MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000916	ACC	2	6	27843	27848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678078
502	NC_000916	GGAA	2	8	27863	27870	50 %	0 %	50 %	0 %	15678078
503	NC_000916	ACA	2	6	27896	27901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678078
504	NC_000916	AGG	2	6	27918	27923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678078
505	NC_000916	GGA	2	6	27961	27966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678078
506	NC_000916	GAA	2	6	27973	27978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678078
507	NC_000916	GGA	2	6	27985	27990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678078
508	NC_000916	GAT	2	6	28000	28005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678078
509	NC_000916	AT	3	6	28163	28168	50 %	50 %	0 %	0 %	15678078
510	NC_000916	CCT	2	6	28228	28233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678078
511	NC_000916	TGT	2	6	28324	28329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678078
512	NC_000916	GGA	2	6	28453	28458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678078
513	NC_000916	ATA	2	6	28496	28501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678078
514	NC_000916	AGG	3	9	28551	28559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678078
515	NC_000916	GAT	2	6	28629	28634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678078
516	NC_000916	TGA	2	6	28674	28679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678079
517	NC_000916	TCA	2	6	28742	28747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678079
518	NC_000916	CAG	2	6	28748	28753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678079
519	NC_000916	AAG	2	6	28759	28764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678079
520	NC_000916	TGC	2	6	28821	28826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678079
521	NC_000916	CA	3	6	28855	28860	50 %	0 %	0 %	50 %	15678079
522	NC_000916	GAT	2	6	28876	28881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678079
523	NC_000916	G	6	6	28934	28939	0 %	0 %	100 %	0 %	15678079
524	NC_000916	TTCTC	2	10	28967	28976	0 %	60 %	0 %	40 %	15678079
525	NC_000916	GAAG	2	8	29022	29029	50 %	0 %	50 %	0 %	15678079
526	NC_000916	GAG	2	6	29095	29100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678079
527	NC_000916	AGG	2	6	29117	29122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678079
528	NC_000916	GAT	2	6	29133	29138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678079
529	NC_000916	AAG	2	6	29143	29148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678079
530	NC_000916	CAG	2	6	29150	29155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678079
531	NC_000916	GCA	3	9	29164	29172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678079
532	NC_000916	GTG	2	6	29195	29200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678079
533	NC_000916	CGC	2	6	29217	29222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678079
534	NC_000916	ACG	2	6	29267	29272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678079
535	NC_000916	ATCC	2	8	29406	29413	25 %	25 %	0 %	50 %	15678079
536	NC_000916	GGT	2	6	29607	29612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678079
537	NC_000916	GGA	2	6	29619	29624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
538	NC_000916	GAG	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
539	NC_000916	CAG	3	9	29800	29808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678080
540	NC_000916	AGA	2	6	29849	29854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678080
541	NC_000916	GGT	2	6	29895	29900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678080
542	NC_000916	CTA	2	6	30129	30134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678080
543	NC_000916	AG	3	6	30156	30161	50 %	0 %	50 %	0 %	15678080
544	NC_000916	GTG	2	6	30164	30169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678080
545	NC_000916	GTAT	2	8	30171	30178	25 %	50 %	25 %	0 %	15678080
546	NC_000916	GGA	2	6	30192	30197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
547	NC_000916	AGG	2	6	30293	30298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
548	NC_000916	ACC	2	6	30332	30337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678080
549	NC_000916	ATG	2	6	30424	30429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678080
550	NC_000916	TGA	2	6	30447	30452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678080
551	NC_000916	CCT	2	6	30456	30461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678080
552	NC_000916	AC	3	6	30469	30474	50 %	0 %	0 %	50 %	15678080
553	NC_000916	ACC	2	6	30491	30496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678080
554	NC_000916	AG	3	6	30505	30510	50 %	0 %	50 %	0 %	15678080
555	NC_000916	C	6	6	30547	30552	0 %	0 %	0 %	100 %	15678080
556	NC_000916	GAC	2	6	30583	30588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678080
557	NC_000916	GAC	2	6	30649	30654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678080
558	NC_000916	AGG	2	6	30685	30690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
559	NC_000916	GAA	2	6	30765	30770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678080
560	NC_000916	AGG	2	6	30803	30808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
561	NC_000916	AGG	2	6	30811	30816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
562	NC_000916	CTT	2	6	30819	30824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678080
563	NC_000916	TGC	2	6	30825	30830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678080
564	NC_000916	GTG	2	6	30850	30855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678080
565	NC_000916	ACC	2	6	30899	30904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678080
566	NC_000916	GAG	2	6	31048	31053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678080
567	NC_000916	TCA	2	6	31118	31123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678080
568	NC_000916	TGA	2	6	31182	31187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678080
569	NC_000916	TGT	2	6	31188	31193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678080
570	NC_000916	CGCC	2	8	31215	31222	0 %	0 %	25 %	75 %	15678080
571	NC_000916	TCT	2	6	31247	31252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678080
572	NC_000916	AGC	2	6	31495	31500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678081
573	NC_000916	A	6	6	31545	31550	100 %	0 %	0 %	0 %	15678081
574	NC_000916	GTT	2	6	31612	31617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678081
575	NC_000916	TGA	2	6	31638	31643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678081
576	NC_000916	AGG	2	6	31652	31657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678081
577	NC_000916	CAG	2	6	31751	31756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678081
578	NC_000916	CCGGC	2	10	31892	31901	0 %	0 %	40 %	60 %	15678081
579	NC_000916	GAC	2	6	31903	31908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678081
580	NC_000916	CCCT	2	8	31966	31973	0 %	25 %	0 %	75 %	15678081
581	NC_000916	AGAGG	2	10	31977	31986	40 %	0 %	60 %	0 %	15678081
582	NC_000916	CAA	2	6	32013	32018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678081
583	NC_000916	AAC	2	6	32028	32033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678081
584	NC_000916	GTGG	2	8	32058	32065	0 %	25 %	75 %	0 %	15678081
585	NC_000916	AGG	2	6	32126	32131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678081
586	NC_000916	GAA	2	6	32251	32256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678081
587	NC_000916	CAG	2	6	32271	32276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678081
588	NC_000916	ACA	2	6	32320	32325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678081
589	NC_000916	GGC	2	6	32358	32363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678081
590	NC_000916	AC	3	6	32375	32380	50 %	0 %	0 %	50 %	15678081
591	NC_000916	TAC	2	6	32416	32421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678081
592	NC_000916	ATA	2	6	32437	32442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678081
593	NC_000916	TGG	2	6	32478	32483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678081
594	NC_000916	CTC	2	6	32551	32556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678081
595	NC_000916	ATG	2	6	32558	32563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678081
596	NC_000916	GTG	2	6	32603	32608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678081
597	NC_000916	GAT	2	6	32691	32696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678081
598	NC_000916	T	6	6	32748	32753	0 %	100 %	0 %	0 %	15678082
599	NC_000916	AT	3	6	32777	32782	50 %	50 %	0 %	0 %	15678082
600	NC_000916	TCA	2	6	32883	32888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678082
601	NC_000916	GT	3	6	32889	32894	0 %	50 %	50 %	0 %	15678082
602	NC_000916	GCCT	2	8	32939	32946	0 %	25 %	25 %	50 %	15678082
603	NC_000916	TGA	3	9	32965	32973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678082
604	NC_000916	CA	3	6	32983	32988	50 %	0 %	0 %	50 %	15678082
605	NC_000916	G	6	6	32991	32996	0 %	0 %	100 %	0 %	15678082
606	NC_000916	GTTCCT	2	12	33058	33069	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15678082
607	NC_000916	TTC	2	6	33098	33103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678082
608	NC_000916	TCA	2	6	33155	33160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678082
609	NC_000916	CTG	2	6	33240	33245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678082
610	NC_000916	CAT	2	6	33295	33300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678082
611	NC_000916	AC	3	6	33318	33323	50 %	0 %	0 %	50 %	15678082
612	NC_000916	CAA	2	6	33481	33486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678083
613	NC_000916	GAG	2	6	33516	33521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678083
614	NC_000916	CTC	2	6	33587	33592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678083
615	NC_000916	CCG	2	6	33666	33671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678083
616	NC_000916	ACC	2	6	33677	33682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678083
617	NC_000916	ACC	2	6	33701	33706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678083
618	NC_000916	TCC	2	6	33725	33730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678083
619	NC_000916	GTT	2	6	33731	33736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678083
620	NC_000916	GTT	2	6	33752	33757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678083
621	NC_000916	TCC	2	6	33858	33863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678083
622	NC_000916	GAG	2	6	33921	33926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678083
623	NC_000916	ATG	2	6	34044	34049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678083
624	NC_000916	CCATT	2	10	34057	34066	20 %	40 %	0 %	40 %	15678083
625	NC_000916	GAG	2	6	34151	34156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678084
626	NC_000916	GTC	2	6	34169	34174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678084
627	NC_000916	CCA	2	6	34274	34279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678084
628	NC_000916	AAC	2	6	34372	34377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678084
629	NC_000916	TGT	2	6	34395	34400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678084
630	NC_000916	TTGAT	2	10	34407	34416	20 %	60 %	20 %	0 %	15678084
631	NC_000916	TCT	2	6	34419	34424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678084
632	NC_000916	CAGA	2	8	34438	34445	50 %	0 %	25 %	25 %	15678084
633	NC_000916	CTG	2	6	34499	34504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678084
634	NC_000916	GTT	2	6	34558	34563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678084
635	NC_000916	CTG	2	6	34578	34583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678084
636	NC_000916	GGC	2	6	34668	34673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678084
637	NC_000916	CTGTA	2	10	34707	34716	20 %	40 %	20 %	20 %	15678084
638	NC_000916	CTG	2	6	34718	34723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678084
639	NC_000916	GCG	2	6	34787	34792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678084
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641	NC_000916	TTG	2	6	34896	34901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678084
642	NC_000916	T	6	6	34906	34911	0 %	100 %	0 %	0 %	15678084
643	NC_000916	CTG	2	6	34944	34949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678084
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652	NC_000916	T	6	6	35367	35372	0 %	100 %	0 %	0 %	15678085
653	NC_000916	TG	3	6	35389	35394	0 %	50 %	50 %	0 %	15678085
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657	NC_000916	CTG	2	6	35630	35635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678085
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659	NC_000916	TGT	2	6	35694	35699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678085
660	NC_000916	TTCCC	2	10	35700	35709	0 %	40 %	0 %	60 %	15678085
661	NC_000916	TGC	2	6	35888	35893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678086
662	NC_000916	TCG	2	6	35976	35981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678086
663	NC_000916	GAA	2	6	36064	36069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678086
664	NC_000916	CCT	2	6	36111	36116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678086
665	NC_000916	AAT	2	6	36135	36140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678086
666	NC_000916	ATT	2	6	36165	36170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678086
667	NC_000916	ACT	2	6	36171	36176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678086
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677	NC_000916	ACC	2	6	36780	36785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678088
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691	NC_000916	TTAC	2	8	37615	37622	25 %	50 %	0 %	25 %	15678089
692	NC_000916	ACTGTA	2	12	37708	37719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15678089
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695	NC_000916	AAG	2	6	38244	38249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678090
696	NC_000916	ACCCC	2	10	38370	38379	20 %	0 %	0 %	80 %	15678090
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729	NC_000916	CTA	2	6	40577	40582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678093
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731	NC_000916	A	7	7	40630	40636	100 %	0 %	0 %	0 %	15678093
732	NC_000916	A	6	6	40638	40643	100 %	0 %	0 %	0 %	15678093
733	NC_000916	TGC	2	6	40655	40660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678093
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739	NC_000916	AGG	2	6	40989	40994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678094
740	NC_000916	TAT	2	6	41006	41011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678094
741	NC_000916	TGC	2	6	41021	41026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678094
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743	NC_000916	ATC	2	6	41130	41135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678095
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746	NC_000916	TAG	2	6	41239	41244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678095
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748	NC_000916	T	8	8	41444	41451	0 %	100 %	0 %	0 %	15678096
749	NC_000916	T	6	6	41474	41479	0 %	100 %	0 %	0 %	15678096
750	NC_000916	T	6	6	41483	41488	0 %	100 %	0 %	0 %	15678096
751	NC_000916	CTT	2	6	41533	41538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678096
752	NC_000916	GTTTT	2	10	41586	41595	0 %	80 %	20 %	0 %	15679902
753	NC_000916	G	6	6	41596	41601	0 %	0 %	100 %	0 %	15679902
754	NC_000916	T	6	6	41646	41651	0 %	100 %	0 %	0 %	15679902
755	NC_000916	TCT	2	6	41656	41661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679902
756	NC_000916	TTTCCA	2	12	41673	41684	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15679902
757	NC_000916	TTC	2	6	41757	41762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15679902
758	NC_000916	TGT	2	6	41777	41782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15679902
759	NC_000916	GTC	2	6	41793	41798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15679902
760	NC_000916	CCT	2	6	41840	41845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15679902
761	NC_000916	ACT	2	6	41869	41874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15679902
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789	NC_000916	TGC	2	6	43050	43055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678099
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791	NC_000916	TGA	2	6	43097	43102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678099
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793	NC_000916	T	6	6	43266	43271	0 %	100 %	0 %	0 %	15678100
794	NC_000916	T	6	6	43296	43301	0 %	100 %	0 %	0 %	15678100
795	NC_000916	T	6	6	43308	43313	0 %	100 %	0 %	0 %	15678100
796	NC_000916	T	6	6	43428	43433	0 %	100 %	0 %	0 %	15678100
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883	NC_000916	GTGCTT	2	12	47510	47521	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15678103
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886	NC_000916	TAT	2	6	47704	47709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678103
887	NC_000916	AT	3	6	47722	47727	50 %	50 %	0 %	0 %	15678103
888	NC_000916	GTTCCT	2	12	47846	47857	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15678103
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