MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 62730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007796	GAA	2	6	220510	220515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601510
4002	NC_007796	AATCC	2	10	220528	220537	40 %	20 %	0 %	40 %	88601510
4003	NC_007796	ATG	2	6	220562	220567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601510
4004	NC_007796	AAC	2	6	220603	220608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601510
4005	NC_007796	GAT	2	6	220614	220619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601510
4006	NC_007796	ATC	2	6	220663	220668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601510
4007	NC_007796	GA	3	6	220677	220682	50 %	0 %	50 %	0 %	88601510
4008	NC_007796	ATG	2	6	220697	220702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601510
4009	NC_007796	TGA	2	6	220719	220724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601510
4010	NC_007796	A	7	7	220825	220831	100 %	0 %	0 %	0 %	88601510
4011	NC_007796	AGG	2	6	220850	220855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601510
4012	NC_007796	GAG	2	6	220996	221001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601510
4013	NC_007796	ATC	2	6	221002	221007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601510
4014	NC_007796	ATC	2	6	221065	221070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601510
4015	NC_007796	CAGG	2	8	221164	221171	25 %	0 %	50 %	25 %	88601510
4016	NC_007796	TGGTA	2	10	221203	221212	20 %	40 %	40 %	0 %	88601510
4017	NC_007796	TTC	2	6	221228	221233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601510
4018	NC_007796	A	6	6	221284	221289	100 %	0 %	0 %	0 %	88601510
4019	NC_007796	TGCC	2	8	221324	221331	0 %	25 %	25 %	50 %	88601510
4020	NC_007796	AG	3	6	221349	221354	50 %	0 %	50 %	0 %	88601510
4021	NC_007796	CTT	2	6	221410	221415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601510
4022	NC_007796	GAT	2	6	221416	221421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601510
4023	NC_007796	AGGAA	2	10	221507	221516	60 %	0 %	40 %	0 %	88601510
4024	NC_007796	ATA	2	6	221618	221623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601510
4025	NC_007796	AAT	2	6	221713	221718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601510
4026	NC_007796	GGA	2	6	221784	221789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601510
4027	NC_007796	AGA	2	6	221816	221821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601510
4028	NC_007796	TC	3	6	221823	221828	0 %	50 %	0 %	50 %	88601510
4029	NC_007796	TTCTC	2	10	221852	221861	0 %	60 %	0 %	40 %	88601510
4030	NC_007796	AGTG	2	8	221877	221884	25 %	25 %	50 %	0 %	88601510
4031	NC_007796	TGG	2	6	221953	221958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601510
4032	NC_007796	AT	3	6	222015	222020	50 %	50 %	0 %	0 %	88601511
4033	NC_007796	TTC	2	6	222032	222037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601511
4034	NC_007796	CTT	2	6	222046	222051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601511
4035	NC_007796	T	6	6	222075	222080	0 %	100 %	0 %	0 %	88601511
4036	NC_007796	TC	4	8	222090	222097	0 %	50 %	0 %	50 %	88601511
4037	NC_007796	AGA	2	6	222140	222145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601511
4038	NC_007796	TGAA	2	8	222188	222195	50 %	25 %	25 %	0 %	88601511
4039	NC_007796	ATT	3	9	222286	222294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601511
4040	NC_007796	TTG	2	6	222326	222331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601511
4041	NC_007796	TGC	2	6	222363	222368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601511
4042	NC_007796	TCA	2	6	222377	222382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601511
4043	NC_007796	GGGA	2	8	222386	222393	25 %	0 %	75 %	0 %	88601511
4044	NC_007796	GATC	2	8	222399	222406	25 %	25 %	25 %	25 %	88601511
4045	NC_007796	ATT	2	6	222409	222414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601511
4046	NC_007796	GCA	2	6	222439	222444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601511
4047	NC_007796	T	6	6	222450	222455	0 %	100 %	0 %	0 %	88601511
4048	NC_007796	T	7	7	222543	222549	0 %	100 %	0 %	0 %	88601511
4049	NC_007796	ATT	2	6	222577	222582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601511
4050	NC_007796	CTG	2	6	222587	222592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601511
4051	NC_007796	ATC	2	6	222673	222678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601511
4052	NC_007796	GTT	2	6	222799	222804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601511
4053	NC_007796	ATG	2	6	222848	222853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601511
4054	NC_007796	TCT	2	6	222927	222932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601511
4055	NC_007796	AGTA	2	8	222992	222999	50 %	25 %	25 %	0 %	88601512
4056	NC_007796	ATC	2	6	223035	223040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601512
4057	NC_007796	TCCT	2	8	223069	223076	0 %	50 %	0 %	50 %	88601512
4058	NC_007796	AT	3	6	223179	223184	50 %	50 %	0 %	0 %	88601512
4059	NC_007796	TTG	2	6	223204	223209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601512
4060	NC_007796	CTC	2	6	223324	223329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601512
4061	NC_007796	ATT	2	6	223395	223400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601512
4062	NC_007796	GATT	2	8	223429	223436	25 %	50 %	25 %	0 %	88601512
4063	NC_007796	GA	3	6	223441	223446	50 %	0 %	50 %	0 %	88601512
4064	NC_007796	TTG	2	6	223471	223476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601512
4065	NC_007796	TTC	2	6	223528	223533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601512
4066	NC_007796	GCT	2	6	223575	223580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601512
4067	NC_007796	ATG	2	6	223590	223595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601512
4068	NC_007796	CTGGGG	2	12	223614	223625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	88601512
4069	NC_007796	CA	3	6	223633	223638	50 %	0 %	0 %	50 %	88601512
4070	NC_007796	TGG	2	6	223695	223700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601512
4071	NC_007796	TTG	2	6	223726	223731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601512
4072	NC_007796	CA	3	6	223786	223791	50 %	0 %	0 %	50 %	88601512
4073	NC_007796	T	6	6	223796	223801	0 %	100 %	0 %	0 %	88601512
4074	NC_007796	AT	3	6	223913	223918	50 %	50 %	0 %	0 %	88601513
4075	NC_007796	GAAC	2	8	223921	223928	50 %	0 %	25 %	25 %	88601513
4076	NC_007796	ATC	2	6	223968	223973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601513
4077	NC_007796	CGA	2	6	224017	224022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601513
4078	NC_007796	A	6	6	224024	224029	100 %	0 %	0 %	0 %	88601513
4079	NC_007796	TG	3	6	224112	224117	0 %	50 %	50 %	0 %	88601513
4080	NC_007796	ACT	2	6	224349	224354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601513
4081	NC_007796	TCA	2	6	224356	224361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601513
4082	NC_007796	ATCAG	2	10	224389	224398	40 %	20 %	20 %	20 %	88601513
4083	NC_007796	CAA	2	6	224493	224498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601513
4084	NC_007796	ATC	2	6	224600	224605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601513
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4086	NC_007796	AT	3	6	224705	224710	50 %	50 %	0 %	0 %	88601514
4087	NC_007796	GCA	2	6	224767	224772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601514
4088	NC_007796	TAT	2	6	224913	224918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88601514
4089	NC_007796	TCA	2	6	224956	224961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601514
4090	NC_007796	GACT	2	8	224978	224985	25 %	25 %	25 %	25 %	88601514
4091	NC_007796	CAGG	2	8	225016	225023	25 %	0 %	50 %	25 %	88601514
4092	NC_007796	ATGG	2	8	225026	225033	25 %	25 %	50 %	0 %	88601514
4093	NC_007796	CTT	2	6	225049	225054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601514
4094	NC_007796	GATG	2	8	225132	225139	25 %	25 %	50 %	0 %	88601514
4095	NC_007796	CA	3	6	225165	225170	50 %	0 %	0 %	50 %	88601514
4096	NC_007796	GTA	2	6	225251	225256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601514
4097	NC_007796	TGTC	2	8	225315	225322	0 %	50 %	25 %	25 %	88601514
4098	NC_007796	ACT	2	6	225337	225342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601514
4099	NC_007796	AAT	2	6	225343	225348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601514
4100	NC_007796	CAAG	2	8	225359	225366	50 %	0 %	25 %	25 %	88601514
4101	NC_007796	TGT	2	6	225410	225415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601515
4102	NC_007796	CT	3	6	225418	225423	0 %	50 %	0 %	50 %	88601515
4103	NC_007796	CTTC	2	8	225444	225451	0 %	50 %	0 %	50 %	88601515
4104	NC_007796	GAG	2	6	225504	225509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601515
4105	NC_007796	TTG	2	6	226088	226093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601516
4106	NC_007796	CTG	2	6	226121	226126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601516
4107	NC_007796	GAG	2	6	226152	226157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601516
4108	NC_007796	ATG	2	6	226240	226245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601516
4109	NC_007796	T	6	6	226330	226335	0 %	100 %	0 %	0 %	88601516
4110	NC_007796	CAA	2	6	226358	226363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601516
4111	NC_007796	TTGA	2	8	226375	226382	25 %	50 %	25 %	0 %	88601516
4112	NC_007796	GAG	2	6	226390	226395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88601516
4113	NC_007796	CAC	2	6	226491	226496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88601516
4114	NC_007796	TCA	2	6	226532	226537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601516
4115	NC_007796	GAT	2	6	226590	226595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601516
4116	NC_007796	GAC	2	6	226614	226619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601516
4117	NC_007796	CA	3	6	226665	226670	50 %	0 %	0 %	50 %	88601516
4118	NC_007796	AT	3	6	226762	226767	50 %	50 %	0 %	0 %	88601516
4119	NC_007796	T	6	6	226833	226838	0 %	100 %	0 %	0 %	88601516
4120	NC_007796	CTGAT	2	10	226869	226878	20 %	40 %	20 %	20 %	88601516
4121	NC_007796	TAC	2	6	226895	226900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601516
4122	NC_007796	GTA	2	6	226933	226938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601517
4123	NC_007796	GATT	2	8	226956	226963	25 %	50 %	25 %	0 %	88601517
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4125	NC_007796	ATA	2	6	226973	226978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88601517
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4243	NC_007796	A	6	6	235540	235545	100 %	0 %	0 %	0 %	88601523
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4499	NC_007796	TGA	2	6	248511	248516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601535
4500	NC_007796	GAA	2	6	248546	248551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601535

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