MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002944	GCT	2	6	185023	185028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
4502	NC_002944	GC	3	6	185119	185124	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
4503	NC_002944	GGCC	2	8	185166	185173	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
4504	NC_002944	GCT	2	6	185179	185184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406275
4505	NC_002944	CGGC	2	8	185193	185200	0 %	0 %	50 %	50 %	41406275
4506	NC_002944	CCG	2	6	185260	185265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
4507	NC_002944	GCC	2	6	185274	185279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
4508	NC_002944	GCG	2	6	185288	185293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4509	NC_002944	GGC	2	6	185328	185333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4510	NC_002944	GCA	2	6	185347	185352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4511	NC_002944	CTG	2	6	185357	185362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4512	NC_002944	CCGCG	2	10	185412	185421	0 %	0 %	40 %	60 %	41406276
4513	NC_002944	ATC	2	6	185424	185429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406276
4514	NC_002944	GCGCC	2	10	185431	185440	0 %	0 %	40 %	60 %	41406276
4515	NC_002944	CCA	2	6	185443	185448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
4516	NC_002944	GCC	2	6	185449	185454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
4517	NC_002944	GCG	2	6	185457	185462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4518	NC_002944	GAC	2	6	185481	185486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4519	NC_002944	GTC	2	6	185528	185533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4520	NC_002944	GCA	2	6	185545	185550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4521	NC_002944	CGG	2	6	185572	185577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4522	NC_002944	ACC	2	6	185613	185618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
4523	NC_002944	CCGGC	2	10	185652	185661	0 %	0 %	40 %	60 %	41406276
4524	NC_002944	CCGA	2	8	185679	185686	25 %	0 %	25 %	50 %	41406276
4525	NC_002944	GCG	2	6	185760	185765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4526	NC_002944	CCA	2	6	185767	185772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
4527	NC_002944	GC	4	8	185830	185837	0 %	0 %	50 %	50 %	41406276
4528	NC_002944	GGC	2	6	185916	185921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4529	NC_002944	CTG	2	6	185948	185953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4530	NC_002944	GC	3	6	186030	186035	0 %	0 %	50 %	50 %	41406276
4531	NC_002944	GCCC	2	8	186079	186086	0 %	0 %	25 %	75 %	41406276
4532	NC_002944	TCG	2	6	186102	186107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4533	NC_002944	CCA	2	6	186121	186126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
4534	NC_002944	CGG	2	6	186191	186196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4535	NC_002944	CAC	3	9	186197	186205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
4536	NC_002944	CGG	2	6	186222	186227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4537	NC_002944	GCC	2	6	186282	186287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
4538	NC_002944	CAC	2	6	186290	186295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406276
4539	NC_002944	GCC	3	9	186296	186304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406276
4540	NC_002944	GGC	2	6	186316	186321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406276
4541	NC_002944	GTC	2	6	186335	186340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406276
4542	NC_002944	TGC	2	6	186462	186467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406277
4543	NC_002944	ACC	2	6	186494	186499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406277
4544	NC_002944	CGG	2	6	186525	186530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
4545	NC_002944	CAT	2	6	186541	186546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406277
4546	NC_002944	ACG	2	6	186570	186575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406277
4547	NC_002944	CGG	3	9	186585	186593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
4548	NC_002944	GCGCC	2	10	186606	186615	0 %	0 %	40 %	60 %	41406277
4549	NC_002944	CGG	2	6	186627	186632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
4550	NC_002944	CG	3	6	186685	186690	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
4551	NC_002944	TGG	2	6	186702	186707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406277
4552	NC_002944	CG	3	6	186724	186729	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
4553	NC_002944	GC	3	6	186735	186740	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
4554	NC_002944	GAA	2	6	186760	186765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406277
4555	NC_002944	CGC	2	6	186791	186796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406277
4556	NC_002944	AGC	2	6	186863	186868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406277
4557	NC_002944	CAC	2	6	186874	186879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406277
4558	NC_002944	GTC	2	6	186943	186948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406277
4559	NC_002944	CAG	2	6	186979	186984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406277
4560	NC_002944	CGG	2	6	186990	186995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
4561	NC_002944	TCG	2	6	187019	187024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406277
4562	NC_002944	GC	3	6	187058	187063	0 %	0 %	50 %	50 %	41406277
4563	NC_002944	CGG	2	6	187071	187076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406277
4564	NC_002944	GCC	2	6	187215	187220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
4565	NC_002944	CCA	2	6	187243	187248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406278
4566	NC_002944	CGC	2	6	187269	187274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
4567	NC_002944	GGC	2	6	187284	187289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406278
4568	NC_002944	TCCGAC	2	12	187323	187334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	41406278
4569	NC_002944	AGG	2	6	187417	187422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406278
4570	NC_002944	GTG	2	6	187470	187475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406278
4571	NC_002944	GCC	2	6	187476	187481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
4572	NC_002944	ACG	2	6	187525	187530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4573	NC_002944	CAGCG	2	10	187533	187542	20 %	0 %	40 %	40 %	41406278
4574	NC_002944	CTA	2	6	187577	187582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406278
4575	NC_002944	ACG	2	6	187588	187593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
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4577	NC_002944	GCA	2	6	187652	187657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4578	NC_002944	TGC	2	6	187771	187776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4579	NC_002944	GCT	2	6	187841	187846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4580	NC_002944	TGA	2	6	187951	187956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406278
4581	NC_002944	GCC	2	6	187969	187974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
4582	NC_002944	ACG	2	6	187987	187992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4583	NC_002944	CTT	2	6	188060	188065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406278
4584	NC_002944	CGGCA	2	10	188076	188085	20 %	0 %	40 %	40 %	41406278
4585	NC_002944	CGT	2	6	188093	188098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4586	NC_002944	CAC	2	6	188120	188125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406278
4587	NC_002944	GCCG	2	8	188159	188166	0 %	0 %	50 %	50 %	41406278
4588	NC_002944	CAT	2	6	188168	188173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406278
4589	NC_002944	GCT	2	6	188201	188206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4590	NC_002944	TGA	2	6	188257	188262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406278
4591	NC_002944	GCT	2	6	188372	188377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4592	NC_002944	GCA	2	6	188417	188422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4593	NC_002944	CGA	2	6	188438	188443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4594	NC_002944	CCG	2	6	188477	188482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406278
4595	NC_002944	CTG	2	6	188493	188498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4596	NC_002944	GGC	2	6	188524	188529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406278
4597	NC_002944	ACT	2	6	188539	188544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406278
4598	NC_002944	CGA	2	6	188579	188584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406278
4599	NC_002944	CGA	3	9	188641	188649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406279
4600	NC_002944	CGT	3	9	188653	188661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406279
4601	NC_002944	CCG	2	6	188697	188702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
4602	NC_002944	CGCCGG	2	12	188725	188736	0 %	0 %	50 %	50 %	41406279
4603	NC_002944	GCG	2	6	188799	188804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406279
4604	NC_002944	GCC	3	9	188900	188908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
4605	NC_002944	ACC	2	6	188913	188918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406279
4606	NC_002944	CCG	2	6	188925	188930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
4607	NC_002944	AGC	2	6	188958	188963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406279
4608	NC_002944	AGC	2	6	188977	188982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406279
4609	NC_002944	CCG	2	6	189018	189023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406279
4610	NC_002944	GTC	2	6	189068	189073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406279
4611	NC_002944	CGG	2	6	189082	189087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406279
4612	NC_002944	GCG	3	9	189121	189129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406280
4613	NC_002944	CAG	2	6	189154	189159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406280
4614	NC_002944	GACGGC	2	12	189163	189174	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	41406280
4615	NC_002944	CGC	2	6	189202	189207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406280
4616	NC_002944	GGC	3	9	189283	189291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406280
4617	NC_002944	CGC	2	6	189324	189329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406280
4618	NC_002944	CTT	2	6	189355	189360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
4619	NC_002944	CTT	2	6	189370	189375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
4620	NC_002944	GGCG	2	8	189391	189398	0 %	0 %	75 %	25 %	41406280
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4622	NC_002944	CTT	2	6	189415	189420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41406280
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4990	NC_002944	GCG	2	6	203129	203134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406295
4991	NC_002944	CCCA	2	8	203162	203169	25 %	0 %	0 %	75 %	41406295
4992	NC_002944	GACGTC	2	12	203188	203199	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406295
4993	NC_002944	CAC	2	6	203206	203211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406295
4994	NC_002944	GC	3	6	203219	203224	0 %	0 %	50 %	50 %	41406295
4995	NC_002944	CGG	2	6	203248	203253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406295
4996	NC_002944	CAC	2	6	203305	203310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406295
4997	NC_002944	GCTG	2	8	203313	203320	0 %	25 %	50 %	25 %	41406295
4998	NC_002944	ACC	2	6	203337	203342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406295
4999	NC_002944	TCG	2	6	203388	203393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295
5000	NC_002944	GCT	2	6	203401	203406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406295

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