MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002944	GGCGC	3	15	129368	129382	0 %	0 %	60 %	40 %	41406217
3002	NC_002944	ACG	3	9	129400	129408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
3003	NC_002944	GAT	2	6	129468	129473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406217
3004	NC_002944	CGC	2	6	129483	129488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
3005	NC_002944	GCCAG	2	10	129512	129521	20 %	0 %	40 %	40 %	41406217
3006	NC_002944	GTC	2	6	129558	129563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406217
3007	NC_002944	CAG	2	6	129567	129572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
3008	NC_002944	TGA	2	6	129574	129579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406217
3009	NC_002944	CCG	2	6	129590	129595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
3010	NC_002944	CGC	2	6	129609	129614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406217
3011	NC_002944	GCA	2	6	129626	129631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
3012	NC_002944	GGGCCC	2	12	129632	129643	0 %	0 %	50 %	50 %	41406217
3013	NC_002944	GTC	2	6	129678	129683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406217
3014	NC_002944	CAG	2	6	129693	129698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406217
3015	NC_002944	CGGCC	2	10	129716	129725	0 %	0 %	40 %	60 %	41406217
3016	NC_002944	GGTC	2	8	129745	129752	0 %	25 %	50 %	25 %	41406218
3017	NC_002944	GT	3	6	129802	129807	0 %	50 %	50 %	0 %	41406218
3018	NC_002944	ATC	2	6	129836	129841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406218
3019	NC_002944	GCC	2	6	129849	129854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406218
3020	NC_002944	CACCCG	2	12	129884	129895	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	41406218
3021	NC_002944	GAC	2	6	129896	129901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406218
3022	NC_002944	ACGC	2	8	129932	129939	25 %	0 %	25 %	50 %	41406218
3023	NC_002944	GCG	2	6	129973	129978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406218
3024	NC_002944	GCT	2	6	130000	130005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406218
3025	NC_002944	GCA	2	6	130030	130035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406218
3026	NC_002944	GCCC	2	8	130066	130073	0 %	0 %	25 %	75 %	41406218
3027	NC_002944	CGC	2	6	130078	130083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406218
3028	NC_002944	CGA	2	6	130087	130092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406218
3029	NC_002944	ACC	2	6	130119	130124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406218
3030	NC_002944	CGG	2	6	130241	130246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406219
3031	NC_002944	CAT	2	6	130296	130301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406219
3032	NC_002944	GGC	2	6	130374	130379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406219
3033	NC_002944	ACGGC	2	10	130393	130402	20 %	0 %	40 %	40 %	41406219
3034	NC_002944	CGGT	2	8	130418	130425	0 %	25 %	50 %	25 %	41406219
3035	NC_002944	GCG	2	6	130426	130431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406219
3036	NC_002944	ATCG	2	8	130434	130441	25 %	25 %	25 %	25 %	41406219
3037	NC_002944	GCC	3	9	130495	130503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406219
3038	NC_002944	CTTCC	2	10	130523	130532	0 %	40 %	0 %	60 %	41406219
3039	NC_002944	G	7	7	130667	130673	0 %	0 %	100 %	0 %	41406219
3040	NC_002944	TCG	2	6	130694	130699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406219
3041	NC_002944	GTG	2	6	130717	130722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406219
3042	NC_002944	CGCC	2	8	130738	130745	0 %	0 %	25 %	75 %	41406219
3043	NC_002944	CGA	2	6	130829	130834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406220
3044	NC_002944	GCG	2	6	130837	130842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406220
3045	NC_002944	GGC	2	6	130866	130871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406220
3046	NC_002944	GCGGCC	2	12	130879	130890	0 %	0 %	50 %	50 %	41406220
3047	NC_002944	GGT	2	6	130893	130898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406220
3048	NC_002944	GGT	3	9	130902	130910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406220
3049	NC_002944	GCTG	2	8	130935	130942	0 %	25 %	50 %	25 %	41406220
3050	NC_002944	CCG	2	6	130943	130948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406220
3051	NC_002944	CAGC	2	8	130968	130975	25 %	0 %	25 %	50 %	41406220
3052	NC_002944	GGGC	2	8	131011	131018	0 %	0 %	75 %	25 %	41406220
3053	NC_002944	GCG	2	6	131065	131070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406220
3054	NC_002944	ACCT	2	8	131080	131087	25 %	25 %	0 %	50 %	41406220
3055	NC_002944	GCT	2	6	131150	131155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406221
3056	NC_002944	AGC	2	6	131157	131162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
3057	NC_002944	GCCCG	2	10	131171	131180	0 %	0 %	40 %	60 %	41406221
3058	NC_002944	GCA	2	6	131193	131198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
3059	NC_002944	CGG	2	6	131230	131235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
3060	NC_002944	CCG	2	6	131290	131295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
3061	NC_002944	GCC	2	6	131367	131372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
3062	NC_002944	CCG	2	6	131401	131406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
3063	NC_002944	GCC	2	6	131466	131471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406221
3064	NC_002944	TGG	2	6	131494	131499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406221
3065	NC_002944	CGA	2	6	131500	131505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
3066	NC_002944	CG	3	6	131555	131560	0 %	0 %	50 %	50 %	41406221
3067	NC_002944	GGC	2	6	131573	131578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
3068	NC_002944	CAC	2	6	131579	131584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406221
3069	NC_002944	ACC	2	6	131589	131594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406221
3070	NC_002944	CGA	2	6	131602	131607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
3071	NC_002944	AGC	2	6	131625	131630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
3072	NC_002944	GGA	2	6	131649	131654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406221
3073	NC_002944	CGGCAG	2	12	131659	131670	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	41406221
3074	NC_002944	CGG	2	6	131761	131766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
3075	NC_002944	CCGGCG	2	12	131772	131783	0 %	0 %	50 %	50 %	41406221
3076	NC_002944	GCG	4	12	131781	131792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406221
3077	NC_002944	AGA	2	6	131821	131826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406221
3078	NC_002944	TTC	2	6	131924	131929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406221
3079	NC_002944	CAG	2	6	131960	131965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406221
3080	NC_002944	GCT	3	9	132091	132099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406222
3081	NC_002944	GGA	2	6	132134	132139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406222
3082	NC_002944	GC	3	6	132192	132197	0 %	0 %	50 %	50 %	41406222
3083	NC_002944	CGC	2	6	132223	132228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406222
3084	NC_002944	GC	3	6	132234	132239	0 %	0 %	50 %	50 %	41406222
3085	NC_002944	CCG	2	6	132242	132247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406222
3086	NC_002944	GTG	2	6	132248	132253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406222
3087	NC_002944	CGG	2	6	132312	132317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406222
3088	NC_002944	CCG	2	6	132353	132358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406222
3089	NC_002944	C	6	6	132373	132378	0 %	0 %	0 %	100 %	41406222
3090	NC_002944	TGG	2	6	132414	132419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406222
3091	NC_002944	GC	3	6	132468	132473	0 %	0 %	50 %	50 %	41406222
3092	NC_002944	GCC	2	6	132476	132481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406222
3093	NC_002944	CGGC	2	8	132485	132492	0 %	0 %	50 %	50 %	41406222
3094	NC_002944	GCG	2	6	132512	132517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406222
3095	NC_002944	GAGCAG	2	12	132521	132532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	41406222
3096	NC_002944	CCG	2	6	132541	132546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406222
3097	NC_002944	CGA	3	9	132598	132606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406222
3098	NC_002944	AGT	2	6	132607	132612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406222
3099	NC_002944	GCA	2	6	132626	132631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406222
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3101	NC_002944	GC	3	6	132706	132711	0 %	0 %	50 %	50 %	41406222
3102	NC_002944	TGC	2	6	132768	132773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406222
3103	NC_002944	TCG	2	6	132873	132878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406223
3104	NC_002944	GC	3	6	132944	132949	0 %	0 %	50 %	50 %	41406223
3105	NC_002944	TCG	2	6	132960	132965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406223
3106	NC_002944	ACC	2	6	132984	132989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406223
3107	NC_002944	CGGC	2	8	133030	133037	0 %	0 %	50 %	50 %	41406223
3108	NC_002944	ACG	2	6	133069	133074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406223
3109	NC_002944	CGGCG	2	10	133079	133088	0 %	0 %	60 %	40 %	41406223
3110	NC_002944	CGAT	2	8	133096	133103	25 %	25 %	25 %	25 %	41406223
3111	NC_002944	CGT	2	6	133177	133182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406223
3112	NC_002944	GGC	2	6	133241	133246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406223
3113	NC_002944	GTG	2	6	133296	133301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406223
3114	NC_002944	GTTG	2	8	133494	133501	0 %	50 %	50 %	0 %	41406223
3115	NC_002944	CGA	2	6	133660	133665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406224
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3117	NC_002944	CGT	2	6	133759	133764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406224
3118	NC_002944	ACG	2	6	133830	133835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406224
3119	NC_002944	CGT	2	6	133846	133851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406224
3120	NC_002944	GCG	2	6	133863	133868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406224
3121	NC_002944	GTG	2	6	133987	133992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406224
3122	NC_002944	CG	3	6	133997	134002	0 %	0 %	50 %	50 %	41406224
3123	NC_002944	TCC	2	6	134014	134019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406224
3124	NC_002944	GT	3	6	134332	134337	0 %	50 %	50 %	0 %	41406225
3125	NC_002944	TGG	2	6	134395	134400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3126	NC_002944	TGG	2	6	134407	134412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3127	NC_002944	GATCGC	2	12	134432	134443	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3128	NC_002944	TCG	2	6	134482	134487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3129	NC_002944	TCG	2	6	134494	134499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3130	NC_002944	CGC	2	6	134518	134523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406225
3131	NC_002944	CGC	2	6	134540	134545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406225
3132	NC_002944	CGT	2	6	134555	134560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3133	NC_002944	TCA	2	6	134605	134610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406225
3134	NC_002944	CGT	2	6	134612	134617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
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3138	NC_002944	CGT	2	6	134684	134689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3139	NC_002944	GCA	2	6	134732	134737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3140	NC_002944	CTG	2	6	134844	134849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3141	NC_002944	TGG	2	6	134863	134868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3142	NC_002944	CCCGG	2	10	134882	134891	0 %	0 %	40 %	60 %	41406225
3143	NC_002944	GTG	2	6	134925	134930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406225
3144	NC_002944	ATC	2	6	134937	134942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406225
3145	NC_002944	TGC	2	6	134950	134955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3146	NC_002944	G	6	6	135034	135039	0 %	0 %	100 %	0 %	41406225
3147	NC_002944	TCGA	2	8	135105	135112	25 %	25 %	25 %	25 %	41406225
3148	NC_002944	GC	3	6	135187	135192	0 %	0 %	50 %	50 %	41406225
3149	NC_002944	TGGG	2	8	135193	135200	0 %	25 %	75 %	0 %	41406225
3150	NC_002944	CAT	2	6	135272	135277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406225
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3152	NC_002944	CTG	2	6	135357	135362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3153	NC_002944	ATCT	2	8	135432	135439	25 %	50 %	0 %	25 %	41406225
3154	NC_002944	GGTCAC	2	12	135440	135451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3155	NC_002944	CTG	2	6	135471	135476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
3156	NC_002944	CTG	2	6	135495	135500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406225
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3230	NC_002944	ACG	2	6	137988	137993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406228
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3233	NC_002944	CAT	2	6	138187	138192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406228
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3242	NC_002944	CTG	2	6	138771	138776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406229
3243	NC_002944	CGG	2	6	138780	138785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406229
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3245	NC_002944	TGA	2	6	138827	138832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406229
3246	NC_002944	GTC	2	6	138852	138857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406229
3247	NC_002944	GCC	2	6	138900	138905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406229
3248	NC_002944	GTC	3	9	138909	138917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406229
3249	NC_002944	GC	3	6	138991	138996	0 %	0 %	50 %	50 %	41406229
3250	NC_002944	GC	3	6	138998	139003	0 %	0 %	50 %	50 %	41406229
3251	NC_002944	CGA	2	6	139005	139010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406229
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3275	NC_002944	GTC	3	9	140087	140095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406230
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3354	NC_002944	GACCC	2	10	143126	143135	20 %	0 %	20 %	60 %	41406233
3355	NC_002944	GAC	2	6	143165	143170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
3356	NC_002944	CGGCTG	2	12	143257	143268	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	41406233
3357	NC_002944	CAC	2	6	143272	143277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406233
3358	NC_002944	GC	4	8	143284	143291	0 %	0 %	50 %	50 %	41406233
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3363	NC_002944	TGC	3	9	143397	143405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406233
3364	NC_002944	CGA	2	6	143422	143427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
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3366	NC_002944	CTT	2	6	143491	143496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406233
3367	NC_002944	GAC	2	6	143522	143527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
3368	NC_002944	TGC	3	9	143535	143543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406233
3369	NC_002944	CAT	2	6	143548	143553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406233
3370	NC_002944	CGA	2	6	143563	143568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
3371	NC_002944	TCA	2	6	143625	143630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406233
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3374	NC_002944	CGA	2	6	143785	143790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406233
3375	NC_002944	GAGC	2	8	144116	144123	25 %	0 %	50 %	25 %	41406234
3376	NC_002944	CGAAG	2	10	144125	144134	40 %	0 %	40 %	20 %	41406234
3377	NC_002944	ATC	2	6	144138	144143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406234
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3379	NC_002944	CGC	2	6	144230	144235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406234
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3387	NC_002944	ACA	2	6	144421	144426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406234
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3489	NC_002944	GGC	2	6	147765	147770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406239
3490	NC_002944	ACC	2	6	147790	147795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406239
3491	NC_002944	CCG	2	6	147824	147829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406239
3492	NC_002944	GGT	2	6	147917	147922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406240
3493	NC_002944	TCG	2	6	147927	147932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3494	NC_002944	CCG	3	9	147953	147961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406240
3495	NC_002944	GCC	2	6	148079	148084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406240
3496	NC_002944	GCG	2	6	148096	148101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3497	NC_002944	CGG	2	6	148102	148107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3498	NC_002944	GATC	2	8	148115	148122	25 %	25 %	25 %	25 %	41406240
3499	NC_002944	GCG	2	6	148202	148207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3500	NC_002944	CGG	2	6	148211	148216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240

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