MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium smegmatis str. MC2 155 chromosome

Total Repeats: 125664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008596	CGA	3	9	503	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
2	NC_008596	CGT	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
3	NC_008596	CCA	2	6	602	607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
4	NC_008596	CTG	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
5	NC_008596	CCG	2	6	716	721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
6	NC_008596	GCT	2	6	744	749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
7	NC_008596	GAG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118468117
8	NC_008596	CGA	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
9	NC_008596	GTG	2	6	1018	1023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118468117
10	NC_008596	CGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
11	NC_008596	CAC	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
12	NC_008596	GCC	2	6	1132	1137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
13	NC_008596	GCA	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
14	NC_008596	GCT	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
15	NC_008596	CCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
16	NC_008596	CGA	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
17	NC_008596	CGA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118468117
18	NC_008596	CAC	2	6	1560	1565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118468117
19	NC_008596	GAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118468117
20	NC_008596	GGT	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118468117
21	NC_008596	GCC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118468117
22	NC_008596	CTG	2	6	1663	1668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118468117
23	NC_008596	GAG	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118471954
24	NC_008596	CGG	2	6	1969	1974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
25	NC_008596	TTG	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118471954
26	NC_008596	CGG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
27	NC_008596	CGG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118471954
28	NC_008596	GAC	3	9	2108	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118471954
29	NC_008596	CCG	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118471954
30	NC_008596	CTG	2	6	2276	2281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118471954
31	NC_008596	TCA	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118471954
32	NC_008596	GTG	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118471954
33	NC_008596	GAG	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118471954
34	NC_008596	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118471954
35	NC_008596	TTG	2	6	2739	2744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
36	NC_008596	CGC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467917
37	NC_008596	TCG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
38	NC_008596	CAA	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118467917
39	NC_008596	TGC	2	6	2955	2960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
40	NC_008596	GTT	2	6	2968	2973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
41	NC_008596	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
42	NC_008596	GGT	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
43	NC_008596	CGC	2	6	3193	3198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467917
44	NC_008596	TCG	2	6	3234	3239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
45	NC_008596	GCA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
46	NC_008596	GTG	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
47	NC_008596	TCG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
48	NC_008596	CGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
49	NC_008596	TGT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118467917
50	NC_008596	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467917
51	NC_008596	CGA	2	6	3592	3597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
52	NC_008596	GGC	2	6	3624	3629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118467917
53	NC_008596	GGA	2	6	3700	3705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118467917
54	NC_008596	GAC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467917
55	NC_008596	TGG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467917
56	NC_008596	CGA	3	9	3789	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470893
57	NC_008596	GAG	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470893
58	NC_008596	ATC	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470893
59	NC_008596	GAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470893
60	NC_008596	ACT	2	6	4017	4022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470893
61	NC_008596	GGT	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
62	NC_008596	CTG	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
63	NC_008596	CGC	2	6	4239	4244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470893
64	NC_008596	GGT	2	6	4245	4250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
65	NC_008596	GTG	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470893
66	NC_008596	TCG	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
67	NC_008596	CGT	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470893
68	NC_008596	AGA	2	6	4601	4606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
69	NC_008596	CAC	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
70	NC_008596	CGA	2	6	4752	4757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
71	NC_008596	CGA	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
72	NC_008596	CCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
73	NC_008596	GTC	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
74	NC_008596	GGT	2	6	4942	4947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
75	NC_008596	TAC	2	6	5035	5040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
76	NC_008596	CAC	2	6	5094	5099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470567
77	NC_008596	CAA	2	6	5190	5195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118470567
78	NC_008596	CGA	2	6	5217	5222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
79	NC_008596	GGT	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
80	NC_008596	CGA	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
81	NC_008596	CGT	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
82	NC_008596	CCG	2	6	5267	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
83	NC_008596	CGA	2	6	5289	5294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
84	NC_008596	GCC	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
85	NC_008596	CAG	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
86	NC_008596	CAT	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
87	NC_008596	GGT	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
88	NC_008596	GAG	2	6	5539	5544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118470567
89	NC_008596	GCG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470567
90	NC_008596	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
91	NC_008596	AAG	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
92	NC_008596	TGA	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118470567
93	NC_008596	GGC	2	6	5652	5657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470567
94	NC_008596	AGA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
95	NC_008596	AGC	2	6	5759	5764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
96	NC_008596	GCA	2	6	5766	5771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
97	NC_008596	CTG	2	6	5789	5794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
98	NC_008596	CAA	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118470567
99	NC_008596	TCG	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
100	NC_008596	GCG	2	6	5871	5876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118470567
101	NC_008596	TGG	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
102	NC_008596	GGT	2	6	5980	5985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
103	NC_008596	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
104	NC_008596	GAA	2	6	6081	6086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
105	NC_008596	ATC	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
106	NC_008596	GTT	3	9	6216	6224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118470567
107	NC_008596	GTT	3	9	6228	6236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118470567
108	NC_008596	TGG	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118470567
109	NC_008596	TCT	2	6	6272	6277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118470567
110	NC_008596	GCC	2	6	6285	6290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
111	NC_008596	AAG	2	6	6385	6390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118470567
112	NC_008596	CGA	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
113	NC_008596	TGC	2	6	6485	6490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118470567
114	NC_008596	CGA	2	6	6504	6509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
115	NC_008596	CGC	3	9	6510	6518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118470567
116	NC_008596	CGA	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118470567
117	NC_008596	TCA	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118470567
118	NC_008596	ACG	2	6	6657	6662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467811
119	NC_008596	GCC	2	6	6665	6670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467811
120	NC_008596	CAG	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467811
121	NC_008596	CCG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467811
122	NC_008596	TGG	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118467811
123	NC_008596	CGA	2	6	7085	7090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467811
124	NC_008596	ACG	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467811
125	NC_008596	CCA	2	6	7207	7212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118467811
126	NC_008596	CGC	2	6	7219	7224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118467811
127	NC_008596	CGA	2	6	7280	7285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118467811
128	NC_008596	CGT	2	6	7415	7420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118467811
129	NC_008596	GAG	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118467811
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251	NC_008596	CGA	2	6	15450	15455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118469728
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253	NC_008596	CAT	2	6	15674	15679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118472346
254	NC_008596	CGC	2	6	15740	15745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118472346
255	NC_008596	GTG	2	6	15753	15758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118472346
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499	NC_008596	ACC	2	6	27306	27311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470215
500	NC_008596	ACC	2	6	27399	27404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118470215

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