MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002944	GGT	2	6	19621	19626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406116
502	NC_002944	GTG	2	6	19638	19643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406116
503	NC_002944	GCC	2	6	19763	19768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406116
504	NC_002944	TCC	2	6	19834	19839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406117
505	NC_002944	CGGCG	2	10	19873	19882	0 %	0 %	60 %	40 %	41406117
506	NC_002944	C	6	6	19889	19894	0 %	0 %	0 %	100 %	41406117
507	NC_002944	CCA	2	6	19923	19928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406117
508	NC_002944	GCG	2	6	19986	19991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406117
509	NC_002944	GT	3	6	19992	19997	0 %	50 %	50 %	0 %	41406117
510	NC_002944	CTG	2	6	20068	20073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
511	NC_002944	TTAGC	2	10	20106	20115	20 %	40 %	20 %	20 %	41406117
512	NC_002944	GCG	2	6	20124	20129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406117
513	NC_002944	CG	3	6	20134	20139	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
514	NC_002944	GCT	2	6	20142	20147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
515	NC_002944	GTG	3	9	20156	20164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406117
516	NC_002944	CCG	2	6	20225	20230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
517	NC_002944	GAT	2	6	20326	20331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406117
518	NC_002944	GC	3	6	20395	20400	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
519	NC_002944	TGC	2	6	20403	20408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
520	NC_002944	CTG	2	6	20476	20481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
521	NC_002944	GGTCG	2	10	20491	20500	0 %	20 %	60 %	20 %	41406117
522	NC_002944	CGGCG	2	10	20563	20572	0 %	0 %	60 %	40 %	41406117
523	NC_002944	GCT	2	6	20577	20582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
524	NC_002944	GCC	2	6	20612	20617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
525	NC_002944	GTG	2	6	20618	20623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406117
526	NC_002944	CGGG	2	8	20643	20650	0 %	0 %	75 %	25 %	41406117
527	NC_002944	TCG	2	6	20693	20698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
528	NC_002944	CGCCTG	2	12	20713	20724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	41406117
529	NC_002944	CAG	2	6	20746	20751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
530	NC_002944	CGA	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
531	NC_002944	ACC	2	6	20816	20821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406117
532	NC_002944	CGG	2	6	20833	20838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406117
533	NC_002944	GCC	2	6	20839	20844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
534	NC_002944	CTG	2	6	20851	20856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
535	NC_002944	GCC	2	6	20870	20875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
536	NC_002944	TGG	2	6	20895	20900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406117
537	NC_002944	CG	3	6	20916	20921	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
538	NC_002944	GAA	2	6	20935	20940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406117
539	NC_002944	TCG	2	6	20969	20974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
540	NC_002944	CAG	2	6	20983	20988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
541	NC_002944	CAG	2	6	21121	21126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
542	NC_002944	GCC	2	6	21130	21135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406117
543	NC_002944	TCG	2	6	21167	21172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406117
544	NC_002944	AGC	2	6	21173	21178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
545	NC_002944	GC	3	6	21200	21205	0 %	0 %	50 %	50 %	41406117
546	NC_002944	AGC	4	12	21245	21256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406117
547	NC_002944	GCC	2	6	21331	21336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406118
548	NC_002944	ACGG	2	8	21371	21378	25 %	0 %	50 %	25 %	41406118
549	NC_002944	CAG	2	6	21411	21416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
550	NC_002944	CGA	2	6	21435	21440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
551	NC_002944	GGT	2	6	21462	21467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406118
552	NC_002944	CGA	3	9	21503	21511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
553	NC_002944	CGG	2	6	21545	21550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
554	NC_002944	CAG	2	6	21552	21557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
555	NC_002944	ACGATG	2	12	21604	21615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	41406118
556	NC_002944	GGC	2	6	21633	21638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
557	NC_002944	CCA	2	6	21644	21649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406118
558	NC_002944	GGC	2	6	21669	21674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
559	NC_002944	GAT	2	6	21675	21680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406118
560	NC_002944	GTCG	2	8	21684	21691	0 %	25 %	50 %	25 %	41406118
561	NC_002944	CGG	2	6	21695	21700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
562	NC_002944	CCG	2	6	21745	21750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406118
563	NC_002944	CAC	2	6	21817	21822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406118
564	NC_002944	GCACCC	2	12	21827	21838	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	41406118
565	NC_002944	CGA	2	6	21878	21883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
566	NC_002944	ACC	3	9	21934	21942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406118
567	NC_002944	ACG	2	6	21947	21952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
568	NC_002944	CCGA	2	8	22000	22007	25 %	0 %	25 %	50 %	41406118
569	NC_002944	GCC	2	6	22018	22023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406118
570	NC_002944	AGC	2	6	22024	22029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
571	NC_002944	CG	3	6	22040	22045	0 %	0 %	50 %	50 %	41406118
572	NC_002944	GAA	2	6	22122	22127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406118
573	NC_002944	CAG	2	6	22131	22136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
574	NC_002944	CGG	2	6	22154	22159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
575	NC_002944	ACC	2	6	22318	22323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406118
576	NC_002944	CTG	2	6	22362	22367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406118
577	NC_002944	GTG	2	6	22380	22385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406118
578	NC_002944	GCTGA	2	10	22392	22401	20 %	20 %	40 %	20 %	41406118
579	NC_002944	CAG	2	6	22470	22475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
580	NC_002944	GAC	2	6	22527	22532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
581	NC_002944	GTT	2	6	22577	22582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406118
582	NC_002944	CAG	2	6	22599	22604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
583	NC_002944	TGG	2	6	22619	22624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406118
584	NC_002944	CAG	2	6	22635	22640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406118
585	NC_002944	CAA	2	6	22641	22646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406118
586	NC_002944	CGG	2	6	22689	22694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406118
587	NC_002944	TG	3	6	22702	22707	0 %	50 %	50 %	0 %	41406118
588	NC_002944	GTG	2	6	22779	22784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406119
589	NC_002944	GCCGG	2	10	22809	22818	0 %	0 %	60 %	40 %	41406119
590	NC_002944	TGG	2	6	22852	22857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406119
591	NC_002944	GGT	2	6	22860	22865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406119
592	NC_002944	GCC	2	6	22880	22885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
593	NC_002944	GC	3	6	22935	22940	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
594	NC_002944	GGC	2	6	22941	22946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
595	NC_002944	GCA	2	6	22957	22962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
596	NC_002944	CAG	2	6	22973	22978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
597	NC_002944	GCC	2	6	23012	23017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
598	NC_002944	GCG	2	6	23051	23056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
599	NC_002944	TCA	2	6	23071	23076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406119
600	NC_002944	GCC	2	6	23090	23095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
601	NC_002944	CG	3	6	23130	23135	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
602	NC_002944	CCA	2	6	23146	23151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406119
603	NC_002944	GCT	2	6	23158	23163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
604	NC_002944	CAG	2	6	23177	23182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
605	NC_002944	GTA	2	6	23234	23239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406119
606	NC_002944	CAC	2	6	23256	23261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406119
607	NC_002944	GGCC	2	8	23272	23279	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
608	NC_002944	GAC	2	6	23306	23311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
609	NC_002944	CGC	2	6	23322	23327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
610	NC_002944	ACC	2	6	23329	23334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406119
611	NC_002944	CGGC	2	8	23336	23343	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
612	NC_002944	GCG	2	6	23359	23364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
613	NC_002944	TCG	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
614	NC_002944	CG	3	6	23386	23391	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
615	NC_002944	TCG	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
616	NC_002944	CGTAGT	2	12	23488	23499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	41406119
617	NC_002944	ACG	2	6	23517	23522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
618	NC_002944	GCC	3	9	23537	23545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406119
619	NC_002944	GGC	2	6	23573	23578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406119
620	NC_002944	TCG	2	6	23619	23624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
621	NC_002944	CAG	2	6	23654	23659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
622	NC_002944	GC	4	8	23722	23729	0 %	0 %	50 %	50 %	41406119
623	NC_002944	CCT	2	6	23761	23766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406119
624	NC_002944	TCG	2	6	23784	23789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
625	NC_002944	GTC	2	6	23810	23815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406119
626	NC_002944	GCA	2	6	23845	23850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406119
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757	NC_002944	CGAC	2	8	28980	28987	25 %	0 %	25 %	50 %	41406124
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761	NC_002944	CGGT	2	8	29137	29144	0 %	25 %	50 %	25 %	41406124
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880	NC_002944	AGA	2	6	36797	36802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406128
881	NC_002944	CTTT	2	8	36934	36941	0 %	75 %	0 %	25 %	41406129
882	NC_002944	TCGG	2	8	36948	36955	0 %	25 %	50 %	25 %	41406129
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