MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000916	GGA	2	6	191301	191306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678274
3502	NC_000916	GAG	2	6	191317	191322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678274
3503	NC_000916	GAT	2	6	191413	191418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678274
3504	NC_000916	AAG	2	6	191446	191451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678274
3505	NC_000916	GCTG	2	8	191481	191488	0 %	25 %	50 %	25 %	15678274
3506	NC_000916	CAT	2	6	191490	191495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678274
3507	NC_000916	GAA	2	6	191508	191513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678274
3508	NC_000916	GTG	2	6	191556	191561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678275
3509	NC_000916	TGA	2	6	191562	191567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678275
3510	NC_000916	AT	3	6	191660	191665	50 %	50 %	0 %	0 %	15678275
3511	NC_000916	CT	3	6	191675	191680	0 %	50 %	0 %	50 %	15678275
3512	NC_000916	GAGG	2	8	191770	191777	25 %	0 %	75 %	0 %	15678275
3513	NC_000916	GTG	3	9	191834	191842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678275
3514	NC_000916	GCA	2	6	191918	191923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678275
3515	NC_000916	GAG	2	6	192008	192013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678275
3516	NC_000916	CCA	2	6	192072	192077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678275
3517	NC_000916	GGA	2	6	192091	192096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678275
3518	NC_000916	CT	3	6	192128	192133	0 %	50 %	0 %	50 %	15678275
3519	NC_000916	ACA	2	6	192135	192140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678275
3520	NC_000916	ACG	2	6	192159	192164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678275
3521	NC_000916	TGA	2	6	192260	192265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678275
3522	NC_000916	TGG	2	6	192493	192498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678276
3523	NC_000916	AGC	2	6	192592	192597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678276
3524	NC_000916	CCA	2	6	192648	192653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678276
3525	NC_000916	TGG	2	6	192681	192686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678276
3526	NC_000916	CGG	2	6	192793	192798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678276
3527	NC_000916	CAG	2	6	192801	192806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678276
3528	NC_000916	GCA	2	6	192884	192889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678276
3529	NC_000916	CAA	2	6	192895	192900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678276
3530	NC_000916	CCT	2	6	192916	192921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678276
3531	NC_000916	GACTGT	2	12	192941	192952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15678276
3532	NC_000916	TGG	2	6	192954	192959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678276
3533	NC_000916	AGA	2	6	193005	193010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678276
3534	NC_000916	GCG	2	6	193035	193040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678276
3535	NC_000916	TTGA	2	8	193221	193228	25 %	50 %	25 %	0 %	15678277
3536	NC_000916	AGA	2	6	193255	193260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678277
3537	NC_000916	GAT	3	9	193313	193321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678277
3538	NC_000916	TGGT	2	8	193432	193439	0 %	50 %	50 %	0 %	15678277
3539	NC_000916	GGT	2	6	193553	193558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678277
3540	NC_000916	TAC	2	6	193647	193652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678277
3541	NC_000916	ATG	2	6	193678	193683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678277
3542	NC_000916	CACC	2	8	193718	193725	25 %	0 %	0 %	75 %	15678277
3543	NC_000916	GGT	2	6	193867	193872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678278
3544	NC_000916	CATC	2	8	193887	193894	25 %	25 %	0 %	50 %	15678278
3545	NC_000916	AGG	2	6	193898	193903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678278
3546	NC_000916	GGC	2	6	193966	193971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678278
3547	NC_000916	GAT	2	6	194012	194017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678278
3548	NC_000916	CTC	2	6	194045	194050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678278
3549	NC_000916	GAGGG	2	10	194158	194167	20 %	0 %	80 %	0 %	15678278
3550	NC_000916	AAG	2	6	194276	194281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678278
3551	NC_000916	CTC	2	6	194282	194287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678278
3552	NC_000916	CGA	2	6	194299	194304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678278
3553	NC_000916	GAG	2	6	194306	194311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678278
3554	NC_000916	CTA	2	6	194320	194325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678278
3555	NC_000916	TGAT	2	8	194402	194409	25 %	50 %	25 %	0 %	15678279
3556	NC_000916	GAA	2	6	194572	194577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678279
3557	NC_000916	GAT	2	6	194605	194610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678279
3558	NC_000916	GAT	2	6	194641	194646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678279
3559	NC_000916	G	6	6	194727	194732	0 %	0 %	100 %	0 %	15678279
3560	NC_000916	AGG	2	6	194750	194755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
3561	NC_000916	GAG	2	6	194765	194770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
3562	NC_000916	TGG	2	6	194850	194855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678279
3563	NC_000916	ATA	2	6	194957	194962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678279
3564	NC_000916	G	6	6	195001	195006	0 %	0 %	100 %	0 %	15678279
3565	NC_000916	AGC	2	6	195073	195078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678279
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3567	NC_000916	TCA	2	6	195113	195118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678279
3568	NC_000916	GGC	2	6	195137	195142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678279
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3570	NC_000916	GAG	2	6	195206	195211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
3571	NC_000916	G	6	6	195242	195247	0 %	0 %	100 %	0 %	15678279
3572	NC_000916	GGA	2	6	195278	195283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
3573	NC_000916	GGA	2	6	195289	195294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678279
3574	NC_000916	ATA	2	6	195299	195304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678279
3575	NC_000916	CTC	2	6	195314	195319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678279
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3578	NC_000916	ATA	2	6	195405	195410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678279
3579	NC_000916	TTC	2	6	195431	195436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678279
3580	NC_000916	CTG	2	6	195471	195476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678279
3581	NC_000916	GAAG	2	8	195550	195557	50 %	0 %	50 %	0 %	15678280
3582	NC_000916	CAT	2	6	195584	195589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678280
3583	NC_000916	TCC	2	6	195607	195612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678280
3584	NC_000916	CTTCCT	2	12	195623	195634	0 %	50 %	0 %	50 %	15678280
3585	NC_000916	GGA	2	6	195709	195714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678280
3586	NC_000916	ATTC	2	8	195755	195762	25 %	50 %	0 %	25 %	15678280
3587	NC_000916	AT	3	6	195786	195791	50 %	50 %	0 %	0 %	15678280
3588	NC_000916	TCTT	2	8	195892	195899	0 %	75 %	0 %	25 %	15678280
3589	NC_000916	GCT	2	6	195948	195953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678280
3590	NC_000916	CTT	2	6	195983	195988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678280
3591	NC_000916	CTC	2	6	196083	196088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678280
3592	NC_000916	TGG	3	9	196111	196119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678280
3593	NC_000916	ATGG	2	8	196257	196264	25 %	25 %	50 %	0 %	15678281
3594	NC_000916	GGA	2	6	196310	196315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678281
3595	NC_000916	G	6	6	196469	196474	0 %	0 %	100 %	0 %	15678281
3596	NC_000916	GGGCT	3	15	196678	196692	0 %	20 %	60 %	20 %	15678281
3597	NC_000916	CGT	2	6	196694	196699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678281
3598	NC_000916	CCT	2	6	196838	196843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678281
3599	NC_000916	CAT	2	6	196931	196936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678281
3600	NC_000916	GAT	2	6	197024	197029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678281
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3602	NC_000916	AT	3	6	197178	197183	50 %	50 %	0 %	0 %	15678281
3603	NC_000916	GAG	2	6	197217	197222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678281
3604	NC_000916	CT	3	6	197226	197231	0 %	50 %	0 %	50 %	15678281
3605	NC_000916	AGG	2	6	197250	197255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678281
3606	NC_000916	GCG	2	6	197283	197288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678281
3607	NC_000916	TCA	2	6	197302	197307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678281
3608	NC_000916	TGA	2	6	197315	197320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678281
3609	NC_000916	GTT	2	6	197325	197330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678281
3610	NC_000916	TGT	2	6	197354	197359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678281
3611	NC_000916	TCC	2	6	197469	197474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678281
3612	NC_000916	GGT	2	6	197688	197693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678282
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3614	NC_000916	TAA	2	6	197730	197735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678282
3615	NC_000916	TGA	2	6	197761	197766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678282
3616	NC_000916	GAA	2	6	197807	197812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678282
3617	NC_000916	GGAA	2	8	197849	197856	50 %	0 %	50 %	0 %	15678282
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3619	NC_000916	AGGTA	2	10	198279	198288	40 %	20 %	40 %	0 %	15678283
3620	NC_000916	CTC	2	6	198394	198399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678283
3621	NC_000916	AGGAAA	2	12	198404	198415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678283
3622	NC_000916	CATA	2	8	198419	198426	50 %	25 %	0 %	25 %	15678283
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3624	NC_000916	CAT	2	6	198482	198487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678283
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3994	NC_000916	CAC	2	6	219162	219167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678312
3995	NC_000916	CCAG	2	8	219178	219185	25 %	0 %	25 %	50 %	15678312
3996	NC_000916	GGA	2	6	219241	219246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678312
3997	NC_000916	TGA	2	6	219262	219267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678312
3998	NC_000916	TAT	2	6	219280	219285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678312
3999	NC_000916	CAG	2	6	219342	219347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678312
4000	NC_000916	AGA	2	6	219366	219371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678312

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