MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000916	CTC	2	6	162505	162510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678248
3002	NC_000916	GAAG	2	8	162521	162528	50 %	0 %	50 %	0 %	15678248
3003	NC_000916	TGG	2	6	162590	162595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678248
3004	NC_000916	AGT	2	6	162596	162601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678248
3005	NC_000916	TGG	2	6	162620	162625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678248
3006	NC_000916	CAGT	2	8	162652	162659	25 %	25 %	25 %	25 %	15678248
3007	NC_000916	TAT	2	6	162669	162674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678248
3008	NC_000916	ATC	2	6	162715	162720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678248
3009	NC_000916	TCT	2	6	162725	162730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678248
3010	NC_000916	AGG	2	6	162733	162738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678248
3011	NC_000916	G	6	6	162776	162781	0 %	0 %	100 %	0 %	15678248
3012	NC_000916	GTG	2	6	162785	162790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678248
3013	NC_000916	GCA	2	6	162817	162822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678248
3014	NC_000916	CAT	2	6	162890	162895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678248
3015	NC_000916	GAGAA	2	10	162898	162907	60 %	0 %	40 %	0 %	15678248
3016	NC_000916	TCC	2	6	162913	162918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678248
3017	NC_000916	GAG	2	6	162921	162926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678248
3018	NC_000916	TGC	2	6	163051	163056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678248
3019	NC_000916	TAT	2	6	163158	163163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678248
3020	NC_000916	CTTC	2	8	163183	163190	0 %	50 %	0 %	50 %	15678248
3021	NC_000916	CAA	2	6	163253	163258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678248
3022	NC_000916	AGGT	2	8	163285	163292	25 %	25 %	50 %	0 %	15678248
3023	NC_000916	TTC	2	6	163655	163660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678249
3024	NC_000916	CT	3	6	163728	163733	0 %	50 %	0 %	50 %	15678249
3025	NC_000916	CAG	2	6	163800	163805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678249
3026	NC_000916	TCCACC	2	12	163809	163820	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	15678249
3027	NC_000916	GGCC	2	8	163946	163953	0 %	0 %	50 %	50 %	15678249
3028	NC_000916	TC	3	6	164074	164079	0 %	50 %	0 %	50 %	15678249
3029	NC_000916	TCAT	2	8	164133	164140	25 %	50 %	0 %	25 %	15678249
3030	NC_000916	CCT	2	6	164149	164154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678249
3031	NC_000916	GGA	2	6	164160	164165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678249
3032	NC_000916	TCA	2	6	164178	164183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678249
3033	NC_000916	CTG	2	6	164322	164327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678249
3034	NC_000916	TGG	2	6	164332	164337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678249
3035	NC_000916	TTCAGG	2	12	164345	164356	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15678249
3036	NC_000916	CAGCTG	2	12	164391	164402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15678249
3037	NC_000916	CAG	2	6	164433	164438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678249
3038	NC_000916	TCC	2	6	164445	164450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678249
3039	NC_000916	CTC	2	6	164553	164558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678250
3040	NC_000916	CAA	2	6	164741	164746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678250
3041	NC_000916	CTCG	2	8	164771	164778	0 %	25 %	25 %	50 %	15678250
3042	NC_000916	CTC	2	6	164817	164822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678250
3043	NC_000916	ATC	2	6	164875	164880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678250
3044	NC_000916	TCA	2	6	164887	164892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678250
3045	NC_000916	TTC	2	6	164935	164940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678250
3046	NC_000916	AAG	2	6	164976	164981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678250
3047	NC_000916	GGA	2	6	164984	164989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678250
3048	NC_000916	G	6	6	164997	165002	0 %	0 %	100 %	0 %	15678250
3049	NC_000916	GAG	2	6	165048	165053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678250
3050	NC_000916	TTC	2	6	165055	165060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678250
3051	NC_000916	CCA	2	6	165170	165175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678251
3052	NC_000916	ATT	2	6	165181	165186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678251
3053	NC_000916	CAT	2	6	165188	165193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678251
3054	NC_000916	TGT	2	6	165230	165235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678251
3055	NC_000916	CATCA	2	10	165315	165324	40 %	20 %	0 %	40 %	15678251
3056	NC_000916	GGTGT	2	10	165377	165386	0 %	40 %	60 %	0 %	15678251
3057	NC_000916	AGG	2	6	165433	165438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678251
3058	NC_000916	TGT	2	6	165459	165464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678251
3059	NC_000916	GTT	2	6	165520	165525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678251
3060	NC_000916	CTC	2	6	165600	165605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678251
3061	NC_000916	GAA	2	6	165654	165659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678251
3062	NC_000916	TGTT	2	8	165803	165810	0 %	75 %	25 %	0 %	15678251
3063	NC_000916	CCA	2	6	165824	165829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678251
3064	NC_000916	TCT	2	6	165843	165848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678251
3065	NC_000916	TCC	2	6	165883	165888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678251
3066	NC_000916	TGCA	2	8	165903	165910	25 %	25 %	25 %	25 %	15678251
3067	NC_000916	GGC	2	6	166047	166052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678251
3068	NC_000916	TGAG	2	8	166103	166110	25 %	25 %	50 %	0 %	15678251
3069	NC_000916	AGT	2	6	166217	166222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678251
3070	NC_000916	TCA	2	6	166234	166239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678251
3071	NC_000916	ATT	2	6	166342	166347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678251
3072	NC_000916	GGA	2	6	166365	166370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678251
3073	NC_000916	CCA	2	6	166390	166395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678251
3074	NC_000916	CTG	2	6	166448	166453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678251
3075	NC_000916	CAGG	2	8	166463	166470	25 %	0 %	50 %	25 %	15678251
3076	NC_000916	CAA	2	6	166484	166489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678251
3077	NC_000916	AAAC	2	8	166518	166525	75 %	0 %	0 %	25 %	15678251
3078	NC_000916	GAC	2	6	166717	166722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678252
3079	NC_000916	TGG	2	6	166771	166776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678252
3080	NC_000916	CTT	2	6	166788	166793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678252
3081	NC_000916	TGG	2	6	166871	166876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678252
3082	NC_000916	CTC	2	6	166900	166905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678252
3083	NC_000916	GGA	2	6	167293	167298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3084	NC_000916	TGA	2	6	167302	167307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678253
3085	NC_000916	GAT	2	6	167370	167375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678253
3086	NC_000916	CAT	2	6	167396	167401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678253
3087	NC_000916	CAG	2	6	167486	167491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678253
3088	NC_000916	GGA	2	6	167492	167497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3089	NC_000916	AGG	2	6	167503	167508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3090	NC_000916	AGG	2	6	167536	167541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3091	NC_000916	GCC	2	6	167553	167558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678253
3092	NC_000916	GGCC	2	8	167630	167637	0 %	0 %	50 %	50 %	15678253
3093	NC_000916	GCT	2	6	167665	167670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678253
3094	NC_000916	TGC	2	6	167757	167762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678253
3095	NC_000916	CCG	2	6	167766	167771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678253
3096	NC_000916	GAT	2	6	168203	168208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678253
3097	NC_000916	TGA	2	6	168227	168232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678253
3098	NC_000916	AGA	2	6	168293	168298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678253
3099	NC_000916	TGC	2	6	168391	168396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678253
3100	NC_000916	TC	3	6	168428	168433	0 %	50 %	0 %	50 %	15678253
3101	NC_000916	TCA	2	6	168445	168450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678253
3102	NC_000916	A	6	6	168450	168455	100 %	0 %	0 %	0 %	15678253
3103	NC_000916	AGG	2	6	168478	168483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3104	NC_000916	CCATGC	2	12	168536	168547	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15678253
3105	NC_000916	AGG	3	9	168558	168566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678253
3106	NC_000916	TGAT	2	8	168576	168583	25 %	50 %	25 %	0 %	15678253
3107	NC_000916	TGATT	2	10	168664	168673	20 %	60 %	20 %	0 %	15678254
3108	NC_000916	GATG	2	8	168725	168732	25 %	25 %	50 %	0 %	15678254
3109	NC_000916	ATA	2	6	168786	168791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678254
3110	NC_000916	TGG	2	6	168908	168913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678254
3111	NC_000916	AGGCA	2	10	168929	168938	40 %	0 %	40 %	20 %	15678254
3112	NC_000916	ATA	2	6	168954	168959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678254
3113	NC_000916	TCCT	2	8	168963	168970	0 %	50 %	0 %	50 %	15678254
3114	NC_000916	AGC	2	6	168991	168996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678254
3115	NC_000916	TGC	2	6	169114	169119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678254
3116	NC_000916	TCAG	2	8	169122	169129	25 %	25 %	25 %	25 %	15678254
3117	NC_000916	GAA	2	6	169140	169145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678254
3118	NC_000916	AGTT	2	8	169174	169181	25 %	50 %	25 %	0 %	15678254
3119	NC_000916	GAGG	2	8	169232	169239	25 %	0 %	75 %	0 %	15678254
3120	NC_000916	ATG	2	6	169278	169283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678254
3121	NC_000916	GT	3	6	169300	169305	0 %	50 %	50 %	0 %	15678254
3122	NC_000916	TTG	2	6	169393	169398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678254
3123	NC_000916	TGA	2	6	169411	169416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678254
3124	NC_000916	GTG	2	6	169434	169439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678254
3125	NC_000916	GCACT	2	10	169463	169472	20 %	20 %	20 %	40 %	15678254
3126	NC_000916	ATG	2	6	169537	169542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678254
3127	NC_000916	ATGG	2	8	169632	169639	25 %	25 %	50 %	0 %	15678254
3128	NC_000916	CTA	2	6	169640	169645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678254
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3132	NC_000916	AT	3	6	170073	170078	50 %	50 %	0 %	0 %	15678255
3133	NC_000916	TCCAC	2	10	170121	170130	20 %	20 %	0 %	60 %	15678255
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3146	NC_000916	G	6	6	170724	170729	0 %	0 %	100 %	0 %	15678256
3147	NC_000916	ACT	2	6	170774	170779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678256
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3149	NC_000916	CAT	2	6	170907	170912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678256
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3152	NC_000916	GGC	2	6	171081	171086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678256
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3245	NC_000916	GAG	2	6	176584	176589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678263
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3248	NC_000916	C	7	7	176749	176755	0 %	0 %	0 %	100 %	15678263
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3369	NC_000916	CTG	2	6	183838	183843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678268
3370	NC_000916	GAT	2	6	183844	183849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678268
3371	NC_000916	ATC	2	6	183864	183869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678268
3372	NC_000916	TCTT	2	8	183946	183953	0 %	75 %	0 %	25 %	15678268
3373	NC_000916	TTC	2	6	184000	184005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678268
3374	NC_000916	TCA	2	6	184093	184098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678268
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3376	NC_000916	GAT	2	6	184234	184239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678268
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3378	NC_000916	CTG	2	6	184396	184401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678268
3379	NC_000916	TCA	2	6	184468	184473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678268
3380	NC_000916	CTC	2	6	184581	184586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678268
3381	NC_000916	CTC	2	6	184596	184601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678268
3382	NC_000916	CAC	2	6	184646	184651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678268
3383	NC_000916	CAT	2	6	184679	184684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678268
3384	NC_000916	TCC	2	6	184715	184720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678268
3385	NC_000916	GCT	3	9	184726	184734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678268
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3388	NC_000916	GAT	2	6	184920	184925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678268
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3393	NC_000916	AGG	2	6	185095	185100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678268
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3397	NC_000916	TCC	2	6	185414	185419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678269
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3400	NC_000916	GGA	2	6	185589	185594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678269
3401	NC_000916	TGG	2	6	185708	185713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678269
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3403	NC_000916	GGATC	2	10	185754	185763	20 %	20 %	40 %	20 %	15678269
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3453	NC_000916	TAC	2	6	188352	188357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678272
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3461	NC_000916	G	6	6	188744	188749	0 %	0 %	100 %	0 %	15678272
3462	NC_000916	ACT	2	6	188806	188811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678272
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3473	NC_000916	AGG	2	6	189779	189784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678274
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3476	NC_000916	TCG	2	6	189938	189943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678274
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3483	NC_000916	GAG	2	6	190123	190128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678274
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3486	NC_000916	ACC	2	6	190389	190394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678274
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3491	NC_000916	CTC	3	9	190690	190698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678274
3492	NC_000916	TGGT	2	8	190787	190794	0 %	50 %	50 %	0 %	15678274
3493	NC_000916	GTT	2	6	190870	190875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678274
3494	NC_000916	ACA	2	6	190879	190884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678274
3495	NC_000916	AGG	2	6	190958	190963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678274
3496	NC_000916	CATG	2	8	191016	191023	25 %	25 %	25 %	25 %	15678274
3497	NC_000916	AGG	2	6	191140	191145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678274
3498	NC_000916	TGA	2	6	191181	191186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678274
3499	NC_000916	AAG	2	6	191236	191241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678274
3500	NC_000916	GAG	2	6	191254	191259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678274

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