MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium sp. KMS plasmid pMKMS01

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008703	CACCG	2	10	812	821	20 %	0 %	20 %	60 %	119854891
2	NC_008703	GTGGC	2	10	897	906	0 %	20 %	60 %	20 %	119854891
3	NC_008703	GGGGC	2	10	1288	1297	0 %	0 %	80 %	20 %	119854892
4	NC_008703	CTGCC	2	10	1883	1892	0 %	20 %	20 %	60 %	119854892
5	NC_008703	CCCGG	2	10	2589	2598	0 %	0 %	40 %	60 %	119854893
6	NC_008703	TCATC	2	10	3637	3646	20 %	40 %	0 %	40 %	119854895
7	NC_008703	TGGAC	2	10	4562	4571	20 %	20 %	40 %	20 %	119854896
8	NC_008703	GCGCC	2	10	4917	4926	0 %	0 %	40 %	60 %	119854896
9	NC_008703	GCAGC	2	10	6237	6246	20 %	0 %	40 %	40 %	119854896
10	NC_008703	TGTGG	2	10	7388	7397	0 %	40 %	60 %	0 %	119854897
11	NC_008703	CGCCA	2	10	7407	7416	20 %	0 %	20 %	60 %	119854897
12	NC_008703	CCCCG	2	10	7925	7934	0 %	0 %	20 %	80 %	119854897
13	NC_008703	CGCTG	2	10	8999	9008	0 %	20 %	40 %	40 %	119854898
14	NC_008703	GCGCC	2	10	10078	10087	0 %	0 %	40 %	60 %	119854898
15	NC_008703	GCTGA	2	10	10464	10473	20 %	20 %	40 %	20 %	119854900
16	NC_008703	CGGCG	2	10	10475	10484	0 %	0 %	60 %	40 %	119854900
17	NC_008703	TGCGG	2	10	10749	10758	0 %	20 %	60 %	20 %	119854900
18	NC_008703	TCGCG	2	10	12716	12725	0 %	20 %	40 %	40 %	119854900
19	NC_008703	GCCGC	2	10	12915	12924	0 %	0 %	40 %	60 %	119854900
20	NC_008703	GATCG	2	10	14165	14174	20 %	20 %	40 %	20 %	119854901
21	NC_008703	CCGCC	2	10	16613	16622	0 %	0 %	20 %	80 %	119854904
22	NC_008703	CCGTG	2	10	17106	17115	0 %	20 %	40 %	40 %	119854904
23	NC_008703	CGGCC	2	10	18793	18802	0 %	0 %	40 %	60 %	119854906
24	NC_008703	GCCGC	2	10	18989	18998	0 %	0 %	40 %	60 %	119854906
25	NC_008703	CTCGT	2	10	20997	21006	0 %	40 %	20 %	40 %	119854906
26	NC_008703	CGCGG	2	10	22406	22415	0 %	0 %	60 %	40 %	119854907
27	NC_008703	GATCG	2	10	23703	23712	20 %	20 %	40 %	20 %	119854908
28	NC_008703	TGCGC	2	10	25344	25353	0 %	20 %	40 %	40 %	119854910
29	NC_008703	GGGGT	2	10	26636	26645	0 %	20 %	80 %	0 %	119854912
30	NC_008703	TCGGC	2	10	26766	26775	0 %	20 %	40 %	40 %	119854912
31	NC_008703	CAGGC	2	10	26913	26922	20 %	0 %	40 %	40 %	119854912
32	NC_008703	CAGGG	2	10	28165	28174	20 %	0 %	60 %	20 %	119854914
33	NC_008703	GATCG	2	10	29715	29724	20 %	20 %	40 %	20 %	119854915
34	NC_008703	GGCGC	2	10	30398	30407	0 %	0 %	60 %	40 %	119854916
35	NC_008703	AGTCG	2	10	32169	32178	20 %	20 %	40 %	20 %	119854919
36	NC_008703	GATCG	2	10	33834	33843	20 %	20 %	40 %	20 %	119854921
37	NC_008703	AGGTC	2	10	34415	34424	20 %	20 %	40 %	20 %	119854922
38	NC_008703	GTGGG	2	10	35791	35800	0 %	20 %	80 %	0 %	119854923
39	NC_008703	CGTCG	2	10	36551	36560	0 %	20 %	40 %	40 %	119854924
40	NC_008703	GGTGT	2	10	37619	37628	0 %	40 %	60 %	0 %	119854926
41	NC_008703	CGCAC	2	10	40176	40185	20 %	0 %	20 %	60 %	119854928
42	NC_008703	GGTCG	2	10	41354	41363	0 %	20 %	60 %	20 %	119854930
43	NC_008703	TTGCA	2	10	41512	41521	20 %	40 %	20 %	20 %	119854930
44	NC_008703	CGCGC	2	10	42651	42660	0 %	0 %	40 %	60 %	119854931
45	NC_008703	ACCGC	2	10	44908	44917	20 %	0 %	20 %	60 %	119854932
46	NC_008703	GCGGG	2	10	45059	45068	0 %	0 %	80 %	20 %	119854932
47	NC_008703	GATCG	2	10	46410	46419	20 %	20 %	40 %	20 %	119854933
48	NC_008703	GATGG	2	10	48494	48503	20 %	20 %	60 %	0 %	119854935
49	NC_008703	CGCCA	2	10	49848	49857	20 %	0 %	20 %	60 %	119854936
50	NC_008703	ACCAC	2	10	50121	50130	40 %	0 %	0 %	60 %	119854936
51	NC_008703	GACGG	2	10	51334	51343	20 %	0 %	60 %	20 %	119854937
52	NC_008703	GCCGC	2	10	51413	51422	0 %	0 %	40 %	60 %	119854937
53	NC_008703	GCCGG	2	10	54576	54585	0 %	0 %	60 %	40 %	119854939
54	NC_008703	GTGGA	2	10	58018	58027	20 %	20 %	60 %	0 %	119854943
55	NC_008703	GCGCC	2	10	62976	62985	0 %	0 %	40 %	60 %	119854948
56	NC_008703	CGGCG	2	10	67715	67724	0 %	0 %	60 %	40 %	119854951
57	NC_008703	CGGGG	2	10	68566	68575	0 %	0 %	80 %	20 %	119854952
58	NC_008703	CGCAG	2	10	68968	68977	20 %	0 %	40 %	40 %	119854952
59	NC_008703	GCAAG	2	10	71331	71340	40 %	0 %	40 %	20 %	119854956
60	NC_008703	CGCGC	2	10	73434	73443	0 %	0 %	40 %	60 %	119854959
61	NC_008703	TTCGG	2	10	77837	77846	0 %	40 %	40 %	20 %	119854963
62	NC_008703	TGGTG	2	10	78885	78894	0 %	40 %	60 %	0 %	119854965
63	NC_008703	TCGCT	2	10	79404	79413	0 %	40 %	20 %	40 %	119854965
64	NC_008703	TCGGG	2	10	79711	79720	0 %	20 %	60 %	20 %	119854966
65	NC_008703	TCGGG	2	10	80492	80501	0 %	20 %	60 %	20 %	119854966
66	NC_008703	CCCGT	2	10	83631	83640	0 %	20 %	20 %	60 %	119854969
67	NC_008703	GCGCT	2	10	85191	85200	0 %	20 %	40 %	40 %	119854969
68	NC_008703	ACGGC	2	10	88235	88244	20 %	0 %	40 %	40 %	119854972
69	NC_008703	CGAGG	2	10	88531	88540	20 %	0 %	60 %	20 %	119854972
70	NC_008703	CTGGT	2	10	88894	88903	0 %	40 %	40 %	20 %	119854973
71	NC_008703	GCACC	2	10	90813	90822	20 %	0 %	20 %	60 %	119854974
72	NC_008703	GGGTG	2	10	92005	92014	0 %	20 %	80 %	0 %	119854975
73	NC_008703	GCCGC	2	10	93405	93414	0 %	0 %	40 %	60 %	119854976
74	NC_008703	GCGCT	2	10	93538	93547	0 %	20 %	40 %	40 %	119854976
75	NC_008703	AGCCG	2	10	93748	93757	20 %	0 %	40 %	40 %	119854977
76	NC_008703	CAGCG	2	10	93935	93944	20 %	0 %	40 %	40 %	119854977
77	NC_008703	GCGGT	2	10	94694	94703	0 %	20 %	60 %	20 %	119854978
78	NC_008703	GCGCG	2	10	94781	94790	0 %	0 %	60 %	40 %	119854978
79	NC_008703	CCGGT	2	10	95114	95123	0 %	20 %	40 %	40 %	119854978
80	NC_008703	CGCTG	2	10	96991	97000	0 %	20 %	40 %	40 %	119854980
81	NC_008703	TCCGC	2	10	99744	99753	0 %	20 %	20 %	60 %	119854983
82	NC_008703	CGCTG	2	10	106212	106221	0 %	20 %	40 %	40 %	119854986
83	NC_008703	CTGCG	2	10	107181	107190	0 %	20 %	40 %	40 %	119854988
84	NC_008703	CGACC	2	10	107630	107639	20 %	0 %	20 %	60 %	119854989
85	NC_008703	GTGCG	2	10	109596	109605	0 %	20 %	60 %	20 %	119854991
86	NC_008703	TCAGG	2	10	110169	110178	20 %	20 %	40 %	20 %	119854992
87	NC_008703	CGCGC	2	10	110603	110612	0 %	0 %	40 %	60 %	119854993
88	NC_008703	GCCGT	2	10	112163	112172	0 %	20 %	40 %	40 %	119854996
89	NC_008703	GCAGC	2	10	117385	117394	20 %	0 %	40 %	40 %	119854999
90	NC_008703	TGAGC	2	10	124500	124509	20 %	20 %	40 %	20 %	119855006
91	NC_008703	GTGAC	2	10	126013	126022	20 %	20 %	40 %	20 %	119855008
92	NC_008703	CCGCA	2	10	127716	127725	20 %	0 %	20 %	60 %	119855010
93	NC_008703	ACGAA	2	10	127871	127880	60 %	0 %	20 %	20 %	119855010
94	NC_008703	CCGGA	2	10	132969	132978	20 %	0 %	40 %	40 %	119855013
95	NC_008703	GGCGA	2	10	134644	134653	20 %	0 %	60 %	20 %	119855014
96	NC_008703	TCGGT	2	10	135643	135652	0 %	40 %	40 %	20 %	119855016
97	NC_008703	CCGGA	2	10	137877	137886	20 %	0 %	40 %	40 %	119855017
98	NC_008703	CGGCG	2	10	139741	139750	0 %	0 %	60 %	40 %	119855019
99	NC_008703	CGTCG	2	10	139999	140008	0 %	20 %	40 %	40 %	119855019
100	NC_008703	CGTTG	2	10	144254	144263	0 %	40 %	40 %	20 %	119855024
101	NC_008703	AGGTC	2	10	144611	144620	20 %	20 %	40 %	20 %	119855024
102	NC_008703	AAGCC	2	10	148517	148526	40 %	0 %	20 %	40 %	119855028
103	NC_008703	GCGAT	2	10	150854	150863	20 %	20 %	40 %	20 %	119855030
104	NC_008703	TTGAA	2	10	151341	151350	40 %	40 %	20 %	0 %	119855031
105	NC_008703	GGTCC	2	10	154452	154461	0 %	20 %	40 %	40 %	119855033
106	NC_008703	TGGGA	2	10	154629	154638	20 %	20 %	60 %	0 %	119855033
107	NC_008703	GAGCG	2	10	154747	154756	20 %	0 %	60 %	20 %	119855033
108	NC_008703	GTCCG	2	10	155355	155364	0 %	20 %	40 %	40 %	119855033
109	NC_008703	CGTTT	2	10	156170	156179	0 %	60 %	20 %	20 %	119855034
110	NC_008703	ATCAA	2	10	159354	159363	60 %	20 %	0 %	20 %	119855038
111	NC_008703	CCGTG	2	10	162468	162477	0 %	20 %	40 %	40 %	119855042
112	NC_008703	AGCGC	2	10	164758	164767	20 %	0 %	40 %	40 %	119855045
113	NC_008703	GCGCC	2	10	164804	164813	0 %	0 %	40 %	60 %	119855045
114	NC_008703	CAGTT	2	10	167847	167856	20 %	40 %	20 %	20 %	119855048
115	NC_008703	GCGCG	2	10	170296	170305	0 %	0 %	60 %	40 %	119855050
116	NC_008703	CTGCG	2	10	170565	170574	0 %	20 %	40 %	40 %	119855050
117	NC_008703	CACGG	2	10	171096	171105	20 %	0 %	40 %	40 %	119855051
118	NC_008703	CGCAG	2	10	176236	176245	20 %	0 %	40 %	40 %	119855057
119	NC_008703	CGGTC	2	10	176857	176866	0 %	20 %	40 %	40 %	119855058
120	NC_008703	GCCGT	2	10	177203	177212	0 %	20 %	40 %	40 %	119855058
121	NC_008703	GCACG	2	10	178558	178567	20 %	0 %	40 %	40 %	119855059
122	NC_008703	TGGGC	2	10	178837	178846	0 %	20 %	60 %	20 %	119855059
123	NC_008703	CGGTG	2	10	179257	179266	0 %	20 %	60 %	20 %	119855059
124	NC_008703	GCCGC	2	10	179674	179683	0 %	0 %	40 %	60 %	119855059
125	NC_008703	AGCGC	2	10	180245	180254	20 %	0 %	40 %	40 %	119855060
126	NC_008703	CCGCC	2	10	181959	181968	0 %	0 %	20 %	80 %	119855062
127	NC_008703	GCCCC	2	10	181998	182007	0 %	0 %	20 %	80 %	119855062
128	NC_008703	TCCTG	2	10	182748	182757	0 %	40 %	20 %	40 %	119855062
129	NC_008703	CTGGC	2	10	183062	183071	0 %	20 %	40 %	40 %	119855062
130	NC_008703	GGGCG	2	10	183205	183214	0 %	0 %	80 %	20 %	119855062
131	NC_008703	CGGTG	2	10	186860	186869	0 %	20 %	60 %	20 %	119855063
132	NC_008703	GGCCA	2	10	188067	188076	20 %	0 %	40 %	40 %	119855064
133	NC_008703	GGGCA	2	10	192678	192687	20 %	0 %	60 %	20 %	119855070
134	NC_008703	ACGCG	2	10	192876	192885	20 %	0 %	40 %	40 %	119855070
135	NC_008703	GGGCT	2	10	192946	192955	0 %	20 %	60 %	20 %	119855070
136	NC_008703	CGCTG	2	10	193713	193722	0 %	20 %	40 %	40 %	119855071
137	NC_008703	GCCGC	2	10	195252	195261	0 %	0 %	40 %	60 %	119855071
138	NC_008703	CGGAC	2	10	197392	197401	20 %	0 %	40 %	40 %	119855074
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143	NC_008703	CCGCG	2	10	205252	205261	0 %	0 %	40 %	60 %	119855081
144	NC_008703	AACTC	2	10	205395	205404	40 %	20 %	0 %	40 %	119855081
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151	NC_008703	CGAGG	2	10	220598	220607	20 %	0 %	60 %	20 %	119855097
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153	NC_008703	CCGGA	2	10	220853	220862	20 %	0 %	40 %	40 %	119855097
154	NC_008703	GCGTC	2	10	226943	226952	0 %	20 %	40 %	40 %	119855103
155	NC_008703	GAAGT	2	10	227240	227249	40 %	20 %	40 %	0 %	119855103
156	NC_008703	CGCTT	2	10	230273	230282	0 %	40 %	20 %	40 %	119855107
157	NC_008703	AGCCG	2	10	234857	234866	20 %	0 %	40 %	40 %	119855110
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161	NC_008703	GTGCG	2	10	247595	247604	0 %	20 %	60 %	20 %	119855125
162	NC_008703	CCAGC	2	10	247815	247824	20 %	0 %	20 %	60 %	119855125
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168	NC_008703	CGTTG	2	10	252679	252688	0 %	40 %	40 %	20 %	119855130
169	NC_008703	CGGGC	2	10	252779	252788	0 %	0 %	60 %	40 %	119855130
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175	NC_008703	CCGGG	2	10	259815	259824	0 %	0 %	60 %	40 %	119855135
176	NC_008703	GCCCG	2	10	259833	259842	0 %	0 %	40 %	60 %	119855135
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212	NC_008703	CCAAC	2	10	297975	297984	40 %	0 %	0 %	60 %	119855167
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214	NC_008703	CGCGG	2	10	301216	301225	0 %	0 %	60 %	40 %	119855171

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.