MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 19344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	TGA	2	6	10205	10210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357564
2	NC_005791	CTT	2	6	10254	10259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357564
3	NC_005791	TTG	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357564
4	NC_005791	AGA	2	6	10272	10277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357564
5	NC_005791	GAA	3	9	10299	10307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357564
6	NC_005791	ATA	2	6	10461	10466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
7	NC_005791	GAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
8	NC_005791	GAA	2	6	10542	10547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
9	NC_005791	AAT	2	6	10602	10607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
10	NC_005791	CTT	2	6	10669	10674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357565
11	NC_005791	AAT	2	6	10691	10696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
12	NC_005791	AGA	2	6	10814	10819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
13	NC_005791	TGA	2	6	10835	10840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357565
14	NC_005791	GAA	2	6	10893	10898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
15	NC_005791	ATA	2	6	10911	10916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
16	NC_005791	GAT	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357565
17	NC_005791	CTT	2	6	11070	11075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357565
18	NC_005791	AAT	2	6	11147	11152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
19	NC_005791	AAT	2	6	11190	11195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
20	NC_005791	TAA	2	6	11287	11292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
21	NC_005791	TCA	2	6	11298	11303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357565
22	NC_005791	GAA	2	6	11304	11309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
23	NC_005791	TAA	2	6	11449	11454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
24	NC_005791	CCA	2	6	11557	11562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45357566
25	NC_005791	ACT	2	6	11578	11583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
26	NC_005791	ATC	2	6	11835	11840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
27	NC_005791	TTC	2	6	11867	11872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357566
28	NC_005791	CTG	2	6	11894	11899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357566
29	NC_005791	CTT	2	6	11984	11989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357566
30	NC_005791	TCT	2	6	12022	12027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357566
31	NC_005791	ACT	2	6	12067	12072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
32	NC_005791	TGA	2	6	12180	12185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357566
33	NC_005791	CAT	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
34	NC_005791	TTG	2	6	12374	12379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357566
35	NC_005791	ATT	2	6	12415	12420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357566
36	NC_005791	TCC	2	6	12528	12533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45357566
37	NC_005791	TTC	2	6	12767	12772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
38	NC_005791	CTT	2	6	12784	12789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
39	NC_005791	AAT	2	6	12848	12853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357567
40	NC_005791	AAT	2	6	12908	12913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357567
41	NC_005791	CCA	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45357567
42	NC_005791	TTC	2	6	12962	12967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
43	NC_005791	AAG	2	6	12986	12991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357567
44	NC_005791	TTC	2	6	13007	13012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
45	NC_005791	ATT	3	9	13029	13037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357567
46	NC_005791	GCA	2	6	13113	13118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357567
47	NC_005791	TGG	2	6	13212	13217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45357567
48	NC_005791	CTT	2	6	13270	13275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
49	NC_005791	CAT	2	6	13345	13350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357567
50	NC_005791	TTG	2	6	13386	13391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357567
51	NC_005791	ATT	2	6	13509	13514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357567
52	NC_005791	CAA	2	6	13517	13522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357567
53	NC_005791	ATT	2	6	13628	13633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
54	NC_005791	AGT	2	6	13656	13661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357568
55	NC_005791	CAA	2	6	13714	13719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
56	NC_005791	ATT	2	6	13839	13844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
57	NC_005791	TTC	2	6	13892	13897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357568
58	NC_005791	ATT	2	6	14018	14023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
59	NC_005791	CAG	2	6	14047	14052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357568
60	NC_005791	CAT	2	6	14126	14131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357568
61	NC_005791	ATT	2	6	14376	14381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
62	NC_005791	TTA	2	6	14686	14691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
63	NC_005791	TTC	2	6	14733	14738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357568
64	NC_005791	TAT	2	6	14900	14905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
65	NC_005791	CTG	2	6	14957	14962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357568
66	NC_005791	CAA	2	6	14980	14985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
67	NC_005791	CAA	2	6	14998	15003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
68	NC_005791	CAA	2	6	15007	15012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
69	NC_005791	TCA	2	6	15060	15065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357568
70	NC_005791	AAT	2	6	15097	15102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357568
71	NC_005791	TGC	2	6	15122	15127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357568
72	NC_005791	ACA	2	6	15357	15362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357569
73	NC_005791	GAA	2	6	15441	15446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357569
74	NC_005791	TAA	2	6	15589	15594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357569
75	NC_005791	AGA	2	6	15602	15607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357569
76	NC_005791	GTT	2	6	15654	15659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357569
77	NC_005791	ATT	2	6	15681	15686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357569
78	NC_005791	CAT	2	6	15698	15703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357569
79	NC_005791	GAA	2	6	15720	15725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357569
80	NC_005791	ATG	2	6	15957	15962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357569
81	NC_005791	GTT	2	6	16155	16160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357569
82	NC_005791	TAT	2	6	16187	16192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357569
83	NC_005791	ATT	2	6	16220	16225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357569
84	NC_005791	TTG	2	6	16228	16233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357569
85	NC_005791	TCC	2	6	16267	16272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45357569
86	NC_005791	GTT	2	6	16323	16328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357569
87	NC_005791	ATG	2	6	16800	16805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357570
88	NC_005791	GAA	3	9	16851	16859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357570
89	NC_005791	TGA	2	6	16889	16894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357570
90	NC_005791	AAT	2	6	16943	16948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357570
91	NC_005791	AAT	2	6	16967	16972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357570
92	NC_005791	AAT	2	6	17021	17026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357570
93	NC_005791	ATT	2	6	17027	17032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357570
94	NC_005791	AAG	2	6	17059	17064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357570
95	NC_005791	CTG	2	6	17212	17217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357570
96	NC_005791	CGG	2	6	17405	17410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45357570
97	NC_005791	TGT	2	6	17642	17647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357571
98	NC_005791	AAT	2	6	17674	17679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357571
99	NC_005791	ATC	2	6	17747	17752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357571
100	NC_005791	CTT	2	6	17891	17896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357571
101	NC_005791	TGA	2	6	17941	17946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357571
102	NC_005791	ATC	2	6	17962	17967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357571
103	NC_005791	ACA	2	6	18014	18019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357571
104	NC_005791	CAA	2	6	18030	18035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357571
105	NC_005791	TCA	2	6	18074	18079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357571
106	NC_005791	CAT	2	6	18204	18209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357571
107	NC_005791	TGT	2	6	18421	18426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357571
108	NC_005791	TCA	2	6	18570	18575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357571
109	NC_005791	TCT	2	6	18602	18607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357571
110	NC_005791	TGG	2	6	18633	18638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45357571
111	NC_005791	CGT	2	6	18825	18830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357571
112	NC_005791	TCG	2	6	18833	18838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357571
113	NC_005791	TTA	2	6	18887	18892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357571
114	NC_005791	TCA	2	6	18962	18967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357571
115	NC_005791	CTT	2	6	18981	18986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357571
116	NC_005791	TTC	2	6	19042	19047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357571
117	NC_005791	ATC	2	6	19081	19086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357571
118	NC_005791	TTC	2	6	19159	19164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357571
119	NC_005791	ATT	2	6	19180	19185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357571
120	NC_005791	TGT	2	6	19399	19404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357572
121	NC_005791	CAT	2	6	19489	19494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357572
122	NC_005791	GTA	2	6	19565	19570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357572
123	NC_005791	TAT	2	6	19616	19621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357572
124	NC_005791	TAA	2	6	19681	19686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357572
125	NC_005791	CTT	2	6	19690	19695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357572
126	NC_005791	ACA	2	6	19740	19745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357572
127	NC_005791	CTT	2	6	19912	19917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357572
128	NC_005791	TAA	2	6	20042	20047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357572
129	NC_005791	ATT	2	6	20090	20095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357572
130	NC_005791	TGT	2	6	20203	20208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357572
131	NC_005791	TGC	2	6	20222	20227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357572
132	NC_005791	AAT	2	6	20262	20267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357572
133	NC_005791	TTC	2	6	20342	20347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357572
134	NC_005791	ATT	2	6	20557	20562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357573
135	NC_005791	GAA	2	6	20615	20620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357573
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137	NC_005791	CAT	2	6	20736	20741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357573
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139	NC_005791	TTC	2	6	20884	20889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357573
140	NC_005791	CTT	2	6	20997	21002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357574
141	NC_005791	AGG	2	6	21025	21030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45357574
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144	NC_005791	AAT	2	6	21400	21405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357574
145	NC_005791	TCG	2	6	21467	21472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357574
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148	NC_005791	TTC	2	6	21820	21825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357574
149	NC_005791	ATC	2	6	21829	21834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357574
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151	NC_005791	TTC	2	6	22188	22193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357575
152	NC_005791	TGT	2	6	22329	22334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357575
153	NC_005791	CAT	2	6	22530	22535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357575
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156	NC_005791	TGA	2	6	22651	22656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357576
157	NC_005791	ACG	2	6	22725	22730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357576
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159	NC_005791	GAC	2	6	22842	22847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357576
160	NC_005791	TAA	2	6	22873	22878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357576
161	NC_005791	GAA	2	6	22903	22908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357576
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164	NC_005791	AAT	2	6	23261	23266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357576
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182	NC_005791	ATC	2	6	24805	24810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357577
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186	NC_005791	TCC	2	6	25499	25504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45357578
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248	NC_005791	TAA	2	6	30404	30409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357584
249	NC_005791	TTG	2	6	30524	30529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357585
250	NC_005791	CAA	2	6	30536	30541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357585
251	NC_005791	ATC	2	6	30546	30551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357585
252	NC_005791	AAT	2	6	30628	30633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357585
253	NC_005791	TTA	2	6	30885	30890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357586
254	NC_005791	TTC	2	6	30956	30961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357586
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