MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanothermobacter thermautotrophicus str. Delta H chromosome

Total Repeats: 31292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_000916	TCAT	2	8	245911	245918	25 %	50 %	0 %	25 %	15678339
4502	NC_000916	TGT	2	6	245931	245936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678339
4503	NC_000916	CAG	2	6	245938	245943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678339
4504	NC_000916	GAG	2	6	245986	245991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678339
4505	NC_000916	GAG	2	6	246007	246012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678339
4506	NC_000916	GGA	2	6	246139	246144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4507	NC_000916	AGGG	2	8	246182	246189	25 %	0 %	75 %	0 %	15678340
4508	NC_000916	GGC	2	6	246236	246241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678340
4509	NC_000916	GCC	2	6	246340	246345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678340
4510	NC_000916	AGG	2	6	246417	246422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4511	NC_000916	TCC	2	6	246445	246450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678340
4512	NC_000916	ATG	2	6	246477	246482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678340
4513	NC_000916	CAT	2	6	246533	246538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678340
4514	NC_000916	CTCC	2	8	246590	246597	0 %	25 %	0 %	75 %	15678340
4515	NC_000916	CT	3	6	246645	246650	0 %	50 %	0 %	50 %	15678340
4516	NC_000916	TGT	2	6	246704	246709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678340
4517	NC_000916	GAG	2	6	246782	246787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4518	NC_000916	GAA	2	6	246797	246802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678340
4519	NC_000916	TAC	2	6	246843	246848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678340
4520	NC_000916	CAT	2	6	246851	246856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678340
4521	NC_000916	CCA	2	6	246887	246892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678340
4522	NC_000916	GAG	2	6	246918	246923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4523	NC_000916	GAG	2	6	246927	246932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4524	NC_000916	GTG	2	6	247011	247016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678340
4525	NC_000916	CCA	2	6	247033	247038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678340
4526	NC_000916	TCC	2	6	247051	247056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678340
4527	NC_000916	GAG	2	6	247067	247072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4528	NC_000916	AGG	2	6	247080	247085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4529	NC_000916	ATA	2	6	247101	247106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678340
4530	NC_000916	AGG	2	6	247117	247122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4531	NC_000916	CCA	2	6	247211	247216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678340
4532	NC_000916	CGA	2	6	247310	247315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678340
4533	NC_000916	TGG	2	6	247339	247344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678340
4534	NC_000916	CCA	2	6	247379	247384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678340
4535	NC_000916	CCCA	2	8	247445	247452	25 %	0 %	0 %	75 %	15678340
4536	NC_000916	CTT	2	6	247505	247510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678340
4537	NC_000916	GTC	2	6	247512	247517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678340
4538	NC_000916	ACCT	2	8	247518	247525	25 %	25 %	0 %	50 %	15678340
4539	NC_000916	GTG	2	6	247552	247557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678340
4540	NC_000916	GTGG	2	8	247562	247569	0 %	25 %	75 %	0 %	15678340
4541	NC_000916	CAC	2	6	247661	247666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15678340
4542	NC_000916	CTC	2	6	247698	247703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678340
4543	NC_000916	CCT	2	6	247721	247726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678340
4544	NC_000916	CAT	2	6	247997	248002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678340
4545	NC_000916	AGG	2	6	248008	248013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4546	NC_000916	TCC	2	6	248017	248022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678340
4547	NC_000916	GGA	2	6	248030	248035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678340
4548	NC_000916	CCT	2	6	248111	248116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678340
4549	NC_000916	CTC	2	6	248142	248147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678340
4550	NC_000916	CTC	2	6	248296	248301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678341
4551	NC_000916	AAT	2	6	248304	248309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678341
4552	NC_000916	GGGA	2	8	248335	248342	25 %	0 %	75 %	0 %	15678341
4553	NC_000916	CCT	2	6	248382	248387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678341
4554	NC_000916	CTT	2	6	248433	248438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678341
4555	NC_000916	GGA	2	6	248481	248486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678341
4556	NC_000916	GA	4	8	248500	248507	50 %	0 %	50 %	0 %	15678341
4557	NC_000916	AGG	2	6	248551	248556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678341
4558	NC_000916	ATC	2	6	248566	248571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678341
4559	NC_000916	GAG	2	6	248590	248595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678341
4560	NC_000916	CCT	2	6	248607	248612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678341
4561	NC_000916	AGG	2	6	248675	248680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678341
4562	NC_000916	AGG	2	6	248742	248747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678342
4563	NC_000916	TCA	2	6	248752	248757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678342
4564	NC_000916	CTC	2	6	248787	248792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4565	NC_000916	CATC	2	8	248794	248801	25 %	25 %	0 %	50 %	15678342
4566	NC_000916	GAGGC	2	10	248839	248848	20 %	0 %	60 %	20 %	15678342
4567	NC_000916	GCA	2	6	248922	248927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15678342
4568	NC_000916	TGA	2	6	248957	248962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678342
4569	NC_000916	AAC	2	6	248973	248978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15678342
4570	NC_000916	CA	3	6	248988	248993	50 %	0 %	0 %	50 %	15678342
4571	NC_000916	ATC	3	9	248994	249002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678342
4572	NC_000916	AAT	2	6	249017	249022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678342
4573	NC_000916	TCC	2	6	249043	249048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4574	NC_000916	TCC	2	6	249058	249063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4575	NC_000916	GCC	2	6	249075	249080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15678342
4576	NC_000916	AGG	2	6	249189	249194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678342
4577	NC_000916	CGG	2	6	249259	249264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678342
4578	NC_000916	GGC	2	6	249281	249286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678342
4579	NC_000916	CTC	2	6	249321	249326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4580	NC_000916	GGA	2	6	249349	249354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678342
4581	NC_000916	G	6	6	249394	249399	0 %	0 %	100 %	0 %	15678342
4582	NC_000916	CTC	2	6	249471	249476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4583	NC_000916	CGG	2	6	249508	249513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678342
4584	NC_000916	GGA	2	6	249535	249540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678342
4585	NC_000916	CCT	2	6	249668	249673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4586	NC_000916	CGG	2	6	249688	249693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15678342
4587	NC_000916	CAT	2	6	249748	249753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678342
4588	NC_000916	TCC	2	6	249898	249903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4589	NC_000916	CCT	2	6	249923	249928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15678342
4590	NC_000916	TGG	2	6	249963	249968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678342
4591	NC_000916	TGG	2	6	250000	250005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678342
4592	NC_000916	ATC	2	6	250058	250063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678342
4593	NC_000916	ATGA	2	8	250207	250214	50 %	25 %	25 %	0 %	15678343
4594	NC_000916	ATTG	2	8	250221	250228	25 %	50 %	25 %	0 %	15678343
4595	NC_000916	ATA	2	6	250271	250276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678343
4596	NC_000916	ACT	2	6	250315	250320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15678343
4597	NC_000916	CTT	2	6	250321	250326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15678343
4598	NC_000916	GAA	2	6	250341	250346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678343
4599	NC_000916	ATT	2	6	250388	250393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678343
4600	NC_000916	ACAT	2	8	250432	250439	50 %	25 %	0 %	25 %	15678343
4601	NC_000916	TGG	2	6	250518	250523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678343
4602	NC_000916	ATA	2	6	250562	250567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678343
4603	NC_000916	TGA	2	6	250650	250655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678343
4604	NC_000916	ATT	2	6	250691	250696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678343
4605	NC_000916	AAT	2	6	250719	250724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678343
4606	NC_000916	TTAC	2	8	250754	250761	25 %	50 %	0 %	25 %	15678343
4607	NC_000916	TAA	2	6	250791	250796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15678343
4608	NC_000916	TTG	2	6	250811	250816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678343
4609	NC_000916	GTG	2	6	250840	250845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15678343
4610	NC_000916	AT	3	6	250954	250959	50 %	50 %	0 %	0 %	15678343
4611	NC_000916	AAAAT	2	10	251093	251102	80 %	20 %	0 %	0 %	15678344
4612	NC_000916	CTG	2	6	251137	251142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678344
4613	NC_000916	GAT	2	6	251161	251166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678344
4614	NC_000916	GAG	2	6	251173	251178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678344
4615	NC_000916	A	7	7	251297	251303	100 %	0 %	0 %	0 %	15678344
4616	NC_000916	AGA	2	6	251321	251326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15678344
4617	NC_000916	GTT	2	6	251335	251340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678344
4618	NC_000916	ATT	2	6	251620	251625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15678345
4619	NC_000916	GAG	2	6	251645	251650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15678345
4620	NC_000916	ATG	2	6	251682	251687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678345
4621	NC_000916	TGT	2	6	251714	251719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15678345
4622	NC_000916	TGC	2	6	251741	251746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15678345
4623	NC_000916	TGA	2	6	251783	251788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678345
4624	NC_000916	TGA	2	6	251873	251878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15678345
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