MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 223

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	TG	3	6	149	154	0 %	50 %	50 %	0 %	49146085
2	NC_005916	CA	4	8	498	505	50 %	0 %	0 %	50 %	49146085
3	NC_005916	GC	3	6	781	786	0 %	0 %	50 %	50 %	49146085
4	NC_005916	GC	3	6	2039	2044	0 %	0 %	50 %	50 %	49146087
5	NC_005916	CG	3	6	2143	2148	0 %	0 %	50 %	50 %	49146087
6	NC_005916	GC	3	6	2444	2449	0 %	0 %	50 %	50 %	49146088
7	NC_005916	CA	3	6	3394	3399	50 %	0 %	0 %	50 %	49146089
8	NC_005916	GC	4	8	3735	3742	0 %	0 %	50 %	50 %	49146089
9	NC_005916	CG	3	6	5731	5736	0 %	0 %	50 %	50 %	49146090
10	NC_005916	GC	3	6	7588	7593	0 %	0 %	50 %	50 %	49146093
11	NC_005916	GC	3	6	7674	7679	0 %	0 %	50 %	50 %	49146094
12	NC_005916	CG	3	6	8021	8026	0 %	0 %	50 %	50 %	49146094
13	NC_005916	GC	3	6	8999	9004	0 %	0 %	50 %	50 %	49146095
14	NC_005916	TC	3	6	9358	9363	0 %	50 %	0 %	50 %	49146095
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16	NC_005916	CG	3	6	10194	10199	0 %	0 %	50 %	50 %	49146095
17	NC_005916	CG	3	6	10512	10517	0 %	0 %	50 %	50 %	49146096
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20	NC_005916	CG	3	6	11607	11612	0 %	0 %	50 %	50 %	49146098
21	NC_005916	CG	3	6	13192	13197	0 %	0 %	50 %	50 %	49146100
22	NC_005916	GT	3	6	13703	13708	0 %	50 %	50 %	0 %	49146101
23	NC_005916	CG	3	6	14171	14176	0 %	0 %	50 %	50 %	49146102
24	NC_005916	AG	3	6	14210	14215	50 %	0 %	50 %	0 %	49146102
25	NC_005916	CG	3	6	14485	14490	0 %	0 %	50 %	50 %	49146102
26	NC_005916	GC	3	6	14892	14897	0 %	0 %	50 %	50 %	49146102
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29	NC_005916	GC	3	6	19407	19412	0 %	0 %	50 %	50 %	49146108
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31	NC_005916	CG	3	6	20783	20788	0 %	0 %	50 %	50 %	49146109
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40	NC_005916	GT	3	6	34578	34583	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
41	NC_005916	TG	3	6	34885	34890	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
42	NC_005916	CG	3	6	35919	35924	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
43	NC_005916	GA	3	6	35936	35941	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
44	NC_005916	TG	3	6	37060	37065	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
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50	NC_005916	CG	3	6	41316	41321	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
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52	NC_005916	TG	3	6	42457	42462	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
53	NC_005916	GT	3	6	43051	43056	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
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67	NC_005916	GA	3	6	52127	52132	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
68	NC_005916	TG	3	6	53251	53256	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.