MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium sp. BNC1 plasmid 1

Total Repeats: 6428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008242	CCG	2	6	27375	27380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346943
502	NC_008242	CGA	2	6	27412	27417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346943
503	NC_008242	GCA	2	6	27521	27526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346943
504	NC_008242	ACA	2	6	27534	27539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110346943
505	NC_008242	ATC	2	6	27551	27556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346943
506	NC_008242	GAG	2	6	27566	27571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346943
507	NC_008242	CCGA	2	8	27590	27597	25 %	0 %	25 %	50 %	110346943
508	NC_008242	ATCG	2	8	27605	27612	25 %	25 %	25 %	25 %	110346943
509	NC_008242	TGG	3	9	27642	27650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346943
510	NC_008242	GCC	2	6	27670	27675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346943
511	NC_008242	GCT	2	6	27676	27681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
512	NC_008242	TTC	2	6	27726	27731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346943
513	NC_008242	GC	3	6	27747	27752	0 %	0 %	50 %	50 %	110346943
514	NC_008242	CGC	2	6	27778	27783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346943
515	NC_008242	CCG	2	6	27792	27797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346943
516	NC_008242	GC	4	8	27798	27805	0 %	0 %	50 %	50 %	110346943
517	NC_008242	TGA	2	6	27816	27821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346943
518	NC_008242	CAT	2	6	27916	27921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346943
519	NC_008242	GCTG	2	8	27991	27998	0 %	25 %	50 %	25 %	110346943
520	NC_008242	GTC	2	6	28037	28042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
521	NC_008242	GCC	2	6	28043	28048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346943
522	NC_008242	GGC	2	6	28067	28072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346943
523	NC_008242	CG	3	6	28122	28127	0 %	0 %	50 %	50 %	110346943
524	NC_008242	GCT	2	6	28159	28164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
525	NC_008242	CGC	2	6	28174	28179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346943
526	NC_008242	ACG	2	6	28185	28190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346943
527	NC_008242	TGC	2	6	28209	28214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
528	NC_008242	CGGAA	2	10	28219	28228	40 %	0 %	40 %	20 %	110346943
529	NC_008242	CGA	2	6	28252	28257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346943
530	NC_008242	TCG	2	6	28361	28366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
531	NC_008242	AGA	2	6	28410	28415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346943
532	NC_008242	TCG	2	6	28416	28421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
533	NC_008242	GC	3	6	28429	28434	0 %	0 %	50 %	50 %	110346943
534	NC_008242	GCT	2	6	28493	28498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346943
535	NC_008242	GCG	2	6	28553	28558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346943
536	NC_008242	TGG	2	6	28593	28598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346943
537	NC_008242	TGT	2	6	28599	28604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110346943
538	NC_008242	TCC	2	6	28626	28631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110346943
539	NC_008242	ATG	2	6	28792	28797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346943
540	NC_008242	TGC	2	6	28938	28943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346944
541	NC_008242	CGG	2	6	29089	29094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346944
542	NC_008242	GATCG	2	10	29111	29120	20 %	20 %	40 %	20 %	110346944
543	NC_008242	GGC	2	6	29219	29224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346944
544	NC_008242	TCA	2	6	29238	29243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346944
545	NC_008242	CAG	2	6	29252	29257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346944
546	NC_008242	AGC	2	6	29270	29275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346944
547	NC_008242	CCGGG	2	10	29299	29308	0 %	0 %	60 %	40 %	110346944
548	NC_008242	CGG	2	6	29374	29379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346944
549	NC_008242	GCC	2	6	29425	29430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346945
550	NC_008242	GTG	2	6	29434	29439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346945
551	NC_008242	CGA	2	6	29633	29638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346945
552	NC_008242	TGA	2	6	29660	29665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346945
553	NC_008242	TCA	2	6	29705	29710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346945
554	NC_008242	AAG	2	6	29735	29740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346945
555	NC_008242	ATG	2	6	29929	29934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346945
556	NC_008242	TCG	2	6	29973	29978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346945
557	NC_008242	ACG	2	6	30032	30037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346946
558	NC_008242	TGG	2	6	30038	30043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346946
559	NC_008242	GAT	2	6	30078	30083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110346946
560	NC_008242	AGC	2	6	30090	30095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346946
561	NC_008242	GA	3	6	30119	30124	50 %	0 %	50 %	0 %	110346946
562	NC_008242	CTG	2	6	30150	30155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346946
563	NC_008242	GCG	2	6	30262	30267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346946
564	NC_008242	CA	3	6	30280	30285	50 %	0 %	0 %	50 %	110346946
565	NC_008242	AGA	2	6	30306	30311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110346946
566	NC_008242	CG	3	6	30329	30334	0 %	0 %	50 %	50 %	110346946
567	NC_008242	CGCT	2	8	30389	30396	0 %	25 %	25 %	50 %	110346946
568	NC_008242	CGG	2	6	30420	30425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346946
569	NC_008242	GCC	2	6	30440	30445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346946
570	NC_008242	CCA	2	6	30502	30507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346947
571	NC_008242	CTA	2	6	30530	30535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346947
572	NC_008242	TGG	2	6	30545	30550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346947
573	NC_008242	ACT	2	6	30595	30600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346947
574	NC_008242	TTC	2	6	30645	30650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346947
575	NC_008242	CGC	2	6	30743	30748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346947
576	NC_008242	ACG	2	6	30754	30759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346947
577	NC_008242	GGCCGC	2	12	30893	30904	0 %	0 %	50 %	50 %	110346947
578	NC_008242	GC	4	8	30923	30930	0 %	0 %	50 %	50 %	110346947
579	NC_008242	CAG	2	6	30958	30963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346947
580	NC_008242	TTC	2	6	31020	31025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346947
581	NC_008242	TCG	2	6	31066	31071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346947
582	NC_008242	GCTC	2	8	31094	31101	0 %	25 %	25 %	50 %	110346947
583	NC_008242	CGT	2	6	31269	31274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346948
584	NC_008242	TG	3	6	31287	31292	0 %	50 %	50 %	0 %	110346948
585	NC_008242	ATC	2	6	31312	31317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346948
586	NC_008242	CCG	2	6	31443	31448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346948
587	NC_008242	TCA	2	6	31478	31483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346948
588	NC_008242	GCT	2	6	31557	31562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346948
589	NC_008242	GC	3	6	31578	31583	0 %	0 %	50 %	50 %	110346948
590	NC_008242	TGC	2	6	31625	31630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346948
591	NC_008242	TGGC	2	8	31666	31673	0 %	25 %	50 %	25 %	110346948
592	NC_008242	CAC	2	6	31934	31939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346948
593	NC_008242	GGA	2	6	32077	32082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346949
594	NC_008242	GTG	2	6	32086	32091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110346949
595	NC_008242	ATC	2	6	32116	32121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346949
596	NC_008242	G	6	6	32129	32134	0 %	0 %	100 %	0 %	110346949
597	NC_008242	A	6	6	32139	32144	100 %	0 %	0 %	0 %	110346949
598	NC_008242	GGA	2	6	32150	32155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346949
599	NC_008242	A	6	6	32195	32200	100 %	0 %	0 %	0 %	110346949
600	NC_008242	C	6	6	32202	32207	0 %	0 %	0 %	100 %	110346949
601	NC_008242	GAG	2	6	32216	32221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346949
602	NC_008242	GAG	2	6	32256	32261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346949
603	NC_008242	GCATCG	2	12	32276	32287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	110346949
604	NC_008242	GAG	2	6	32295	32300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110346949
605	NC_008242	AGGGC	2	10	32417	32426	20 %	0 %	60 %	20 %	110346949
606	NC_008242	TTC	3	9	32560	32568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110346949
607	NC_008242	CCG	2	6	32592	32597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346949
608	NC_008242	CCG	2	6	32649	32654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346949
609	NC_008242	TCG	2	6	34049	34054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346950
610	NC_008242	CCGG	2	8	34066	34073	0 %	0 %	50 %	50 %	110346950
611	NC_008242	ACG	2	6	34074	34079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346950
612	NC_008242	CT	4	8	34088	34095	0 %	50 %	0 %	50 %	110346950
613	NC_008242	CAA	2	6	34105	34110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110346950
614	NC_008242	CGG	2	6	34121	34126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110346950
615	NC_008242	TGC	2	6	34212	34217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110346950
616	NC_008242	AC	3	6	34244	34249	50 %	0 %	0 %	50 %	110346950
617	NC_008242	CCAC	2	8	34350	34357	25 %	0 %	0 %	75 %	110346950
618	NC_008242	TCGAGA	2	12	34380	34391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	110346950
619	NC_008242	GCC	2	6	34395	34400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346950
620	NC_008242	ATC	2	6	34622	34627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110346951
621	NC_008242	GCCC	2	8	34691	34698	0 %	0 %	25 %	75 %	110346951
622	NC_008242	GCC	2	6	34814	34819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346951
623	NC_008242	ACC	2	6	34850	34855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110346951
624	NC_008242	GAC	2	6	34895	34900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346951
625	NC_008242	ACG	2	6	34908	34913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110346951
626	NC_008242	CCG	2	6	34924	34929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346951
627	NC_008242	GCC	2	6	34987	34992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110346951
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