MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS02

Total Repeats: 353

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008704	CG	3	6	498	503	0 %	0 %	50 %	50 %	119855175
2	NC_008704	CG	3	6	830	835	0 %	0 %	50 %	50 %	119855176
3	NC_008704	GC	3	6	1291	1296	0 %	0 %	50 %	50 %	119855177
4	NC_008704	GC	3	6	1470	1475	0 %	0 %	50 %	50 %	119855177
5	NC_008704	CG	3	6	2772	2777	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
6	NC_008704	GC	4	8	3107	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
7	NC_008704	GC	4	8	3446	3453	0 %	0 %	50 %	50 %	119855180
8	NC_008704	CG	3	6	3685	3690	0 %	0 %	50 %	50 %	119855181
9	NC_008704	GT	3	6	4905	4910	0 %	50 %	50 %	0 %	119855182
10	NC_008704	GC	3	6	5242	5247	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
11	NC_008704	CG	4	8	6167	6174	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
12	NC_008704	GC	3	6	6732	6737	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
13	NC_008704	CA	3	6	6766	6771	50 %	0 %	0 %	50 %	119855183
14	NC_008704	CG	3	6	7017	7022	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
15	NC_008704	GC	3	6	7218	7223	0 %	0 %	50 %	50 %	119855183
16	NC_008704	CG	3	6	8828	8833	0 %	0 %	50 %	50 %	119855184
17	NC_008704	CG	3	6	8960	8965	0 %	0 %	50 %	50 %	119855184
18	NC_008704	GA	3	6	9426	9431	50 %	0 %	50 %	0 %	119855184
19	NC_008704	CG	3	6	9764	9769	0 %	0 %	50 %	50 %	119855184
20	NC_008704	GC	3	6	10313	10318	0 %	0 %	50 %	50 %	119855185
21	NC_008704	CG	3	6	10439	10444	0 %	0 %	50 %	50 %	119855185
22	NC_008704	CA	3	6	10820	10825	50 %	0 %	0 %	50 %	119855185
23	NC_008704	AC	3	6	11253	11258	50 %	0 %	0 %	50 %	119855186
24	NC_008704	CG	3	6	11584	11589	0 %	0 %	50 %	50 %	119855186
25	NC_008704	GC	3	6	11811	11816	0 %	0 %	50 %	50 %	119855186
26	NC_008704	CA	3	6	11970	11975	50 %	0 %	0 %	50 %	119855186
27	NC_008704	GC	3	6	12878	12883	0 %	0 %	50 %	50 %	119855187
28	NC_008704	GC	3	6	13203	13208	0 %	0 %	50 %	50 %	119855187
29	NC_008704	GC	3	6	13617	13622	0 %	0 %	50 %	50 %	119855187
30	NC_008704	GC	3	6	14995	15000	0 %	0 %	50 %	50 %	119855188
31	NC_008704	GC	3	6	16011	16016	0 %	0 %	50 %	50 %	119855189
32	NC_008704	GC	3	6	16109	16114	0 %	0 %	50 %	50 %	119855189
33	NC_008704	GC	3	6	16721	16726	0 %	0 %	50 %	50 %	119855189
34	NC_008704	GC	3	6	16828	16833	0 %	0 %	50 %	50 %	119855190
35	NC_008704	GC	3	6	16905	16910	0 %	0 %	50 %	50 %	119855190
36	NC_008704	CG	3	6	17349	17354	0 %	0 %	50 %	50 %	119855190
37	NC_008704	CG	3	6	19444	19449	0 %	0 %	50 %	50 %	119855193
38	NC_008704	GC	3	6	19545	19550	0 %	0 %	50 %	50 %	119855193
39	NC_008704	CG	3	6	20070	20075	0 %	0 %	50 %	50 %	119855194
40	NC_008704	CG	3	6	20552	20557	0 %	0 %	50 %	50 %	119855194
41	NC_008704	CG	4	8	21180	21187	0 %	0 %	50 %	50 %	119855195
42	NC_008704	CG	3	6	22628	22633	0 %	0 %	50 %	50 %	119855197
43	NC_008704	TG	4	8	23457	23464	0 %	50 %	50 %	0 %	119855198
44	NC_008704	GC	3	6	23731	23736	0 %	0 %	50 %	50 %	119855198
45	NC_008704	CG	3	6	23805	23810	0 %	0 %	50 %	50 %	119855198
46	NC_008704	GC	3	6	24275	24280	0 %	0 %	50 %	50 %	119855199
47	NC_008704	GC	3	6	27168	27173	0 %	0 %	50 %	50 %	119855202
48	NC_008704	CT	3	6	27681	27686	0 %	50 %	0 %	50 %	119855203
49	NC_008704	CG	3	6	28125	28130	0 %	0 %	50 %	50 %	119855204
50	NC_008704	GC	3	6	28206	28211	0 %	0 %	50 %	50 %	119855204
51	NC_008704	CA	3	6	28564	28569	50 %	0 %	0 %	50 %	119855204
52	NC_008704	CG	3	6	29850	29855	0 %	0 %	50 %	50 %	119855206
53	NC_008704	CG	3	6	31151	31156	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
54	NC_008704	GT	3	6	31630	31635	0 %	50 %	50 %	0 %	119855207
55	NC_008704	CG	3	6	32497	32502	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
56	NC_008704	AC	3	6	32632	32637	50 %	0 %	0 %	50 %	119855207
57	NC_008704	AC	3	6	32684	32689	50 %	0 %	0 %	50 %	119855207
58	NC_008704	GC	3	6	32777	32782	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
59	NC_008704	CG	3	6	32857	32862	0 %	0 %	50 %	50 %	119855207
60	NC_008704	GT	3	6	34454	34459	0 %	50 %	50 %	0 %	119855209
61	NC_008704	CA	3	6	35877	35882	50 %	0 %	0 %	50 %	119855210
62	NC_008704	AC	3	6	39081	39086	50 %	0 %	0 %	50 %	119855215
63	NC_008704	CG	3	6	39903	39908	0 %	0 %	50 %	50 %	119855216
64	NC_008704	GC	3	6	40185	40190	0 %	0 %	50 %	50 %	119855216
65	NC_008704	GT	3	6	42080	42085	0 %	50 %	50 %	0 %	119855219
66	NC_008704	GC	3	6	44332	44337	0 %	0 %	50 %	50 %	119855221
67	NC_008704	CG	3	6	46017	46022	0 %	0 %	50 %	50 %	119855223
68	NC_008704	GC	3	6	46071	46076	0 %	0 %	50 %	50 %	119855223
69	NC_008704	GC	3	6	47251	47256	0 %	0 %	50 %	50 %	119855224
70	NC_008704	CA	3	6	48384	48389	50 %	0 %	0 %	50 %	119855226
71	NC_008704	TG	3	6	48585	48590	0 %	50 %	50 %	0 %	119855226
72	NC_008704	AC	3	6	48776	48781	50 %	0 %	0 %	50 %	119855226
73	NC_008704	CG	3	6	49093	49098	0 %	0 %	50 %	50 %	119855226
74	NC_008704	GA	3	6	49317	49322	50 %	0 %	50 %	0 %	119855226
75	NC_008704	CG	3	6	49438	49443	0 %	0 %	50 %	50 %	119855226
76	NC_008704	GC	3	6	49531	49536	0 %	0 %	50 %	50 %	119855226
77	NC_008704	TC	3	6	49594	49599	0 %	50 %	0 %	50 %	119855226
78	NC_008704	CG	3	6	49985	49990	0 %	0 %	50 %	50 %	119855227
79	NC_008704	CG	3	6	50338	50343	0 %	0 %	50 %	50 %	119855227
80	NC_008704	GC	3	6	51281	51286	0 %	0 %	50 %	50 %	119855228
81	NC_008704	CG	3	6	51728	51733	0 %	0 %	50 %	50 %	119855228
82	NC_008704	AG	3	6	51954	51959	50 %	0 %	50 %	0 %	119855228
83	NC_008704	CG	3	6	53514	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	119855230
84	NC_008704	GC	3	6	53876	53881	0 %	0 %	50 %	50 %	119855231
85	NC_008704	AG	3	6	53922	53927	50 %	0 %	50 %	0 %	119855231
86	NC_008704	GC	3	6	54088	54093	0 %	0 %	50 %	50 %	119855231
87	NC_008704	CT	3	6	54875	54880	0 %	50 %	0 %	50 %	119855233
88	NC_008704	AC	3	6	55980	55985	50 %	0 %	0 %	50 %	119855233
89	NC_008704	GT	3	6	57459	57464	0 %	50 %	50 %	0 %	119855235
90	NC_008704	GC	3	6	58006	58011	0 %	0 %	50 %	50 %	119855236
91	NC_008704	CG	4	8	58628	58635	0 %	0 %	50 %	50 %	119855237
92	NC_008704	CG	3	6	59136	59141	0 %	0 %	50 %	50 %	119855237
93	NC_008704	AG	3	6	60078	60083	50 %	0 %	50 %	0 %	119855238
94	NC_008704	CG	3	6	61156	61161	0 %	0 %	50 %	50 %	119855239
95	NC_008704	GC	3	6	61773	61778	0 %	0 %	50 %	50 %	119855239
96	NC_008704	CG	3	6	62028	62033	0 %	0 %	50 %	50 %	119855240
97	NC_008704	CG	4	8	62264	62271	0 %	0 %	50 %	50 %	119855240
98	NC_008704	CG	3	6	62378	62383	0 %	0 %	50 %	50 %	119855240
99	NC_008704	AC	4	8	63283	63290	50 %	0 %	0 %	50 %	119855241
100	NC_008704	GC	3	6	63330	63335	0 %	0 %	50 %	50 %	119855241
101	NC_008704	CG	3	6	63537	63542	0 %	0 %	50 %	50 %	119855241
102	NC_008704	GA	3	6	63680	63685	50 %	0 %	50 %	0 %	119855241
103	NC_008704	CG	3	6	63715	63720	0 %	0 %	50 %	50 %	119855241
104	NC_008704	GC	3	6	64405	64410	0 %	0 %	50 %	50 %	119855242
105	NC_008704	GC	3	6	64686	64691	0 %	0 %	50 %	50 %	119855242
106	NC_008704	CG	3	6	67422	67427	0 %	0 %	50 %	50 %	119855245
107	NC_008704	GC	4	8	67524	67531	0 %	0 %	50 %	50 %	119855246
108	NC_008704	GC	3	6	68364	68369	0 %	0 %	50 %	50 %	119855246
109	NC_008704	CG	5	10	68487	68496	0 %	0 %	50 %	50 %	119855246
110	NC_008704	TG	3	6	68913	68918	0 %	50 %	50 %	0 %	119855247
111	NC_008704	GC	3	6	69067	69072	0 %	0 %	50 %	50 %	119855248
112	NC_008704	CG	3	6	69424	69429	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
113	NC_008704	CG	3	6	69747	69752	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
114	NC_008704	GC	3	6	69875	69880	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
115	NC_008704	GC	3	6	70005	70010	0 %	0 %	50 %	50 %	119855249
116	NC_008704	CG	3	6	70277	70282	0 %	0 %	50 %	50 %	119855250
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118	NC_008704	CG	3	6	71275	71280	0 %	0 %	50 %	50 %	119855251
119	NC_008704	AC	3	6	71585	71590	50 %	0 %	0 %	50 %	119855251
120	NC_008704	CG	3	6	72283	72288	0 %	0 %	50 %	50 %	119855252
121	NC_008704	CG	3	6	72411	72416	0 %	0 %	50 %	50 %	119855252
122	NC_008704	GC	3	6	72433	72438	0 %	0 %	50 %	50 %	119855252
123	NC_008704	GC	3	6	73190	73195	0 %	0 %	50 %	50 %	119855254
124	NC_008704	GC	3	6	73642	73647	0 %	0 %	50 %	50 %	119855254
125	NC_008704	GC	3	6	73983	73988	0 %	0 %	50 %	50 %	119855254
126	NC_008704	GC	3	6	74160	74165	0 %	0 %	50 %	50 %	119855254
127	NC_008704	GC	3	6	74742	74747	0 %	0 %	50 %	50 %	119855255
128	NC_008704	GC	3	6	74857	74862	0 %	0 %	50 %	50 %	119855255
129	NC_008704	GC	3	6	74872	74877	0 %	0 %	50 %	50 %	119855255
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132	NC_008704	GC	3	6	76781	76786	0 %	0 %	50 %	50 %	119855258
133	NC_008704	CG	3	6	76963	76968	0 %	0 %	50 %	50 %	119855258
134	NC_008704	GC	3	6	77491	77496	0 %	0 %	50 %	50 %	119855259
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136	NC_008704	GC	3	6	78364	78369	0 %	0 %	50 %	50 %	119855260
137	NC_008704	GC	3	6	79111	79116	0 %	0 %	50 %	50 %	119855261
138	NC_008704	TC	3	6	79422	79427	0 %	50 %	0 %	50 %	119855262
139	NC_008704	GC	3	6	79508	79513	0 %	0 %	50 %	50 %	119855262
140	NC_008704	GC	3	6	80101	80106	0 %	0 %	50 %	50 %	119855263
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142	NC_008704	CG	3	6	81504	81509	0 %	0 %	50 %	50 %	119855266
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.