MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium leprae TN chromosome

Total Repeats: 34154

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002677	GAT	2	6	220171	220176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826979
3002	NC_002677	ATCGGT	2	12	220211	220222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15826979
3003	NC_002677	ATC	2	6	220292	220297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826979
3004	NC_002677	G	7	7	220316	220322	0 %	0 %	100 %	0 %	15826979
3005	NC_002677	TCG	2	6	220448	220453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826979
3006	NC_002677	AAG	2	6	220469	220474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826979
3007	NC_002677	GCA	2	6	221664	221669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826980
3008	NC_002677	AGG	2	6	221698	221703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15826980
3009	NC_002677	CCG	2	6	221751	221756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826980
3010	NC_002677	CTT	2	6	221778	221783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826980
3011	NC_002677	GGT	3	9	221836	221844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826980
3012	NC_002677	GTC	2	6	221948	221953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826980
3013	NC_002677	GCT	2	6	221959	221964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826980
3014	NC_002677	GCC	2	6	221966	221971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826980
3015	NC_002677	AGC	2	6	222008	222013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826980
3016	NC_002677	GTT	2	6	222049	222054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826980
3017	NC_002677	GAT	2	6	222067	222072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826980
3018	NC_002677	CCG	2	6	222081	222086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826980
3019	NC_002677	GCC	2	6	222146	222151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826980
3020	NC_002677	CGC	2	6	222154	222159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826980
3021	NC_002677	GCA	2	6	222304	222309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826980
3022	NC_002677	CCG	2	6	222315	222320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826980
3023	NC_002677	CAGG	2	8	222368	222375	25 %	0 %	50 %	25 %	15826980
3024	NC_002677	GCA	2	6	222403	222408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826980
3025	NC_002677	CAA	2	6	222416	222421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826980
3026	NC_002677	CCACC	2	10	222429	222438	20 %	0 %	0 %	80 %	15826980
3027	NC_002677	CCA	2	6	222464	222469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826980
3028	NC_002677	TCGG	2	8	222470	222477	0 %	25 %	50 %	25 %	15826980
3029	NC_002677	GCC	2	6	222482	222487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826980
3030	NC_002677	GTTA	2	8	222512	222519	25 %	50 %	25 %	0 %	15826980
3031	NC_002677	CGT	2	6	222570	222575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826980
3032	NC_002677	CAT	2	6	222576	222581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826980
3033	NC_002677	CGG	2	6	222714	222719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826981
3034	NC_002677	TGG	2	6	222720	222725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826981
3035	NC_002677	GCT	2	6	222760	222765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3036	NC_002677	CGATCG	2	12	222837	222848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3037	NC_002677	TTG	2	6	222887	222892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15826981
3038	NC_002677	TCG	2	6	222941	222946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3039	NC_002677	GTC	2	6	222965	222970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3040	NC_002677	AGC	2	6	223000	223005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3041	NC_002677	TCGC	2	8	223010	223017	0 %	25 %	25 %	50 %	15826981
3042	NC_002677	ACG	2	6	223026	223031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3043	NC_002677	TCG	2	6	223034	223039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3044	NC_002677	TGG	2	6	223092	223097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826981
3045	NC_002677	GCG	2	6	223112	223117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826981
3046	NC_002677	GGGT	2	8	223134	223141	0 %	25 %	75 %	0 %	15826981
3047	NC_002677	TGGG	2	8	223175	223182	0 %	25 %	75 %	0 %	15826981
3048	NC_002677	CGC	2	6	223195	223200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826981
3049	NC_002677	CGG	2	6	223245	223250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826981
3050	NC_002677	CGGT	2	8	223383	223390	0 %	25 %	50 %	25 %	15826981
3051	NC_002677	GTTC	2	8	223422	223429	0 %	50 %	25 %	25 %	15826981
3052	NC_002677	GGC	2	6	223439	223444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826981
3053	NC_002677	CCG	2	6	223484	223489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826981
3054	NC_002677	CTG	2	6	223511	223516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3055	NC_002677	CAA	2	6	223550	223555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15826981
3056	NC_002677	CTT	2	6	223577	223582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15826981
3057	NC_002677	GCT	2	6	223597	223602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3058	NC_002677	GCG	3	9	223607	223615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826981
3059	NC_002677	TGA	2	6	223626	223631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826981
3060	NC_002677	CGGC	2	8	223657	223664	0 %	0 %	50 %	50 %	15826981
3061	NC_002677	TGG	2	6	223704	223709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826981
3062	NC_002677	T	7	7	223716	223722	0 %	100 %	0 %	0 %	15826981
3063	NC_002677	GTC	2	6	223733	223738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
3064	NC_002677	GGT	3	9	223750	223758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826981
3065	NC_002677	ACC	3	9	223795	223803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15826981
3066	NC_002677	TCG	2	6	223835	223840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826981
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3068	NC_002677	TG	3	6	223987	223992	0 %	50 %	50 %	0 %	15826982
3069	NC_002677	GTG	3	9	224014	224022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826982
3070	NC_002677	CCCGG	2	10	224082	224091	0 %	0 %	40 %	60 %	15826982
3071	NC_002677	GTG	2	6	224092	224097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826982
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3074	NC_002677	GTC	2	6	224248	224253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826982
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3082	NC_002677	CGC	2	6	224658	224663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826983
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3084	NC_002677	GGA	2	6	224798	224803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15826983
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3088	NC_002677	CGA	2	6	224996	225001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826983
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3105	NC_002677	CCGG	2	8	225840	225847	0 %	0 %	50 %	50 %	15826983
3106	NC_002677	GCGTG	2	10	225876	225885	0 %	20 %	60 %	20 %	15826983
3107	NC_002677	CG	3	6	225891	225896	0 %	0 %	50 %	50 %	15826983
3108	NC_002677	CGC	2	6	225920	225925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826983
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3110	NC_002677	CGC	2	6	225974	225979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826983
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3122	NC_002677	AGC	2	6	235116	235121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826985
3123	NC_002677	TCG	2	6	235156	235161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826985
3124	NC_002677	GGC	2	6	235163	235168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826985
3125	NC_002677	GCT	2	6	235192	235197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826985
3126	NC_002677	TGA	2	6	235206	235211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15826985
3127	NC_002677	CGA	2	6	235223	235228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826985
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3129	NC_002677	TGC	2	6	235365	235370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826985
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3131	NC_002677	GCG	2	6	235491	235496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826985
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3142	NC_002677	CGA	2	6	240815	240820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15826987
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3149	NC_002677	CGC	2	6	241207	241212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15826987
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3152	NC_002677	TGG	2	6	241308	241313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826988
3153	NC_002677	GTC	3	9	241319	241327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15826988
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3232	NC_002677	CTA	2	6	247202	247207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15826994
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3242	NC_002677	AGA	2	6	247612	247617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15826994
3243	NC_002677	CGG	2	6	247657	247662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15826994
3244	NC_002677	TGG	2	6	247695	247700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15826994
3245	NC_002677	TGCGT	2	10	247777	247786	0 %	40 %	40 %	20 %	15826994
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3349	NC_002677	AT	3	6	254279	254284	50 %	50 %	0 %	0 %	15826999
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3362	NC_002677	CAG	2	6	255608	255613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827000
3363	NC_002677	AGCC	2	8	255630	255637	25 %	0 %	25 %	50 %	15827000
3364	NC_002677	TTCG	2	8	255676	255683	0 %	50 %	25 %	25 %	15827000
3365	NC_002677	AAC	2	6	255693	255698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15827000
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3367	NC_002677	G	6	6	257225	257230	0 %	0 %	100 %	0 %	15827001
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3491	NC_002677	GTGCG	2	10	268925	268934	0 %	20 %	60 %	20 %	15827006
3492	NC_002677	CGA	2	6	268946	268951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15827006
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3494	NC_002677	GCCG	2	8	269136	269143	0 %	0 %	50 %	50 %	15827006
3495	NC_002677	GGC	2	6	269205	269210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15827006
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3499	NC_002677	GAG	2	6	269346	269351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15827006
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