MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 2137

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	ACTAT	2	10	778	787	40 %	40 %	0 %	20 %	21226103
2	NC_003901	GGGAC	2	10	1960	1969	20 %	0 %	60 %	20 %	21226103
3	NC_003901	TGGAA	2	10	2107	2116	40 %	20 %	40 %	0 %	21226103
4	NC_003901	CCAGT	2	10	3123	3132	20 %	20 %	20 %	40 %	21226104
5	NC_003901	GTACT	2	10	5916	5925	20 %	40 %	20 %	20 %	21226107
6	NC_003901	CAGAG	2	10	6118	6127	40 %	0 %	40 %	20 %	21226107
7	NC_003901	TGGAT	2	10	7098	7107	20 %	40 %	40 %	0 %	21226108
8	NC_003901	ACCCT	2	10	8212	8221	20 %	20 %	0 %	60 %	21226110
9	NC_003901	CCTGC	2	10	8298	8307	0 %	20 %	20 %	60 %	21226110
10	NC_003901	GTATC	2	10	15209	15218	20 %	40 %	20 %	20 %	21226115
11	NC_003901	GAAAA	2	10	15414	15423	80 %	0 %	20 %	0 %	21226115
12	NC_003901	TAAAC	2	10	30013	30022	60 %	20 %	0 %	20 %	21226129
13	NC_003901	ATGAT	2	10	34889	34898	40 %	40 %	20 %	0 %	21226132
14	NC_003901	CTTTC	2	10	37319	37328	0 %	60 %	0 %	40 %	21226135
15	NC_003901	TTTCA	2	10	38490	38499	20 %	60 %	0 %	20 %	21226136
16	NC_003901	GCAAT	2	10	41293	41302	40 %	20 %	20 %	20 %	21226137
17	NC_003901	GTCCT	2	10	46226	46235	0 %	40 %	20 %	40 %	21226140
18	NC_003901	GGTCA	2	10	49879	49888	20 %	20 %	40 %	20 %	21226141
19	NC_003901	CTCAG	2	10	51918	51927	20 %	20 %	20 %	40 %	21226142
20	NC_003901	ACTGA	2	10	55251	55260	40 %	20 %	20 %	20 %	21226145
21	NC_003901	TATTG	2	10	56830	56839	20 %	60 %	20 %	0 %	21226145
22	NC_003901	ATTTT	2	10	57092	57101	20 %	80 %	0 %	0 %	21226145
23	NC_003901	AGGAA	2	10	58426	58435	60 %	0 %	40 %	0 %	21226146
24	NC_003901	GGAAA	2	10	58851	58860	60 %	0 %	40 %	0 %	21226146
25	NC_003901	TGAAA	2	10	59068	59077	60 %	20 %	20 %	0 %	21226146
26	NC_003901	AAGGA	2	10	62173	62182	60 %	0 %	40 %	0 %	21226149
27	NC_003901	GAATT	2	10	62972	62981	40 %	40 %	20 %	0 %	21226149
28	NC_003901	AAATG	2	10	73551	73560	60 %	20 %	20 %	0 %	21226157
29	NC_003901	GCTCG	2	10	74706	74715	0 %	20 %	40 %	40 %	21226158
30	NC_003901	TAAGG	2	10	75917	75926	40 %	20 %	40 %	0 %	21226158
31	NC_003901	AAGAT	2	10	77030	77039	60 %	20 %	20 %	0 %	21226159
32	NC_003901	TCTGC	2	10	81490	81499	0 %	40 %	20 %	40 %	21226165
33	NC_003901	ATTTC	2	10	88257	88266	20 %	60 %	0 %	20 %	21226168
34	NC_003901	CCTGC	2	10	90351	90360	0 %	20 %	20 %	60 %	21226169
35	NC_003901	GTCCC	2	10	90596	90605	0 %	20 %	20 %	60 %	21226169
36	NC_003901	TTCCC	2	10	92637	92646	0 %	40 %	0 %	60 %	21226170
37	NC_003901	GCTGT	2	10	92890	92899	0 %	40 %	40 %	20 %	21226170
38	NC_003901	TCAGG	2	10	96110	96119	20 %	20 %	40 %	20 %	21226173
39	NC_003901	AAGGG	2	10	96165	96174	40 %	0 %	60 %	0 %	21226173
40	NC_003901	CCCTG	2	10	97253	97262	0 %	20 %	20 %	60 %	21226174
41	NC_003901	CATGT	2	10	97880	97889	20 %	40 %	20 %	20 %	21226174
42	NC_003901	AGGGA	2	10	99582	99591	40 %	0 %	60 %	0 %	21226176
43	NC_003901	GGCAT	2	10	99678	99687	20 %	20 %	40 %	20 %	21226176
44	NC_003901	GGGAA	2	10	103079	103088	40 %	0 %	60 %	0 %	21226179
45	NC_003901	TATTT	2	10	103953	103962	20 %	80 %	0 %	0 %	21226180
46	NC_003901	AGCAT	2	10	105719	105728	40 %	20 %	20 %	20 %	21226181
47	NC_003901	TCAGG	2	10	106316	106325	20 %	20 %	40 %	20 %	21226182
48	NC_003901	TTACC	2	10	106433	106442	20 %	40 %	0 %	40 %	21226182
49	NC_003901	CTGAA	2	10	107801	107810	40 %	20 %	20 %	20 %	21226183
50	NC_003901	GGAAT	2	10	108697	108706	40 %	20 %	40 %	0 %	21226183
51	NC_003901	TTTCC	2	10	109900	109909	0 %	60 %	0 %	40 %	21226186
52	NC_003901	ATGTT	2	10	110341	110350	20 %	60 %	20 %	0 %	21226186
53	NC_003901	CTGTT	2	10	110624	110633	0 %	60 %	20 %	20 %	21226187
54	NC_003901	GCCCG	2	10	112675	112684	0 %	0 %	40 %	60 %	21226189
55	NC_003901	AATAA	2	10	115260	115269	80 %	20 %	0 %	0 %	21226191
56	NC_003901	GCTTT	2	10	119317	119326	0 %	60 %	20 %	20 %	21226194
57	NC_003901	TAAAA	2	10	132343	132352	80 %	20 %	0 %	0 %	21226206
58	NC_003901	AAATA	2	10	132441	132450	80 %	20 %	0 %	0 %	21226206
59	NC_003901	ACTTC	2	10	135891	135900	20 %	40 %	0 %	40 %	21226211
60	NC_003901	AAGGA	2	10	136513	136522	60 %	0 %	40 %	0 %	21226211
61	NC_003901	AAAAC	2	10	142575	142584	80 %	0 %	0 %	20 %	21226217
62	NC_003901	TTATT	2	10	147779	147788	20 %	80 %	0 %	0 %	21226220
63	NC_003901	AAAAC	2	10	150709	150718	80 %	0 %	0 %	20 %	21226223
64	NC_003901	ATGCA	2	10	151767	151776	40 %	20 %	20 %	20 %	21226223
65	NC_003901	AAAAG	2	10	152197	152206	80 %	0 %	20 %	0 %	21226223
66	NC_003901	AAAAG	2	10	161531	161540	80 %	0 %	20 %	0 %	21226231
67	NC_003901	TGATC	2	10	161592	161601	20 %	40 %	20 %	20 %	21226231
68	NC_003901	GGGAA	2	10	164228	164237	40 %	0 %	60 %	0 %	21226234
69	NC_003901	ATTCC	2	10	165063	165072	20 %	40 %	0 %	40 %	21226235
70	NC_003901	GAAGG	2	10	165533	165542	40 %	0 %	60 %	0 %	21226235
71	NC_003901	AAGAG	2	10	165912	165921	60 %	0 %	40 %	0 %	21226235
72	NC_003901	CCCTG	2	10	166360	166369	0 %	20 %	20 %	60 %	21226236
73	NC_003901	CTTTT	2	10	169630	169639	0 %	80 %	0 %	20 %	21226238
74	NC_003901	GGCAA	2	10	169645	169654	40 %	0 %	40 %	20 %	21226238
75	NC_003901	CCAGA	2	10	174909	174918	40 %	0 %	20 %	40 %	21226241
76	NC_003901	CTGCC	2	10	179007	179016	0 %	20 %	20 %	60 %	21226246
77	NC_003901	TGCAG	2	10	179271	179280	20 %	20 %	40 %	20 %	21226246
78	NC_003901	AGCAG	2	10	180804	180813	40 %	0 %	40 %	20 %	161485684
79	NC_003901	ATCAA	2	10	182897	182906	60 %	20 %	0 %	20 %	21226248
80	NC_003901	TGCAT	2	10	183903	183912	20 %	40 %	20 %	20 %	21226249
81	NC_003901	TTGGC	2	10	185381	185390	0 %	40 %	40 %	20 %	21226251
82	NC_003901	GGCTT	2	10	186279	186288	0 %	40 %	40 %	20 %	21226252
83	NC_003901	GATCT	2	10	186484	186493	20 %	40 %	20 %	20 %	21226252
84	NC_003901	AAAGA	2	10	193922	193931	80 %	0 %	20 %	0 %	21226255
85	NC_003901	GAAAT	2	10	193968	193977	60 %	20 %	20 %	0 %	21226255
86	NC_003901	ACTAA	2	10	195461	195470	60 %	20 %	0 %	20 %	21226256
87	NC_003901	AGAGA	2	10	197072	197081	60 %	0 %	40 %	0 %	21226256
88	NC_003901	AAGAC	2	10	197981	197990	60 %	0 %	20 %	20 %	21226256
89	NC_003901	AAGAA	2	10	199908	199917	80 %	0 %	20 %	0 %	21226257
90	NC_003901	TTCAA	2	10	201047	201056	40 %	40 %	0 %	20 %	21226258
91	NC_003901	TACTT	2	10	202117	202126	20 %	60 %	0 %	20 %	21226258
92	NC_003901	CTATC	2	10	202533	202542	20 %	40 %	0 %	40 %	21226258
93	NC_003901	CAGAT	2	10	204309	204318	40 %	20 %	20 %	20 %	21226258
94	NC_003901	GAGAT	2	10	209566	209575	40 %	20 %	40 %	0 %	21226264
95	NC_003901	GAAAA	2	10	210818	210827	80 %	0 %	20 %	0 %	21226265
96	NC_003901	TAAAG	2	10	212436	212445	60 %	20 %	20 %	0 %	21226265
97	NC_003901	AAAAC	2	10	212630	212639	80 %	0 %	0 %	20 %	21226265
98	NC_003901	TCAAG	2	10	213069	213078	40 %	20 %	20 %	20 %	21226266
99	NC_003901	GTGAT	2	10	214053	214062	20 %	40 %	40 %	0 %	21226266
100	NC_003901	AAAAG	2	10	214516	214525	80 %	0 %	20 %	0 %	21226266
101	NC_003901	TGTAC	2	10	215914	215923	20 %	40 %	20 %	20 %	21226268
102	NC_003901	ATTTT	2	10	217038	217047	20 %	80 %	0 %	0 %	21226268
103	NC_003901	CTGCT	2	10	220480	220489	0 %	40 %	20 %	40 %	21226270
104	NC_003901	GGAAG	2	10	221614	221623	40 %	0 %	60 %	0 %	21226270
105	NC_003901	AGTAA	2	10	222121	222130	60 %	20 %	20 %	0 %	21226270
106	NC_003901	AATCA	2	10	222148	222157	60 %	20 %	0 %	20 %	21226270
107	NC_003901	TCCCA	2	10	222614	222623	20 %	20 %	0 %	60 %	21226270
108	NC_003901	ATTAT	2	10	223484	223493	40 %	60 %	0 %	0 %	21226270
109	NC_003901	GATAC	2	10	224907	224916	40 %	20 %	20 %	20 %	21226271
110	NC_003901	GTTCC	2	10	226712	226721	0 %	40 %	20 %	40 %	21226272
111	NC_003901	AGTAA	2	10	227651	227660	60 %	20 %	20 %	0 %	21226274
112	NC_003901	AAAAC	2	10	231270	231279	80 %	0 %	0 %	20 %	21226275
113	NC_003901	AGGAT	2	10	240809	240818	40 %	20 %	40 %	0 %	21226278
114	NC_003901	AGGAA	2	10	244733	244742	60 %	0 %	40 %	0 %	21226280
115	NC_003901	GGAAA	2	10	245731	245740	60 %	0 %	40 %	0 %	21226280
116	NC_003901	ACCTG	2	10	247543	247552	20 %	20 %	20 %	40 %	21226280
117	NC_003901	TTCAG	2	10	247622	247631	20 %	40 %	20 %	20 %	21226280
118	NC_003901	ATTAA	2	10	248105	248114	60 %	40 %	0 %	0 %	21226280
119	NC_003901	GTCCA	2	10	248480	248489	20 %	20 %	20 %	40 %	21226280
120	NC_003901	CATTC	2	10	249978	249987	20 %	40 %	0 %	40 %	21226282
121	NC_003901	TGCAG	2	10	250018	250027	20 %	20 %	40 %	20 %	21226282
122	NC_003901	GTTTC	2	10	251706	251715	0 %	60 %	20 %	20 %	21226283
123	NC_003901	TCATA	2	10	252567	252576	40 %	40 %	0 %	20 %	161485683
124	NC_003901	CCCTG	2	10	256112	256121	0 %	20 %	20 %	60 %	21226285
125	NC_003901	AAGGA	2	10	256451	256460	60 %	0 %	40 %	0 %	21226285
126	NC_003901	GCGGA	2	10	257108	257117	20 %	0 %	60 %	20 %	21226286
127	NC_003901	GAGTT	2	10	258761	258770	20 %	40 %	40 %	0 %	21226287
128	NC_003901	TGGGA	2	10	261760	261769	20 %	20 %	60 %	0 %	21226292
129	NC_003901	TGTCC	2	10	264742	264751	0 %	40 %	20 %	40 %	21226293
130	NC_003901	TTCGA	2	10	266993	267002	20 %	40 %	20 %	20 %	21226295
131	NC_003901	GAAAA	2	10	267661	267670	80 %	0 %	20 %	0 %	21226295
132	NC_003901	TTACA	2	10	269660	269669	40 %	40 %	0 %	20 %	21226295
133	NC_003901	AATAT	2	10	271265	271274	60 %	40 %	0 %	0 %	21226297
134	NC_003901	TCAAG	2	10	273329	273338	40 %	20 %	20 %	20 %	21226299
135	NC_003901	GAATT	2	10	273906	273915	40 %	40 %	20 %	0 %	21226299
136	NC_003901	TAAAG	2	10	279860	279869	60 %	20 %	20 %	0 %	21226305
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