MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000916	GAT	2	6	52812	52817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678112
1002	NC_000916	C	6	6	52840	52845	0 %	0 %	0 %	100 %	15678112
1003	NC_000916	TTCTT	2	10	52855	52864	0 %	80 %	0 %	20 %	15678112
1004	NC_000916	TAT	2	6	52880	52885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678112
1005	NC_000916	TG	3	6	52908	52913	0 %	50 %	50 %	0 %	15678112
1006	NC_000916	TAG	2	6	52922	52927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678112
1007	NC_000916	TGA	2	6	52936	52941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678112
1008	NC_000916	ACC	2	6	52952	52957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678112
1009	NC_000916	TCA	3	9	52975	52983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678112
1010	NC_000916	ATA	2	6	53025	53030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678112
1011	NC_000916	TAA	2	6	53044	53049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678112
1012	NC_000916	GCT	2	6	53103	53108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678112
1013	NC_000916	CCA	2	6	53144	53149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678112
1014	NC_000916	CTC	2	6	53291	53296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678113
1015	NC_000916	TAAT	2	8	53312	53319	50 %	50 %	0 %	0 %	15678113
1016	NC_000916	ATC	2	6	53335	53340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678113
1017	NC_000916	TCT	2	6	53350	53355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678113
1018	NC_000916	T	7	7	53355	53361	0 %	100 %	0 %	0 %	15678113
1019	NC_000916	GAA	2	6	53379	53384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678113
1020	NC_000916	AAAT	2	8	53404	53411	75 %	25 %	0 %	0 %	15678113
1021	NC_000916	TAT	2	6	53740	53745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678114
1022	NC_000916	GGA	2	6	53746	53751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678114
1023	NC_000916	AAG	2	6	53792	53797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678114
1024	NC_000916	C	7	7	53835	53841	0 %	0 %	0 %	100 %	15678114
1025	NC_000916	A	6	6	53846	53851	100 %	0 %	0 %	0 %	15678114
1026	NC_000916	GCAA	2	8	53861	53868	50 %	0 %	25 %	25 %	15678114
1027	NC_000916	CAC	2	6	53871	53876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678114
1028	NC_000916	CCT	2	6	53927	53932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678114
1029	NC_000916	ATT	2	6	53987	53992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678114
1030	NC_000916	ACC	2	6	54010	54015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678114
1031	NC_000916	CAC	2	6	54038	54043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678114
1032	NC_000916	AT	3	6	54154	54159	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
1033	NC_000916	GAT	2	6	54272	54277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678115
1034	NC_000916	AT	3	6	54283	54288	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
1035	NC_000916	CAC	2	6	54380	54385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678115
1036	NC_000916	ATA	2	6	54395	54400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678115
1037	NC_000916	AT	3	6	54402	54407	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
1038	NC_000916	CTG	2	6	54410	54415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1039	NC_000916	AT	3	6	54421	54426	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
1040	NC_000916	CAA	2	6	54428	54433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678115
1041	NC_000916	ATGT	2	8	54445	54452	25 %	50 %	25 %	0 %	15678115
1042	NC_000916	TGC	2	6	54479	54484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1043	NC_000916	TGT	2	6	54491	54496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1044	NC_000916	TTG	3	9	54521	54529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1045	NC_000916	TGC	2	6	54534	54539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1046	NC_000916	CCA	2	6	54566	54571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678115
1047	NC_000916	TGA	2	6	54581	54586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678115
1048	NC_000916	CAA	2	6	54590	54595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678115
1049	NC_000916	TGTT	2	8	54762	54769	0 %	75 %	25 %	0 %	15678115
1050	NC_000916	GGT	2	6	54770	54775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678115
1051	NC_000916	ATG	2	6	54838	54843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678115
1052	NC_000916	GAG	2	6	54915	54920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678115
1053	NC_000916	TGT	2	6	54936	54941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1054	NC_000916	GC	3	6	54944	54949	0 %	0 %	50 %	50 %	15678115
1055	NC_000916	TGT	2	6	55073	55078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1056	NC_000916	CTG	2	6	55121	55126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1057	NC_000916	TGGTCC	2	12	55142	55153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1058	NC_000916	GCT	2	6	55174	55179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1059	NC_000916	TCT	2	6	55180	55185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678115
1060	NC_000916	ATG	2	6	55330	55335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678115
1061	NC_000916	CGT	2	6	55337	55342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1062	NC_000916	TAT	2	6	55374	55379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678115
1063	NC_000916	TGG	2	6	55401	55406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678115
1064	NC_000916	GTAT	2	8	55409	55416	25 %	50 %	25 %	0 %	15678115
1065	NC_000916	AGG	2	6	55435	55440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678115
1066	NC_000916	TTG	2	6	55448	55453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1067	NC_000916	GTT	2	6	55590	55595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1068	NC_000916	ATTC	2	8	55601	55608	25 %	50 %	0 %	25 %	15678115
1069	NC_000916	TATGC	2	10	55741	55750	20 %	40 %	20 %	20 %	15678115
1070	NC_000916	TCC	2	6	55753	55758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678115
1071	NC_000916	TTC	2	6	56002	56007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678115
1072	NC_000916	GTGCTT	2	12	56011	56022	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15678115
1073	NC_000916	GTA	2	6	56043	56048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678115
1074	NC_000916	TGT	2	6	56192	56197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1075	NC_000916	TAT	2	6	56205	56210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678115
1076	NC_000916	AT	3	6	56223	56228	50 %	50 %	0 %	0 %	15678115
1077	NC_000916	GTTCCT	2	12	56347	56358	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15678115
1078	NC_000916	ATG	2	6	56431	56436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678115
1079	NC_000916	GTC	2	6	56460	56465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678115
1080	NC_000916	T	6	6	56507	56512	0 %	100 %	0 %	0 %	15678115
1081	NC_000916	TGT	2	6	56515	56520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678115
1082	NC_000916	TCA	2	6	56560	56565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678115
1083	NC_000916	GAA	2	6	56584	56589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678115
1084	NC_000916	AG	3	6	56610	56615	50 %	0 %	50 %	0 %	15678115
1085	NC_000916	AGA	2	6	56623	56628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678115
1086	NC_000916	CCT	2	6	56637	56642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678115
1087	NC_000916	CCA	3	9	56648	56656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678115
1088	NC_000916	AAATAT	2	12	56712	56723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678116
1089	NC_000916	GTT	2	6	56737	56742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678116
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1091	NC_000916	CAG	2	6	56956	56961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678117
1092	NC_000916	AAT	2	6	56975	56980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678117
1093	NC_000916	A	7	7	56992	56998	100 %	0 %	0 %	0 %	15678117
1094	NC_000916	GT	3	6	57075	57080	0 %	50 %	50 %	0 %	15678117
1095	NC_000916	ACC	2	6	57087	57092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678117
1096	NC_000916	AAAC	2	8	57114	57121	75 %	0 %	0 %	25 %	15678117
1097	NC_000916	CTT	2	6	57211	57216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678118
1098	NC_000916	GTAA	2	8	57229	57236	50 %	25 %	25 %	0 %	15678118
1099	NC_000916	CGC	2	6	57243	57248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678118
1100	NC_000916	ATA	2	6	57265	57270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678118
1101	NC_000916	TAC	2	6	57300	57305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678118
1102	NC_000916	TA	3	6	57306	57311	50 %	50 %	0 %	0 %	15678118
1103	NC_000916	A	7	7	57311	57317	100 %	0 %	0 %	0 %	15678118
1104	NC_000916	TCT	2	6	57354	57359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678118
1105	NC_000916	TAT	2	6	57368	57373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678118
1106	NC_000916	A	6	6	57454	57459	100 %	0 %	0 %	0 %	15678118
1107	NC_000916	A	7	7	57475	57481	100 %	0 %	0 %	0 %	15678118
1108	NC_000916	A	6	6	57486	57491	100 %	0 %	0 %	0 %	15678118
1109	NC_000916	T	6	6	57518	57523	0 %	100 %	0 %	0 %	15678118
1110	NC_000916	T	7	7	57526	57532	0 %	100 %	0 %	0 %	15678118
1111	NC_000916	CTT	2	6	57550	57555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678118
1112	NC_000916	TAAAAT	2	12	57564	57575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678118
1113	NC_000916	AAT	3	9	57573	57581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678118
1114	NC_000916	CCA	2	6	57593	57598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678118
1115	NC_000916	TAAG	2	8	57632	57639	50 %	25 %	25 %	0 %	15678119
1116	NC_000916	TAA	2	6	57647	57652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678119
1117	NC_000916	A	6	6	57656	57661	100 %	0 %	0 %	0 %	15678119
1118	NC_000916	GAT	2	6	57673	57678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678119
1119	NC_000916	CA	3	6	57695	57700	50 %	0 %	0 %	50 %	15678119
1120	NC_000916	TAG	2	6	57717	57722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678119
1121	NC_000916	CCA	2	6	57728	57733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678119
1122	NC_000916	CTT	3	9	57761	57769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678119
1123	NC_000916	AAT	2	6	58027	58032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678120
1124	NC_000916	TCA	2	6	58040	58045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678120
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1126	NC_000916	TAA	2	6	58110	58115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678120
1127	NC_000916	CCA	2	6	58145	58150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678120
1128	NC_000916	ATA	2	6	58156	58161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678120
1129	NC_000916	CCA	2	6	58175	58180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678120
1130	NC_000916	TTC	2	6	58197	58202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678120
1131	NC_000916	TGT	2	6	58459	58464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678121
1132	NC_000916	ATG	2	6	58523	58528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678121
1133	NC_000916	CAA	2	6	58557	58562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678121
1134	NC_000916	CAT	2	6	58630	58635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678121
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1136	NC_000916	TCC	2	6	58740	58745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678121
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1143	NC_000916	CTT	3	9	58960	58968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678122
1144	NC_000916	TGT	2	6	59053	59058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678122
1145	NC_000916	TAA	2	6	59129	59134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678123
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1149	NC_000916	TTG	2	6	59258	59263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678123
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1151	NC_000916	AGT	2	6	59336	59341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678123
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1159	NC_000916	TTC	2	6	59986	59991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678124
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1243	NC_000916	CAG	2	6	65078	65083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678132
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1249	NC_000916	TGA	2	6	65399	65404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678132
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1252	NC_000916	G	6	6	65517	65522	0 %	0 %	100 %	0 %	15678132
1253	NC_000916	C	6	6	65562	65567	0 %	0 %	0 %	100 %	15678132
1254	NC_000916	AGG	2	6	65602	65607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678132
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1256	NC_000916	GACC	2	8	65634	65641	25 %	0 %	25 %	50 %	15678132
1257	NC_000916	CAAAG	2	10	65643	65652	60 %	0 %	20 %	20 %	15678132
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1261	NC_000916	CAA	2	6	65852	65857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678132
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1265	NC_000916	CTT	2	6	66230	66235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678133
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1379	NC_000916	CGG	2	6	73364	73369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678143
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