MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Magnetospirillum magneticum AMB-1 chromosome

Total Repeats: 3337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007626	CCGCGC	2	12	3823182	3823193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83312577
2502	NC_007626	CCACGT	2	12	3824255	3824266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312578
2503	NC_007626	TCAACC	2	12	3827195	3827206	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	83312580
2504	NC_007626	CCATCA	2	12	3827396	3827407	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	83312580
2505	NC_007626	GGTGCT	2	12	3827912	3827923	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	83312581
2506	NC_007626	CGACGG	2	12	3828035	3828046	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312581
2507	NC_007626	TCGGGC	2	12	3830847	3830858	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312583
2508	NC_007626	GGCGAT	2	12	3830957	3830968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83312583
2509	NC_007626	ACGGCG	2	12	3832969	3832980	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312585
2510	NC_007626	GCCTAC	2	12	3833370	3833381	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312585
2511	NC_007626	GCATCC	2	12	3833533	3833544	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312585
2512	NC_007626	GGACCT	2	12	3834016	3834027	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312586
2513	NC_007626	CCCGCG	2	12	3836190	3836201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83312588
2514	NC_007626	CCGCGC	2	12	3837075	3837086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83312589
2515	NC_007626	CGCCGA	2	12	3838009	3838020	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312591
2516	NC_007626	CTTCGG	2	12	3838201	3838212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83312591
2517	NC_007626	GCCCGC	2	12	3838241	3838252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83312591
2518	NC_007626	CATCGG	2	12	3838393	3838404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312591
2519	NC_007626	GCATCC	2	12	3838485	3838496	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312591
2520	NC_007626	GGCATG	2	12	3840196	3840207	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83312592
2521	NC_007626	CCAGGG	2	12	3840329	3840340	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312592
2522	NC_007626	TGGCGG	2	12	3840949	3840960	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83312593
2523	NC_007626	CGGCGC	2	12	3841190	3841201	0 %	0 %	50 %	50 %	83312593
2524	NC_007626	GCCCAG	2	12	3841971	3841982	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312594
2525	NC_007626	CGCCTC	2	12	3843481	3843492	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83312596
2526	NC_007626	GCTGGA	2	12	3843593	3843604	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83312596
2527	NC_007626	CCAAGG	2	12	3846273	3846284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312599
2528	NC_007626	CCGTCC	2	12	3847900	3847911	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83312602
2529	NC_007626	GGCCAA	2	12	3848102	3848113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312602
2530	NC_007626	AGGCCA	2	12	3848368	3848379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312602
2531	NC_007626	CGGCAA	2	12	3848633	3848644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312602
2532	NC_007626	ACCGCC	2	12	3850839	3850850	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83312602
2533	NC_007626	TCGCCG	2	12	3852163	3852174	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312604
2534	NC_007626	TCGACA	2	12	3852863	3852874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83312604
2535	NC_007626	TGGCGC	2	12	3853029	3853040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312605
2536	NC_007626	CGTGGC	2	12	3856382	3856393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	162319782
2537	NC_007626	CCGCCA	2	12	3856408	3856419	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	162319782
2538	NC_007626	GGTGGC	2	12	3856706	3856717	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	162319782
2539	NC_007626	CGTGGC	2	12	3857488	3857499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312609
2540	NC_007626	CGGCCA	2	12	3858766	3858777	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312610
2541	NC_007626	TCCCGA	2	12	3862796	3862807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312613
2542	NC_007626	GGCGCC	2	12	3862875	3862886	0 %	0 %	50 %	50 %	83312613
2543	NC_007626	CACCCG	2	12	3863024	3863035	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83312613
2544	NC_007626	CGGCGA	2	12	3864166	3864177	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312615
2545	NC_007626	CACCGC	2	12	3865186	3865197	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83312615
2546	NC_007626	GCGCGA	2	12	3865477	3865488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312615
2547	NC_007626	CATCGG	2	12	3865929	3865940	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312616
2548	NC_007626	CGCCAT	2	12	3866646	3866657	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312616
2549	NC_007626	TGCCGC	2	12	3866771	3866782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312616
2550	NC_007626	GACGGA	2	12	3868414	3868425	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83312619
2551	NC_007626	CTCCAC	2	12	3871997	3872008	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	83312621
2552	NC_007626	CGAACA	2	12	3873765	3873776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	83312622
2553	NC_007626	ACCAGC	2	12	3874637	3874648	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	83312622
2554	NC_007626	ACCGCC	2	12	3874917	3874928	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83312623
2555	NC_007626	GTCCTC	2	12	3875081	3875092	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	83312623
2556	NC_007626	CCGTCG	2	12	3877064	3877075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312626
2557	NC_007626	GCCCAT	2	12	3879029	3879040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312629
2558	NC_007626	CGGTGG	2	12	3881557	3881568	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83312631
2559	NC_007626	ATCGGC	2	12	3883980	3883991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312634
2560	NC_007626	CCTCCA	2	12	3884282	3884293	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	83312634
2561	NC_007626	GGACAG	2	12	3885942	3885953	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83312634
2562	NC_007626	ATGCCG	2	12	3886339	3886350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312635
2563	NC_007626	CTGCAT	2	12	3890504	3890515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83312637
2564	NC_007626	CGTCAT	2	12	3891290	3891301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83312638
2565	NC_007626	CAGGAG	2	12	3892056	3892067	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83312638
2566	NC_007626	CCGAGG	2	12	3892897	3892908	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312638
2567	NC_007626	CCCAAC	2	12	3895433	3895444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	83312640
2568	NC_007626	TGGGTG	2	12	3895898	3895909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83312640
2569	NC_007626	CACCGT	2	12	3899073	3899084	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312645
2570	NC_007626	CCAATC	2	12	3900871	3900882	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	83312646
2571	NC_007626	CTGAAG	2	12	3901485	3901496	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	83312646
2572	NC_007626	CCCTGG	2	12	3901882	3901893	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312647
2573	NC_007626	GGCTGG	2	12	3902050	3902061	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83312647
2574	NC_007626	CGACCG	2	12	3902231	3902242	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312647
2575	NC_007626	CGGCAA	2	12	3902627	3902638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312647
2576	NC_007626	GCGCCC	2	12	3903678	3903689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	83312649
2577	NC_007626	TGGCCG	2	12	3904014	3904025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312649
2578	NC_007626	CCGTGG	2	12	3904370	3904381	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312650
2579	NC_007626	ATCGAC	2	12	3904796	3904807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83312651
2580	NC_007626	CCCCGA	2	12	3905524	3905535	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83312652
2581	NC_007626	CGCCAC	2	12	3905900	3905911	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	83312652
2582	NC_007626	GGTCAT	2	12	3906786	3906797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	83312653
2583	NC_007626	GCCGAG	2	12	3910951	3910962	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312657
2584	NC_007626	ATGCCG	2	12	3911048	3911059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312657
2585	NC_007626	ATGCCT	2	12	3912653	3912664	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83312658
2586	NC_007626	GGGCGC	2	12	3912887	3912898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83312658
2587	NC_007626	CGAAGC	2	12	3913289	3913300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312658
2588	NC_007626	TTGCCG	2	12	3913495	3913506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83312658
2589	NC_007626	AGGCCC	2	12	3914853	3914864	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312660
2590	NC_007626	CCCGAG	2	12	3918389	3918400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312663
2591	NC_007626	ACCGTT	2	12	3919406	3919417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83312663
2592	NC_007626	CGGCAT	2	12	3919582	3919593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312663
2593	NC_007626	CGAAGG	2	12	3920726	3920737	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83312665
2594	NC_007626	CTCGGT	2	12	3920986	3920997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83312665
2595	NC_007626	ATGGCG	2	12	3921059	3921070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83312665
2596	NC_007626	TTGGGG	2	12	3922130	3922141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83312666
2597	NC_007626	ATCAGG	2	12	3924459	3924470	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	83312669
2598	NC_007626	CTGGCC	2	12	3925649	3925660	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312670
2599	NC_007626	GTGTGG	2	12	3926206	3926217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	83312671
2600	NC_007626	GTCGGC	2	12	3926445	3926456	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312671
2601	NC_007626	CGAGGA	2	12	3927357	3927368	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83312672
2602	NC_007626	CCTCGG	2	12	3930878	3930889	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312677
2603	NC_007626	CTTCAG	2	12	3930930	3930941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83312677
2604	NC_007626	CGTCCA	2	12	3931172	3931183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312677
2605	NC_007626	AATTGC	2	12	3931339	3931350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	83312677
2606	NC_007626	CTGGGC	2	12	3940261	3940272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312687
2607	NC_007626	CGAGGA	2	12	3941165	3941176	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83312688
2608	NC_007626	AAGGCC	2	12	3941298	3941309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312688
2609	NC_007626	GGGCAA	2	12	3941354	3941365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	83312688
2610	NC_007626	CATCGT	2	12	3950656	3950667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83312697
2611	NC_007626	CGGCAC	2	12	3953732	3953743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312699
2612	NC_007626	CGGGTC	2	12	3957594	3957605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	83312704
2613	NC_007626	GAGCGC	2	12	3957932	3957943	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312705
2614	NC_007626	GGCTGG	2	12	3959807	3959818	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83312707
2615	NC_007626	CGAGGC	2	12	3959943	3959954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83312707
2616	NC_007626	GGCTGG	2	12	3960067	3960078	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	83312707
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2618	NC_007626	GAGACC	2	12	3961255	3961266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312707
2619	NC_007626	TCCAAG	2	12	3965393	3965404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83312710
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2638	NC_007626	TGCGCT	2	12	3987174	3987185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83312725
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2640	NC_007626	CACCGT	2	12	3996362	3996373	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162319780
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2681	NC_007626	CGAAGC	2	12	4080440	4080451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312812
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2708	NC_007626	CTCGGC	2	12	4123098	4123109	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312846
2709	NC_007626	TTGGCC	2	12	4123486	4123497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83312847
2710	NC_007626	CTCGGC	2	12	4123530	4123541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312847
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2715	NC_007626	GCCTCG	2	12	4137483	4137494	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312862
2716	NC_007626	CTGCCC	2	12	4138504	4138515	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	83312863
2717	NC_007626	CAAGGC	2	12	4149530	4149541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83312871
2718	NC_007626	CGCGGG	2	12	4150141	4150152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83312871
2719	NC_007626	AGCGCC	2	12	4151413	4151424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312872
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2721	NC_007626	ACACAG	2	12	4154048	4154059	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	83312872
2722	NC_007626	GGTGAT	2	12	4156386	4156397	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	83312874
2723	NC_007626	AAGCTG	2	12	4157665	4157676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	83312875
2724	NC_007626	ACGCTG	2	12	4157995	4158006	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83312875
2725	NC_007626	TACCCG	2	12	4163299	4163310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312880
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2740	NC_007626	GACCGC	2	12	4182687	4182698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312889
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2830	NC_007626	CCGACG	2	12	4279200	4279211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	83312971
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2832	NC_007626	CCATCG	2	12	4285482	4285493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312977
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2834	NC_007626	CCACGT	2	12	4288273	4288284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83312979
2835	NC_007626	GCCCTG	2	12	4288801	4288812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83312980
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2932	NC_007626	CCGACA	2	12	4411279	4411290	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	83313100
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2934	NC_007626	TGGCCA	2	12	4413810	4413821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83313105
2935	NC_007626	GATCGA	2	12	4414317	4414328	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	83313105
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2939	NC_007626	GCCAGG	2	12	4423864	4423875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313114
2940	NC_007626	CGCGGG	2	12	4424441	4424452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83313114
2941	NC_007626	GAACAT	2	12	4424991	4425002	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	83313114
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2943	NC_007626	CGATGG	2	12	4426140	4426151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83313116
2944	NC_007626	GCCGGC	2	12	4427733	4427744	0 %	0 %	50 %	50 %	83313118
2945	NC_007626	GGCCCG	2	12	4428005	4428016	0 %	0 %	50 %	50 %	83313118
2946	NC_007626	GCCCTG	2	12	4428150	4428161	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83313118
2947	NC_007626	TTCGCC	2	12	4428790	4428801	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	83313119
2948	NC_007626	GACGGC	2	12	4440775	4440786	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313134
2949	NC_007626	GCCAAG	2	12	4444204	4444215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313141
2950	NC_007626	GCCAAG	2	12	4445519	4445530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313143
2951	NC_007626	CCGAGG	2	12	4452207	4452218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313155
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2954	NC_007626	CCCATG	2	12	4456944	4456955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	83313157
2955	NC_007626	TCCAGG	2	12	4457241	4457252	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83313157
2956	NC_007626	GGCCAG	2	12	4458212	4458223	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313157
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2963	NC_007626	TGGCCA	2	12	4462953	4462964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83313160
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2966	NC_007626	CAAGGC	2	12	4465387	4465398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313162
2967	NC_007626	TCGGCA	2	12	4467765	4467776	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83313166
2968	NC_007626	CTTGGC	2	12	4471881	4471892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	83313170
2969	NC_007626	CGCGGG	2	12	4471928	4471939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83313170
2970	NC_007626	TCCTCT	3	18	4473166	4473183	0 %	50 %	0 %	50 %	83313170
2971	NC_007626	GGCGGG	2	12	4473273	4473284	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	83313170
2972	NC_007626	GGCGCG	2	12	4473468	4473479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	83313170
2973	NC_007626	CGAACG	2	12	4474891	4474902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313172
2974	NC_007626	CCTCGG	2	12	4474929	4474940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83313172
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2976	NC_007626	TGGGCA	2	12	4481213	4481224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	83313177
2977	NC_007626	TCGTGG	2	12	4481294	4481305	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	83313177
2978	NC_007626	CTCCTT	2	12	4483778	4483789	0 %	50 %	0 %	50 %	83313180
2979	NC_007626	CAAGGC	2	12	4486824	4486835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	83313183
2980	NC_007626	CCTCGG	2	12	4488007	4488018	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83313185
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2982	NC_007626	CTGATC	2	12	4489535	4489546	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83313187
2983	NC_007626	TCCGGC	2	12	4489675	4489686	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	83313187
2984	NC_007626	ATCCTG	2	12	4490710	4490721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	83313188
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2987	NC_007626	CCGAAT	2	12	4494839	4494850	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	83313191
2988	NC_007626	TGGACC	2	12	4495992	4496003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	83313192
2989	NC_007626	GCCGAG	2	12	4496531	4496542	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	83313192
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3000	NC_007626	GTGCTG	2	12	4514787	4514798	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	83313208

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