MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLb

Total Repeats: 2233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002682	GCA	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47060339
2	NC_002682	CCG	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47060339
3	NC_002682	GAA	2	6	501	506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47060339
4	NC_002682	CAT	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47060339
5	NC_002682	AGC	2	6	652	657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47060339
6	NC_002682	GCC	2	6	786	791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47060340
7	NC_002682	AAT	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	47060340
8	NC_002682	ATC	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47060340
9	NC_002682	GGT	2	6	968	973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	47060340
10	NC_002682	GCA	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47060340
11	NC_002682	AGA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	47060340
12	NC_002682	CCG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	47060340
13	NC_002682	CTC	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	47060340
14	NC_002682	TTG	2	6	1083	1088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	47060340
15	NC_002682	ACG	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488373
16	NC_002682	CGC	2	6	1464	1469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488373
17	NC_002682	GGC	2	6	1509	1514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488373
18	NC_002682	GCG	2	6	1696	1701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488373
19	NC_002682	TGT	2	6	1734	1739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488373
20	NC_002682	CGA	2	6	1740	1745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488373
21	NC_002682	GGC	2	6	1783	1788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488373
22	NC_002682	GCA	2	6	1891	1896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488373
23	NC_002682	TGC	2	6	1917	1922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488373
24	NC_002682	TCC	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488374
25	NC_002682	GCC	3	9	3186	3194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488375
26	NC_002682	TCC	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488375
27	NC_002682	CGC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488375
28	NC_002682	TGG	2	6	3362	3367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488375
29	NC_002682	AGC	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488376
30	NC_002682	GCT	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
31	NC_002682	CGT	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
32	NC_002682	TCG	2	6	3778	3783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
33	NC_002682	GTG	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488376
34	NC_002682	AGA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488376
35	NC_002682	ATG	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488376
36	NC_002682	CTG	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488376
37	NC_002682	CGG	2	6	4939	4944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488377
38	NC_002682	GTT	2	6	4986	4991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488377
39	NC_002682	TTC	2	6	5084	5089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488377
40	NC_002682	TCG	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488377
41	NC_002682	ATC	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488377
42	NC_002682	GCC	2	6	5310	5315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488377
43	NC_002682	TCA	2	6	5322	5327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488377
44	NC_002682	TGG	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488377
45	NC_002682	ATA	2	6	5914	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488377
46	NC_002682	GAA	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488378
47	NC_002682	CGG	3	9	5969	5977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488378
48	NC_002682	CCA	2	6	6114	6119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488378
49	NC_002682	GAT	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488378
50	NC_002682	CAA	2	6	6317	6322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488378
51	NC_002682	CGC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488378
52	NC_002682	GCC	2	6	6938	6943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
53	NC_002682	ACG	2	6	6959	6964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
54	NC_002682	ATA	2	6	7006	7011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13488379
55	NC_002682	TCT	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488379
56	NC_002682	ATG	2	6	7073	7078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488379
57	NC_002682	GAC	2	6	7159	7164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
58	NC_002682	CGA	2	6	7360	7365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
59	NC_002682	TCG	2	6	7394	7399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
60	NC_002682	GCT	2	6	7439	7444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
61	NC_002682	ACG	3	9	7559	7567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
62	NC_002682	AGC	2	6	7763	7768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
63	NC_002682	GAG	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488379
64	NC_002682	CCT	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488379
65	NC_002682	CGT	2	6	8055	8060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
66	NC_002682	GCA	2	6	8076	8081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
67	NC_002682	CTC	2	6	8146	8151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488379
68	NC_002682	GCC	2	6	8245	8250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
69	NC_002682	TCG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
70	NC_002682	CCA	2	6	8481	8486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488379
71	NC_002682	CCG	2	6	8487	8492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
72	NC_002682	CGG	2	6	8506	8511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488379
73	NC_002682	GCA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488379
74	NC_002682	GCC	2	6	8598	8603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488379
75	NC_002682	GAG	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488379
76	NC_002682	GTC	2	6	8738	8743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
77	NC_002682	GCT	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
78	NC_002682	GGA	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488379
79	NC_002682	GCG	2	6	8969	8974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488379
80	NC_002682	GAT	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488379
81	NC_002682	CGG	2	6	9084	9089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488379
82	NC_002682	TCG	2	6	9194	9199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488379
83	NC_002682	GCA	2	6	9275	9280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488380
84	NC_002682	TCA	2	6	9370	9375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488380
85	NC_002682	CAC	2	6	9408	9413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488380
86	NC_002682	GGC	2	6	9419	9424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488380
87	NC_002682	CAC	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488380
88	NC_002682	CGA	2	6	9574	9579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488380
89	NC_002682	TCC	2	6	9625	9630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488380
90	NC_002682	TCG	2	6	9664	9669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
91	NC_002682	CGC	2	6	9713	9718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488380
92	NC_002682	TGC	2	6	9732	9737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
93	NC_002682	AGG	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488380
94	NC_002682	CGT	2	6	9751	9756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
95	NC_002682	TCT	2	6	9761	9766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488380
96	NC_002682	TGC	2	6	9796	9801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
97	NC_002682	TAG	2	6	9804	9809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488380
98	NC_002682	GCC	2	6	9842	9847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488380
99	NC_002682	GTC	2	6	9852	9857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488380
100	NC_002682	TCC	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488380
101	NC_002682	GCC	2	6	9898	9903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488380
102	NC_002682	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
103	NC_002682	GAT	2	6	10015	10020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488381
104	NC_002682	GCA	2	6	10068	10073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
105	NC_002682	CAG	2	6	10097	10102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
106	NC_002682	AGA	2	6	10105	10110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488381
107	NC_002682	CTG	2	6	10154	10159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488381
108	NC_002682	CCT	2	6	10162	10167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488381
109	NC_002682	GAA	2	6	10282	10287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488381
110	NC_002682	TTG	2	6	10299	10304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488381
111	NC_002682	GGC	2	6	10334	10339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488381
112	NC_002682	CGG	2	6	10405	10410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488381
113	NC_002682	CCG	2	6	10444	10449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488381
114	NC_002682	AGA	2	6	10458	10463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488381
115	NC_002682	CAG	2	6	10478	10483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488381
116	NC_002682	GCT	2	6	10754	10759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488381
117	NC_002682	CAC	2	6	10958	10963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488381
118	NC_002682	TGC	2	6	11042	11047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488381
119	NC_002682	AGC	2	6	11198	11203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488382
120	NC_002682	CAG	2	6	11350	11355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488382
121	NC_002682	CAT	2	6	11367	11372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488382
122	NC_002682	AAG	2	6	11437	11442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488382
123	NC_002682	GAA	2	6	11514	11519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488382
124	NC_002682	GCA	2	6	11538	11543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488382
125	NC_002682	TGG	2	6	11555	11560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488382
126	NC_002682	CCT	2	6	11616	11621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488382
127	NC_002682	GCC	2	6	11673	11678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488383
128	NC_002682	TCG	2	6	11695	11700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
129	NC_002682	CTG	2	6	11850	11855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
130	NC_002682	CTG	2	6	11883	11888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
131	NC_002682	CGG	2	6	11905	11910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488383
132	NC_002682	CCA	2	6	12038	12043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488383
133	NC_002682	ACA	2	6	12101	12106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488383
134	NC_002682	GTC	2	6	12136	12141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
135	NC_002682	ACC	2	6	12142	12147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488383
136	NC_002682	CTG	2	6	12219	12224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
137	NC_002682	TTC	2	6	12231	12236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488383
138	NC_002682	CCG	2	6	12262	12267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488383
139	NC_002682	CGG	2	6	12272	12277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488383
140	NC_002682	TGT	2	6	12369	12374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488383
141	NC_002682	CTG	2	6	12402	12407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
142	NC_002682	GGC	2	6	12420	12425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488383
143	NC_002682	AAG	2	6	12651	12656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488383
144	NC_002682	CAA	2	6	12675	12680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488383
145	NC_002682	CCG	2	6	12701	12706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488383
146	NC_002682	GAC	2	6	12924	12929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488383
147	NC_002682	TTG	2	6	12962	12967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488383
148	NC_002682	GTC	2	6	12975	12980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488383
149	NC_002682	CCT	2	6	13157	13162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488383
150	NC_002682	GAA	2	6	13172	13177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488383
151	NC_002682	ACC	2	6	13213	13218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488383
152	NC_002682	ATG	2	6	13397	13402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488384
153	NC_002682	GGC	2	6	13407	13412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488384
154	NC_002682	GGT	2	6	13437	13442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488384
155	NC_002682	CCA	2	6	13608	13613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488385
156	NC_002682	TCG	3	9	13646	13654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488385
157	NC_002682	GCG	2	6	13655	13660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488385
158	NC_002682	CGA	2	6	13803	13808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488385
159	NC_002682	GTG	2	6	14545	14550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488386
160	NC_002682	CGA	2	6	14579	14584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488386
161	NC_002682	CCG	2	6	14677	14682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488386
162	NC_002682	GCC	2	6	14685	14690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488386
163	NC_002682	ACC	2	6	14811	14816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488386
164	NC_002682	CCA	2	6	14845	14850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488386
165	NC_002682	CGG	2	6	14888	14893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488386
166	NC_002682	GGC	2	6	17024	17029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488387
167	NC_002682	GTT	2	6	17042	17047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488387
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169	NC_002682	GGC	2	6	17149	17154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488387
170	NC_002682	TTC	2	6	17195	17200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488387
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172	NC_002682	CGC	2	6	17455	17460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488387
173	NC_002682	CCA	2	6	17487	17492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488387
174	NC_002682	GCT	2	6	17498	17503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488387
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228	NC_002682	TGA	2	6	24479	24484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488398
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234	NC_002682	GAT	2	6	24845	24850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488399
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240	NC_002682	GTC	2	6	25295	25300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488399
241	NC_002682	ACA	2	6	25305	25310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488399
242	NC_002682	GGT	2	6	25327	25332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488399
243	NC_002682	GGC	2	6	25420	25425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488399
244	NC_002682	GAG	3	9	25430	25438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488399
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246	NC_002682	GAC	3	9	25589	25597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488399
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248	NC_002682	GGC	2	6	25622	25627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488399
249	NC_002682	CAT	2	6	25642	25647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488399
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252	NC_002682	ACA	2	6	25972	25977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488399
253	NC_002682	GGC	2	6	26365	26370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488399
254	NC_002682	CGC	2	6	26427	26432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488399
255	NC_002682	GGC	2	6	26458	26463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488399
256	NC_002682	CGA	2	6	26482	26487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488399
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498	NC_002682	GAT	2	6	58123	58128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488439
499	NC_002682	CCG	2	6	58148	58153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488439
500	NC_002682	CGG	2	6	58176	58181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488439

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