MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000916	AAC	2	6	219392	219397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678312
4002	NC_000916	GAT	2	6	219427	219432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678312
4003	NC_000916	CAGAG	2	10	219493	219502	40 %	0 %	40 %	20 %	15678312
4004	NC_000916	AGCA	2	8	219535	219542	50 %	0 %	25 %	25 %	15678312
4005	NC_000916	GAA	2	6	219629	219634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678312
4006	NC_000916	TGA	2	6	219637	219642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678312
4007	NC_000916	AAG	2	6	219833	219838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678312
4008	NC_000916	G	6	6	219868	219873	0 %	0 %	100 %	0 %	15678312
4009	NC_000916	TTC	3	9	219896	219904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678312
4010	NC_000916	A	6	6	219941	219946	100 %	0 %	0 %	0 %	15678312
4011	NC_000916	GGA	2	6	219970	219975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678312
4012	NC_000916	CA	3	6	220016	220021	50 %	0 %	0 %	50 %	15678312
4013	NC_000916	TCC	2	6	220042	220047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678312
4014	NC_000916	GGA	2	6	220070	220075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678312
4015	NC_000916	TGA	2	6	220123	220128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678312
4016	NC_000916	AT	3	6	220158	220163	50 %	50 %	0 %	0 %	15678312
4017	NC_000916	TGA	2	6	220177	220182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678312
4018	NC_000916	CAG	2	6	220198	220203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678312
4019	NC_000916	TCT	2	6	220215	220220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678312
4020	NC_000916	AG	3	6	220225	220230	50 %	0 %	50 %	0 %	15678312
4021	NC_000916	ATA	2	6	220235	220240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678312
4022	NC_000916	CAG	2	6	220273	220278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678312
4023	NC_000916	TGA	2	6	220309	220314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678312
4024	NC_000916	AAT	2	6	220315	220320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678312
4025	NC_000916	TC	3	6	220333	220338	0 %	50 %	0 %	50 %	15678312
4026	NC_000916	GA	3	6	220352	220357	50 %	0 %	50 %	0 %	15678312
4027	NC_000916	AG	3	6	220388	220393	50 %	0 %	50 %	0 %	15678312
4028	NC_000916	TTC	2	6	220394	220399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678312
4029	NC_000916	AAG	2	6	220414	220419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678312
4030	NC_000916	CTT	2	6	220424	220429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678312
4031	NC_000916	ATA	2	6	220448	220453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678312
4032	NC_000916	A	6	6	220469	220474	100 %	0 %	0 %	0 %	15678312
4033	NC_000916	AAAC	2	8	220501	220508	75 %	0 %	0 %	25 %	15678312
4034	NC_000916	GCAG	2	8	220544	220551	25 %	0 %	50 %	25 %	15678312
4035	NC_000916	GCT	2	6	220687	220692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678312
4036	NC_000916	AGAGG	2	10	220699	220708	40 %	0 %	60 %	0 %	15678312
4037	NC_000916	GGA	2	6	220842	220847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678313
4038	NC_000916	TTCC	2	8	220878	220885	0 %	50 %	0 %	50 %	15678313
4039	NC_000916	GA	3	6	220959	220964	50 %	0 %	50 %	0 %	15678313
4040	NC_000916	CAG	2	6	220980	220985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678313
4041	NC_000916	TAA	2	6	221006	221011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678313
4042	NC_000916	TCA	2	6	221068	221073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4043	NC_000916	TCA	2	6	221132	221137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4044	NC_000916	CCT	2	6	221211	221216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678313
4045	NC_000916	ATC	2	6	221292	221297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4046	NC_000916	TCC	2	6	221324	221329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678313
4047	NC_000916	CAT	2	6	221342	221347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4048	NC_000916	GCA	2	6	221371	221376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678313
4049	NC_000916	AG	3	6	221433	221438	50 %	0 %	50 %	0 %	15678313
4050	NC_000916	AGG	2	6	221450	221455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678313
4051	NC_000916	TGA	2	6	221493	221498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678313
4052	NC_000916	CAT	2	6	221508	221513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678313
4053	NC_000916	GCAG	2	8	221623	221630	25 %	0 %	50 %	25 %	15678313
4054	NC_000916	GGA	2	6	221691	221696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678313
4055	NC_000916	ATA	2	6	221704	221709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678313
4056	NC_000916	GAT	2	6	221740	221745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678313
4057	NC_000916	TGA	3	9	221790	221798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678313
4058	NC_000916	ATT	2	6	221808	221813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678313
4059	NC_000916	G	6	6	221958	221963	0 %	0 %	100 %	0 %	15678314
4060	NC_000916	TCA	2	6	222023	222028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678314
4061	NC_000916	CTT	2	6	222115	222120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678314
4062	NC_000916	TTC	2	6	222194	222199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678314
4063	NC_000916	CTGG	2	8	222201	222208	0 %	25 %	50 %	25 %	15678314
4064	NC_000916	GAGG	2	8	222231	222238	25 %	0 %	75 %	0 %	15678314
4065	NC_000916	TCT	2	6	222297	222302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678314
4066	NC_000916	AGA	2	6	222321	222326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678314
4067	NC_000916	AGG	2	6	222332	222337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678314
4068	NC_000916	GAT	2	6	222386	222391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678314
4069	NC_000916	ATT	2	6	222429	222434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678315
4070	NC_000916	GAT	2	6	222442	222447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678315
4071	NC_000916	AGG	2	6	222471	222476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678315
4072	NC_000916	TAT	2	6	222507	222512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678315
4073	NC_000916	GAA	2	6	222566	222571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678315
4074	NC_000916	ATG	2	6	222635	222640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678315
4075	NC_000916	GGC	2	6	222646	222651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678315
4076	NC_000916	GGGC	2	8	222852	222859	0 %	0 %	75 %	25 %	15678315
4077	NC_000916	GGA	2	6	223083	223088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678315
4078	NC_000916	AGG	2	6	223096	223101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678315
4079	NC_000916	CTG	2	6	223174	223179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678316
4080	NC_000916	AGG	2	6	223191	223196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
4081	NC_000916	AT	3	6	223326	223331	50 %	50 %	0 %	0 %	15678316
4082	NC_000916	GGA	2	6	223332	223337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
4083	NC_000916	TGA	2	6	223357	223362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678316
4084	NC_000916	ATAAA	2	10	223371	223380	80 %	20 %	0 %	0 %	15678316
4085	NC_000916	TCCA	2	8	223474	223481	25 %	25 %	0 %	50 %	15678316
4086	NC_000916	CGG	2	6	223512	223517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678316
4087	NC_000916	TTCT	2	8	223586	223593	0 %	75 %	0 %	25 %	15678316
4088	NC_000916	AT	3	6	223668	223673	50 %	50 %	0 %	0 %	15678316
4089	NC_000916	G	6	6	223680	223685	0 %	0 %	100 %	0 %	15678316
4090	NC_000916	TCC	2	6	223764	223769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678316
4091	NC_000916	TGG	2	6	223811	223816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678316
4092	NC_000916	ATGA	2	8	223817	223824	50 %	25 %	25 %	0 %	15678316
4093	NC_000916	GGA	2	6	223901	223906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
4094	NC_000916	TCA	2	6	223958	223963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678316
4095	NC_000916	CCAGT	2	10	223971	223980	20 %	20 %	20 %	40 %	15678316
4096	NC_000916	TCA	2	6	224028	224033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678316
4097	NC_000916	GAG	2	6	224053	224058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
4098	NC_000916	AGG	3	9	224111	224119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678316
4099	NC_000916	GAA	2	6	224168	224173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678317
4100	NC_000916	CA	3	6	224198	224203	50 %	0 %	0 %	50 %	15678317
4101	NC_000916	TCT	2	6	224205	224210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678317
4102	NC_000916	GA	3	6	224252	224257	50 %	0 %	50 %	0 %	15678317
4103	NC_000916	AGAT	2	8	224274	224281	50 %	25 %	25 %	0 %	15678317
4104	NC_000916	T	6	6	224304	224309	0 %	100 %	0 %	0 %	15678317
4105	NC_000916	AGAT	2	8	224316	224323	50 %	25 %	25 %	0 %	15678317
4106	NC_000916	GAG	2	6	224366	224371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4107	NC_000916	GGGAG	2	10	224384	224393	20 %	0 %	80 %	0 %	15678317
4108	NC_000916	GAT	2	6	224437	224442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
4109	NC_000916	C	6	6	224576	224581	0 %	0 %	0 %	100 %	15678317
4110	NC_000916	C	6	6	224593	224598	0 %	0 %	0 %	100 %	15678317
4111	NC_000916	CAT	2	6	224628	224633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678317
4112	NC_000916	CTG	2	6	224711	224716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678317
4113	NC_000916	TCT	2	6	224727	224732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678317
4114	NC_000916	AGG	2	6	224826	224831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4115	NC_000916	CAG	2	6	224901	224906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678317
4116	NC_000916	GA	3	6	224933	224938	50 %	0 %	50 %	0 %	15678317
4117	NC_000916	TGA	2	6	224953	224958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
4118	NC_000916	GGA	2	6	224971	224976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4119	NC_000916	CTC	2	6	225028	225033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678317
4120	NC_000916	GAG	2	6	225038	225043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4121	NC_000916	CAT	2	6	225192	225197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678317
4122	NC_000916	GAG	2	6	225251	225256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4123	NC_000916	AG	3	6	225283	225288	50 %	0 %	50 %	0 %	15678317
4124	NC_000916	TGA	2	6	225300	225305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
4125	NC_000916	GAA	2	6	225365	225370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678317
4126	NC_000916	CGC	2	6	225371	225376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678317
4127	NC_000916	AT	3	6	225378	225383	50 %	50 %	0 %	0 %	15678317
4128	NC_000916	TGA	2	6	225411	225416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
4129	NC_000916	GGA	2	6	225472	225477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4130	NC_000916	GAGG	2	8	225478	225485	25 %	0 %	75 %	0 %	15678317
4131	NC_000916	GAT	2	6	225542	225547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678317
4132	NC_000916	CAT	2	6	225565	225570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678317
4133	NC_000916	AGG	2	6	225611	225616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678317
4134	NC_000916	TGT	2	6	225791	225796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678318
4135	NC_000916	GAC	2	6	226050	226055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678318
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4137	NC_000916	CAT	2	6	226177	226182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678318
4138	NC_000916	A	6	6	226238	226243	100 %	0 %	0 %	0 %	15678319
4139	NC_000916	TCC	2	6	226288	226293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678319
4140	NC_000916	GAT	2	6	226296	226301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678319
4141	NC_000916	TCT	2	6	226316	226321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678319
4142	NC_000916	G	6	6	226327	226332	0 %	0 %	100 %	0 %	15678319
4143	NC_000916	ATA	2	6	226338	226343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678319
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4145	NC_000916	ATC	2	6	226401	226406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678319
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4147	NC_000916	TTC	2	6	226419	226424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678319
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4149	NC_000916	TCATGA	2	12	226465	226476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678319
4150	NC_000916	TAT	2	6	226584	226589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678319
4151	NC_000916	CTG	2	6	226612	226617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678319
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4154	NC_000916	TTA	2	6	227236	227241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678320
4155	NC_000916	CCTT	2	8	227360	227367	0 %	50 %	0 %	50 %	15678320
4156	NC_000916	GCC	3	9	227407	227415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678320
4157	NC_000916	AGCC	2	8	227497	227504	25 %	0 %	25 %	50 %	15678320
4158	NC_000916	ATCAT	2	10	227542	227551	40 %	40 %	0 %	20 %	15678320
4159	NC_000916	T	6	6	227570	227575	0 %	100 %	0 %	0 %	15678320
4160	NC_000916	GCAT	2	8	227689	227696	25 %	25 %	25 %	25 %	15678320
4161	NC_000916	CTG	2	6	227702	227707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678320
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4163	NC_000916	CACC	2	8	227742	227749	25 %	0 %	0 %	75 %	15678320
4164	NC_000916	GGA	2	6	227783	227788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678320
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4167	NC_000916	GCA	2	6	227867	227872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678320
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4171	NC_000916	A	6	6	227985	227990	100 %	0 %	0 %	0 %	15678320
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4200	NC_000916	ATT	2	6	229814	229819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678322
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4202	NC_000916	CAT	2	6	229971	229976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678322
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4233	NC_000916	ATA	2	6	231891	231896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678324
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4240	NC_000916	GGA	2	6	232105	232110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678324
4241	NC_000916	AAG	2	6	232209	232214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678324
4242	NC_000916	A	6	6	232240	232245	100 %	0 %	0 %	0 %	15678324
4243	NC_000916	CTG	2	6	232248	232253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678324
4244	NC_000916	CA	3	6	232278	232283	50 %	0 %	0 %	50 %	15678324
4245	NC_000916	TGA	2	6	232303	232308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678324
4246	NC_000916	AGA	2	6	232389	232394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678325
4247	NC_000916	G	6	6	232397	232402	0 %	0 %	100 %	0 %	15678325
4248	NC_000916	GCT	2	6	232548	232553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678325
4249	NC_000916	GCG	2	6	232560	232565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678325
4250	NC_000916	AGGGG	2	10	232568	232577	20 %	0 %	80 %	0 %	15678325
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4279	NC_000916	TGA	2	6	234224	234229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678327
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4281	NC_000916	GAA	2	6	234324	234329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678327
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4285	NC_000916	TGGA	2	8	234523	234530	25 %	25 %	50 %	0 %	15678327
4286	NC_000916	AT	3	6	234539	234544	50 %	50 %	0 %	0 %	15678327
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4369	NC_000916	GCC	2	6	240024	240029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678335
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4371	NC_000916	GGA	2	6	240074	240079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678335
4372	NC_000916	GCT	2	6	240111	240116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678335
4373	NC_000916	CTC	2	6	240232	240237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678335
4374	NC_000916	CTCA	2	8	240348	240355	25 %	25 %	0 %	50 %	15678335
4375	NC_000916	GA	3	6	240356	240361	50 %	0 %	50 %	0 %	15678335
4376	NC_000916	AGG	2	6	240427	240432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678335
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4379	NC_000916	AGG	2	6	240481	240486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678335
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4383	NC_000916	GAG	2	6	240586	240591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678335
4384	NC_000916	ATA	2	6	240592	240597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678335
4385	NC_000916	AGG	2	6	240710	240715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678335
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4388	NC_000916	GAG	2	6	240784	240789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678335
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4393	NC_000916	AGT	2	6	241178	241183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678335
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4481	NC_000916	TCG	2	6	245018	245023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678339
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4484	NC_000916	GAT	2	6	245160	245165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678339
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4486	NC_000916	ACA	2	6	245216	245221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678339
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4488	NC_000916	ACC	2	6	245257	245262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678339
4489	NC_000916	ACT	2	6	245282	245287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678339
4490	NC_000916	GGCT	2	8	245335	245342	0 %	25 %	50 %	25 %	15678339
4491	NC_000916	GA	3	6	245348	245353	50 %	0 %	50 %	0 %	15678339
4492	NC_000916	CGA	2	6	245487	245492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678339
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4494	NC_000916	GCA	2	6	245573	245578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678339
4495	NC_000916	TTC	2	6	245626	245631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678339
4496	NC_000916	CAT	2	6	245724	245729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678339
4497	NC_000916	AGG	2	6	245746	245751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678339
4498	NC_000916	GA	3	6	245773	245778	50 %	0 %	50 %	0 %	15678339
4499	NC_000916	GAG	2	6	245794	245799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678339
4500	NC_000916	ATGG	2	8	245804	245811	25 %	25 %	50 %	0 %	15678339

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