MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium sp. MCS plasmid1

Total Repeats: 4761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008147	CCG	2	6	176218	176223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802559
4002	NC_008147	AGT	2	6	176239	176244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802559
4003	NC_008147	CAGA	2	8	176261	176268	50 %	0 %	25 %	25 %	108802559
4004	NC_008147	GAT	2	6	176300	176305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802559
4005	NC_008147	CCT	2	6	176371	176376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108802559
4006	NC_008147	CAG	3	9	176570	176578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802559
4007	NC_008147	GAT	2	6	176585	176590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802559
4008	NC_008147	GTT	2	6	176615	176620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108802559
4009	NC_008147	CGG	2	6	176696	176701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802559
4010	NC_008147	GCT	2	6	176704	176709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802559
4011	NC_008147	GATT	2	8	176739	176746	25 %	50 %	25 %	0 %	108802559
4012	NC_008147	GGC	2	6	176792	176797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802559
4013	NC_008147	GCC	2	6	176823	176828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802559
4014	NC_008147	GTC	2	6	176900	176905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802559
4015	NC_008147	GGT	2	6	176914	176919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802559
4016	NC_008147	CGGT	2	8	176933	176940	0 %	25 %	50 %	25 %	108802559
4017	NC_008147	TGG	2	6	176968	176973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802559
4018	NC_008147	GCA	2	6	177004	177009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802559
4019	NC_008147	TTC	2	6	177056	177061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802559
4020	NC_008147	TCG	2	6	177094	177099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802559
4021	NC_008147	ACCTC	2	10	177284	177293	20 %	20 %	0 %	60 %	108802560
4022	NC_008147	GTG	2	6	177335	177340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802560
4023	NC_008147	ACA	2	6	177411	177416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802560
4024	NC_008147	CCG	2	6	177425	177430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802560
4025	NC_008147	GCT	2	6	177456	177461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802560
4026	NC_008147	GCC	2	6	177605	177610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802560
4027	NC_008147	GCGG	2	8	178024	178031	0 %	0 %	75 %	25 %	108802561
4028	NC_008147	TGG	2	6	178038	178043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802561
4029	NC_008147	CTG	2	6	178100	178105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802561
4030	NC_008147	TGG	2	6	178162	178167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802561
4031	NC_008147	CGGGC	2	10	178169	178178	0 %	0 %	60 %	40 %	108802561
4032	NC_008147	TGC	2	6	178200	178205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802561
4033	NC_008147	GGC	2	6	178258	178263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802561
4034	NC_008147	TTC	2	6	178271	178276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108802561
4035	NC_008147	AGT	2	6	178302	178307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802561
4036	NC_008147	TCA	2	6	178316	178321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802562
4037	NC_008147	GTCGA	2	10	178369	178378	20 %	20 %	40 %	20 %	108802562
4038	NC_008147	GTG	2	6	178594	178599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802562
4039	NC_008147	GTGC	2	8	178631	178638	0 %	25 %	50 %	25 %	108802562
4040	NC_008147	GCG	2	6	178641	178646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802562
4041	NC_008147	CAC	2	6	178656	178661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802562
4042	NC_008147	CGG	2	6	178673	178678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802562
4043	NC_008147	CGG	3	9	178702	178710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802562
4044	NC_008147	TCG	2	6	178712	178717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802562
4045	NC_008147	GCG	2	6	178786	178791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802562
4046	NC_008147	TCG	2	6	178820	178825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802562
4047	NC_008147	ACA	2	6	178909	178914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802562
4048	NC_008147	CCA	2	6	178932	178937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802562
4049	NC_008147	GTC	2	6	178971	178976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802562
4050	NC_008147	GGTGT	2	10	178996	179005	0 %	40 %	60 %	0 %	108802562
4051	NC_008147	GGC	2	6	179051	179056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802562
4052	NC_008147	CGGT	2	8	179109	179116	0 %	25 %	50 %	25 %	108802562
4053	NC_008147	GGC	2	6	179131	179136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802562
4054	NC_008147	CGA	2	6	179159	179164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802563
4055	NC_008147	GGT	2	6	179206	179211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802563
4056	NC_008147	CCA	2	6	179213	179218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802563
4057	NC_008147	GGC	2	6	179223	179228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802563
4058	NC_008147	GAG	2	6	179286	179291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802563
4059	NC_008147	GCG	2	6	179378	179383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802563
4060	NC_008147	AGCA	2	8	179446	179453	50 %	0 %	25 %	25 %	108802563
4061	NC_008147	GCA	2	6	179510	179515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802563
4062	NC_008147	CCG	2	6	179551	179556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802563
4063	NC_008147	CAA	2	6	179591	179596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802563
4064	NC_008147	GGT	2	6	179617	179622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802563
4065	NC_008147	GAT	2	6	179676	179681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802563
4066	NC_008147	CGT	2	6	179843	179848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802563
4067	NC_008147	GCC	2	6	179871	179876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802563
4068	NC_008147	ATC	2	6	179913	179918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802563
4069	NC_008147	GTG	2	6	179946	179951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802563
4070	NC_008147	GGGGT	2	10	179999	180008	0 %	20 %	80 %	0 %	108802563
4071	NC_008147	GCC	2	6	180014	180019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802563
4072	NC_008147	GAA	2	6	180023	180028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108802563
4073	NC_008147	AGC	2	6	180103	180108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802563
4074	NC_008147	CAA	2	6	180326	180331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802563
4075	NC_008147	CCG	2	6	180364	180369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802563
4076	NC_008147	ACTC	2	8	180391	180398	25 %	25 %	0 %	50 %	108802563
4077	NC_008147	CAA	2	6	180399	180404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802563
4078	NC_008147	TCGGT	2	10	180494	180503	0 %	40 %	40 %	20 %	108802564
4079	NC_008147	CAG	2	6	180543	180548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802564
4080	NC_008147	ACC	2	6	180569	180574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108802564
4081	NC_008147	CCG	2	6	180614	180619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802564
4082	NC_008147	CTA	2	6	180696	180701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802564
4083	NC_008147	GAG	2	6	180727	180732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802564
4084	NC_008147	GTG	2	6	180886	180891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802565
4085	NC_008147	GCC	2	6	180896	180901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802565
4086	NC_008147	CGA	2	6	180933	180938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802565
4087	NC_008147	GCGG	2	8	181009	181016	0 %	0 %	75 %	25 %	108802565
4088	NC_008147	CGG	2	6	181056	181061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802565
4089	NC_008147	TCG	2	6	181106	181111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802566
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4091	NC_008147	TG	3	6	181145	181150	0 %	50 %	50 %	0 %	108802566
4092	NC_008147	ATC	2	6	181170	181175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108802566
4093	NC_008147	TGGC	2	8	181186	181193	0 %	25 %	50 %	25 %	108802566
4094	NC_008147	CGC	2	6	181194	181199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802566
4095	NC_008147	GCC	2	6	181210	181215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802566
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4099	NC_008147	ACG	2	6	181310	181315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802566
4100	NC_008147	CCG	2	6	181469	181474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802566
4101	NC_008147	CGG	2	6	181527	181532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802566
4102	NC_008147	CTG	2	6	181560	181565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802566
4103	NC_008147	TCG	2	6	181616	181621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802566
4104	NC_008147	CGGTG	2	10	181665	181674	0 %	20 %	60 %	20 %	108802566
4105	NC_008147	GCG	2	6	181727	181732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802566
4106	NC_008147	CTG	2	6	181839	181844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802566
4107	NC_008147	GCC	2	6	181862	181867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802566
4108	NC_008147	ACA	2	6	181895	181900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108802566
4109	NC_008147	CGG	2	6	181906	181911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802566
4110	NC_008147	GCC	2	6	181981	181986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802566
4111	NC_008147	AG	3	6	182174	182179	50 %	0 %	50 %	0 %	108802567
4112	NC_008147	GCC	2	6	182180	182185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802567
4113	NC_008147	GCC	2	6	182190	182195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802567
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4119	NC_008147	GCGAC	2	10	183492	183501	20 %	0 %	40 %	40 %	108802568
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4121	NC_008147	CTG	2	6	183536	183541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802568
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4242	NC_008147	CCTCG	2	10	187900	187909	0 %	20 %	20 %	60 %	108802571
4243	NC_008147	CGA	2	6	187915	187920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108802571
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4271	NC_008147	GAG	2	6	188912	188917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802572
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4351	NC_008147	GCCAG	2	10	191873	191882	20 %	0 %	40 %	40 %	108802577
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4482	NC_008147	GCG	2	6	196961	196966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802583
4483	NC_008147	GGC	2	6	197023	197028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108802583
4484	NC_008147	GGA	2	6	197041	197046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108802583
4485	NC_008147	CGC	2	6	197047	197052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802583
4486	NC_008147	GAT	2	6	197155	197160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802584
4487	NC_008147	CGC	2	6	197187	197192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802584
4488	NC_008147	CGCTG	2	10	197217	197226	0 %	20 %	40 %	40 %	108802584
4489	NC_008147	GCT	2	6	197232	197237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802584
4490	NC_008147	TGG	2	6	197248	197253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108802584
4491	NC_008147	TGA	2	6	197264	197269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108802584
4492	NC_008147	GGCC	2	8	197457	197464	0 %	0 %	50 %	50 %	108802584
4493	NC_008147	GTC	2	6	197814	197819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802585
4494	NC_008147	GCTG	2	8	197832	197839	0 %	25 %	50 %	25 %	108802585
4495	NC_008147	GTC	2	6	197911	197916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802585
4496	NC_008147	CTG	3	9	197989	197997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108802585
4497	NC_008147	CCG	2	6	198151	198156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802585
4498	NC_008147	CG	3	6	198248	198253	0 %	0 %	50 %	50 %	108802585
4499	NC_008147	GCC	2	6	198259	198264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108802585
4500	NC_008147	GCGCC	2	10	198273	198282	0 %	0 %	40 %	60 %	108802585

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