MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanococcus maripaludis S2 chromosome

Total Repeats: 33539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_005791	ATTC	2	8	1659747	1659754	25 %	50 %	0 %	25 %	45359284
33502	NC_005791	A	6	6	1659771	1659776	100 %	0 %	0 %	0 %	45359284
33503	NC_005791	TTA	2	6	1659824	1659829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45359284
33504	NC_005791	TCC	2	6	1659835	1659840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45359284
33505	NC_005791	TCT	2	6	1659869	1659874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45359284
33506	NC_005791	AGA	2	6	1659883	1659888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45359284
33507	NC_005791	AGT	2	6	1659892	1659897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45359284
33508	NC_005791	GAT	2	6	1659904	1659909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45359284
33509	NC_005791	TGT	2	6	1659910	1659915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45359284
33510	NC_005791	AGA	2	6	1659919	1659924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45359284
33511	NC_005791	CTT	2	6	1659965	1659970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45359284
33512	NC_005791	ATTG	2	8	1659983	1659990	25 %	50 %	25 %	0 %	45359284
33513	NC_005791	CGA	2	6	1660033	1660038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45359284
33514	NC_005791	TGA	2	6	1660045	1660050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45359284
33515	NC_005791	ATT	2	6	1660052	1660057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45359284
33516	NC_005791	A	6	6	1660076	1660081	100 %	0 %	0 %	0 %	45359284
33517	NC_005791	TGGA	2	8	1660094	1660101	25 %	25 %	50 %	0 %	45359284
33518	NC_005791	AGA	2	6	1660159	1660164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45359284
33519	NC_005791	A	6	6	1660184	1660189	100 %	0 %	0 %	0 %	45359284
33520	NC_005791	GAA	2	6	1660262	1660267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45359284
33521	NC_005791	A	6	6	1660278	1660283	100 %	0 %	0 %	0 %	45359284
33522	NC_005791	GTT	2	6	1660359	1660364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45359285
33523	NC_005791	A	6	6	1660480	1660485	100 %	0 %	0 %	0 %	45359285
33524	NC_005791	ATT	3	9	1660491	1660499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45359285
33525	NC_005791	ATTC	2	8	1660529	1660536	25 %	50 %	0 %	25 %	45359285
33526	NC_005791	TGG	2	6	1660547	1660552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45359285
33527	NC_005791	TGA	2	6	1660568	1660573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45359285
33528	NC_005791	AATA	2	8	1660613	1660620	75 %	25 %	0 %	0 %	45359285
33529	NC_005791	CAG	2	6	1660624	1660629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45359285
33530	NC_005791	AAG	2	6	1660651	1660656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45359285
33531	NC_005791	GT	3	6	1660679	1660684	0 %	50 %	50 %	0 %	45359285
33532	NC_005791	TGT	3	9	1660682	1660690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45359285
33533	NC_005791	TA	3	6	1660713	1660718	50 %	50 %	0 %	0 %	45359285
33534	NC_005791	CTG	2	6	1660778	1660783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45359285
33535	NC_005791	TGG	2	6	1660802	1660807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45359285
33536	NC_005791	AAT	2	6	1660964	1660969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45359285
33537	NC_005791	TGC	2	6	1661033	1661038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45359285
33538	NC_005791	A	6	6	1661088	1661093	100 %	0 %	0 %	0 %	45359285
33539	NC_005791	A	7	7	1661101	1661107	100 %	0 %	0 %	0 %	45359285

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.