MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 plasmid large ECE

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001732	ATCATT	2	12	2201	2212	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954496
2	NC_001732	ACAAAA	2	12	2294	2305	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10954496
3	NC_001732	ATGATA	2	12	3045	3056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10954496
4	NC_001732	ATTTTT	2	12	6402	6413	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10954499
5	NC_001732	GCTTTG	2	12	13065	13076	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	18656943
6	NC_001732	TATTTC	2	12	23328	23339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10954510
7	NC_001732	TACATT	2	12	23747	23758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954510
8	NC_001732	AGCATA	2	12	25895	25906	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10954512
9	NC_001732	TTCATT	2	12	32215	32226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10954517
10	NC_001732	TCATCT	2	12	32726	32737	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10954517
11	NC_001732	AATTTT	2	12	37698	37709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954492
12	NC_001732	TATCAT	2	12	39796	39807	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10954519
13	NC_001732	TTTATC	2	12	40602	40613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10954520
14	NC_001732	TTAATT	2	12	43893	43904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954522
15	NC_001732	AAAATG	2	12	47295	47306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10954525
16	NC_001732	ATTATG	2	12	51272	51283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10954527
17	NC_001732	TTTATA	2	12	51790	51801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10954527
18	NC_001732	ATCTTC	2	12	55587	55598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10954529
19	NC_001732	TTAGAT	2	12	55855	55866	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10954529
20	NC_001732	TTATTG	2	12	56263	56274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10954530
21	NC_001732	GATTTT	2	12	56346	56357	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10954530
22	NC_001732	ATAGAT	2	12	57560	57571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	10954531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.