MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 4965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008726	ATCTC	2	10	1411	1420	20 %	40 %	0 %	40 %	120401029
2	NC_008726	ACCAC	2	10	1615	1624	40 %	0 %	0 %	60 %	120401029
3	NC_008726	CGCGG	2	10	3668	3677	0 %	0 %	60 %	40 %	120401031
4	NC_008726	CATCT	2	10	6519	6528	20 %	40 %	0 %	40 %	120401034
5	NC_008726	AAGTC	2	10	7525	7534	40 %	20 %	20 %	20 %	120401034
6	NC_008726	GCAGC	2	10	8108	8117	20 %	0 %	40 %	40 %	120401034
7	NC_008726	GCCGC	2	10	8170	8179	0 %	0 %	40 %	60 %	120401034
8	NC_008726	GCAGC	2	10	8523	8532	20 %	0 %	40 %	40 %	120401035
9	NC_008726	GCTGT	2	10	11698	11707	0 %	40 %	40 %	20 %	120401035
10	NC_008726	CGGGC	2	10	12389	12398	0 %	0 %	60 %	40 %	120401036
11	NC_008726	CCGAA	2	10	12567	12576	40 %	0 %	20 %	40 %	120401036
12	NC_008726	CGTGC	2	10	12745	12754	0 %	20 %	40 %	40 %	120401036
13	NC_008726	GTCGC	2	10	15260	15269	0 %	20 %	40 %	40 %	120401039
14	NC_008726	CTCGT	2	10	15290	15299	0 %	40 %	20 %	40 %	120401039
15	NC_008726	CGGCA	2	10	15588	15597	20 %	0 %	40 %	40 %	120401039
16	NC_008726	CCGTG	2	10	16127	16136	0 %	20 %	40 %	40 %	120401040
17	NC_008726	GCTGG	2	10	16569	16578	0 %	20 %	60 %	20 %	120401040
18	NC_008726	GCTGT	2	10	17321	17330	0 %	40 %	40 %	20 %	120401041
19	NC_008726	GCGTG	2	10	18527	18536	0 %	20 %	60 %	20 %	120401042
20	NC_008726	TCCAG	2	10	18861	18870	20 %	20 %	20 %	40 %	120401042
21	NC_008726	GCCTC	2	10	19455	19464	0 %	20 %	20 %	60 %	120401042
22	NC_008726	ACCGA	2	10	19916	19925	40 %	0 %	20 %	40 %	120401042
23	NC_008726	CGTTG	2	10	20649	20658	0 %	40 %	40 %	20 %	120401043
24	NC_008726	CGACT	2	10	21988	21997	20 %	20 %	20 %	40 %	120401044
25	NC_008726	CGGGC	2	10	22797	22806	0 %	0 %	60 %	40 %	120401046
26	NC_008726	GTCCG	2	10	23474	23483	0 %	20 %	40 %	40 %	120401047
27	NC_008726	GCTGG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	60 %	20 %	120401049
28	NC_008726	GGCGT	2	10	26229	26238	0 %	20 %	60 %	20 %	120401050
29	NC_008726	TTCTG	2	10	28489	28498	0 %	60 %	20 %	20 %	120401052
30	NC_008726	CCGTG	2	10	30054	30063	0 %	20 %	40 %	40 %	120401053
31	NC_008726	CGGTG	2	10	32879	32888	0 %	20 %	60 %	20 %	120401055
32	NC_008726	TGGCG	2	10	34458	34467	0 %	20 %	60 %	20 %	120401056
33	NC_008726	CACCG	2	10	34657	34666	20 %	0 %	20 %	60 %	120401056
34	NC_008726	GCGGG	2	10	35729	35738	0 %	0 %	80 %	20 %	120401057
35	NC_008726	GACGT	2	10	35931	35940	20 %	20 %	40 %	20 %	120401057
36	NC_008726	GCCGT	2	10	37821	37830	0 %	20 %	40 %	40 %	120401059
37	NC_008726	TGCAG	2	10	38318	38327	20 %	20 %	40 %	20 %	120401060
38	NC_008726	ACCTG	2	10	40829	40838	20 %	20 %	20 %	40 %	120401061
39	NC_008726	CCACG	2	10	41174	41183	20 %	0 %	20 %	60 %	120401061
40	NC_008726	GGAAG	2	10	42269	42278	40 %	0 %	60 %	0 %	120401062
41	NC_008726	ATCTC	2	10	43328	43337	20 %	40 %	0 %	40 %	120401063
42	NC_008726	ATGAC	2	10	44549	44558	40 %	20 %	20 %	20 %	120401064
43	NC_008726	GCTGC	2	10	45321	45330	0 %	20 %	40 %	40 %	120401064
44	NC_008726	CCGGA	2	10	45783	45792	20 %	0 %	40 %	40 %	120401065
45	NC_008726	AGGCG	2	10	47969	47978	20 %	0 %	60 %	20 %	120401065
46	NC_008726	TGCGC	2	10	48059	48068	0 %	20 %	40 %	40 %	120401065
47	NC_008726	CCCGA	2	10	51939	51948	20 %	0 %	20 %	60 %	120401068
48	NC_008726	TCTGC	2	10	52375	52384	0 %	40 %	20 %	40 %	120401068
49	NC_008726	ACCAC	2	10	52724	52733	40 %	0 %	0 %	60 %	120401068
50	NC_008726	CGCTG	2	10	52997	53006	0 %	20 %	40 %	40 %	120401069
51	NC_008726	CCCGA	2	10	53473	53482	20 %	0 %	20 %	60 %	120401069
52	NC_008726	GCGCG	2	10	55421	55430	0 %	0 %	60 %	40 %	120401070
53	NC_008726	CGCCC	2	10	55475	55484	0 %	0 %	20 %	80 %	120401070
54	NC_008726	GCCGT	2	10	56005	56014	0 %	20 %	40 %	40 %	120401070
55	NC_008726	CCTGG	2	10	56640	56649	0 %	20 %	40 %	40 %	120401071
56	NC_008726	CCGGG	2	10	56944	56953	0 %	0 %	60 %	40 %	120401071
57	NC_008726	TCCGA	2	10	58552	58561	20 %	20 %	20 %	40 %	120401073
58	NC_008726	CACCC	2	10	60953	60962	20 %	0 %	0 %	80 %	120401075
59	NC_008726	CGCGG	2	10	62422	62431	0 %	0 %	60 %	40 %	120401077
60	NC_008726	CGATG	2	10	63968	63977	20 %	20 %	40 %	20 %	120401079
61	NC_008726	TCGGC	2	10	65061	65070	0 %	20 %	40 %	40 %	120401079
62	NC_008726	CAGCG	2	10	65572	65581	20 %	0 %	40 %	40 %	120401080
63	NC_008726	GGGCA	2	10	66455	66464	20 %	0 %	60 %	20 %	120401080
64	NC_008726	CCAGC	2	10	66926	66935	20 %	0 %	20 %	60 %	120401081
65	NC_008726	CCAGC	2	10	67475	67484	20 %	0 %	20 %	60 %	120401082
66	NC_008726	GCAGC	2	10	68043	68052	20 %	0 %	40 %	40 %	120401082
67	NC_008726	CGCTG	2	10	68709	68718	0 %	20 %	40 %	40 %	120401083
68	NC_008726	TCGGC	2	10	69577	69586	0 %	20 %	40 %	40 %	120401084
69	NC_008726	GCTGC	2	10	70546	70555	0 %	20 %	40 %	40 %	120401086
70	NC_008726	CCGGG	2	10	72628	72637	0 %	0 %	60 %	40 %	120401090
71	NC_008726	TGCAC	2	10	73666	73675	20 %	20 %	20 %	40 %	120401091
72	NC_008726	TGGCC	2	10	75907	75916	0 %	20 %	40 %	40 %	120401094
73	NC_008726	CGTCG	2	10	77476	77485	0 %	20 %	40 %	40 %	120401096
74	NC_008726	CGCAC	2	10	77581	77590	20 %	0 %	20 %	60 %	120401096
75	NC_008726	TCGCC	2	10	78233	78242	0 %	20 %	20 %	60 %	120401097
76	NC_008726	CCGAT	2	10	78437	78446	20 %	20 %	20 %	40 %	120401097
77	NC_008726	GCAGA	2	10	79857	79866	40 %	0 %	40 %	20 %	120401098
78	NC_008726	TCGGC	2	10	80355	80364	0 %	20 %	40 %	40 %	120401099
79	NC_008726	CGATG	2	10	81060	81069	20 %	20 %	40 %	20 %	120401100
80	NC_008726	CCGAA	2	10	81785	81794	40 %	0 %	20 %	40 %	120401100
81	NC_008726	ACGCC	2	10	82850	82859	20 %	0 %	20 %	60 %	120401101
82	NC_008726	ACACG	2	10	83835	83844	40 %	0 %	20 %	40 %	120401101
83	NC_008726	GGCTC	2	10	84403	84412	0 %	20 %	40 %	40 %	120401102
84	NC_008726	TGTCG	2	10	85770	85779	0 %	40 %	40 %	20 %	120401102
85	NC_008726	GGCTG	2	10	86134	86143	0 %	20 %	60 %	20 %	120401102
86	NC_008726	ACCGG	2	10	86563	86572	20 %	0 %	40 %	40 %	120401103
87	NC_008726	TCGGG	2	10	86638	86647	0 %	20 %	60 %	20 %	120401103
88	NC_008726	CGGGC	2	10	86961	86970	0 %	0 %	60 %	40 %	120401103
89	NC_008726	CGGCA	2	10	88153	88162	20 %	0 %	40 %	40 %	120401104
90	NC_008726	TCCCA	2	10	88416	88425	20 %	20 %	0 %	60 %	120401105
91	NC_008726	GGTGC	2	10	88483	88492	0 %	20 %	60 %	20 %	120401105
92	NC_008726	GCGCC	2	10	90887	90896	0 %	0 %	40 %	60 %	120401108
93	NC_008726	GTCCG	2	10	91022	91031	0 %	20 %	40 %	40 %	120401108
94	NC_008726	CGGCG	2	10	93726	93735	0 %	0 %	60 %	40 %	120401110
95	NC_008726	TGGAT	2	10	94955	94964	20 %	40 %	40 %	0 %	120401112
96	NC_008726	CGCTG	2	10	95741	95750	0 %	20 %	40 %	40 %	120401113
97	NC_008726	GATTG	2	10	97919	97928	20 %	40 %	40 %	0 %	120401114
98	NC_008726	CTGCT	2	10	97929	97938	0 %	40 %	20 %	40 %	120401114
99	NC_008726	GTGGA	2	10	98641	98650	20 %	20 %	60 %	0 %	120401114
100	NC_008726	CCGCC	2	10	100186	100195	0 %	0 %	20 %	80 %	120401116
101	NC_008726	GACCA	2	10	101019	101028	40 %	0 %	20 %	40 %	120401116
102	NC_008726	CAGCG	2	10	104272	104281	20 %	0 %	40 %	40 %	120401119
103	NC_008726	CTCAC	2	10	110307	110316	20 %	20 %	0 %	60 %	120401125
104	NC_008726	CCGGC	2	10	110384	110393	0 %	0 %	40 %	60 %	120401125
105	NC_008726	GCGCG	2	10	113002	113011	0 %	0 %	60 %	40 %	120401127
106	NC_008726	TCCGG	2	10	113029	113038	0 %	20 %	40 %	40 %	120401127
107	NC_008726	GCCGA	2	10	114012	114021	20 %	0 %	40 %	40 %	120401128
108	NC_008726	CGCGC	2	10	114891	114900	0 %	0 %	40 %	60 %	120401128
109	NC_008726	GGACT	2	10	117790	117799	20 %	20 %	40 %	20 %	120401132
110	NC_008726	CCGAC	3	15	119920	119934	20 %	0 %	20 %	60 %	120401133
111	NC_008726	GGCCA	2	10	120514	120523	20 %	0 %	40 %	40 %	120401134
112	NC_008726	CGATC	2	10	121571	121580	20 %	20 %	20 %	40 %	120401135
113	NC_008726	GGGTG	2	10	121719	121728	0 %	20 %	80 %	0 %	120401135
114	NC_008726	CGTGC	2	10	123075	123084	0 %	20 %	40 %	40 %	120401137
115	NC_008726	GCGTG	2	10	123569	123578	0 %	20 %	60 %	20 %	120401138
116	NC_008726	GCGCC	2	10	124532	124541	0 %	0 %	40 %	60 %	120401139
117	NC_008726	CCGGC	2	10	125691	125700	0 %	0 %	40 %	60 %	120401141
118	NC_008726	GTCCG	2	10	125889	125898	0 %	20 %	40 %	40 %	120401141
119	NC_008726	AGGTC	2	10	126031	126040	20 %	20 %	40 %	20 %	120401141
120	NC_008726	GCACG	2	10	127476	127485	20 %	0 %	40 %	40 %	120401143
121	NC_008726	CCGAG	2	10	127488	127497	20 %	0 %	40 %	40 %	120401143
122	NC_008726	GCACG	2	10	127515	127524	20 %	0 %	40 %	40 %	120401143
123	NC_008726	CGGTG	2	10	127534	127543	0 %	20 %	60 %	20 %	120401143
124	NC_008726	GGCCT	2	10	129674	129683	0 %	20 %	40 %	40 %	120401145
125	NC_008726	TCCGG	2	10	129952	129961	0 %	20 %	40 %	40 %	120401145
126	NC_008726	GACCC	2	10	131485	131494	20 %	0 %	20 %	60 %	120401146
127	NC_008726	CGGCG	2	10	131620	131629	0 %	0 %	60 %	40 %	120401146
128	NC_008726	CGGGG	2	10	134376	134385	0 %	0 %	80 %	20 %	120401148
129	NC_008726	GTGGC	2	10	135302	135311	0 %	20 %	60 %	20 %	120401149
130	NC_008726	CGCGC	2	10	135321	135330	0 %	0 %	40 %	60 %	120401149
131	NC_008726	TCTCG	2	10	136124	136133	0 %	40 %	20 %	40 %	120401150
132	NC_008726	AGGCC	2	10	143290	143299	20 %	0 %	40 %	40 %	120401159
133	NC_008726	TCCTG	2	10	143320	143329	0 %	40 %	20 %	40 %	120401159
134	NC_008726	ACCGC	2	10	144075	144084	20 %	0 %	20 %	60 %	120401159
135	NC_008726	CGATC	2	10	144725	144734	20 %	20 %	20 %	40 %	120401160
136	NC_008726	ACGTC	2	10	146407	146416	20 %	20 %	20 %	40 %	120401162
137	NC_008726	CCGAT	2	10	147903	147912	20 %	20 %	20 %	40 %	120401163
138	NC_008726	GTCCC	2	10	149462	149471	0 %	20 %	20 %	60 %	120401164
139	NC_008726	CCCGG	2	10	149725	149734	0 %	0 %	40 %	60 %	120401164
140	NC_008726	GTCCG	2	10	151413	151422	0 %	20 %	40 %	40 %	120401165
141	NC_008726	TCGAC	2	10	152074	152083	20 %	20 %	20 %	40 %	120401166
142	NC_008726	CATCG	2	10	153275	153284	20 %	20 %	20 %	40 %	120401167
143	NC_008726	ACCCC	2	10	154241	154250	20 %	0 %	0 %	80 %	120401168
144	NC_008726	GGACG	2	10	154630	154639	20 %	0 %	60 %	20 %	120401168
145	NC_008726	ACCGG	2	10	155583	155592	20 %	0 %	40 %	40 %	120401169
146	NC_008726	GCCCG	2	10	155761	155770	0 %	0 %	40 %	60 %	120401170
147	NC_008726	CGTCG	2	10	156598	156607	0 %	20 %	40 %	40 %	120401171
148	NC_008726	CGTCC	2	10	159042	159051	0 %	20 %	20 %	60 %	120401174
149	NC_008726	AGCGG	2	10	159564	159573	20 %	0 %	60 %	20 %	120401174
150	NC_008726	CTCGG	2	10	159715	159724	0 %	20 %	40 %	40 %	120401174
151	NC_008726	ACCGC	2	10	160275	160284	20 %	0 %	20 %	60 %	120401175
152	NC_008726	GAGCA	2	10	161243	161252	40 %	0 %	40 %	20 %	120401176
153	NC_008726	CGTCG	2	10	164801	164810	0 %	20 %	40 %	40 %	120401180
154	NC_008726	GACGG	2	10	169493	169502	20 %	0 %	60 %	20 %	120401186
155	NC_008726	GAGCG	2	10	170955	170964	20 %	0 %	60 %	20 %	120401188
156	NC_008726	GTTCC	2	10	171693	171702	0 %	40 %	20 %	40 %	120401188
157	NC_008726	GCCGG	2	10	172538	172547	0 %	0 %	60 %	40 %	120401189
158	NC_008726	CCGGC	2	10	172636	172645	0 %	0 %	40 %	60 %	120401189
159	NC_008726	CACGC	2	10	172895	172904	20 %	0 %	20 %	60 %	120401189
160	NC_008726	ATCCG	2	10	177553	177562	20 %	20 %	20 %	40 %	120401195
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164	NC_008726	GAGCG	2	10	183754	183763	20 %	0 %	60 %	20 %	120401202
165	NC_008726	GCCGG	2	10	184260	184269	0 %	0 %	60 %	40 %	120401204
166	NC_008726	GTCTC	2	10	184459	184468	0 %	40 %	20 %	40 %	120401204
167	NC_008726	GCGCC	2	10	189183	189192	0 %	0 %	40 %	60 %	120401209
168	NC_008726	AGACC	2	10	191823	191832	40 %	0 %	20 %	40 %	120401211
169	NC_008726	CCGAT	2	10	193049	193058	20 %	20 %	20 %	40 %	120401212
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176	NC_008726	GCTGG	2	10	199714	199723	0 %	20 %	60 %	20 %	120401219
177	NC_008726	CCGGC	2	10	199731	199740	0 %	0 %	40 %	60 %	120401219
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187	NC_008726	GCATC	2	10	211303	211312	20 %	20 %	20 %	40 %	120401228
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199	NC_008726	GTCCC	2	10	229565	229574	0 %	20 %	20 %	60 %	120401243
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244	NC_008726	CTGGA	2	10	279192	279201	20 %	20 %	40 %	20 %	120401281
245	NC_008726	TGCGC	2	10	279370	279379	0 %	20 %	40 %	40 %	120401281
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247	NC_008726	GCGCC	2	10	281262	281271	0 %	0 %	40 %	60 %	120401283
248	NC_008726	GGCGA	2	10	281504	281513	20 %	0 %	60 %	20 %	120401283
249	NC_008726	TGGCC	2	10	282505	282514	0 %	20 %	40 %	40 %	120401285
250	NC_008726	GCGCG	2	10	283666	283675	0 %	0 %	60 %	40 %	120401285
251	NC_008726	GCCCG	2	10	283814	283823	0 %	0 %	40 %	60 %	120401285
252	NC_008726	CGACG	2	10	285497	285506	20 %	0 %	40 %	40 %	120401287
253	NC_008726	GACCG	2	10	285992	286001	20 %	0 %	40 %	40 %	120401287
254	NC_008726	CCGAC	2	10	286654	286663	20 %	0 %	20 %	60 %	120401288
255	NC_008726	TGGCC	2	10	294154	294163	0 %	20 %	40 %	40 %	120401295
256	NC_008726	CGAAC	2	10	294167	294176	40 %	0 %	20 %	40 %	120401295
257	NC_008726	GTCGG	2	10	294845	294854	0 %	20 %	60 %	20 %	120401295
258	NC_008726	GCAGC	2	10	295757	295766	20 %	0 %	40 %	40 %	120401295
259	NC_008726	CCGGG	2	10	296930	296939	0 %	0 %	60 %	40 %	120401295
260	NC_008726	AGCCC	2	10	299466	299475	20 %	0 %	20 %	60 %	120401295
261	NC_008726	CGATG	2	10	300503	300512	20 %	20 %	40 %	20 %	120401295
262	NC_008726	TGTGC	2	10	301639	301648	0 %	40 %	40 %	20 %	120401295
263	NC_008726	ACCGG	2	10	303141	303150	20 %	0 %	40 %	40 %	120401295
264	NC_008726	GCACC	2	10	303472	303481	20 %	0 %	20 %	60 %	120401295
265	NC_008726	CGTCA	2	10	304247	304256	20 %	20 %	20 %	40 %	120401295
266	NC_008726	TCGCG	2	10	304357	304366	0 %	20 %	40 %	40 %	120401295
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384	NC_008726	CGGGG	2	10	461907	461916	0 %	0 %	80 %	20 %	120401449
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391	NC_008726	GCCGC	2	10	470511	470520	0 %	0 %	40 %	60 %	120401458
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