MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 33539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005791	AT	3	6	10154	10159	50 %	50 %	0 %	0 %	45357564
2	NC_005791	A	6	6	10199	10204	100 %	0 %	0 %	0 %	45357564
3	NC_005791	TGA	2	6	10205	10210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357564
4	NC_005791	AT	3	6	10236	10241	50 %	50 %	0 %	0 %	45357564
5	NC_005791	CTT	2	6	10254	10259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357564
6	NC_005791	TTG	2	6	10264	10269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357564
7	NC_005791	AGA	2	6	10272	10277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357564
8	NC_005791	A	8	8	10285	10292	100 %	0 %	0 %	0 %	45357564
9	NC_005791	GAA	3	9	10299	10307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357564
10	NC_005791	CGGATG	2	12	10358	10369	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	45357564
11	NC_005791	ATA	2	6	10461	10466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
12	NC_005791	A	8	8	10469	10476	100 %	0 %	0 %	0 %	45357565
13	NC_005791	GAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
14	NC_005791	GAA	2	6	10542	10547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
15	NC_005791	AAT	2	6	10602	10607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
16	NC_005791	CTT	2	6	10669	10674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357565
17	NC_005791	AAT	2	6	10691	10696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
18	NC_005791	TGGAA	2	10	10784	10793	40 %	20 %	40 %	0 %	45357565
19	NC_005791	AGA	2	6	10814	10819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
20	NC_005791	TC	3	6	10823	10828	0 %	50 %	0 %	50 %	45357565
21	NC_005791	TGA	2	6	10835	10840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357565
22	NC_005791	GAA	2	6	10893	10898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
23	NC_005791	TGCA	2	8	10901	10908	25 %	25 %	25 %	25 %	45357565
24	NC_005791	ATA	2	6	10911	10916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
25	NC_005791	T	6	6	10947	10952	0 %	100 %	0 %	0 %	45357565
26	NC_005791	GAT	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357565
27	NC_005791	CTT	2	6	11070	11075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357565
28	NC_005791	AT	3	6	11103	11108	50 %	50 %	0 %	0 %	45357565
29	NC_005791	AAT	2	6	11147	11152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
30	NC_005791	AAT	2	6	11190	11195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
31	NC_005791	A	6	6	11251	11256	100 %	0 %	0 %	0 %	45357565
32	NC_005791	A	7	7	11265	11271	100 %	0 %	0 %	0 %	45357565
33	NC_005791	TAA	2	6	11287	11292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
34	NC_005791	A	6	6	11291	11296	100 %	0 %	0 %	0 %	45357565
35	NC_005791	TCA	2	6	11298	11303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357565
36	NC_005791	GAA	2	6	11304	11309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357565
37	NC_005791	AATT	2	8	11311	11318	50 %	50 %	0 %	0 %	45357565
38	NC_005791	TAA	2	6	11449	11454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357565
39	NC_005791	T	6	6	11513	11518	0 %	100 %	0 %	0 %	45357566
40	NC_005791	AATT	2	8	11520	11527	50 %	50 %	0 %	0 %	45357566
41	NC_005791	CCA	2	6	11557	11562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45357566
42	NC_005791	ACT	2	6	11578	11583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
43	NC_005791	TGGAAA	2	12	11682	11693	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45357566
44	NC_005791	AT	3	6	11710	11715	50 %	50 %	0 %	0 %	45357566
45	NC_005791	GT	3	6	11752	11757	0 %	50 %	50 %	0 %	45357566
46	NC_005791	ATC	2	6	11835	11840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
47	NC_005791	TTC	2	6	11867	11872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357566
48	NC_005791	GT	3	6	11886	11891	0 %	50 %	50 %	0 %	45357566
49	NC_005791	CTG	2	6	11894	11899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357566
50	NC_005791	CTT	2	6	11984	11989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357566
51	NC_005791	TCT	2	6	12022	12027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357566
52	NC_005791	ACT	2	6	12067	12072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
53	NC_005791	TC	3	6	12076	12081	0 %	50 %	0 %	50 %	45357566
54	NC_005791	TGA	2	6	12180	12185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357566
55	NC_005791	CAT	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357566
56	NC_005791	TTG	2	6	12374	12379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357566
57	NC_005791	ATT	2	6	12415	12420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357566
58	NC_005791	TCC	2	6	12528	12533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45357566
59	NC_005791	TA	3	6	12685	12690	50 %	50 %	0 %	0 %	45357567
60	NC_005791	TAGA	2	8	12758	12765	50 %	25 %	25 %	0 %	45357567
61	NC_005791	TTC	2	6	12767	12772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
62	NC_005791	CTT	2	6	12784	12789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
63	NC_005791	T	6	6	12815	12820	0 %	100 %	0 %	0 %	45357567
64	NC_005791	AAT	2	6	12848	12853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357567
65	NC_005791	AATC	2	8	12871	12878	50 %	25 %	0 %	25 %	45357567
66	NC_005791	AT	3	6	12880	12885	50 %	50 %	0 %	0 %	45357567
67	NC_005791	AAT	2	6	12908	12913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357567
68	NC_005791	T	7	7	12928	12934	0 %	100 %	0 %	0 %	45357567
69	NC_005791	CCA	2	6	12940	12945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45357567
70	NC_005791	TTC	2	6	12962	12967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
71	NC_005791	ATTT	2	8	12977	12984	25 %	75 %	0 %	0 %	45357567
72	NC_005791	AAG	2	6	12986	12991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357567
73	NC_005791	TTC	2	6	13007	13012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
74	NC_005791	ATT	3	9	13029	13037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357567
75	NC_005791	CTGTT	2	10	13044	13053	0 %	60 %	20 %	20 %	45357567
76	NC_005791	GCA	2	6	13113	13118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357567
77	NC_005791	TGG	2	6	13212	13217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45357567
78	NC_005791	CTT	2	6	13270	13275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357567
79	NC_005791	TCCAAC	2	12	13277	13288	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	45357567
80	NC_005791	AATT	2	8	13307	13314	50 %	50 %	0 %	0 %	45357567
81	NC_005791	T	6	6	13317	13322	0 %	100 %	0 %	0 %	45357567
82	NC_005791	CAT	2	6	13345	13350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357567
83	NC_005791	TTG	2	6	13386	13391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45357567
84	NC_005791	ATT	2	6	13509	13514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357567
85	NC_005791	CAA	2	6	13517	13522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357567
86	NC_005791	ATT	2	6	13628	13633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
87	NC_005791	T	6	6	13648	13653	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
88	NC_005791	AGT	2	6	13656	13661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45357568
89	NC_005791	ATTTT	2	10	13684	13693	20 %	80 %	0 %	0 %	45357568
90	NC_005791	T	6	6	13690	13695	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
91	NC_005791	CAA	2	6	13714	13719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
92	NC_005791	T	6	6	13804	13809	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
93	NC_005791	T	6	6	13816	13821	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
94	NC_005791	ATT	2	6	13839	13844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
95	NC_005791	AT	3	6	13847	13852	50 %	50 %	0 %	0 %	45357568
96	NC_005791	TTC	2	6	13892	13897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357568
97	NC_005791	AATT	2	8	13910	13917	50 %	50 %	0 %	0 %	45357568
98	NC_005791	ATT	2	6	14018	14023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
99	NC_005791	CAG	2	6	14047	14052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45357568
100	NC_005791	T	6	6	14058	14063	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
101	NC_005791	CAT	2	6	14126	14131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357568
102	NC_005791	T	6	6	14161	14166	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
103	NC_005791	T	7	7	14296	14302	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
104	NC_005791	T	6	6	14362	14367	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
105	NC_005791	ATT	2	6	14376	14381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
106	NC_005791	A	6	6	14456	14461	100 %	0 %	0 %	0 %	45357568
107	NC_005791	T	6	6	14462	14467	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
108	NC_005791	T	7	7	14483	14489	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
109	NC_005791	TA	3	6	14573	14578	50 %	50 %	0 %	0 %	45357568
110	NC_005791	GT	3	6	14593	14598	0 %	50 %	50 %	0 %	45357568
111	NC_005791	T	6	6	14598	14603	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
112	NC_005791	T	6	6	14658	14663	0 %	100 %	0 %	0 %	45357568
113	NC_005791	TTA	2	6	14686	14691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
114	NC_005791	TTC	2	6	14733	14738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45357568
115	NC_005791	ATATG	2	10	14799	14808	40 %	40 %	20 %	0 %	45357568
116	NC_005791	AATA	2	8	14825	14832	75 %	25 %	0 %	0 %	45357568
117	NC_005791	TAT	2	6	14900	14905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45357568
118	NC_005791	CTG	2	6	14957	14962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357568
119	NC_005791	CAA	2	6	14980	14985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
120	NC_005791	CAA	2	6	14998	15003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
121	NC_005791	CAA	2	6	15007	15012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357568
122	NC_005791	TCA	2	6	15060	15065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45357568
123	NC_005791	AAAAT	2	10	15083	15092	80 %	20 %	0 %	0 %	45357568
124	NC_005791	AAT	2	6	15097	15102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357568
125	NC_005791	TGC	2	6	15122	15127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45357568
126	NC_005791	A	6	6	15159	15164	100 %	0 %	0 %	0 %	45357568
127	NC_005791	CATAA	2	10	15170	15179	60 %	20 %	0 %	20 %	45357568
128	NC_005791	AT	3	6	15332	15337	50 %	50 %	0 %	0 %	45357569
129	NC_005791	TGGA	2	8	15344	15351	25 %	25 %	50 %	0 %	45357569
130	NC_005791	ACA	2	6	15357	15362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45357569
131	NC_005791	AG	3	6	15377	15382	50 %	0 %	50 %	0 %	45357569
132	NC_005791	GAA	2	6	15441	15446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45357569
133	NC_005791	TAAT	2	8	15514	15521	50 %	50 %	0 %	0 %	45357569
134	NC_005791	CT	3	6	15558	15563	0 %	50 %	0 %	50 %	45357569
135	NC_005791	TAA	2	6	15589	15594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45357569
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