MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	AAAATA	2	12	1386	1397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54019970
2	NC_006360	ATTTTG	2	12	5671	5682	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54019974
3	NC_006360	TAAAAA	2	12	6219	6230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54019975
4	NC_006360	TCATTT	2	12	6259	6270	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54019975
5	NC_006360	AATTTA	2	12	6383	6394	50 %	50 %	0 %	0 %	54019975
6	NC_006360	AAGAAA	2	12	6863	6874	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54019975
7	NC_006360	GAAAAT	2	12	11340	11351	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54019979
8	NC_006360	AATCAA	2	12	14334	14345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54019981
9	NC_006360	ATTAAC	2	12	14821	14832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54019983
10	NC_006360	TAATTT	2	12	15797	15808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019984
11	NC_006360	TAAATC	2	12	17458	17469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54020307
12	NC_006360	CTTTTT	2	12	18642	18653	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	54019986
13	NC_006360	CAAAAA	2	12	20249	20260	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	54020310
14	NC_006360	ATTGAA	2	12	23875	23886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54020311
15	NC_006360	AATAAG	2	12	25827	25838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54020312
16	NC_006360	TTTCAT	2	12	26022	26033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54020312
17	NC_006360	TTTTCA	2	12	26807	26818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54020312
18	NC_006360	TTAGTT	2	12	31321	31332	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54020315
19	NC_006360	TTTTAA	2	12	31684	31695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020315
20	NC_006360	AATAAA	2	12	32057	32068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54020315
21	NC_006360	TGGTTT	2	12	35823	35834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019988
22	NC_006360	TTGAAA	2	12	36552	36563	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54019989
23	NC_006360	ATTAAA	2	12	38742	38753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020317
24	NC_006360	TGCAAT	2	12	39474	39485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54020318
25	NC_006360	ATCAAT	2	12	41738	41749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54020319
26	NC_006360	TTTTTG	2	12	42590	42601	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	54020319
27	NC_006360	GTTCGA	2	12	43324	43335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54020319
28	NC_006360	TTATTT	2	12	43516	43527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54020319
29	NC_006360	TTAAAA	2	12	44630	44641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020320
30	NC_006360	TGAAGT	2	12	46540	46551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019991
31	NC_006360	ATAAAA	2	12	48425	48436	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54019992
32	NC_006360	TTTTAA	2	12	50393	50404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020321
33	NC_006360	AATAAA	2	12	52983	52994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54020323
34	NC_006360	TTTTGT	2	12	54118	54129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	54020324
35	NC_006360	AATTTT	2	12	54879	54890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019993
36	NC_006360	GGGAAT	2	12	56151	56162	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	54019994
37	NC_006360	TGAATT	2	12	56724	56735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54019994
38	NC_006360	ATATTG	2	12	58907	58918	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54019998
39	NC_006360	ATGATT	2	12	59831	59842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54019998
40	NC_006360	TATAAA	2	12	60439	60450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019999
41	NC_006360	CAAAAA	2	12	60458	60469	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	54019999
42	NC_006360	TAATTT	2	12	61026	61037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020000
43	NC_006360	TAATTT	2	12	61520	61531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020001
44	NC_006360	TAAATC	2	12	61600	61611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54020002
45	NC_006360	ATGTTT	2	12	61648	61659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54020002
46	NC_006360	GGTATT	2	12	66986	66997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	54020007
47	NC_006360	AGCAAC	2	12	68982	68993	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	54020009
48	NC_006360	GTCGAA	2	12	70778	70789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54020010
49	NC_006360	AATTTT	2	12	71769	71780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020011
50	NC_006360	TGTTTT	2	12	71958	71969	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	54020011
51	NC_006360	GAACAA	2	12	79473	79484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54020017
52	NC_006360	TTAATT	2	12	80650	80661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020017
53	NC_006360	GAAAAA	2	12	80712	80723	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	54020017
54	NC_006360	TAAAAT	2	12	81289	81300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020017
55	NC_006360	AACAAA	2	12	82796	82807	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	54020017
56	NC_006360	AATCAC	2	12	83548	83559	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	54020017
57	NC_006360	CTAATT	2	12	88070	88081	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54020325
58	NC_006360	TTGAAC	2	12	89811	89822	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54020021
59	NC_006360	AATTAA	2	12	90672	90683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020021
60	NC_006360	ATCTGA	2	12	90748	90759	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54020021
61	NC_006360	CAAAAT	2	12	92443	92454	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54020023
62	NC_006360	TTGGTT	2	12	95766	95777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54020027
63	NC_006360	TTTTAT	2	12	98574	98585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54020327
64	NC_006360	GCCCAC	2	12	100434	100445	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	54020328
65	NC_006360	TGCAAG	2	12	101296	101307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54020328
66	NC_006360	GGAATT	2	12	101342	101353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54020328
67	NC_006360	CAAAAA	2	12	103154	103165	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	54020331
68	NC_006360	ACAAAA	2	12	105805	105816	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	54020031
69	NC_006360	ATTTAG	2	12	106680	106691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54020032
70	NC_006360	TTTTTA	2	12	106936	106947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54020033
71	NC_006360	TAAAAA	2	12	110361	110372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54020036
72	NC_006360	AGTTGA	2	12	112500	112511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54020038
73	NC_006360	AATTTA	2	12	113091	113102	50 %	50 %	0 %	0 %	54020039
74	NC_006360	ATAATT	2	12	121394	121405	50 %	50 %	0 %	0 %	54020338
75	NC_006360	ATTCCT	2	12	122551	122562	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54020339
76	NC_006360	TTGAAT	2	12	124005	124016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54020042
77	NC_006360	CAAAAA	2	12	124076	124087	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	54020042
78	NC_006360	TAATTT	2	12	125269	125280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020042
79	NC_006360	GATTTA	2	12	126458	126469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54020042
80	NC_006360	AAATAA	2	12	128529	128540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54020043
81	NC_006360	TTGAAA	2	12	132334	132345	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54020044
82	NC_006360	TTAACT	2	12	135918	135929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54020343
83	NC_006360	AATATC	2	12	139773	139784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54020347
84	NC_006360	ATTTTT	2	12	143018	143029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54020352
85	NC_006360	TCAAAG	2	12	143075	143086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54020352
86	NC_006360	GATTTT	2	12	143944	143955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54020353
87	NC_006360	AAAATT	2	12	146893	146904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020047
88	NC_006360	CAATTG	2	12	150191	150202	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54020356
89	NC_006360	TTTGTA	2	12	150769	150780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54020356
90	NC_006360	TTGGTT	2	12	152638	152649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54020050
91	NC_006360	TAAAAA	3	18	153422	153439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54020050
92	NC_006360	CAAATT	2	12	154638	154649	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54020051
93	NC_006360	ATTATG	2	12	154683	154694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	54020051
94	NC_006360	ATTTAA	2	12	155359	155370	50 %	50 %	0 %	0 %	54020051
95	NC_006360	TTGCTC	2	12	157111	157122	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54020051
96	NC_006360	TATCAA	2	12	157925	157936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	54020052
97	NC_006360	TGAAAA	2	12	159085	159096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54020052
98	NC_006360	AAATAT	2	12	159823	159834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020052
99	NC_006360	TTTTTA	2	12	160800	160811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54020052
100	NC_006360	TTGGCT	2	12	160818	160829	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	54020052
101	NC_006360	TTTCAA	2	12	163230	163241	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54020359
102	NC_006360	TTAATT	2	12	164472	164483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020360
103	NC_006360	ATGAAA	2	12	168822	168833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54020053
104	NC_006360	TTGAAA	2	12	169020	169031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	54020053
105	NC_006360	AAATAC	2	12	170984	170995	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54020056
106	NC_006360	GTCCTA	2	12	172650	172661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	54020362
107	NC_006360	TTTATC	2	12	172844	172855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	54020363
108	NC_006360	TAAAAT	2	12	174291	174302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020364
109	NC_006360	AATCGC	2	12	174519	174530	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54020364
110	NC_006360	TAATAT	2	12	179196	179207	50 %	50 %	0 %	0 %	54020367
111	NC_006360	GCAGTT	2	12	179861	179872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54020367
112	NC_006360	GCAATT	2	12	181102	181113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54020368
113	NC_006360	TGCAAG	2	12	182126	182137	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	54020370
114	NC_006360	AAGCAT	2	12	182188	182199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54020370
115	NC_006360	AGTTGA	2	12	184330	184341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54020371
116	NC_006360	TAAAAA	2	12	186928	186939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	54020059
117	NC_006360	TGAAGA	2	12	187922	187933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	54020059
118	NC_006360	AAATTT	2	12	188611	188622	50 %	50 %	0 %	0 %	54020061
119	NC_006360	TTTATT	2	12	191661	191672	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	54020063
120	NC_006360	ATTTTA	2	12	193798	193809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020373
121	NC_006360	TTTAAA	2	12	197389	197400	50 %	50 %	0 %	0 %	54020374
122	NC_006360	GTATTT	2	12	197435	197446	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54020374
123	NC_006360	TCAAAA	2	12	203683	203694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54020376
124	NC_006360	CAAAAT	2	12	205652	205663	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54020378
125	NC_006360	ATTTAA	2	12	206536	206547	50 %	50 %	0 %	0 %	54020379
126	NC_006360	ATGCTA	2	12	208492	208503	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54020065
127	NC_006360	CAATGC	2	12	211627	211638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54020381
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131	NC_006360	CTTTTC	2	12	221752	221763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54020388
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228	NC_006360	ATAATT	2	12	384717	384728	50 %	50 %	0 %	0 %	54020144
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240	NC_006360	CAAAAT	2	12	399153	399164	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	54020461
241	NC_006360	AATAAG	2	12	400297	400308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54020462
242	NC_006360	TTTATG	2	12	406583	406594	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54020154
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351	NC_006360	GCAAAA	2	12	586242	586253	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	54020529
352	NC_006360	AAACTG	2	12	592828	592839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	54020534
353	NC_006360	GTTTTA	2	12	593910	593921	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	54020534
354	NC_006360	ATCAGC	2	12	594217	594228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	54020534
355	NC_006360	TTATCA	2	12	594284	594295	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	54020534
356	NC_006360	TCAATG	2	12	601012	601023	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	54020540
357	NC_006360	TGCAGT	2	12	601185	601196	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	54020540
358	NC_006360	TAAAGA	2	12	601895	601906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	54020541
359	NC_006360	TCTTCA	2	12	602349	602360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	54020542
360	NC_006360	TTGAAG	2	12	602368	602379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54020542
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362	NC_006360	CGCTTT	2	12	609393	609404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	54020220
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475	NC_006360	TATAAT	2	12	810088	810099	50 %	50 %	0 %	0 %	54020278
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477	NC_006360	TGGTAA	2	12	811321	811332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54020279
478	NC_006360	AAATTT	2	12	811472	811483	50 %	50 %	0 %	0 %	54020279
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483	NC_006360	AAATTT	2	12	818167	818178	50 %	50 %	0 %	0 %	54020282
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