MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome

Total Repeats: 502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007295	AAAATA	2	12	1592	1603	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893360
2	NC_007295	ATTTTG	2	12	5879	5890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71893364
3	NC_007295	TAAAAA	2	12	6427	6438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893365
4	NC_007295	TCATTT	2	12	6467	6478	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893365
5	NC_007295	AATTTA	2	12	6591	6602	50 %	50 %	0 %	0 %	71893365
6	NC_007295	AAGAAA	2	12	7071	7082	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893365
7	NC_007295	GAAAAT	2	12	11548	11559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893369
8	NC_007295	AATCAA	2	12	14542	14553	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893371
9	NC_007295	ATTAAC	2	12	15032	15043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71893373
10	NC_007295	TAATTT	2	12	16008	16019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893374
11	NC_007295	CAAAAA	2	12	18001	18012	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893377
12	NC_007295	ATTGAA	2	12	21616	21627	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893378
13	NC_007295	TCAAAA	2	12	21838	21849	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893378
14	NC_007295	ATTTCA	2	12	21883	21894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71893378
15	NC_007295	TTTTCA	2	12	22147	22158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893378
16	NC_007295	AATAAG	2	12	23568	23579	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893379
17	NC_007295	TTTCAT	2	12	23763	23774	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893379
18	NC_007295	TTTTCA	2	12	24548	24559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	71893379
19	NC_007295	TTATTT	2	12	26102	26113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893381
20	NC_007295	TGGTTT	2	12	27922	27933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893383
21	NC_007295	TTGAAA	2	12	28651	28662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893384
22	NC_007295	ATTAAA	2	12	30842	30853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893386
23	NC_007295	TGCAAT	2	12	31574	31585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893387
24	NC_007295	ATCAAT	2	12	33838	33849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	71893388
25	NC_007295	TTTTTG	2	12	34690	34701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893388
26	NC_007295	GTTCGA	2	12	35424	35435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71893388
27	NC_007295	TTATTT	2	12	35616	35627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893388
28	NC_007295	TTAAAA	2	12	36733	36744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893389
29	NC_007295	TGAAGT	2	12	38643	38654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893390
30	NC_007295	ATAAAA	2	12	40510	40521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893391
31	NC_007295	TTTTAA	2	12	42478	42489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893392
32	NC_007295	AATAAA	2	12	45068	45079	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	71893393
33	NC_007295	TTTTGT	2	12	46203	46214	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893394
34	NC_007295	AATTTT	2	12	46964	46975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893395
35	NC_007295	GGGAAT	2	12	48236	48247	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	71893396
36	NC_007295	TGAATT	2	12	48809	48820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893396
37	NC_007295	ATATTG	2	12	50992	51003	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893400
38	NC_007295	ATGATT	2	12	51916	51927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893400
39	NC_007295	TATAAA	2	12	52524	52535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893401
40	NC_007295	CAAAAA	2	12	52543	52554	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893401
41	NC_007295	TAATTT	2	12	53111	53122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893402
42	NC_007295	TAATTT	2	12	53605	53616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893403
43	NC_007295	ATGTTT	2	12	53733	53744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71893404
44	NC_007295	GGTATT	2	12	59072	59083	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	71893409
45	NC_007295	AGCAAC	2	12	61081	61092	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	71893411
46	NC_007295	GTCGAA	2	12	62877	62888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71893412
47	NC_007295	AATTTT	2	12	63869	63880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893413
48	NC_007295	TGTTTT	2	12	64058	64069	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893413
49	NC_007295	GAACAA	2	12	71570	71581	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71893419
50	NC_007295	TTAATT	2	12	72747	72758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893419
51	NC_007295	GAAAAA	2	12	72809	72820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893419
52	NC_007295	TAAAAT	2	12	73386	73397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893419
53	NC_007295	AACAAA	2	12	74893	74904	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893419
54	NC_007295	AATCAC	2	12	75645	75656	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	71893419
55	NC_007295	CTAATT	2	12	80166	80177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71893421
56	NC_007295	TTGAAC	2	12	81906	81917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893422
57	NC_007295	AATTAA	2	12	82767	82778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893422
58	NC_007295	ATCTGA	2	12	82843	82854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893422
59	NC_007295	TGGTTT	2	12	83428	83439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893423
60	NC_007295	CAAAAT	2	12	84537	84548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893424
61	NC_007295	TTGGTT	2	12	87860	87871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893428
62	NC_007295	TGCAAG	2	12	91435	91446	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	71893430
63	NC_007295	GGAATT	2	12	91481	91492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893430
64	NC_007295	CAAAAA	2	12	93292	93303	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893433
65	NC_007295	TTTTGC	2	12	94986	94997	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	71893436
66	NC_007295	CATATG	2	12	95036	95047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893436
67	NC_007295	TTGGTT	2	12	95303	95314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	71893436
68	NC_007295	TTAGGA	2	12	95548	95559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893436
69	NC_007295	TTCAGG	2	12	97971	97982	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	71893438
70	NC_007295	AATTTT	2	12	98370	98381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893438
71	NC_007295	ATTTTA	2	12	98563	98574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893438
72	NC_007295	TAGTAA	2	12	105027	105038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893442
73	NC_007295	TTTCTT	2	12	105356	105367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71893442
74	NC_007295	TAAAAC	2	12	105528	105539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893442
75	NC_007295	AATTTA	2	12	105960	105971	50 %	50 %	0 %	0 %	71893443
76	NC_007295	TTTTAA	2	12	109575	109586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893444
77	NC_007295	CAAGAA	2	12	110032	110043	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	71893445
78	NC_007295	AAAGAT	2	12	110044	110055	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893445
79	NC_007295	TCCAGA	2	12	112340	112351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	71893447
80	NC_007295	ATTTTT	2	12	114645	114656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893448
81	NC_007295	ACAAAA	2	12	115324	115335	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893448
82	NC_007295	AATTTT	2	12	115713	115724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893448
83	NC_007295	AAGGAA	2	12	125131	125142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	71893455
84	NC_007295	AGTTCA	2	12	129692	129703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893457
85	NC_007295	ATAATT	2	12	129866	129877	50 %	50 %	0 %	0 %	71893457
86	NC_007295	GCAATT	2	12	137051	137062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893460
87	NC_007295	ATAATT	2	12	141730	141741	50 %	50 %	0 %	0 %	71893462
88	NC_007295	TTTTAA	2	12	142327	142338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893462
89	NC_007295	TTTTTC	3	18	143879	143896	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	71893463
90	NC_007295	ATTTAA	2	12	148657	148668	50 %	50 %	0 %	0 %	71893465
91	NC_007295	ATTGCA	2	12	149545	149556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893466
92	NC_007295	TATCGT	2	12	150225	150236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71893466
93	NC_007295	TTGAAC	2	12	150791	150802	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893467
94	NC_007295	AATGTT	2	12	151468	151479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	71893468
95	NC_007295	TGGAGT	2	12	152384	152395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	71893469
96	NC_007295	AGATCA	2	12	154258	154269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893470
97	NC_007295	AGATCA	2	12	156627	156638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893473
98	NC_007295	GAATCT	2	12	160930	160941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	71893479
99	NC_007295	TTTTTG	2	12	161085	161096	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	71893479
100	NC_007295	AAATTT	2	12	161585	161596	50 %	50 %	0 %	0 %	71893480
101	NC_007295	CTAAAA	2	12	165429	165440	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893486
102	NC_007295	TTTTGA	2	12	169372	169383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	71893489
103	NC_007295	AAAGAA	2	12	170111	170122	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893489
104	NC_007295	TTGACT	2	12	171839	171850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71893490
105	NC_007295	TCTTGA	2	12	172743	172754	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71893490
106	NC_007295	AGAAAA	2	12	173384	173395	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	71893490
107	NC_007295	AAAAGT	2	12	173893	173904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	71893491
108	NC_007295	AAAAAC	2	12	175723	175734	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893493
109	NC_007295	AAATTA	2	12	177676	177687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	71893496
110	NC_007295	TTATTT	2	12	179055	179066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893497
111	NC_007295	TTGAAA	2	12	180073	180084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893499
112	NC_007295	TTTTTA	2	12	181031	181042	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893500
113	NC_007295	AATTGA	2	12	181079	181090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	71893500
114	NC_007295	CAAAAA	2	12	182448	182459	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	71893501
115	NC_007295	ACTTTA	2	12	182524	182535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	71893501
116	NC_007295	TTTTAA	2	12	185584	185595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	71893505
117	NC_007295	ATTTTT	2	12	185993	186004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	71893505
118	NC_007295	CAAAAT	2	12	186847	186858	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	71893507
119	NC_007295	AGTTCT	2	12	191734	191745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	71893512
120	NC_007295	ATTGGA	2	12	192752	192763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	71893513
121	NC_007295	TAAAGC	2	12	193705	193716	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	71893514
122	NC_007295	ATTTCC	2	12	206269	206280	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	71893534
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