MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium vanbaalenii PYR-1 chromosome

Total Repeats: 159442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008726	ACG	3	9	100455	100463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2502	NC_008726	CGG	2	6	100466	100471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401116
2503	NC_008726	TCG	2	6	100473	100478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2504	NC_008726	TCG	2	6	100488	100493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2505	NC_008726	GGC	2	6	100511	100516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401116
2506	NC_008726	CTTG	2	8	100561	100568	0 %	50 %	25 %	25 %	120401116
2507	NC_008726	ACG	2	6	100647	100652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2508	NC_008726	CGCC	2	8	100692	100699	0 %	0 %	25 %	75 %	120401116
2509	NC_008726	TCG	2	6	100722	100727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2510	NC_008726	TG	3	6	100739	100744	0 %	50 %	50 %	0 %	120401116
2511	NC_008726	AGC	2	6	100746	100751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2512	NC_008726	CGT	2	6	100828	100833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2513	NC_008726	CGA	2	6	100837	100842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2514	NC_008726	GTC	2	6	100869	100874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2515	NC_008726	GTC	2	6	100926	100931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2516	NC_008726	GTT	2	6	100958	100963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120401116
2517	NC_008726	CAA	2	6	100973	100978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120401116
2518	NC_008726	GCG	2	6	100979	100984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401116
2519	NC_008726	TCGC	2	8	101004	101011	0 %	25 %	25 %	50 %	120401116
2520	NC_008726	GACCA	2	10	101019	101028	40 %	0 %	20 %	40 %	120401116
2521	NC_008726	GTC	2	6	101069	101074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401116
2522	NC_008726	GC	3	6	101077	101082	0 %	0 %	50 %	50 %	120401116
2523	NC_008726	CGC	2	6	101158	101163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401116
2524	NC_008726	TCG	2	6	101182	101187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401117
2525	NC_008726	CCG	2	6	101198	101203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401117
2526	NC_008726	CGA	2	6	101213	101218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401117
2527	NC_008726	TCGA	2	8	101245	101252	25 %	25 %	25 %	25 %	120401117
2528	NC_008726	GCT	2	6	101297	101302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401117
2529	NC_008726	GCA	2	6	101324	101329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401117
2530	NC_008726	TGG	2	6	101362	101367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401117
2531	NC_008726	CGC	2	6	101464	101469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401117
2532	NC_008726	GTC	2	6	101505	101510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401117
2533	NC_008726	CTT	2	6	101528	101533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401118
2534	NC_008726	CGGT	2	8	101591	101598	0 %	25 %	50 %	25 %	120401118
2535	NC_008726	CTT	2	6	101642	101647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120401118
2536	NC_008726	CAT	2	6	101678	101683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401118
2537	NC_008726	GCC	2	6	101708	101713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2538	NC_008726	CGC	2	6	101719	101724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2539	NC_008726	GCT	2	6	101732	101737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401118
2540	NC_008726	CGC	2	6	101750	101755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2541	NC_008726	TCGGCG	2	12	101770	101781	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	120401118
2542	NC_008726	CCG	2	6	101800	101805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2543	NC_008726	CGG	2	6	101818	101823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401118
2544	NC_008726	CTCCGC	2	12	101827	101838	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	120401118
2545	NC_008726	CAC	2	6	101839	101844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120401118
2546	NC_008726	CGC	2	6	101845	101850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2547	NC_008726	GCC	3	9	101855	101863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2548	NC_008726	CTG	2	6	101866	101871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401118
2549	NC_008726	CGGC	2	8	101872	101879	0 %	0 %	50 %	50 %	120401118
2550	NC_008726	GC	3	6	101944	101949	0 %	0 %	50 %	50 %	120401118
2551	NC_008726	CCGC	2	8	101961	101968	0 %	0 %	25 %	75 %	120401118
2552	NC_008726	GCC	2	6	101975	101980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2553	NC_008726	GCC	3	9	102002	102010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2554	NC_008726	C	6	6	102030	102035	0 %	0 %	0 %	100 %	120401118
2555	NC_008726	GCG	2	6	102037	102042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401118
2556	NC_008726	GC	3	6	102052	102057	0 %	0 %	50 %	50 %	120401118
2557	NC_008726	GCC	2	6	102063	102068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2558	NC_008726	GCC	2	6	102075	102080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2559	NC_008726	CCT	2	6	102100	102105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401118
2560	NC_008726	GCCC	2	8	102121	102128	0 %	0 %	25 %	75 %	120401118
2561	NC_008726	GCT	2	6	102130	102135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401118
2562	NC_008726	CCCGAC	2	12	102141	102152	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	120401118
2563	NC_008726	CCG	2	6	102171	102176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2564	NC_008726	CCG	2	6	102179	102184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2565	NC_008726	CTC	3	9	102188	102196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120401118
2566	NC_008726	CGGC	2	8	102250	102257	0 %	0 %	50 %	50 %	120401118
2567	NC_008726	GCG	2	6	102280	102285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401118
2568	NC_008726	GCT	2	6	102352	102357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401118
2569	NC_008726	GCC	2	6	102386	102391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2570	NC_008726	CGT	2	6	102401	102406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401118
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2572	NC_008726	TCGGCC	2	12	102492	102503	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	120401118
2573	NC_008726	TGCC	2	8	102520	102527	0 %	25 %	25 %	50 %	120401118
2574	NC_008726	CCG	2	6	102543	102548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401118
2575	NC_008726	ACTTGA	2	12	102553	102564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	120401118
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2579	NC_008726	GCG	2	6	102681	102686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401118
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2583	NC_008726	CGG	2	6	102773	102778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401118
2584	NC_008726	GGC	2	6	102783	102788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120401118
2585	NC_008726	TGGG	2	8	102805	102812	0 %	25 %	75 %	0 %	120401118
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2588	NC_008726	TCG	2	6	102885	102890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401118
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2590	NC_008726	GTC	2	6	103014	103019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401118
2591	NC_008726	ACCGCG	2	12	103044	103055	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	120401118
2592	NC_008726	C	6	6	103066	103071	0 %	0 %	0 %	100 %	120401118
2593	NC_008726	ATC	2	6	103109	103114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120401118
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2601	NC_008726	CGT	2	6	103481	103486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401119
2602	NC_008726	GTCG	2	8	103565	103572	0 %	25 %	50 %	25 %	120401119
2603	NC_008726	CAG	2	6	103590	103595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401119
2604	NC_008726	GC	3	6	103600	103605	0 %	0 %	50 %	50 %	120401119
2605	NC_008726	CCG	2	6	103609	103614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120401119
2606	NC_008726	GTG	2	6	103634	103639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401119
2607	NC_008726	GAG	2	6	103662	103667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120401119
2608	NC_008726	CGT	3	9	103671	103679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401119
2609	NC_008726	GC	4	8	103726	103733	0 %	0 %	50 %	50 %	120401119
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2615	NC_008726	GTC	2	6	103848	103853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401119
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2617	NC_008726	GTG	2	6	103912	103917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401119
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2619	NC_008726	GC	3	6	103996	104001	0 %	0 %	50 %	50 %	120401119
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2621	NC_008726	CGA	2	6	104159	104164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401119
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2981	NC_008726	CGAT	2	8	116271	116278	25 %	25 %	25 %	25 %	120401130
2982	NC_008726	CGA	2	6	116314	116319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401130
2983	NC_008726	AGT	2	6	116386	116391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120401130
2984	NC_008726	GGT	2	6	116405	116410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401130
2985	NC_008726	CA	3	6	116425	116430	50 %	0 %	0 %	50 %	120401130
2986	NC_008726	GAA	2	6	116489	116494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120401130
2987	NC_008726	ACG	2	6	116797	116802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401131
2988	NC_008726	CGGC	2	8	116844	116851	0 %	0 %	50 %	50 %	120401131
2989	NC_008726	CAG	2	6	116867	116872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401131
2990	NC_008726	GGT	2	6	116894	116899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401131
2991	NC_008726	GCT	2	6	116960	116965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401131
2992	NC_008726	CGA	2	6	117011	117016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401131
2993	NC_008726	GCT	2	6	117027	117032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401131
2994	NC_008726	GAC	2	6	117084	117089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401131
2995	NC_008726	ACG	2	6	117136	117141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120401131
2996	NC_008726	CG	4	8	117146	117153	0 %	0 %	50 %	50 %	120401131
2997	NC_008726	TGG	2	6	117199	117204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401131
2998	NC_008726	GGT	2	6	117206	117211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120401131
2999	NC_008726	TCG	2	6	117238	117243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401131
3000	NC_008726	CTG	3	9	117285	117293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120401131

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