MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 chromosome

Total Repeats: 40086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000909	AGCGA	2	10	25316	25325	40 %	0 %	40 %	20 %	15668194
502	NC_000909	CAT	2	6	25333	25338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668194
503	NC_000909	TGA	2	6	25343	25348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15668194
504	NC_000909	T	6	6	25352	25357	0 %	100 %	0 %	0 %	15668194
505	NC_000909	ATT	2	6	25389	25394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668194
506	NC_000909	TAT	2	6	25418	25423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668194
507	NC_000909	AGA	2	6	25469	25474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668194
508	NC_000909	AGA	2	6	25487	25492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15668194
509	NC_000909	A	7	7	25503	25509	100 %	0 %	0 %	0 %	15668194
510	NC_000909	ATT	2	6	25514	25519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668194
511	NC_000909	A	6	6	25525	25530	100 %	0 %	0 %	0 %	15668194
512	NC_000909	TTAG	2	8	25548	25555	25 %	50 %	25 %	0 %	15668194
513	NC_000909	ATA	2	6	25566	25571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668194
514	NC_000909	TATG	2	8	25595	25602	25 %	50 %	25 %	0 %	15668194
515	NC_000909	ATT	2	6	25611	25616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668194
516	NC_000909	TAGA	2	8	25634	25641	50 %	25 %	25 %	0 %	15668194
517	NC_000909	TA	3	6	25698	25703	50 %	50 %	0 %	0 %	15668195
518	NC_000909	TCCA	2	8	25712	25719	25 %	25 %	0 %	50 %	15668195
519	NC_000909	TCT	3	9	25720	25728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668195
520	NC_000909	CCT	2	6	25766	25771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668195
521	NC_000909	TAT	2	6	25778	25783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668195
522	NC_000909	T	7	7	25843	25849	0 %	100 %	0 %	0 %	15668195
523	NC_000909	A	6	6	25898	25903	100 %	0 %	0 %	0 %	15668195
524	NC_000909	TCT	2	6	25942	25947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668195
525	NC_000909	T	6	6	25967	25972	0 %	100 %	0 %	0 %	15668195
526	NC_000909	T	6	6	25974	25979	0 %	100 %	0 %	0 %	15668195
527	NC_000909	ATA	2	6	26002	26007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668195
528	NC_000909	CTT	2	6	26027	26032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668195
529	NC_000909	CAG	2	6	26078	26083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668195
530	NC_000909	AAT	2	6	26093	26098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668195
531	NC_000909	ACC	2	6	26110	26115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15668196
532	NC_000909	ATT	2	6	26136	26141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668196
533	NC_000909	AAC	2	6	26187	26192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668196
534	NC_000909	TGTT	2	8	26198	26205	0 %	75 %	25 %	0 %	15668196
535	NC_000909	ATT	2	6	26266	26271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668196
536	NC_000909	AT	3	6	26281	26286	50 %	50 %	0 %	0 %	15668196
537	NC_000909	TAA	2	6	26319	26324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668196
538	NC_000909	CAA	2	6	26345	26350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668196
539	NC_000909	TC	3	6	26369	26374	0 %	50 %	0 %	50 %	15668196
540	NC_000909	AAC	2	6	26378	26383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15668196
541	NC_000909	TAA	2	6	26481	26486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668196
542	NC_000909	T	6	6	26497	26502	0 %	100 %	0 %	0 %	15668196
543	NC_000909	TTC	2	6	26507	26512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15668196
544	NC_000909	T	6	6	26592	26597	0 %	100 %	0 %	0 %	15668196
545	NC_000909	CTC	2	6	26630	26635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668196
546	NC_000909	T	6	6	26716	26721	0 %	100 %	0 %	0 %	15668196
547	NC_000909	TGG	2	6	26733	26738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668196
548	NC_000909	TCCC	2	8	26756	26763	0 %	25 %	0 %	75 %	15668196
549	NC_000909	T	6	6	26781	26786	0 %	100 %	0 %	0 %	15668196
550	NC_000909	GAG	2	6	26808	26813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668196
551	NC_000909	CAG	2	6	26840	26845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668196
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554	NC_000909	GAG	2	6	26978	26983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15668196
555	NC_000909	TTCT	2	8	26995	27002	0 %	75 %	0 %	25 %	15668196
556	NC_000909	TAA	2	6	27017	27022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668196
557	NC_000909	CAG	2	6	27059	27064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15668196
558	NC_000909	CTC	2	6	27080	27085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15668196
559	NC_000909	CAATAA	2	12	27104	27115	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15668196
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561	NC_000909	TGG	2	6	27173	27178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15668197
562	NC_000909	TA	3	6	27200	27205	50 %	50 %	0 %	0 %	15668197
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564	NC_000909	CAT	2	6	27262	27267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668197
565	NC_000909	T	6	6	27271	27276	0 %	100 %	0 %	0 %	15668197
566	NC_000909	AT	3	6	27282	27287	50 %	50 %	0 %	0 %	15668197
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593	NC_000909	AAT	2	6	28261	28266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668198
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598	NC_000909	ATT	2	6	28376	28381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15668198
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601	NC_000909	ACT	2	6	28454	28459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668198
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603	NC_000909	T	6	6	28494	28499	0 %	100 %	0 %	0 %	15668198
604	NC_000909	T	6	6	28501	28506	0 %	100 %	0 %	0 %	15668198
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612	NC_000909	TTTCC	2	10	28795	28804	0 %	60 %	0 %	40 %	15668199
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616	NC_000909	ATATA	2	10	28962	28971	60 %	40 %	0 %	0 %	15668199
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618	NC_000909	ATC	2	6	29018	29023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668199
619	NC_000909	TA	4	8	29041	29048	50 %	50 %	0 %	0 %	15668199
620	NC_000909	ATA	2	6	29080	29085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15668199
621	NC_000909	ACCA	2	8	29114	29121	50 %	0 %	0 %	50 %	15668199
622	NC_000909	ATC	2	6	29147	29152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15668199
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625	NC_000909	TGGCT	2	10	29231	29240	0 %	40 %	40 %	20 %	15668199
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