MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 4048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002677	CGTT	2	8	569	576	0 %	50 %	25 %	25 %	15826866
2	NC_002677	GTTG	2	8	2102	2109	0 %	50 %	50 %	0 %	15826867
3	NC_002677	TGTC	2	8	2753	2760	0 %	50 %	25 %	25 %	15826867
4	NC_002677	CTGA	2	8	3098	3105	25 %	25 %	25 %	25 %	15826867
5	NC_002677	GGAC	2	8	3350	3357	25 %	0 %	50 %	25 %	15826868
6	NC_002677	GATT	2	8	3526	3533	25 %	50 %	25 %	0 %	15826868
7	NC_002677	GGGC	2	8	3548	3555	0 %	0 %	75 %	25 %	15826868
8	NC_002677	GCCA	2	8	4157	4164	25 %	0 %	25 %	50 %	15826868
9	NC_002677	TGTA	2	8	6601	6608	25 %	50 %	25 %	0 %	15826870
10	NC_002677	AGCG	2	8	6990	6997	25 %	0 %	50 %	25 %	15826870
11	NC_002677	TGAC	2	8	8831	8838	25 %	25 %	25 %	25 %	15826871
12	NC_002677	CTAC	2	8	9710	9717	25 %	25 %	0 %	50 %	15826871
13	NC_002677	ACTG	2	8	10026	10033	25 %	25 %	25 %	25 %	15826871
14	NC_002677	TTGC	2	8	10375	10382	0 %	50 %	25 %	25 %	15826871
15	NC_002677	AATT	2	8	10530	10537	50 %	50 %	0 %	0 %	15826871
16	NC_002677	GGGC	2	8	10660	10667	0 %	0 %	75 %	25 %	15826871
17	NC_002677	TTGG	2	8	10864	10871	0 %	50 %	50 %	0 %	15826871
18	NC_002677	CAGG	2	8	10957	10964	25 %	0 %	50 %	25 %	15826871
19	NC_002677	CGAA	2	8	11205	11212	50 %	0 %	25 %	25 %	15826872
20	NC_002677	CTTG	2	8	13885	13892	0 %	50 %	25 %	25 %	15826874
21	NC_002677	GACC	2	8	16433	16440	25 %	0 %	25 %	50 %	15826875
22	NC_002677	CAGC	2	8	16567	16574	25 %	0 %	25 %	50 %	15826876
23	NC_002677	TCAT	2	8	18717	18724	25 %	50 %	0 %	25 %	15826878
24	NC_002677	CACC	2	8	19648	19655	25 %	0 %	0 %	75 %	15826879
25	NC_002677	ATGA	2	8	20462	20469	50 %	25 %	25 %	0 %	15826879
26	NC_002677	GCAA	2	8	21266	21273	50 %	0 %	25 %	25 %	15826880
27	NC_002677	CCGG	2	8	21320	21327	0 %	0 %	50 %	50 %	15826880
28	NC_002677	TTGG	2	8	21338	21345	0 %	50 %	50 %	0 %	15826880
29	NC_002677	GGCC	2	8	21361	21368	0 %	0 %	50 %	50 %	15826880
30	NC_002677	GCCG	2	8	21856	21863	0 %	0 %	50 %	50 %	15826880
31	NC_002677	TTGG	2	8	24930	24937	0 %	50 %	50 %	0 %	15826882
32	NC_002677	GTGG	2	8	25215	25222	0 %	25 %	75 %	0 %	15826883
33	NC_002677	GTTG	2	8	25251	25258	0 %	50 %	50 %	0 %	15826883
34	NC_002677	CTGT	2	8	25269	25276	0 %	50 %	25 %	25 %	15826883
35	NC_002677	TCAC	2	8	26001	26008	25 %	25 %	0 %	50 %	15826883
36	NC_002677	TCCG	2	8	26021	26028	0 %	25 %	25 %	50 %	15826883
37	NC_002677	GTAG	2	8	26227	26234	25 %	25 %	50 %	0 %	15826883
38	NC_002677	GCAC	2	8	26361	26368	25 %	0 %	25 %	50 %	15826883
39	NC_002677	CGGC	2	8	27543	27550	0 %	0 %	50 %	50 %	15826885
40	NC_002677	CTGG	2	8	27805	27812	0 %	25 %	50 %	25 %	15826885
41	NC_002677	CGGG	2	8	28241	28248	0 %	0 %	75 %	25 %	15826885
42	NC_002677	TTTG	2	8	29030	29037	0 %	75 %	25 %	0 %	15826886
43	NC_002677	CTGG	2	8	29071	29078	0 %	25 %	50 %	25 %	15826886
44	NC_002677	GTTG	2	8	29119	29126	0 %	50 %	50 %	0 %	15826886
45	NC_002677	GTGC	2	8	33151	33158	0 %	25 %	50 %	25 %	15826889
46	NC_002677	TTGG	2	8	33604	33611	0 %	50 %	50 %	0 %	15826889
47	NC_002677	ACCA	2	8	34510	34517	50 %	0 %	0 %	50 %	15826890
48	NC_002677	GCCA	2	8	34519	34526	25 %	0 %	25 %	50 %	15826890
49	NC_002677	CGTG	2	8	35592	35599	0 %	25 %	50 %	25 %	15826892
50	NC_002677	CCAA	2	8	35624	35631	50 %	0 %	0 %	50 %	15826892
51	NC_002677	CGGA	2	8	36502	36509	25 %	0 %	50 %	25 %	15826893
52	NC_002677	ACCC	2	8	36714	36721	25 %	0 %	0 %	75 %	15826893
53	NC_002677	ATTG	2	8	36911	36918	25 %	50 %	25 %	0 %	15826893
54	NC_002677	CCGG	2	8	37337	37344	0 %	0 %	50 %	50 %	15826893
55	NC_002677	GGAC	2	8	37429	37436	25 %	0 %	50 %	25 %	15826893
56	NC_002677	CCGC	2	8	37825	37832	0 %	0 %	25 %	75 %	15826893
57	NC_002677	GACG	2	8	37941	37948	25 %	0 %	50 %	25 %	15826893
58	NC_002677	GGGC	2	8	38149	38156	0 %	0 %	75 %	25 %	15826893
59	NC_002677	ACCA	2	8	38871	38878	50 %	0 %	0 %	50 %	15826893
60	NC_002677	ACCC	2	8	50723	50730	25 %	0 %	0 %	75 %	15826894
61	NC_002677	GGCG	2	8	51974	51981	0 %	0 %	75 %	25 %	15826894
62	NC_002677	ATTC	2	8	52186	52193	25 %	50 %	0 %	25 %	15826895
63	NC_002677	AGCG	2	8	53265	53272	25 %	0 %	50 %	25 %	15826895
64	NC_002677	TGAC	2	8	54780	54787	25 %	25 %	25 %	25 %	15826896
65	NC_002677	TCGA	2	8	59425	59432	25 %	25 %	25 %	25 %	15826897
66	NC_002677	GGTC	2	8	59453	59460	0 %	25 %	50 %	25 %	15826897
67	NC_002677	CCGG	2	8	59696	59703	0 %	0 %	50 %	50 %	15826898
68	NC_002677	CGAC	2	8	59863	59870	25 %	0 %	25 %	50 %	15826898
69	NC_002677	GTGC	2	8	60083	60090	0 %	25 %	50 %	25 %	15826898
70	NC_002677	TCGG	2	8	60164	60171	0 %	25 %	50 %	25 %	15826898
71	NC_002677	GCCT	2	8	61430	61437	0 %	25 %	25 %	50 %	15826899
72	NC_002677	TGAT	2	8	61464	61471	25 %	50 %	25 %	0 %	15826899
73	NC_002677	CTAT	2	8	62505	62512	25 %	50 %	0 %	25 %	15826901
74	NC_002677	TTGC	2	8	62911	62918	0 %	50 %	25 %	25 %	15826901
75	NC_002677	CTCG	2	8	63068	63075	0 %	25 %	25 %	50 %	15826901
76	NC_002677	TGCT	2	8	63324	63331	0 %	50 %	25 %	25 %	15826902
77	NC_002677	GCCG	2	8	63652	63659	0 %	0 %	50 %	50 %	15826902
78	NC_002677	CGAA	2	8	64443	64450	50 %	0 %	25 %	25 %	15826902
79	NC_002677	TCGG	2	8	64684	64691	0 %	25 %	50 %	25 %	15826902
80	NC_002677	TTCA	2	8	64990	64997	25 %	50 %	0 %	25 %	15826902
81	NC_002677	GGAC	2	8	65267	65274	25 %	0 %	50 %	25 %	15826903
82	NC_002677	CCTT	2	8	66030	66037	0 %	50 %	0 %	50 %	15826903
83	NC_002677	CGGG	2	8	66427	66434	0 %	0 %	75 %	25 %	15826903
84	NC_002677	CCGC	2	8	66720	66727	0 %	0 %	25 %	75 %	15826903
85	NC_002677	CGCT	2	8	66874	66881	0 %	25 %	25 %	50 %	15826903
86	NC_002677	ACGA	2	8	67534	67541	50 %	0 %	25 %	25 %	15826904
87	NC_002677	CTCC	2	8	67617	67624	0 %	25 %	0 %	75 %	15826904
88	NC_002677	TTCG	2	8	68308	68315	0 %	50 %	25 %	25 %	15826904
89	NC_002677	GTGC	2	8	68886	68893	0 %	25 %	50 %	25 %	15826905
90	NC_002677	AGCC	2	8	68977	68984	25 %	0 %	25 %	50 %	15826905
91	NC_002677	CGAT	2	8	69254	69261	25 %	25 %	25 %	25 %	15826905
92	NC_002677	GTCT	2	8	69744	69751	0 %	50 %	25 %	25 %	15826905
93	NC_002677	GGGT	2	8	69878	69885	0 %	25 %	75 %	0 %	15826905
94	NC_002677	GCCG	2	8	69985	69992	0 %	0 %	50 %	50 %	15826905
95	NC_002677	TAGC	2	8	70284	70291	25 %	25 %	25 %	25 %	15826905
96	NC_002677	TCGG	2	8	70432	70439	0 %	25 %	50 %	25 %	15826905
97	NC_002677	GCAG	2	8	70474	70481	25 %	0 %	50 %	25 %	15826905
98	NC_002677	ATCA	2	8	70579	70586	50 %	25 %	0 %	25 %	15826905
99	NC_002677	GGTC	2	8	70820	70827	0 %	25 %	50 %	25 %	15826906
100	NC_002677	TCAG	2	8	70924	70931	25 %	25 %	25 %	25 %	15826906
101	NC_002677	CTGC	2	8	78013	78020	0 %	25 %	25 %	50 %	15826907
102	NC_002677	CTGT	2	8	79496	79503	0 %	50 %	25 %	25 %	15826907
103	NC_002677	CTGA	2	8	79542	79549	25 %	25 %	25 %	25 %	15826907
104	NC_002677	TCGA	2	8	79806	79813	25 %	25 %	25 %	25 %	15826907
105	NC_002677	CTTA	2	8	80080	80087	25 %	50 %	0 %	25 %	15826907
106	NC_002677	GACC	2	8	80088	80095	25 %	0 %	25 %	50 %	15826907
107	NC_002677	GCTG	2	8	81108	81115	0 %	25 %	50 %	25 %	15826907
108	NC_002677	GGTG	2	8	81302	81309	0 %	25 %	75 %	0 %	15826907
109	NC_002677	CTGG	3	12	82152	82163	0 %	25 %	50 %	25 %	15826907
110	NC_002677	GGCT	2	8	82296	82303	0 %	25 %	50 %	25 %	15826908
111	NC_002677	GGAA	2	8	82367	82374	50 %	0 %	50 %	0 %	15826908
112	NC_002677	CGGG	2	8	83379	83386	0 %	0 %	75 %	25 %	15826908
113	NC_002677	ACCG	2	8	83545	83552	25 %	0 %	25 %	50 %	15826908
114	NC_002677	CGGT	2	8	86490	86497	0 %	25 %	50 %	25 %	15826909
115	NC_002677	TTCG	2	8	86853	86860	0 %	50 %	25 %	25 %	15826910
116	NC_002677	CATG	2	8	86965	86972	25 %	25 %	25 %	25 %	15826910
117	NC_002677	CCTT	2	8	87144	87151	0 %	50 %	0 %	50 %	15826910
118	NC_002677	GGCC	2	8	88443	88450	0 %	0 %	50 %	50 %	15826911
119	NC_002677	ACGG	2	8	88591	88598	25 %	0 %	50 %	25 %	15826911
120	NC_002677	TTGG	2	8	88957	88964	0 %	50 %	50 %	0 %	15826912
121	NC_002677	CTGC	2	8	88965	88972	0 %	25 %	25 %	50 %	15826912
122	NC_002677	CCTT	2	8	90104	90111	0 %	50 %	0 %	50 %	15826913
123	NC_002677	TTGT	2	8	91396	91403	0 %	75 %	25 %	0 %	15826915
124	NC_002677	GCAA	2	8	91920	91927	50 %	0 %	25 %	25 %	15826916
125	NC_002677	CTGG	2	8	92173	92180	0 %	25 %	50 %	25 %	15826916
126	NC_002677	ATCA	2	8	95018	95025	50 %	25 %	0 %	25 %	15826918
127	NC_002677	ACCG	2	8	95484	95491	25 %	0 %	25 %	50 %	15826919
128	NC_002677	TTGC	2	8	95552	95559	0 %	50 %	25 %	25 %	15826919
129	NC_002677	CTAC	2	8	95672	95679	25 %	25 %	0 %	50 %	15826919
130	NC_002677	GCCG	2	8	95696	95703	0 %	0 %	50 %	50 %	15826919
131	NC_002677	CCGA	2	8	98545	98552	25 %	0 %	25 %	50 %	15826920
132	NC_002677	CGCC	2	8	98558	98565	0 %	0 %	25 %	75 %	15826920
133	NC_002677	TGCG	2	8	98601	98608	0 %	25 %	50 %	25 %	15826920
134	NC_002677	CTGG	2	8	98815	98822	0 %	25 %	50 %	25 %	15826920
135	NC_002677	CGGC	2	8	98833	98840	0 %	0 %	50 %	50 %	15826920
136	NC_002677	GCTG	2	8	99084	99091	0 %	25 %	50 %	25 %	15826920
137	NC_002677	GGCA	2	8	99345	99352	25 %	0 %	50 %	25 %	15826920
138	NC_002677	GGCT	2	8	100668	100675	0 %	25 %	50 %	25 %	15826922
139	NC_002677	TTGC	2	8	100825	100832	0 %	50 %	25 %	25 %	15826922
140	NC_002677	CTGC	2	8	101063	101070	0 %	25 %	25 %	50 %	15826922
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