MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 49064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_003552	CTC	2	6	5742890	5742895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093430
49002	NC_003552	GAA	3	9	5742958	5742966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093430
49003	NC_003552	GCC	2	6	5743258	5743263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093431
49004	NC_003552	GAA	2	6	5743590	5743595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093431
49005	NC_003552	CAC	2	6	5743605	5743610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20093431
49006	NC_003552	GCA	2	6	5743667	5743672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093431
49007	NC_003552	TAA	2	6	5743803	5743808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20093431
49008	NC_003552	GAG	2	6	5743858	5743863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093431
49009	NC_003552	AAT	2	6	5743993	5743998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20093431
49010	NC_003552	GAA	2	6	5744288	5744293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093432
49011	NC_003552	AAG	2	6	5744318	5744323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093432
49012	NC_003552	ATT	2	6	5744432	5744437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20093432
49013	NC_003552	AGA	2	6	5744521	5744526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093432
49014	NC_003552	ACA	2	6	5744612	5744617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20093432
49015	NC_003552	GAA	2	6	5744879	5744884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093432
49016	NC_003552	ATC	2	6	5744894	5744899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093432
49017	NC_003552	TCA	2	6	5744934	5744939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093432
49018	NC_003552	CCT	2	6	5744976	5744981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093432
49019	NC_003552	ATC	2	6	5745811	5745816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093433
49020	NC_003552	GGA	2	6	5745833	5745838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20093433
49021	NC_003552	CAT	2	6	5746044	5746049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093433
49022	NC_003552	ATT	2	6	5746081	5746086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20093433
49023	NC_003552	TGA	2	6	5746125	5746130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093433
49024	NC_003552	ATG	2	6	5746460	5746465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093433
49025	NC_003552	TCA	2	6	5746547	5746552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093433
49026	NC_003552	AAG	2	6	5746712	5746717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093433
49027	NC_003552	ACC	2	6	5746729	5746734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	20093433
49028	NC_003552	AGA	2	6	5746779	5746784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093433
49029	NC_003552	GAA	2	6	5746952	5746957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093434
49030	NC_003552	CTG	2	6	5747020	5747025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093434
49031	NC_003552	GAA	2	6	5747054	5747059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093434
49032	NC_003552	CTG	2	6	5747193	5747198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093434
49033	NC_003552	ATC	2	6	5747357	5747362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20093434
49034	NC_003552	TTG	2	6	5747947	5747952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093435
49035	NC_003552	GAA	2	6	5747993	5747998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093435
49036	NC_003552	GAA	2	6	5748229	5748234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093435
49037	NC_003552	ATG	2	6	5748253	5748258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	20093435
49038	NC_003552	GTT	2	6	5748303	5748308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093435
49039	NC_003552	GAA	2	6	5748573	5748578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20093435
49040	NC_003552	CTG	2	6	5748580	5748585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093435
49041	NC_003552	AAC	2	6	5748675	5748680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20093435
49042	NC_003552	ATT	2	6	5748717	5748722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20093436
49043	NC_003552	ATT	2	6	5748762	5748767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20093436
49044	NC_003552	CCT	2	6	5749025	5749030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093437
49045	NC_003552	GCA	2	6	5749361	5749366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093437
49046	NC_003552	TTC	2	6	5749499	5749504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093437
49047	NC_003552	TGG	2	6	5749593	5749598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20093437
49048	NC_003552	TTC	2	6	5749610	5749615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093437
49049	NC_003552	TGC	2	6	5749632	5749637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093437
49050	NC_003552	CGA	2	6	5749735	5749740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20093437
49051	NC_003552	CAA	2	6	5750058	5750063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20093438
49052	NC_003552	CTT	2	6	5750073	5750078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093438
49053	NC_003552	TTC	3	9	5750164	5750172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20093438
49054	NC_003552	TTG	2	6	5750267	5750272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	20093438
49055	NC_003552	TCC	2	6	5750335	5750340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20093438
49056	NC_003552	CCG	2	6	5750385	5750390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	20093438
49057	NC_003552	GCT	2	6	5750480	5750485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20093438
49058	NC_003552	CAT	2	6	5750722	5750727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484931
49059	NC_003552	ATC	2	6	5750858	5750863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484931
49060	NC_003552	CAA	2	6	5750989	5750994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161484931
49061	NC_003552	ATA	3	9	5751153	5751161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161484931
49062	NC_003552	CAG	2	6	5751178	5751183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161484931
49063	NC_003552	TAT	2	6	5751233	5751238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161484931
49064	NC_003552	TCA	2	6	5751241	5751246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161484931

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.