MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_000916	TGG	2	6	324205	324210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678406
6002	NC_000916	TCT	2	6	324253	324258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678406
6003	NC_000916	TGA	2	6	324284	324289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678406
6004	NC_000916	TGA	2	6	324321	324326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678406
6005	NC_000916	TGA	2	6	324408	324413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678407
6006	NC_000916	CAC	2	6	324421	324426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678407
6007	NC_000916	AGG	2	6	324458	324463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678407
6008	NC_000916	CCAGGG	2	12	324483	324494	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15678407
6009	NC_000916	GAT	2	6	324532	324537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678407
6010	NC_000916	GCT	2	6	324542	324547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678407
6011	NC_000916	GAG	2	6	324553	324558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678407
6012	NC_000916	TCC	2	6	324561	324566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678407
6013	NC_000916	GCA	2	6	324662	324667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678407
6014	NC_000916	AGG	2	6	324779	324784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678407
6015	NC_000916	AGA	2	6	324870	324875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678407
6016	NC_000916	GTGAT	2	10	325044	325053	20 %	40 %	40 %	0 %	15678407
6017	NC_000916	GAG	2	6	325060	325065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678407
6018	NC_000916	AG	3	6	325148	325153	50 %	0 %	50 %	0 %	15678407
6019	NC_000916	GAA	2	6	325222	325227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678407
6020	NC_000916	ACG	2	6	325228	325233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678407
6021	NC_000916	TGT	2	6	325240	325245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678407
6022	NC_000916	GGC	2	6	325267	325272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678407
6023	NC_000916	CCCA	2	8	325309	325316	25 %	0 %	0 %	75 %	15678407
6024	NC_000916	GAA	2	6	325417	325422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678407
6025	NC_000916	AGG	2	6	325431	325436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678407
6026	NC_000916	GAT	2	6	325543	325548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678407
6027	NC_000916	CGC	2	6	325564	325569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678407
6028	NC_000916	CCA	2	6	325764	325769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678407
6029	NC_000916	GGA	2	6	325770	325775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678407
6030	NC_000916	AGG	2	6	325826	325831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678408
6031	NC_000916	CTC	2	6	325881	325886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678408
6032	NC_000916	CTG	2	6	325910	325915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678408
6033	NC_000916	TCA	2	6	325966	325971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678408
6034	NC_000916	GCTCT	2	10	326136	326145	0 %	40 %	20 %	40 %	15678408
6035	NC_000916	GAG	2	6	326178	326183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678408
6036	NC_000916	AGT	2	6	326303	326308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678408
6037	NC_000916	TCC	2	6	326362	326367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678408
6038	NC_000916	GTT	2	6	326385	326390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678408
6039	NC_000916	CAG	2	6	326399	326404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678408
6040	NC_000916	GGA	2	6	326442	326447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678408
6041	NC_000916	TGG	2	6	326539	326544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678408
6042	NC_000916	TGG	2	6	326623	326628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678408
6043	NC_000916	TCC	2	6	326736	326741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678408
6044	NC_000916	TC	3	6	326761	326766	0 %	50 %	0 %	50 %	15678408
6045	NC_000916	CAC	2	6	327062	327067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678409
6046	NC_000916	CAC	2	6	327101	327106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678409
6047	NC_000916	ACC	2	6	327167	327172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678409
6048	NC_000916	GA	3	6	327297	327302	50 %	0 %	50 %	0 %	15678409
6049	NC_000916	AAG	2	6	327419	327424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678409
6050	NC_000916	ACC	2	6	327443	327448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678409
6051	NC_000916	GAT	2	6	327468	327473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678409
6052	NC_000916	AGA	2	6	327589	327594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678409
6053	NC_000916	ATTG	2	8	327623	327630	25 %	50 %	25 %	0 %	15678409
6054	NC_000916	CT	3	6	327762	327767	0 %	50 %	0 %	50 %	15678409
6055	NC_000916	CTT	3	9	327785	327793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678409
6056	NC_000916	CAT	2	6	327856	327861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678409
6057	NC_000916	CGA	2	6	327865	327870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678409
6058	NC_000916	CT	3	6	327894	327899	0 %	50 %	0 %	50 %	15678409
6059	NC_000916	TCC	2	6	327940	327945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678409
6060	NC_000916	CTG	2	6	327976	327981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678409
6061	NC_000916	ACC	3	9	327990	327998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678409
6062	NC_000916	ATGGT	2	10	328048	328057	20 %	40 %	40 %	0 %	15678409
6063	NC_000916	GGC	2	6	328106	328111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678409
6064	NC_000916	GAG	2	6	328128	328133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678409
6065	NC_000916	ATG	2	6	328146	328151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678409
6066	NC_000916	TTTC	2	8	328281	328288	0 %	75 %	0 %	25 %	15678409
6067	NC_000916	GGT	2	6	328315	328320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678409
6068	NC_000916	GAT	2	6	328400	328405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678409
6069	NC_000916	GTAT	2	8	328454	328461	25 %	50 %	25 %	0 %	15678409
6070	NC_000916	GAAT	2	8	328468	328475	50 %	25 %	25 %	0 %	15678409
6071	NC_000916	CA	3	6	328568	328573	50 %	0 %	0 %	50 %	15678409
6072	NC_000916	GCT	2	6	328611	328616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678409
6073	NC_000916	AGA	2	6	328620	328625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678409
6074	NC_000916	GAG	2	6	328646	328651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678409
6075	NC_000916	TGG	2	6	328901	328906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678410
6076	NC_000916	CAC	2	6	328931	328936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678410
6077	NC_000916	TTCT	2	8	328965	328972	0 %	75 %	0 %	25 %	15678410
6078	NC_000916	GT	3	6	328978	328983	0 %	50 %	50 %	0 %	15678410
6079	NC_000916	GTT	3	9	328986	328994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678410
6080	NC_000916	GTG	2	6	328996	329001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678410
6081	NC_000916	GTATGG	2	12	329044	329055	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15678410
6082	NC_000916	TCC	2	6	329141	329146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678410
6083	NC_000916	AGT	2	6	329152	329157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678410
6084	NC_000916	TCCCT	2	10	329208	329217	0 %	40 %	0 %	60 %	15678410
6085	NC_000916	ATT	2	6	329229	329234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678410
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6087	NC_000916	CCAT	2	8	329326	329333	25 %	25 %	0 %	50 %	15678410
6088	NC_000916	TGG	2	6	329576	329581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678411
6089	NC_000916	TTCT	2	8	329640	329647	0 %	75 %	0 %	25 %	15678411
6090	NC_000916	GT	3	6	329653	329658	0 %	50 %	50 %	0 %	15678411
6091	NC_000916	GTT	3	9	329661	329669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678411
6092	NC_000916	GTG	2	6	329671	329676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678411
6093	NC_000916	GTATGG	2	12	329719	329730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15678411
6094	NC_000916	TCC	2	6	329816	329821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678411
6095	NC_000916	AGT	2	6	329827	329832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678411
6096	NC_000916	TCCCT	2	10	329883	329892	0 %	40 %	0 %	60 %	15678411
6097	NC_000916	ATT	2	6	329904	329909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678411
6098	NC_000916	CCT	2	6	329938	329943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678411
6099	NC_000916	CTG	2	6	329959	329964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678411
6100	NC_000916	AGG	2	6	329982	329987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678411
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6102	NC_000916	TA	3	6	330267	330272	50 %	50 %	0 %	0 %	15678412
6103	NC_000916	ATT	2	6	330299	330304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678412
6104	NC_000916	AGC	2	6	330331	330336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678412
6105	NC_000916	ATT	2	6	330338	330343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678412
6106	NC_000916	GGCC	2	8	330393	330400	0 %	0 %	50 %	50 %	15678412
6107	NC_000916	AAT	2	6	330535	330540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678412
6108	NC_000916	AT	3	6	330561	330566	50 %	50 %	0 %	0 %	15678412
6109	NC_000916	GGA	2	6	330577	330582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678412
6110	NC_000916	ATG	2	6	330586	330591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678412
6111	NC_000916	GCA	2	6	330616	330621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678413
6112	NC_000916	ATGG	2	8	330657	330664	25 %	25 %	50 %	0 %	15678413
6113	NC_000916	G	6	6	330689	330694	0 %	0 %	100 %	0 %	15678413
6114	NC_000916	AGA	2	6	330719	330724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678413
6115	NC_000916	CTT	2	6	330747	330752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678413
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6117	NC_000916	CTC	2	6	330796	330801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678413
6118	NC_000916	GAGG	2	8	330835	330842	25 %	0 %	75 %	0 %	15678413
6119	NC_000916	CCT	2	6	330855	330860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678413
6120	NC_000916	ATA	2	6	330934	330939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678413
6121	NC_000916	TCG	2	6	330977	330982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678413
6122	NC_000916	ACC	2	6	331003	331008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678413
6123	NC_000916	ATC	2	6	331032	331037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678413
6124	NC_000916	AGG	2	6	331060	331065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678413
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6129	NC_000916	CAT	2	6	331455	331460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678415
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6131	NC_000916	GATAA	2	10	331480	331489	60 %	20 %	20 %	0 %	15678415
6132	NC_000916	CTC	2	6	331501	331506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678415
6133	NC_000916	G	6	6	331509	331514	0 %	0 %	100 %	0 %	15678415
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6143	NC_000916	CTC	2	6	332296	332301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678417
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6148	NC_000916	ATG	2	6	332437	332442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678417
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6239	NC_000916	GTT	2	6	337563	337568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678426
6240	NC_000916	AG	3	6	337574	337579	50 %	0 %	50 %	0 %	15678426
6241	NC_000916	CTC	2	6	337596	337601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678426
6242	NC_000916	TAA	2	6	337602	337607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678426
6243	NC_000916	CA	4	8	337695	337702	50 %	0 %	0 %	50 %	15678427
6244	NC_000916	AG	3	6	337726	337731	50 %	0 %	50 %	0 %	15678427
6245	NC_000916	GAG	3	9	337844	337852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678427
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6247	NC_000916	GA	3	6	337947	337952	50 %	0 %	50 %	0 %	15678427
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6494	NC_000916	CAG	2	6	352829	352834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678444
6495	NC_000916	GCA	2	6	352862	352867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678444
6496	NC_000916	GAG	2	6	352881	352886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678444
6497	NC_000916	GCC	2	6	352897	352902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678444
6498	NC_000916	CCT	2	6	352914	352919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678444
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