MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 3143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000962	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	15607143
2	NC_000962	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	15607144
3	NC_000962	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	15607144
4	NC_000962	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	15607146
5	NC_000962	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	15607148
6	NC_000962	CGGTG	2	10	9281	9290	0 %	20 %	60 %	20 %	15607148
7	NC_000962	CAGAC	2	10	9799	9808	40 %	0 %	20 %	40 %	15607148
8	NC_000962	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	15607149
9	NC_000962	CGGCG	2	10	10449	10458	0 %	0 %	60 %	40 %	15607149
10	NC_000962	GGCGT	2	10	14154	14163	0 %	20 %	60 %	20 %	15607154
11	NC_000962	GGGCC	2	10	14437	14446	0 %	0 %	60 %	40 %	15607154
12	NC_000962	GCGTT	2	10	15182	15191	0 %	40 %	40 %	20 %	57116682
13	NC_000962	CCAGC	2	10	15722	15731	20 %	0 %	20 %	60 %	15607156
14	NC_000962	ACCGA	2	10	16485	16494	40 %	0 %	20 %	40 %	15607156
15	NC_000962	ATCGG	2	10	16877	16886	20 %	20 %	40 %	20 %	15607156
16	NC_000962	CGGCC	2	10	17886	17895	0 %	0 %	40 %	60 %	15607157
17	NC_000962	TTAGC	2	10	19037	19046	20 %	40 %	20 %	20 %	15607158
18	NC_000962	GGTCC	2	10	19109	19118	0 %	20 %	40 %	40 %	15607158
19	NC_000962	GTCGT	2	10	21628	21637	0 %	40 %	40 %	20 %	15607159
20	NC_000962	ATCAC	2	10	23901	23910	40 %	20 %	0 %	40 %	15607162
21	NC_000962	GCCGG	2	10	24588	24597	0 %	0 %	60 %	40 %	15607162
22	NC_000962	GGCAA	2	10	29301	29310	40 %	0 %	40 %	20 %	15607167
23	NC_000962	CGATC	2	10	30127	30136	20 %	20 %	20 %	40 %	15607168
24	NC_000962	CGACG	2	10	32310	32319	20 %	0 %	40 %	40 %	15607171
25	NC_000962	GCGTC	2	10	32365	32374	0 %	20 %	40 %	40 %	15607171
26	NC_000962	GACAC	2	10	32462	32471	40 %	0 %	20 %	40 %	15607171
27	NC_000962	TCCTG	2	10	37467	37476	0 %	40 %	20 %	40 %	57116683
28	NC_000962	CTCGG	2	10	37560	37569	0 %	20 %	40 %	40 %	57116683
29	NC_000962	GGCGC	2	10	38103	38112	0 %	0 %	60 %	40 %	57116683
30	NC_000962	TGGCC	2	10	38251	38260	0 %	20 %	40 %	40 %	57116683
31	NC_000962	CGGCG	2	10	38783	38792	0 %	0 %	60 %	40 %	57116683
32	NC_000962	GTCCA	2	10	39395	39404	20 %	20 %	20 %	40 %	15607178
33	NC_000962	GCCAA	2	10	41529	41538	40 %	0 %	20 %	40 %	15607180
34	NC_000962	GCACA	2	10	42328	42337	40 %	0 %	20 %	40 %	15607181
35	NC_000962	GGTAC	2	10	44862	44871	20 %	20 %	40 %	20 %	15607183
36	NC_000962	TCGAA	2	10	45094	45103	40 %	20 %	20 %	20 %	15607183
37	NC_000962	GCACC	2	10	46024	46033	20 %	0 %	20 %	60 %	15607183
38	NC_000962	CGGTG	2	10	47058	47067	0 %	20 %	60 %	20 %	15607184
39	NC_000962	TCATG	2	10	47204	47213	20 %	40 %	20 %	20 %	15607184
40	NC_000962	GCAGC	2	10	48598	48607	20 %	0 %	40 %	40 %	15607186
41	NC_000962	CCCGA	2	10	48681	48690	20 %	0 %	20 %	60 %	15607186
42	NC_000962	CAGCG	2	10	49806	49815	20 %	0 %	40 %	40 %	15607187
43	NC_000962	CTCCC	2	10	56240	56249	0 %	20 %	0 %	80 %	15607193
44	NC_000962	CGGCG	2	10	56689	56698	0 %	0 %	60 %	40 %	15607193
45	NC_000962	CGACC	2	10	58221	58230	20 %	0 %	20 %	60 %	15607195
46	NC_000962	CTTCG	2	10	58908	58917	0 %	40 %	20 %	40 %	15607196
47	NC_000962	CGGTG	2	10	59964	59973	0 %	20 %	60 %	20 %	15607199
48	NC_000962	TCAGG	2	10	62450	62459	20 %	20 %	40 %	20 %	15607200
49	NC_000962	GGCGA	2	10	66413	66422	20 %	0 %	60 %	20 %	57116687
50	NC_000962	GGTGT	2	10	68989	68998	0 %	40 %	60 %	0 %	15607206
51	NC_000962	ATCGG	2	10	69626	69635	20 %	20 %	40 %	20 %	15607206
52	NC_000962	CCGCG	2	10	70163	70172	0 %	0 %	40 %	60 %	15607206
53	NC_000962	GGCAA	2	10	70514	70523	40 %	0 %	40 %	20 %	15607206
54	NC_000962	CGACC	2	10	70803	70812	20 %	0 %	20 %	60 %	15607206
55	NC_000962	CGGGT	2	10	71257	71266	0 %	20 %	60 %	20 %	15607206
56	NC_000962	GGTCG	2	10	71317	71326	0 %	20 %	60 %	20 %	15607206
57	NC_000962	TGCCT	2	10	72021	72030	0 %	40 %	20 %	40 %	15607207
58	NC_000962	GTCCA	2	10	72892	72901	20 %	20 %	20 %	40 %	15607208
59	NC_000962	TGACC	2	10	75516	75525	20 %	20 %	20 %	40 %	15607210
60	NC_000962	GCCAA	2	10	75830	75839	40 %	0 %	20 %	40 %	15607210
61	NC_000962	GTCGC	2	10	75907	75916	0 %	20 %	40 %	40 %	15607210
62	NC_000962	GCGCG	2	10	76995	77004	0 %	0 %	60 %	40 %	15607211
63	NC_000962	CACGA	2	10	79852	79861	40 %	0 %	20 %	40 %	15607213
64	NC_000962	GAGCA	2	10	82390	82399	40 %	0 %	40 %	20 %	15607215
65	NC_000962	GCCGG	2	10	82489	82498	0 %	0 %	60 %	40 %	15607215
66	NC_000962	GCGAC	2	10	82565	82574	20 %	0 %	40 %	40 %	15607215
67	NC_000962	ATCCG	2	10	83335	83344	20 %	20 %	20 %	40 %	15607216
68	NC_000962	CACCG	2	10	84115	84124	20 %	0 %	20 %	60 %	15607217
69	NC_000962	TGGTC	2	10	86250	86259	0 %	40 %	40 %	20 %	15607219
70	NC_000962	GCTGG	2	10	86887	86896	0 %	20 %	60 %	20 %	15607220
71	NC_000962	TGGGT	2	10	89925	89934	0 %	40 %	60 %	0 %	448824737
72	NC_000962	TCGCC	2	10	90132	90141	0 %	20 %	20 %	60 %	448824737
73	NC_000962	GGGCC	2	10	91105	91114	0 %	0 %	60 %	40 %	15607225
74	NC_000962	GGCCG	2	10	92424	92433	0 %	0 %	60 %	40 %	15607226
75	NC_000962	GCGCC	2	10	93076	93085	0 %	0 %	40 %	60 %	15607226
76	NC_000962	GCTTG	2	10	95108	95117	0 %	40 %	40 %	20 %	15607228
77	NC_000962	CGTGT	2	10	95540	95549	0 %	40 %	40 %	20 %	15607229
78	NC_000962	AGATC	2	10	95619	95628	40 %	20 %	20 %	20 %	15607229
79	NC_000962	CGGCG	2	10	99200	99209	0 %	0 %	60 %	40 %	15607232
80	NC_000962	GCGGT	2	10	100276	100285	0 %	20 %	60 %	20 %	15607233
81	NC_000962	GCGCC	2	10	103108	103117	0 %	0 %	40 %	60 %	15607235
82	NC_000962	GGTGG	2	10	103796	103805	0 %	20 %	80 %	0 %	15607236
83	NC_000962	GGCTT	2	10	104809	104818	0 %	40 %	40 %	20 %	15607237
84	NC_000962	CTGGC	2	10	105531	105540	0 %	20 %	40 %	40 %	57116689
85	NC_000962	GCACA	2	10	106652	106661	40 %	0 %	20 %	40 %	57116689
86	NC_000962	CTGAA	2	10	108982	108991	40 %	20 %	20 %	20 %	15607241
87	NC_000962	ATCGC	2	10	109477	109486	20 %	20 %	20 %	40 %	15607241
88	NC_000962	TCTGA	2	10	110811	110820	20 %	40 %	20 %	20 %	15607243
89	NC_000962	CGGTC	2	10	111086	111095	0 %	20 %	40 %	40 %	15607243
90	NC_000962	GACCA	2	10	112224	112233	40 %	0 %	20 %	40 %	15607243
91	NC_000962	GGCTG	2	10	114788	114797	0 %	20 %	60 %	20 %	15607243
92	NC_000962	CCGCG	2	10	118708	118717	0 %	0 %	40 %	60 %	15607244
93	NC_000962	TCGTG	2	10	122661	122670	0 %	40 %	40 %	20 %	15607246
94	NC_000962	CCGGA	2	10	124442	124451	20 %	0 %	40 %	40 %	15607248
95	NC_000962	TGCGC	2	10	126914	126923	0 %	20 %	40 %	40 %	15607249
96	NC_000962	GCGAG	2	10	127425	127434	20 %	0 %	60 %	20 %	15607249
97	NC_000962	GGGGT	2	10	128434	128443	0 %	20 %	80 %	0 %	15607249
98	NC_000962	CCCAC	2	10	128996	129005	20 %	0 %	0 %	80 %	15607249
99	NC_000962	CCGGC	2	10	129506	129515	0 %	0 %	40 %	60 %	15607249
100	NC_000962	TGCGG	2	10	129916	129925	0 %	20 %	60 %	20 %	15607249
101	NC_000962	ATCAC	2	10	131394	131403	40 %	20 %	0 %	40 %	57116691
102	NC_000962	ATCGG	2	10	131442	131451	20 %	20 %	40 %	20 %	57116691
103	NC_000962	CGGGC	2	10	132533	132542	0 %	0 %	60 %	40 %	57116691
104	NC_000962	GCGAT	2	10	134338	134347	20 %	20 %	40 %	20 %	15607253
105	NC_000962	GTTCG	2	10	134559	134568	0 %	40 %	40 %	20 %	15607253
106	NC_000962	CCTGG	2	10	134951	134960	0 %	20 %	40 %	40 %	15607253
107	NC_000962	GGCCC	2	10	135057	135066	0 %	0 %	40 %	60 %	15607253
108	NC_000962	CGTTG	2	10	135569	135578	0 %	40 %	40 %	20 %	15607253
109	NC_000962	CGACC	2	10	135641	135650	20 %	0 %	20 %	60 %	15607253
110	NC_000962	GAGAT	2	10	138661	138670	40 %	20 %	40 %	0 %	15607257
111	NC_000962	CGGCG	2	10	140815	140824	0 %	0 %	60 %	40 %	15607258
112	NC_000962	TGCGG	2	10	141448	141457	0 %	20 %	60 %	20 %	15607259
113	NC_000962	CGCTG	2	10	142155	142164	0 %	20 %	40 %	40 %	15607260
114	NC_000962	GTTGC	2	10	142701	142710	0 %	40 %	40 %	20 %	15607260
115	NC_000962	CCGAT	2	10	143449	143458	20 %	20 %	20 %	40 %	15607260
116	NC_000962	ATCGC	2	10	144140	144149	20 %	20 %	20 %	40 %	15607261
117	NC_000962	AACCG	2	10	144879	144888	40 %	0 %	20 %	40 %	15607261
118	NC_000962	CCGCC	2	10	145466	145475	0 %	0 %	20 %	80 %	15607261
119	NC_000962	CCGCC	2	10	146109	146118	0 %	0 %	20 %	80 %	15607262
120	NC_000962	ATCGG	2	10	149593	149602	20 %	20 %	40 %	20 %	57116692
121	NC_000962	TCGTC	2	10	154551	154560	0 %	40 %	20 %	40 %	15607269
122	NC_000962	CACGC	2	10	155015	155024	20 %	0 %	20 %	60 %	15607269
123	NC_000962	ATTCT	2	10	155859	155868	20 %	60 %	0 %	20 %	15607270
124	NC_000962	AGGCG	2	10	156387	156396	20 %	0 %	60 %	20 %	15607270
125	NC_000962	TGACC	2	10	159391	159400	20 %	20 %	20 %	40 %	15607273
126	NC_000962	CGGCG	2	10	159637	159646	0 %	0 %	60 %	40 %	15607273
127	NC_000962	GCACC	2	10	159807	159816	20 %	0 %	20 %	60 %	15607274
128	NC_000962	CCGCA	2	10	160985	160994	20 %	0 %	20 %	60 %	15607275
129	NC_000962	CGCGG	2	10	161064	161073	0 %	0 %	60 %	40 %	15607275
130	NC_000962	CGGTT	2	10	161391	161400	0 %	40 %	40 %	20 %	15607275
131	NC_000962	GCCGG	2	10	161852	161861	0 %	0 %	60 %	40 %	15607276
132	NC_000962	GCGCG	2	10	161974	161983	0 %	0 %	60 %	40 %	15607276
133	NC_000962	CTGGG	2	10	164188	164197	0 %	20 %	60 %	20 %	15607278
134	NC_000962	GCCGG	2	10	164781	164790	0 %	0 %	60 %	40 %	15607279
135	NC_000962	GTTGG	2	10	166750	166759	0 %	40 %	60 %	0 %	15607281
136	NC_000962	GCGTG	2	10	167916	167925	0 %	20 %	60 %	20 %	15607284
137	NC_000962	GCCGC	2	10	168589	168598	0 %	0 %	40 %	60 %	15607284
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