MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 41362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007796	GAA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601323
2	NC_007796	TAC	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601323
3	NC_007796	ATT	2	6	733	738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601324
4	NC_007796	AAT	2	6	751	756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601324
5	NC_007796	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601324
6	NC_007796	GCA	2	6	812	817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601324
7	NC_007796	GCG	2	6	1267	1272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88601325
8	NC_007796	GTT	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601325
9	NC_007796	TCT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601325
10	NC_007796	TGA	2	6	1355	1360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
11	NC_007796	TCT	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601325
12	NC_007796	GAT	2	6	1390	1395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
13	NC_007796	AGA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601325
14	NC_007796	CAT	2	6	1445	1450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601325
15	NC_007796	GAT	2	6	1497	1502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
16	NC_007796	GAT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
17	NC_007796	GGT	2	6	1530	1535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601325
18	NC_007796	ATG	2	6	1561	1566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601325
19	NC_007796	AGG	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601325
20	NC_007796	CCT	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601326
21	NC_007796	TCA	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
22	NC_007796	TTG	2	6	2102	2107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
23	NC_007796	TCC	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601326
24	NC_007796	CAT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
25	NC_007796	GAT	2	6	2302	2307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
26	NC_007796	TAT	2	6	2316	2321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601326
27	NC_007796	GTT	2	6	2347	2352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
28	NC_007796	ATC	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
29	NC_007796	GCA	2	6	2575	2580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
30	NC_007796	AGC	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
31	NC_007796	GAT	3	9	2755	2763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
32	NC_007796	TGA	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
33	NC_007796	AGA	3	9	3095	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601326
34	NC_007796	GAC	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
35	NC_007796	ATC	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
36	NC_007796	ATC	3	9	3500	3508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601326
37	NC_007796	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601326
38	NC_007796	ATA	2	6	3764	3769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601326
39	NC_007796	TAA	2	6	3843	3848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601326
40	NC_007796	TTG	2	6	4067	4072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
41	NC_007796	CAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601326
42	NC_007796	TCC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601326
43	NC_007796	ATG	2	6	4190	4195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
44	NC_007796	ATG	2	6	4226	4231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601326
45	NC_007796	GCT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601326
46	NC_007796	GGT	2	6	4446	4451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601326
47	NC_007796	AAT	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601326
48	NC_007796	TCT	2	6	4575	4580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601326
49	NC_007796	TGT	2	6	4620	4625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601326
50	NC_007796	GGA	2	6	4778	4783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601326
51	NC_007796	GAA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601326
52	NC_007796	TGG	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601326
53	NC_007796	ATT	2	6	4942	4947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601326
54	NC_007796	CAG	2	6	5039	5044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601326
55	NC_007796	GGA	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601326
56	NC_007796	GAG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601327
57	NC_007796	CGA	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
58	NC_007796	ATG	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
59	NC_007796	TGA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
60	NC_007796	GAA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
61	NC_007796	GAA	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
62	NC_007796	TCA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
63	NC_007796	AGC	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
64	NC_007796	GAA	2	6	5670	5675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
65	NC_007796	GAA	2	6	5748	5753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
66	NC_007796	ATC	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
67	NC_007796	GAA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
68	NC_007796	TTA	2	6	6076	6081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601327
69	NC_007796	ATT	2	6	6099	6104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601327
70	NC_007796	CTT	2	6	6153	6158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601327
71	NC_007796	TGA	2	6	6215	6220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
72	NC_007796	GCT	2	6	6435	6440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601327
73	NC_007796	CAT	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
74	NC_007796	GAA	2	6	6644	6649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
75	NC_007796	CAA	2	6	6680	6685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601327
76	NC_007796	AAT	2	6	6924	6929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601327
77	NC_007796	TGA	2	6	6971	6976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
78	NC_007796	GGT	2	6	7030	7035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601327
79	NC_007796	AGA	2	6	7111	7116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
80	NC_007796	AGA	3	9	7124	7132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
81	NC_007796	GCA	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
82	NC_007796	AGA	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
83	NC_007796	ATG	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
84	NC_007796	AGC	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
85	NC_007796	GAG	2	6	7524	7529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601327
86	NC_007796	AGA	2	6	7585	7590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
87	NC_007796	CAT	2	6	7666	7671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
88	NC_007796	CCA	2	6	7677	7682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88601327
89	NC_007796	ATC	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
90	NC_007796	GAT	2	6	7709	7714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
91	NC_007796	AAT	2	6	7923	7928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601327
92	NC_007796	ATT	2	6	8037	8042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601327
93	NC_007796	GCA	2	6	8316	8321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
94	NC_007796	TGG	2	6	8402	8407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601327
95	NC_007796	TGA	2	6	8423	8428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
96	NC_007796	ATA	2	6	8478	8483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601327
97	NC_007796	GCA	2	6	8490	8495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601327
98	NC_007796	ATC	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601327
99	NC_007796	GAT	2	6	8519	8524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
100	NC_007796	ACC	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88601327
101	NC_007796	GAT	2	6	8595	8600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
102	NC_007796	CTC	2	6	8697	8702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601327
103	NC_007796	CCT	2	6	8878	8883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601327
104	NC_007796	TCC	2	6	8902	8907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601327
105	NC_007796	GAA	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
106	NC_007796	GAT	2	6	9002	9007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601327
107	NC_007796	AGA	2	6	9312	9317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601327
108	NC_007796	ATG	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601328
109	NC_007796	GAA	2	6	9736	9741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601328
110	NC_007796	TCT	2	6	9823	9828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601328
111	NC_007796	TCA	2	6	9843	9848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601328
112	NC_007796	GAT	2	6	9869	9874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601328
113	NC_007796	TTC	2	6	9924	9929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601328
114	NC_007796	CTG	2	6	9943	9948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601328
115	NC_007796	GAA	2	6	10127	10132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601328
116	NC_007796	GAA	2	6	10139	10144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601328
117	NC_007796	ATC	2	6	10208	10213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601328
118	NC_007796	ATC	2	6	10287	10292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601328
119	NC_007796	CTT	2	6	10477	10482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601328
120	NC_007796	AGA	2	6	10617	10622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601328
121	NC_007796	CAA	2	6	10639	10644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601328
122	NC_007796	TAA	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601328
123	NC_007796	GTT	2	6	10684	10689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601328
124	NC_007796	GCT	2	6	10726	10731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601328
125	NC_007796	CTG	2	6	10754	10759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601328
126	NC_007796	TAT	3	9	11168	11176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601329
127	NC_007796	TAT	2	6	11266	11271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601329
128	NC_007796	CTT	2	6	11289	11294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601329
129	NC_007796	CAA	2	6	11364	11369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601329
130	NC_007796	ATC	2	6	11395	11400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601329
131	NC_007796	AGA	2	6	11425	11430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601329
132	NC_007796	TGC	3	9	11440	11448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601329
133	NC_007796	AAT	2	6	11608	11613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601329
134	NC_007796	CAA	2	6	11619	11624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601329
135	NC_007796	TCA	2	6	11633	11638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601329
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139	NC_007796	TTC	2	6	11895	11900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601330
140	NC_007796	TGA	3	9	11901	11909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601330
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148	NC_007796	TGC	2	6	12375	12380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601330
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152	NC_007796	GGT	2	6	12429	12434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601330
153	NC_007796	TCT	2	6	12475	12480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601330
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156	NC_007796	CTT	2	6	12566	12571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601330
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163	NC_007796	TCC	2	6	13162	13167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601330
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254	NC_007796	GAG	2	6	21925	21930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601334
255	NC_007796	CTC	2	6	21973	21978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601334
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258	NC_007796	AAC	2	6	22893	22898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601335
259	NC_007796	GTT	2	6	22921	22926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601335
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261	NC_007796	CGA	2	6	22965	22970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601335
262	NC_007796	AGC	2	6	23046	23051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601335
263	NC_007796	TTC	2	6	23055	23060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601335
264	NC_007796	TCT	2	6	23243	23248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601335
265	NC_007796	TGC	2	6	23343	23348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601335
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280	NC_007796	ATA	2	6	24560	24565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601335
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282	NC_007796	CTG	2	6	24630	24635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601335
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287	NC_007796	TAA	2	6	25096	25101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601336
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290	NC_007796	CGT	2	6	25292	25297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601336
291	NC_007796	TGC	2	6	25331	25336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601336
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