MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia succiniciproducens MBEL55E chromosome

Total Repeats: 27831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006300	AGG	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52424056
2	NC_006300	GAT	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424056
3	NC_006300	TGA	3	9	3937	3945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424056
4	NC_006300	CAG	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424056
5	NC_006300	GGA	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	52424056
6	NC_006300	ATT	2	6	4064	4069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424056
7	NC_006300	ATC	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424056
8	NC_006300	ATA	2	6	4424	4429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424057
9	NC_006300	CTT	2	6	4471	4476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424057
10	NC_006300	ACC	2	6	4604	4609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424058
11	NC_006300	ATA	2	6	4665	4670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424058
12	NC_006300	GGC	2	6	4693	4698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424058
13	NC_006300	AAT	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424058
14	NC_006300	GGC	2	6	4795	4800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424058
15	NC_006300	ATT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424058
16	NC_006300	TGA	2	6	4860	4865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424058
17	NC_006300	TGA	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424058
18	NC_006300	ATT	2	6	4993	4998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424058
19	NC_006300	TCA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424058
20	NC_006300	ATA	2	6	5091	5096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424058
21	NC_006300	TTC	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424059
22	NC_006300	AAT	2	6	5409	5414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424059
23	NC_006300	GAT	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424059
24	NC_006300	CTT	2	6	5576	5581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424059
25	NC_006300	ATC	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424059
26	NC_006300	ATA	2	6	5724	5729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424059
27	NC_006300	CCG	2	6	5810	5815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424059
28	NC_006300	TCA	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424059
29	NC_006300	GAT	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424059
30	NC_006300	CAT	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424059
31	NC_006300	TGT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424059
32	NC_006300	TGA	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424060
33	NC_006300	ATT	2	6	6252	6257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424060
34	NC_006300	CTA	2	6	6320	6325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424061
35	NC_006300	ATA	2	6	6365	6370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424061
36	NC_006300	TCT	2	6	6553	6558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424061
37	NC_006300	TTG	2	6	6673	6678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424061
38	NC_006300	TTC	2	6	6699	6704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424061
39	NC_006300	CAA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424061
40	NC_006300	GCG	2	6	6763	6768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424061
41	NC_006300	CGG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424061
42	NC_006300	CAA	2	6	6879	6884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424061
43	NC_006300	CCA	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424061
44	NC_006300	GCC	2	6	6987	6992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424061
45	NC_006300	CCG	2	6	7027	7032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424061
46	NC_006300	ATG	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424061
47	NC_006300	GCG	2	6	7132	7137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424061
48	NC_006300	ATA	2	6	7219	7224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424061
49	NC_006300	TTC	2	6	7239	7244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424061
50	NC_006300	CCG	2	6	7282	7287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424061
51	NC_006300	AAT	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
52	NC_006300	GCT	2	6	7763	7768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511015
53	NC_006300	GAA	2	6	7769	7774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511015
54	NC_006300	CCG	2	6	7788	7793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511015
55	NC_006300	AAG	2	6	7794	7799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511015
56	NC_006300	AAT	2	6	7805	7810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
57	NC_006300	TAA	2	6	7856	7861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
58	NC_006300	CTG	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511015
59	NC_006300	ATC	2	6	8112	8117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511015
60	NC_006300	TTC	2	6	8156	8161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511015
61	NC_006300	TTG	2	6	8198	8203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511015
62	NC_006300	ACC	2	6	8256	8261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161511015
63	NC_006300	TCT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161511015
64	NC_006300	ATA	2	6	8508	8513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511015
65	NC_006300	TTG	2	6	8566	8571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424063
66	NC_006300	TAA	3	9	8692	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
67	NC_006300	CGC	2	6	8748	8753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424063
68	NC_006300	AAT	2	6	8772	8777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
69	NC_006300	GGC	2	6	8809	8814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424063
70	NC_006300	TAA	2	6	8853	8858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
71	NC_006300	TGA	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424063
72	NC_006300	CCG	2	6	9002	9007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424063
73	NC_006300	TAA	2	6	9037	9042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424063
74	NC_006300	GCC	2	6	9130	9135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424063
75	NC_006300	CCG	2	6	9386	9391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424064
76	NC_006300	AAT	2	6	9519	9524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424064
77	NC_006300	TAA	2	6	9560	9565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424064
78	NC_006300	ATT	3	9	9651	9659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424064
79	NC_006300	TAA	2	6	9833	9838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424065
80	NC_006300	CAA	2	6	9861	9866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424065
81	NC_006300	TTG	2	6	9889	9894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424066
82	NC_006300	TTG	2	6	9976	9981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424066
83	NC_006300	CAC	2	6	10044	10049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424066
84	NC_006300	GCC	2	6	10061	10066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424066
85	NC_006300	ACC	2	6	10337	10342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424066
86	NC_006300	ATA	2	6	10400	10405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424066
87	NC_006300	TTA	2	6	10666	10671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424067
88	NC_006300	TTG	2	6	10743	10748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424067
89	NC_006300	CTT	2	6	10784	10789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424067
90	NC_006300	GTT	2	6	10834	10839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424067
91	NC_006300	CAT	2	6	10866	10871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424067
92	NC_006300	CAT	2	6	11014	11019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424068
93	NC_006300	AGT	2	6	11021	11026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
94	NC_006300	CCG	2	6	11040	11045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
95	NC_006300	GAA	2	6	11066	11071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424068
96	NC_006300	CGC	2	6	11074	11079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
97	NC_006300	AGT	2	6	11116	11121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
98	NC_006300	TAA	2	6	11135	11140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424068
99	NC_006300	AAG	2	6	11175	11180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424068
100	NC_006300	CCA	2	6	11233	11238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
101	NC_006300	AAT	2	6	11360	11365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424068
102	NC_006300	AAT	2	6	11550	11555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424068
103	NC_006300	AGA	2	6	11585	11590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	52424068
104	NC_006300	CGG	2	6	11686	11691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424068
105	NC_006300	CCA	2	6	11761	11766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
106	NC_006300	TTG	2	6	11795	11800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424068
107	NC_006300	TTC	2	6	11816	11821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424068
108	NC_006300	CTT	2	6	11839	11844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424068
109	NC_006300	CAA	2	6	11949	11954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424068
110	NC_006300	ATG	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
111	NC_006300	CTT	2	6	12061	12066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424068
112	NC_006300	CGC	2	6	12067	12072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
113	NC_006300	CGG	2	6	12126	12131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424068
114	NC_006300	ACC	2	6	12155	12160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
115	NC_006300	GTA	2	6	12193	12198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424068
116	NC_006300	CCA	2	6	12217	12222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
117	NC_006300	GCG	2	6	12273	12278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424068
118	NC_006300	ATA	2	6	12303	12308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424068
119	NC_006300	CGC	2	6	12320	12325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424068
120	NC_006300	CCA	2	6	12370	12375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	52424068
121	NC_006300	TTG	2	6	12454	12459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424068
122	NC_006300	ATT	2	6	12616	12621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424069
123	NC_006300	TTC	2	6	12821	12826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424069
124	NC_006300	TTC	2	6	12857	12862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424069
125	NC_006300	TAA	2	6	12941	12946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424069
126	NC_006300	AAT	2	6	13028	13033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424069
127	NC_006300	TGG	2	6	13060	13065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424069
128	NC_006300	TTC	2	6	13169	13174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424069
129	NC_006300	GCC	2	6	13214	13219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424069
130	NC_006300	ATA	2	6	13253	13258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424069
131	NC_006300	ATA	2	6	13335	13340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424069
132	NC_006300	ATT	2	6	13344	13349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424069
133	NC_006300	TAT	2	6	13352	13357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424069
134	NC_006300	TTA	2	6	13412	13417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424070
135	NC_006300	AAT	2	6	13419	13424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424070
136	NC_006300	GTT	2	6	13498	13503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424070
137	NC_006300	CCG	2	6	13765	13770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424070
138	NC_006300	CGC	2	6	13804	13809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424070
139	NC_006300	AAT	2	6	13854	13859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424070
140	NC_006300	GGT	2	6	13962	13967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424070
141	NC_006300	CCG	2	6	14004	14009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424070
142	NC_006300	TTC	2	6	14212	14217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	52424071
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146	NC_006300	GCC	2	6	14650	14655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424071
147	NC_006300	CGG	2	6	14751	14756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424071
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150	NC_006300	TGT	2	6	14836	14841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424071
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152	NC_006300	CGG	2	6	14922	14927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	52424071
153	NC_006300	TAA	2	6	14955	14960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424071
154	NC_006300	CGT	2	6	14996	15001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424071
155	NC_006300	GCC	2	6	15006	15011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424071
156	NC_006300	GTT	2	6	15014	15019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424071
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160	NC_006300	GCC	2	6	15289	15294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424071
161	NC_006300	GTA	2	6	15339	15344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424071
162	NC_006300	CCG	2	6	15413	15418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424071
163	NC_006300	TAA	2	6	15442	15447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424071
164	NC_006300	ATT	2	6	15462	15467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424071
165	NC_006300	TCG	2	6	15472	15477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424071
166	NC_006300	GCC	2	6	15884	15889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	52424072
167	NC_006300	CAA	2	6	15976	15981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424072
168	NC_006300	CTG	2	6	15996	16001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	52424072
169	NC_006300	TGA	2	6	16095	16100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	52424072
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171	NC_006300	ATA	2	6	16175	16180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424072
172	NC_006300	TTG	2	6	16280	16285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424072
173	NC_006300	TCC	2	6	16359	16364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	52424072
174	NC_006300	GTT	2	6	16546	16551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	52424072
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242	NC_006300	TCG	2	6	20992	20997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511014
243	NC_006300	AAT	2	6	21018	21023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511014
244	NC_006300	ATC	2	6	21124	21129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511014
245	NC_006300	GAA	2	6	21133	21138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511014
246	NC_006300	ATC	2	6	21246	21251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511014
247	NC_006300	GCC	2	6	21289	21294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511014
248	NC_006300	GCC	2	6	21298	21303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511014
249	NC_006300	ATG	2	6	21364	21369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511014
250	NC_006300	AAG	3	9	21370	21378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511014
251	NC_006300	CGG	2	6	21408	21413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511014
252	NC_006300	GAA	2	6	21414	21419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511014
253	NC_006300	AAT	2	6	21510	21515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511014
254	NC_006300	CCG	2	6	21553	21558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161511014
255	NC_006300	AGA	2	6	21593	21598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511014
256	NC_006300	CGA	2	6	21806	21811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511014
257	NC_006300	AAT	2	6	21939	21944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511014
258	NC_006300	GAA	2	6	21948	21953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161511014
259	NC_006300	TGT	2	6	22090	22095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511014
260	NC_006300	CGG	2	6	22190	22195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161511014
261	NC_006300	TGG	2	6	22400	22405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511014
262	NC_006300	ATG	2	6	22446	22451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161511014
263	NC_006300	AAT	2	6	22470	22475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161511014
264	NC_006300	CAT	2	6	22518	22523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511014
265	NC_006300	TGG	2	6	22562	22567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511014
266	NC_006300	TGG	2	6	23161	23166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161511013
267	NC_006300	TTG	2	6	23378	23383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161511013
268	NC_006300	TGC	2	6	23421	23426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161511013
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273	NC_006300	CGA	2	6	23670	23675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161511013
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276	NC_006300	TCA	2	6	23907	23912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161511013
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354	NC_006300	CAT	2	6	29490	29495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	52424085
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359	NC_006300	AAT	2	6	29647	29652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424085
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372	NC_006300	ATA	2	6	30706	30711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424087
373	NC_006300	AGC	2	6	30769	30774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	52424087
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379	NC_006300	ATA	2	6	31148	31153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	52424087
380	NC_006300	AAC	2	6	31170	31175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424087
381	NC_006300	CAA	2	6	31255	31260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	52424088
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385	NC_006300	TTA	2	6	31726	31731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	52424089
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500	NC_006300	GTG	2	6	41491	41496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	52424100

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