MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_002944	CG	3	6	276961	276966	0 %	0 %	50 %	50 %	41406354
7004	NC_002944	TCG	2	6	276972	276977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406354
7005	NC_002944	GCC	2	6	276980	276985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406354
7006	NC_002944	GCT	2	6	277021	277026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406354
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7009	NC_002944	TGA	2	6	277074	277079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406354
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7122	NC_002944	GCC	2	6	281625	281630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406360
7123	NC_002944	CAT	2	6	281720	281725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406360
7124	NC_002944	CGG	2	6	281761	281766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406360
7125	NC_002944	CGCA	2	8	281781	281788	25 %	0 %	25 %	50 %	41406360
7126	NC_002944	CGG	2	6	281792	281797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406360
7127	NC_002944	CGG	2	6	281849	281854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406360
7128	NC_002944	CAC	2	6	281867	281872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406360
7129	NC_002944	GCCG	2	8	281889	281896	0 %	0 %	50 %	50 %	41406360
7130	NC_002944	TCG	2	6	281923	281928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406360
7131	NC_002944	CCGGC	2	10	281956	281965	0 %	0 %	40 %	60 %	41406360
7132	NC_002944	TGC	2	6	281968	281973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406360
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7135	NC_002944	GCC	2	6	282048	282053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406360
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7139	NC_002944	CTG	2	6	282246	282251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406360
7140	NC_002944	GCGCG	2	10	282257	282266	0 %	0 %	60 %	40 %	41406360
7141	NC_002944	CG	3	6	282280	282285	0 %	0 %	50 %	50 %	41406360
7142	NC_002944	CGT	2	6	282338	282343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406360
7143	NC_002944	TCG	2	6	282385	282390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406360
7144	NC_002944	CG	3	6	282524	282529	0 %	0 %	50 %	50 %	41406360
7145	NC_002944	TAC	2	6	282534	282539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406360
7146	NC_002944	GGTC	2	8	282541	282548	0 %	25 %	50 %	25 %	41406360
7147	NC_002944	CCCGG	2	10	282602	282611	0 %	0 %	40 %	60 %	41406360
7148	NC_002944	C	6	6	282624	282629	0 %	0 %	0 %	100 %	41406360
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7155	NC_002944	CCG	2	6	282892	282897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406360
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7183	NC_002944	CGG	2	6	283898	283903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406361
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7189	NC_002944	CG	3	6	284136	284141	0 %	0 %	50 %	50 %	41406361
7190	NC_002944	CAG	2	6	284151	284156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406361
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7228	NC_002944	GCC	2	6	285356	285361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406363
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7233	NC_002944	CGA	3	9	285587	285595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
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7235	NC_002944	GACG	2	8	285609	285616	25 %	0 %	50 %	25 %	41406363
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7239	NC_002944	GAT	2	6	285801	285806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406363
7240	NC_002944	GCCC	2	8	285914	285921	0 %	0 %	25 %	75 %	41406363
7241	NC_002944	CGA	2	6	285983	285988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406363
7242	NC_002944	TCG	2	6	286000	286005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406363
7243	NC_002944	TCG	2	6	286057	286062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406363
7244	NC_002944	GGT	2	6	286188	286193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406364
7245	NC_002944	GCG	2	6	286225	286230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406364
7246	NC_002944	CGA	2	6	286232	286237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406364
7247	NC_002944	GC	3	6	286255	286260	0 %	0 %	50 %	50 %	41406364
7248	NC_002944	CGGCC	2	10	286335	286344	0 %	0 %	40 %	60 %	41406364
7249	NC_002944	CCG	2	6	286364	286369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406364
7250	NC_002944	CGG	2	6	286463	286468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406364
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7366	NC_002944	GAC	2	6	290985	290990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406369
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7369	NC_002944	GCA	2	6	291011	291016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406369
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7487	NC_002944	TGG	2	6	295120	295125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406375
7488	NC_002944	GC	3	6	295141	295146	0 %	0 %	50 %	50 %	41406375
7489	NC_002944	GCC	2	6	295234	295239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406375
7490	NC_002944	GGC	2	6	295347	295352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375
7491	NC_002944	CGG	2	6	295355	295360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375
7492	NC_002944	CGT	2	6	295361	295366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406375
7493	NC_002944	ATCGG	2	10	295371	295380	20 %	20 %	40 %	20 %	41406375
7494	NC_002944	CAC	2	6	295386	295391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406375
7495	NC_002944	CCAGCG	2	12	295406	295417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	41406375
7496	NC_002944	TCA	2	6	295418	295423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406375
7497	NC_002944	CAC	2	6	295434	295439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406375
7498	NC_002944	GTC	2	6	295452	295457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406375
7499	NC_002944	ACC	2	6	295465	295470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406375
7500	NC_002944	CGG	2	6	295502	295507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406375

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