MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 146288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002678	CCAGCG	2	12	23170	23181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	13470352
502	NC_002678	CAC	2	6	23204	23209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470352
503	NC_002678	ATGGCA	2	12	23223	23234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	13470352
504	NC_002678	CGG	2	6	23248	23253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352
505	NC_002678	GCC	2	6	23277	23282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
506	NC_002678	CGG	3	9	23314	23322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352
507	NC_002678	CGA	2	6	23398	23403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470352
508	NC_002678	CGAT	2	8	23418	23425	25 %	25 %	25 %	25 %	13470352
509	NC_002678	CGT	2	6	23444	23449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470352
510	NC_002678	CCG	2	6	23464	23469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
511	NC_002678	CGC	3	9	23527	23535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
512	NC_002678	CGC	2	6	23560	23565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
513	NC_002678	TGC	2	6	23575	23580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470352
514	NC_002678	CGC	3	9	23596	23604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
515	NC_002678	CGGC	2	8	23638	23645	0 %	0 %	50 %	50 %	13470352
516	NC_002678	GCC	2	6	23687	23692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470352
517	NC_002678	GCG	2	6	24067	24072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
518	NC_002678	GTC	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470353
519	NC_002678	GCTC	2	8	24164	24171	0 %	25 %	25 %	50 %	13470353
520	NC_002678	CG	3	6	24206	24211	0 %	0 %	50 %	50 %	13470353
521	NC_002678	CAT	2	6	24216	24221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470353
522	NC_002678	GAC	2	6	24252	24257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470353
523	NC_002678	AGA	2	6	24287	24292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470353
524	NC_002678	GGC	2	6	24295	24300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
525	NC_002678	TCG	2	6	24311	24316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470353
526	NC_002678	CTG	2	6	24376	24381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470353
527	NC_002678	TGG	2	6	24458	24463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470353
528	NC_002678	CGC	2	6	24485	24490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470353
529	NC_002678	GC	3	6	24489	24494	0 %	0 %	50 %	50 %	13470353
530	NC_002678	TGA	2	6	24545	24550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470353
531	NC_002678	TCA	2	6	24608	24613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470353
532	NC_002678	GTTCG	2	10	24642	24651	0 %	40 %	40 %	20 %	13470353
533	NC_002678	CGG	2	6	24666	24671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
534	NC_002678	CCG	2	6	24711	24716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470353
535	NC_002678	CGA	2	6	24738	24743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470353
536	NC_002678	GGT	2	6	24771	24776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470353
537	NC_002678	GCC	2	6	24792	24797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470353
538	NC_002678	GGT	2	6	24804	24809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470353
539	NC_002678	CAT	2	6	24819	24824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470353
540	NC_002678	GGC	2	6	25048	25053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
541	NC_002678	GGC	2	6	25060	25065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470353
542	NC_002678	GAC	2	6	25066	25071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470353
543	NC_002678	AGG	2	6	25411	25416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470354
544	NC_002678	CG	3	6	25537	25542	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
545	NC_002678	CCA	2	6	25543	25548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470354
546	NC_002678	AGA	2	6	25555	25560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
547	NC_002678	CGG	2	6	25571	25576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
548	NC_002678	CG	3	6	25610	25615	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
549	NC_002678	CTT	2	6	25625	25630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470354
550	NC_002678	GC	3	6	25673	25678	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
551	NC_002678	GAA	2	6	25721	25726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
552	NC_002678	GCT	2	6	25733	25738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
553	NC_002678	GGC	2	6	25766	25771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
554	NC_002678	GAA	2	6	25781	25786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
555	NC_002678	CAT	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470354
556	NC_002678	ATCG	2	8	25890	25897	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
557	NC_002678	GGGC	2	8	25913	25920	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
558	NC_002678	AGG	2	6	26002	26007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470354
559	NC_002678	TCGA	2	8	26031	26038	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
560	NC_002678	GCG	2	6	26127	26132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
561	NC_002678	TCC	2	6	26133	26138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470354
562	NC_002678	TCC	2	6	26208	26213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470354
563	NC_002678	CGAA	2	8	26242	26249	50 %	0 %	25 %	25 %	13470354
564	NC_002678	CAT	2	6	26273	26278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470354
565	NC_002678	GCGCC	2	10	26279	26288	0 %	0 %	40 %	60 %	13470354
566	NC_002678	GCT	2	6	26303	26308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
567	NC_002678	GCT	2	6	26381	26386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
568	NC_002678	GCG	2	6	26389	26394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
569	NC_002678	CGGCCT	2	12	26456	26467	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13470354
570	NC_002678	AGC	2	6	26629	26634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
571	NC_002678	GC	3	6	26646	26651	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
572	NC_002678	GCC	2	6	26676	26681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470354
573	NC_002678	GCAG	2	8	26750	26757	25 %	0 %	50 %	25 %	13470354
574	NC_002678	GGT	2	6	26828	26833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470354
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576	NC_002678	CAT	2	6	26888	26893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470354
577	NC_002678	TCGA	2	8	26910	26917	25 %	25 %	25 %	25 %	13470354
578	NC_002678	AGA	2	6	26932	26937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
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580	NC_002678	GC	3	6	27024	27029	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
581	NC_002678	CA	3	6	27157	27162	50 %	0 %	0 %	50 %	13470354
582	NC_002678	GAG	2	6	27180	27185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470354
583	NC_002678	TCG	2	6	27217	27222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
584	NC_002678	GTCG	2	8	27254	27261	0 %	25 %	50 %	25 %	13470354
585	NC_002678	CGA	2	6	27311	27316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
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588	NC_002678	CGT	2	6	27434	27439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
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590	NC_002678	GGC	2	6	27494	27499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
591	NC_002678	CGA	2	6	27512	27517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
592	NC_002678	GGC	4	12	27536	27547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
593	NC_002678	CGCC	2	8	27562	27569	0 %	0 %	25 %	75 %	13470354
594	NC_002678	AAG	2	6	27609	27614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470354
595	NC_002678	GC	3	6	27636	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
596	NC_002678	GCG	2	6	27658	27663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
597	NC_002678	GC	3	6	27676	27681	0 %	0 %	50 %	50 %	13470354
598	NC_002678	GCTC	2	8	27781	27788	0 %	25 %	25 %	50 %	13470354
599	NC_002678	CGT	3	9	27797	27805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
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601	NC_002678	ACA	2	6	27826	27831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470354
602	NC_002678	CGT	3	9	27839	27847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470354
603	NC_002678	CGA	2	6	27857	27862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470354
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606	NC_002678	GGGC	2	8	27917	27924	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
607	NC_002678	GGCG	2	8	27933	27940	0 %	0 %	75 %	25 %	13470354
608	NC_002678	CGG	2	6	27959	27964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
609	NC_002678	ATG	2	6	27985	27990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470354
610	NC_002678	GGC	2	6	28007	28012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470354
611	NC_002678	GCC	2	6	28020	28025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470354
612	NC_002678	CATGA	2	10	28033	28042	40 %	20 %	20 %	20 %	13470355
613	NC_002678	TCA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470355
614	NC_002678	GCG	2	6	28152	28157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470355
615	NC_002678	CCGG	2	8	28158	28165	0 %	0 %	50 %	50 %	13470355
616	NC_002678	CGG	2	6	28181	28186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470355
617	NC_002678	GGT	2	6	28224	28229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470355
618	NC_002678	GGT	2	6	28245	28250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470355
619	NC_002678	GGC	2	6	28280	28285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470355
620	NC_002678	CCG	2	6	28306	28311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470355
621	NC_002678	TTGC	2	8	28339	28346	0 %	50 %	25 %	25 %	13470355
622	NC_002678	GGCGC	2	10	28362	28371	0 %	0 %	60 %	40 %	13470355
623	NC_002678	CG	3	6	28471	28476	0 %	0 %	50 %	50 %	13470356
624	NC_002678	GAT	2	6	28547	28552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470356
625	NC_002678	CGGCG	2	10	28553	28562	0 %	0 %	60 %	40 %	13470356
626	NC_002678	AGC	2	6	28593	28598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470356
627	NC_002678	CG	3	6	28783	28788	0 %	0 %	50 %	50 %	13470356
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629	NC_002678	TCG	2	6	28824	28829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470356
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