MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 232 chromosome

Total Repeats: 10261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006360	AAT	2	6	16	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
2	NC_006360	CAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
3	NC_006360	TTA	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019970
4	NC_006360	TGT	2	6	80	85	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019970
5	NC_006360	AAC	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
6	NC_006360	ATT	2	6	136	141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019970
7	NC_006360	AAT	2	6	256	261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
8	NC_006360	TTA	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019970
9	NC_006360	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
10	NC_006360	TTC	2	6	564	569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019970
11	NC_006360	TGA	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019970
12	NC_006360	TTG	2	6	686	691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019970
13	NC_006360	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
14	NC_006360	CTT	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019970
15	NC_006360	TGG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54019970
16	NC_006360	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
17	NC_006360	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
18	NC_006360	ATG	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019970
19	NC_006360	TTG	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019970
20	NC_006360	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019970
21	NC_006360	AAC	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
22	NC_006360	AGA	2	6	1261	1266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019970
23	NC_006360	CAA	2	6	1271	1276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
24	NC_006360	CAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019970
25	NC_006360	TAA	2	6	1602	1607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019971
26	NC_006360	AAG	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019971
27	NC_006360	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019971
28	NC_006360	CAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
29	NC_006360	TAA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019971
30	NC_006360	ATG	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019971
31	NC_006360	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019971
32	NC_006360	TTC	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019971
33	NC_006360	CAA	3	9	1970	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
34	NC_006360	CAA	2	6	2307	2312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
35	NC_006360	ACA	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019971
36	NC_006360	TTG	2	6	2818	2823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019972
37	NC_006360	GGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	54019972
38	NC_006360	ATT	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019972
39	NC_006360	GTT	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019972
40	NC_006360	TAA	2	6	2890	2895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019972
41	NC_006360	TGG	2	6	2942	2947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54019972
42	NC_006360	GGA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54019972
43	NC_006360	ATT	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019972
44	NC_006360	ACA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019972
45	NC_006360	TTC	2	6	3277	3282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019972
46	NC_006360	CAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019972
47	NC_006360	AAT	2	6	3342	3347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019972
48	NC_006360	CTT	2	6	3409	3414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019972
49	NC_006360	ACA	2	6	3525	3530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019972
50	NC_006360	CCA	2	6	3662	3667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54019972
51	NC_006360	ATG	2	6	3820	3825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
52	NC_006360	ATG	2	6	4003	4008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
53	NC_006360	TGA	2	6	4028	4033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
54	NC_006360	GAT	2	6	4424	4429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019972
55	NC_006360	TCA	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019972
56	NC_006360	GTG	2	6	4555	4560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54019972
57	NC_006360	CTG	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019972
58	NC_006360	AAT	2	6	4645	4650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019973
59	NC_006360	TAA	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019973
60	NC_006360	TGA	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019973
61	NC_006360	ACC	2	6	5076	5081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54019973
62	NC_006360	ATA	2	6	5155	5160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019974
63	NC_006360	TCA	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019974
64	NC_006360	CAA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019974
65	NC_006360	CTG	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019974
66	NC_006360	GCT	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019974
67	NC_006360	GAT	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019974
68	NC_006360	CTA	2	6	5529	5534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019974
69	NC_006360	GAA	2	6	5538	5543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019974
70	NC_006360	CAA	2	6	5623	5628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019974
71	NC_006360	TGC	2	6	5648	5653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019974
72	NC_006360	AAG	2	6	5719	5724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019974
73	NC_006360	GCA	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	54019974
74	NC_006360	TTG	2	6	6332	6337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019975
75	NC_006360	ACC	2	6	6413	6418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	54019975
76	NC_006360	GAT	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019975
77	NC_006360	ATT	2	6	6627	6632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019975
78	NC_006360	GAG	2	6	6935	6940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	54019975
79	NC_006360	ATT	2	6	6970	6975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019975
80	NC_006360	ATT	2	6	7202	7207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019976
81	NC_006360	TTG	2	6	7442	7447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019976
82	NC_006360	AGA	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019976
83	NC_006360	TGA	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019976
84	NC_006360	GAT	2	6	7550	7555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019976
85	NC_006360	TAA	2	6	7607	7612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019976
86	NC_006360	TGA	3	9	7692	7700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019976
87	NC_006360	TGA	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019977
88	NC_006360	GAA	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019977
89	NC_006360	AGA	2	6	7988	7993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019977
90	NC_006360	TAA	2	6	7999	8004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019977
91	NC_006360	AAT	2	6	8036	8041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019977
92	NC_006360	AAT	2	6	8079	8084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019977
93	NC_006360	AAT	2	6	8102	8107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019977
94	NC_006360	ACT	2	6	8223	8228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019977
95	NC_006360	GCT	2	6	8286	8291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019977
96	NC_006360	CAA	2	6	8569	8574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019977
97	NC_006360	AAG	2	6	8788	8793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019977
98	NC_006360	TGG	2	6	9011	9016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	54019978
99	NC_006360	ATA	2	6	9061	9066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019978
100	NC_006360	ATT	2	6	9126	9131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019978
101	NC_006360	TCA	2	6	9181	9186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019978
102	NC_006360	ATT	2	6	9282	9287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019978
103	NC_006360	GAA	2	6	9681	9686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019978
104	NC_006360	ATT	2	6	9705	9710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019978
105	NC_006360	AAC	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019978
106	NC_006360	TAA	2	6	9806	9811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019978
107	NC_006360	GAT	2	6	9933	9938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019978
108	NC_006360	CAA	3	9	10042	10050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019978
109	NC_006360	TTG	2	6	10054	10059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019978
110	NC_006360	AGA	2	6	10100	10105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019978
111	NC_006360	GAT	2	6	10115	10120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	54019978
112	NC_006360	TTC	2	6	10144	10149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019978
113	NC_006360	CAT	2	6	10223	10228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019978
114	NC_006360	GAA	2	6	10305	10310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019978
115	NC_006360	ATT	2	6	10392	10397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019978
116	NC_006360	ATT	2	6	10500	10505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019978
117	NC_006360	ATT	2	6	10512	10517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019978
118	NC_006360	TAA	2	6	10520	10525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019978
119	NC_006360	CAA	2	6	10572	10577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019978
120	NC_006360	ATA	2	6	10651	10656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019978
121	NC_006360	TGC	2	6	10742	10747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019978
122	NC_006360	GAA	2	6	10788	10793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019978
123	NC_006360	GAA	2	6	10848	10853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	54019978
124	NC_006360	CGT	2	6	11382	11387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	54019979
125	NC_006360	TAC	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019979
126	NC_006360	CAA	3	9	11461	11469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019979
127	NC_006360	ATT	2	6	11529	11534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019979
128	NC_006360	GTT	3	9	11535	11543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019979
129	NC_006360	TAA	2	6	11641	11646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54019979
130	NC_006360	TTC	2	6	11666	11671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019979
131	NC_006360	CAT	2	6	11733	11738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54019979
132	NC_006360	TTG	2	6	11836	11841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54019979
133	NC_006360	AAC	2	6	11894	11899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	54019979
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168	NC_006360	ATT	2	6	15537	15542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54019983
169	NC_006360	CTT	2	6	15568	15573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	54019983
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262	NC_006360	ATC	2	6	23562	23567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	54020311
263	NC_006360	TTA	2	6	23615	23620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020311
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265	NC_006360	TAA	2	6	23654	23659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	54020311
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270	NC_006360	TTG	2	6	24059	24064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	54020311
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325	NC_006360	ATT	2	6	28456	28461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	54020314
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