20 %	20 %	20 %	120536881
27	NC_008738	CCCTG	2	10	60518	60527	0 %	20 %	20 %	60 %	120536882
28	NC_008738	GGCAA	2	10	61106	61115	40 %	0 %	40 %	20 %	120536883
29	NC_008738	CCCCG	2	10	61618	61627	0 %	0 %	20 %	80 %	120536883
30	NC_008738	AAAGG	2	10	61900	61909	60 %	0 %	40 %	0 %	120536883
31	NC_008738	CAGGG	2	10	64298	64307	20 %	0 %	60 %	20 %	120536885
32	NC_008738	TTGCA	2	10	64637	64646	20 %	40 %	20 %	20 %	120536885
33	NC_008738	GCCTC	2	10	65403	65412	0 %	20 %	20 %	60 %	120536886
34	NC_008738	AGGGG	2	10	68166	68175	20 %	0 %	80 %	0 %	120536887
35	NC_008738	ATGCC	2	10	72260	72269	20 %	20 %	20 %	40 %	120536891
36	NC_008738	GACCA	2	10	73463	73472	40 %	0 %	20 %	40 %	120536891
37	NC_008738	AAAGT	2	10	79090	79099	60 %	20 %	20 %	0 %	120536892
38	NC_008738	AACCA	2	10	80070	80079	60 %	0 %	0 %	40 %	120536893
39	NC_008738	TGCGC	2	10	82727	82736	0 %	20 %	40 %	40 %	120536895
40	NC_008738	TGGTG	2	10	82953	82962	0 %	40 %	60 %	0 %	120536895
41	NC_008738	CGAAC	2	10	83607	83616	40 %	0 %	20 %	40 %	120536895
42	NC_008738	GCAAG	2	10	84143	84152	40 %	0 %	40 %	20 %	120536896
43	NC_008738	TCCGA	2	10	85776	85785	20 %	20 %	20 %	40 %	120536898
44	NC_008738	AGCAC	2	10	93632	93641	40 %	0 %	20 %	40 %	120536905
45	NC_008738	CGGCC	2	10	94611	94620	0 %	0 %	40 %	60 %	120536906
46	NC_008738	ACATC	2	10	95330	95339	40 %	20 %	0 %	40 %	120536906
47	NC_008738	TGATT	2	10	97399	97408	20 %	60 %	20 %	0 %	120536908
48	NC_008738	AGTTG	2	10	103597	103606	20 %	40 %	40 %	0 %	120536913
49	NC_008738	TAACG	2	10	108543	108552	40 %	20 %	20 %	20 %	120536917
50	NC_008738	GGGAG	2	10	110283	110292	20 %	0 %	80 %	0 %	120536920
51	NC_008738	CCGGT	2	10	112134	112143	0 %	20 %	40 %	40 %	120536921
52	NC_008738	GCCAA	2	10	113770	113779	40 %	0 %	20 %	40 %	120536923
53	NC_008738	AGGGG	2	10	114265	114274	20 %	0 %	80 %	0 %	120536923
54	NC_008738	AAAGC	2	10	114392	114401	60 %	0 %	20 %	20 %	120536923
55	NC_008738	GAACG	2	10	114554	114563	40 %	0 %	40 %	20 %	120536923
56	NC_008738	GAAAA	2	10	116044	116053	80 %	0 %	20 %	0 %	120536925
57	NC_008738	CAGTG	2	10	118706	118715	20 %	20 %	40 %	20 %	120536929
58	NC_008738	CATCA	2	10	119442	119451	40 %	20 %	0 %	40 %	120536930
59	NC_008738	AAGCC	2	10	128332	128341	40 %	0 %	20 %	40 %	120536939
60	NC_008738	TCCCT	2	10	130815	130824	0 %	40 %	0 %	60 %	120536940
61	NC_008738	GGTTC	2	10	137286	137295	0 %	40 %	40 %	20 %	120536947
62	NC_008738	ACGGT	2	10	137477	137486	20 %	20 %	40 %	20 %	120536947
63	NC_008738	CGAGG	2	10	141606	141615	20 %	0 %	60 %	20 %	120536950
64	NC_008738	AGCAT	2	10	143937	143946	40 %	20 %	20 %	20 %	120536952
65	NC_008738	ACGGG	2	10	147533	147542	20 %	0 %	60 %	20 %	120536956
66	NC_008738	TCGGT	2	10	148163	148172	0 %	40 %	40 %	20 %	120536957
67	NC_008738	TGCCC	2	10	149121	149130	0 %	20 %	20 %	60 %	120536957
68	NC_008738	GATCA	2	10	150025	150034	40 %	20 %	20 %	20 %	120536957
69	NC_008738	CAAAC	2	10	151919	151928	60 %	0 %	0 %	40 %	120536958
70	NC_008738	GGCGG	2	10	155965	155974	0 %	0 %	80 %	20 %	120536960
71	NC_008738	CGCCA	2	10	157925	157934	20 %	0 %	20 %	60 %	120536961
72	NC_008738	ACAAA	2	10	159440	159449	80 %	0 %	0 %	20 %	120536961
73	NC_008738	GCTTT	2	10	162690	162699	0 %	60 %	20 %	20 %	120536966
74	NC_008738	GAAAA	2	10	170386	170395	80 %	0 %	20 %	0 %	120536967
75	NC_008738	CCTCG	2	10	170856	170865	0 %	20 %	20 %	60 %	120536967
76	NC_008738	GGCGT	2	10	171187	171196	0 %	20 %	60 %	20 %	120536967
77	NC_008738	ACCAA	2	10	171291	171300	60 %	0 %	0 %	40 %	120536968
78	NC_008738	GATTT	2	10	172551	172560	20 %	60 %	20 %	0 %	120536969
79	NC_008738	TGCAT	2	10	174526	174535	20 %	40 %	20 %	20 %	120536971
80	NC_008738	TCGGC	2	10	175125	175134	0 %	20 %	40 %	40 %	120536971
81	NC_008738	CTTTG	2	10	175698	175707	0 %	60 %	20 %	20 %	120536972
82	NC_008738	ATGAA	2	10	177133	177142	60 %	20 %	20 %	0 %	120536973
83	NC_008738	AGAGA	2	10	178367	178376	60 %	0 %	40 %	0 %	120536973
84	NC_008738	ACCCA	2	10	182297	182306	40 %	0 %	0 %	60 %	120536977
85	NC_008738	TCAAG	2	10	183115	183124	40 %	20 %	20 %	20 %	120536978
86	NC_008738	AATGG	2	10	183444	183453	40 %	20 %	40 %	0 %	120536978
87	NC_008738	CGCCC	2	10	186096	186105	0 %	0 %	20 %	80 %	120536981
88	NC_008738	GCGAC	2	10	186712	186721	20 %	0 %	40 %	40 %	120536982
89	NC_008738	CAAGC	2	10	190432	190441	40 %	0 %	20 %	40 %	120536983
90	NC_008738	GCGCT	2	10	191258	191267	0 %	20 %	40 %	40 %	120536984
91	NC_008738	GAATC	2	10	194616	194625	40 %	20 %	20 %	20 %	120536987
92	NC_008738	CAGAG	2	10	198050	198059	40 %	0 %	40 %	20 %	120536991
93	NC_008738	AAGGG	2	10	201871	201880	40 %	0 %	60 %	0 %	120536993
94	NC_008738	GGACT	2	10	202105	202114	20 %	20 %	40 %	20 %	120536993
95	NC_008738	TCACC	2	10	205965	205974	20 %	20 %	0 %	60 %	120536998
96	NC_008738	ACTCG	2	10	211407	211416	20 %	20 %	20 %	40 %	120537004
97	NC_008738	CAGCC	2	10	212234	212243	20 %	0 %	20 %	60 %	120537005
98	NC_008738	GCGCA	2	10	213472	213481	20 %	0 %	40 %	40 %	120537007
99	NC_008738	TCACT	2	10	214818	214827	20 %	40 %	0 %	40 %	120537008
100	NC_008738	GATCA	2	10	216813	216822	40 %	20 %	20 %	20 %	120537011
101	NC_008738	ATACG	2	10	218639	218648	40 %	20 %	20 %	20 %	120537014
102	NC_008738	GATCA	2	10	218915	218924	40 %	20 %	20 %	20 %	120537014
103	NC_008738	AGATC	2	10	219058	219067	40 %	20 %	20 %	20 %	120537014
104	NC_008738	CAAGG	2	10	220422	220431	40 %	0 %	40 %	20 %	120537016
105	NC_008738	CCTGC	2	10	221036	221045	0 %	20 %	20 %	60 %	120537016
106	NC_008738	GCAAG	2	10	225286	225295	40 %	0 %	40 %	20 %	120537020
107	NC_008738	ACCCA	2	10	227003	227012	40 %	0 %	0 %	60 %	120537023
108	NC_008738	CAAGC	2	10	230138	230147	40 %	0 %	20 %	40 %	120537027
109	NC_008738	GCTGA	2	10	232578	232587	20 %	20 %	40 %	20 %	120537031
110	NC_008738	ACACC	2	10	232975	232984	40 %	0 %	0 %	60 %	120537031
111	NC_008738	TGACA	2	10	235268	235277	40 %	20 %	20 %	20 %	120537033
112	NC_008738	CAAGC	2	10	236448	236457	40 %	0 %	20 %	40 %	120537035
113	NC_008738	ATGAA	2	10	237793	237802	60 %	20 %	20 %	0 %	120537035
114	NC_008738	GACAC	2	10	238348	238357	40 %	0 %	20 %	40 %	120537036

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.